| 
[up]
 | 
 | 
drwxr-xr-x | 
  output_dedup_max_mismatch0_sorted.pairsam
 | 
372798 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dedup_max_mismatch0_sorted.stats
 | 
13343 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dedup_max_parent_id_bytile_sorted.pairsam
 | 
372678 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dedup_max_parent_id_bytile_sorted.stats
 | 
13420 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dedup_max_parent_id_bytile_sorted_tile_dups.stats
 | 
151 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dedup_pairs.pairsam
 | 
372026 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dedup_pairs.stats
 | 
13341 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dedup_pairs_markdups.pairsam
 | 
372542 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dedup_pairs_markdups.pairsam.gz
 | 
101201 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dedup_sorted.pairsam
 | 
373866 | 
-rw-r--r-- | 
  output_dups_pairs_markdups.pairsam
 | 
10523 | 
-rw-r--r-- | 
  output_pairs_split.bam
 | 
92148 | 
-rw-r--r-- | 
  output_pairs_split.pairs
 | 
63571 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs.stats
 | 
10895 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_bam.pairs
 | 
876390 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_bam_5unique.pairs
 | 
876160 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_bam_min_mapq_40.pairs
 | 
876148 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_bam_readid_dropped.pairs
 | 
802643 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_bam_readid_dropped_seq.pairs
 | 
231910 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_sam.pairs
 | 
583430 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_sam.pairs.gz
 | 
114431 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_sam.sorted.pairs
 | 
583671 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_sam_assemblyname.pairs
 | 
583462 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_sam_assemblyname.pairs.gz
 | 
114395 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_sam_assemblyname.sorted.pairs
 | 
583729 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_sam_assemblyname.sorted.pairs.gz
 | 
113336 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_sam_mapq.pairs
 | 
740947 | 
-rw-r--r-- | 
  output_parsed_pairs_sam_mapq.sorted.pairs
 | 
741198 | 
-rw-r--r-- | 
  output_sorted_pairs.pairs
 | 
877743 | 
-rw-r--r-- | 
  output_sorted_pairs.pairsam
 | 
876417 | 
-rw-r--r-- | 
  output_sorted_pairs.pairsam.gz
 | 
192747 | 
-rw-r--r-- | 
  pairs_output.stats
 | 
10916 | 
-rw-r--r-- | 
  pairs_output2.stats
 | 
4824 | 
-rw-r--r-- | 
  pairs_output2.stats.gz
 | 
931 | 
-rw-r--r-- | 
  pairs_output_merged.stats
 | 
10930 | 
-rw-r--r-- | 
  pairs_output_with_chromsize.stats
 | 
10916 | 
-rw-r--r-- | 
  pairs_output_yaml.stats
 | 
6422 | 
-rw-r--r-- | 
  test.bam
 | 
176282 | 
-rw-r--r-- | 
  test.genome
 | 
16 | 
-rw-r--r-- | 
  test.reduced.chrom.sizes
 | 
229 | 
-rw-r--r-- | 
  test.sam
 | 
528028 | 
-rw-r--r-- |