Mercurial > repos > iuc > medaka_variant_pipeline
directory /test-data/ @ 5:efca385ce679 draft
name | size | permissions |
---|---|---|
[up] | drwxr-xr-x | |
alignment.bam | 233 | -rw-r--r-- |
all_fasta.loc | 86 | -rw-r--r-- |
annotate_vcf_test.pileup | 1097 | -rw-r--r-- |
annotate_vcf_test.vcf | 425 | -rw-r--r-- |
annotated.vcf | 1135 | -rw-r--r-- |
assembly.fasta | 3889 | -rw-r--r-- |
basecalls.fastq | 607090 | -rw-r--r-- |
bwa-mem-mt-genome.fa | 16837 | -rw-r--r-- |
bwa-mem-mt-genome.fa.fai | 45 | -rw-r--r-- |
consensus.hdf | 32624 | -rw-r--r-- |
medaka_test.bam | 51709 | -rw-r--r-- |
medaka_test.bam.bai | 96 | -rw-r--r-- |
medaka_test.hdf | 108800 | -rw-r--r-- |
ref.fasta | 2954 | -rw-r--r-- |
ref.fasta.fai | 30 | -rw-r--r-- |
variants.vcf.gz | 314 | -rw-r--r-- |