Mercurial > repos > iuc > samtools_fastx

comparison test-data/samtools_fastx-out2-2.fastq @ 1:a8d69aee190e draft

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date Fri, 28 Sep 2018 04:39:19 -0400
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107 + 127 +
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111 + 131 +
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115 + 135 +
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119 + 139 +
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123 +
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127 +
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131 +
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135 + 143 +
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139 + 147 +
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147 + 155 +
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159 +
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151 + 163 +
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155 + 167 +
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159 + 171 +
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163 + 175 +
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166 AGCCGGCCCATTCGCGTTATTCTTTATAGCAGAGTACGCTAACATTATTGTAATAAACGCCCTAACAACT 178 AGCCGGCCCATTCGCGTTATTCTTTATAGCAGAGTACGCTAACATTATTGTAATAAACGCCCTAACAACT
167 + 179 +
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171 +
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175 + 183 +
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179 + 187 +
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183 + 191 +
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199 +
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201 @chrM_4389_4907_2:1:4_2:1:0_43
202 TTACTTGTATTTTCATAGGGGCAAGAGGAGGACTTTAACCAAACACAAATACGAAAAATTGCCTATTCAG
191 + 203 +
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195 + 207 +
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199 + 211 +
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202 CAACTCAATCTCACTTCTATGAAATAAAACTCCATCAATACTAACTATAATCTCACTGATATTACAATCC 214 CAACTCAATCTCACTTCTATGAAATAAAACTCCATCAATACTAACTATAATCTCACTGATATTACAATCC
203 + 215 +
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207 + 219 +
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223 +
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225 @chrM_4740_5317_2:2:0_2:3:0_46
226 GCTGAGTAAGCATTAGACTGTAAATCTAAAGACCCAGGTTTAAGTCCTTTTTTTACCAGAGGTCTTAAGG
211 + 227 +
212 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 228 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
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215 + 231 +
216 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 232 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
217 @chrM_4633_5057_1:1:0_0:1:0_3f 233 @chrM_4989_5463_0:1:2_1:1:0_9a
218 TTGCATTCAATAGATGTAGGATGAAGTCTTTCAGTCCTTATCAGAAGTTAAACTTGTGTGTTTTCTTAGG 234 CACCTGGTTGACCTAATTCTGCGCGAATTAAAATACTTAGTGCAGTACCCACTATTCCCGCTGAGGCTCC
219 + 235 +
220 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 236 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
221 @chrM_4723_5166_3:1:0_1:0:0_7f 237 @chrM_5079_5628_3:1:0_1:0:0_45
222 TAAAACAAACAACTGTCTAATTATAGCAACACTCATAGCAATAATAGCTCTACTATACCTATTCATTTAT 238 TTATATTATTTATTCGTGGGAATGCTATATCTGGGGCTCCGATTATTAGTGGGACCAGTCAGTTTCCAAA
239 +
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241 @chrM_5081_5631_1:1:0_1:1:0_62
242 AACTTGTATTATTTATTCGAGGGAATGCTATATCTGGGGCTCCGATTATTAGTGGGACAAGTCAGTTTCC
243 +
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245 @chrM_5235_5764_4:3:0_1:1:0_18
246 GACATGAATATCACCTTAAGAGCTCTGGTAAAAAAAGGACTTAAACGTGTGTGTTTAGCTTTACAGTGTA
223 + 247 +
224 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 248 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
225 @chrM_5364_5814_0:2:0_0:0:0_ba 249 @chrM_5364_5814_0:2:0_0:0:0_ba
226 AAAGATATCGGAACCCTCTATCTACTATTCAGAGCCTGAGCGGGACTAGTGGGTACTGCACTAAGTATTT 250 AAAGATATCGGAACCCTCTATCTACTATTCAGAGCCTGAGCGGGACTAGTGGGTACTGCACTAAGTATTT
227 + 251 +
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229 @chrM_4989_5463_0:1:2_1:1:0_9a
230 CACCTGGTTGACCTAATTCTGCGCGAATTAAAATACTTAGTGCAGTACCCACTATTCCCGCTGAGGCTCC
231 +
232 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
233 @chrM_5499_6008_3:0:0_1:2:0_53 253 @chrM_5499_6008_3:0:0_1:2:0_53
234 GTAACTGCCCATGCTTATGTTAAAATTTTCTTCATAGTAATACCAATAATAATTGGAGGGTTTGGAAACT 254 GTAACTGCCCATGCTTATGTTAAAATTTTCTTCATAGTAATACCAATAATAATTGGAGGGTTTGGAAACT
235 + 255 +
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239 +
240 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
241 @chrM_5081_5631_1:1:0_1:1:0_62
242 AACTTGTATTATTTATTCGAGGGAATGCTATATCTGGGGCTCCGATTATTAGTGGGACAAGTCAGTTTCC
243 + 259 +
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245 @chrM_5630_6213_1:0:0_0:1:0_91 261 @chrM_5630_6213_1:0:0_0:1:0_91
246 TTTTTGACTCCTACCACCATCATTTCTCCTTCTCCTAGCATCATCAATAGTATAAGCAGGAGCAGGAACA 262 TTTTTGACTCCTACCACCATCATTTCTCCTTCTCCTAGCATCATCAATAGTATAAGCAGGAGCAGGAACA
247 + 263 +
248 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 264 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
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250 GACATGAATATCACCTTAAGAGCTCTGGTAAAAAAAGGACTTAAACGTGTGTGTTTAGCTTTACAGTGTA 266 CATACTGTGAATATGTGGTGGGCTCATACAATAAAGCCTAGAAAGCCAATAGACATTATTGCTCATACTA
251 + 267 +
252 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 268 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
253 @chrM_5735_6152_2:0:0_0:1:0_c1 269 @chrM_5735_6152_2:0:0_0:1:0_c1
254 AGCCCATGCAGGAGCATCAGTAGACCTAACAATTTTCTCCCTTCATTTAGCTGGAGTGTCATCTAATTTC 270 AGCCCATGCAGGAGCATCAGTAGACCTAACAATTTTCTCCCTTCATTTAGCTGGAGTGTCATCTAATTTC
255 + 271 +
256 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 272 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
273 @chrM_5817_6393_0:1:0_2:2:0_a8
274 TTCCCGTTATACCACCAACTGTAAATAAGAAAATAAAGCATAAGGCTCATAGAATAGCTGGAGATCATTT
275 +
276 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
257 @chrM_5893_6392_1:2:0_0:2:0_22 277 @chrM_5893_6392_1:2:0_0:2:0_22
258 TTATTACAGCCGTAGTGCTCCTATTATCACTACCAGTGCTACCCGCAGGCATTACTATACTACTAATAGA 278 TTATTACAGCCGTAGTGCTCCTATTATCACTACCAGTGCTACCCGCAGGCATTACTATACTACTAATAGA
259 + 279 +
260 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 280 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
261 @chrM_5902_6370_4:1:0_3:2:0_8f 281 @chrM_5902_6370_4:1:0_3:2:0_8f
262 AATAAGAAAATACAGCATAAGGCTCATAGTATAGCAGGAGATCATTTACTATTACCTCCGTATAGGGTTG 282 AATAAGAAAATACAGCATAAGGCTCATAGTATAGCAGGAGATCATTTACTATTACCTCCGTATAGGGTTG
263 + 283 +
264 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 284 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
265 @chrM_5575_6058_0:0:0_0:1:0_3a 285 @chrM_5923_6445_3:2:0_1:2:0_b8
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287 +
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289 @chrM_6034_6497_2:3:0_0:1:0_4a
290 TATGATAGCAAACACCGCTCCCATTGATAGAACATAGTGGAAATGGGCTACTACATAGTATGTATCGTGA
267 + 291 +
268 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 292 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
269 @chrM_6047_6600_1:2:0_1:0:0_ac 293 @chrM_6047_6600_1:2:0_1:0:0_ac
270 CCCAGAAGTTTATATTCTTATCCTCCCAGGATTTGGATTCATTTCACATGTAGTTCCTTACTACTCCGGA 294 CCCAGAAGTTTATATTCTTATCCTCCCAGGATTTGGATTCATTTCACATGTAGTTCCTTACTACTCCGGA
271 + 295 +
272 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 296 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
297 @chrM_6123_6649_2:0:0_2:0:0_b9
298 GAGTAGCGTCGAGTTATTCCTGAAAGGCCCAGGAAATGTTGAGGGAAGAATGTTATGTTTACTCCTACGA
299 +
300 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
273 @chrM_6135_6597_0:0:1_2:0:0_90 301 @chrM_6135_6597_0:0:1_2:0:0_90
274 TATATAGGAATAGTATGAGCAATAATGTACTATTGGCTTTCTAGGCTTTATTGTATGAGCCCACCACATA 302 TATATAGGAATAGTATGAGCAATAATGTACTATTGGCTTTCTAGGCTTTATTGTATGAGCCCACCACATA
275 + 303 +
276 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 304 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
277 @chrM_5666_6214_1:0:0_0:1:0_0 305 @chrM_6242_6759_1:2:0_2:2:0_9b
278 CATACTGTGAATATGTGGTGGGCTCATACAATAAAGCCTAGAAAGCCAATAGACATTATTGCTCATACTA 306 TAGCAAAGGCCTGTCAAATTATAAAGATCATGATGAGAACAGCTGTTAGTGAAATAAATGATACAATAGA
279 + 307 +
280 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 308 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
281 @chrM_6286_6744_2:2:0_1:1:0_c4 309 @chrM_6286_6744_2:2:0_1:1:0_c4
282 TATTTAGCTGACTTGCAACGGTATACGGAGGTAATATTAAATGATCTCCAGCTATACTATGAGCCTTATG 310 TATTTAGCTGACTTGCAACGGTATACGGAGGTAATATTAAATGATCTCCAGCTATACTATGAGCCTTATG
283 + 311 +
284 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 312 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
285 @chrM_6288_6809_0:2:0_1:1:0_a6 313 @chrM_6288_6809_0:2:0_1:1:0_a6
286 TTTAGCTGACTTGCAACCCTATACGGAGGTAATATTAAATGATCTCCAGCTATACTATGAGCCTTATGCT 314 TTTAGCTGACTTGCAACCCTATACGGAGGTAATATTAAATGATCTCCAGCTATACTATGAGCCTTATGCT
287 + 315 +
288 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 316 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
289 @chrM_5817_6393_0:1:0_2:2:0_a8
290 TTCCCGTTATACCACCAACTGTAAATAAGAAAATAAAGCATAAGGCTCATAGAATAGCTGGAGATCATTT
291 +
292 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
293 @chrM_5923_6445_3:2:0_1:2:0_b8
294 ACATAGTATGTATCGTGAAGCACGATGTCAGTGGATGAGTTGGATAACACAATTCCGGTTAGACCACCAA
295 +
296 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
297 @chrM_6034_6497_2:3:0_0:1:0_4a
298 TATGATAGCAAACACCGCTCCCATTGATAGAACATAGTGGAAATGGGCTACTACATAGTATGTATCGTGA
299 +
300 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
301 @chrM_6468_6879_3:1:0_3:1:0_12 317 @chrM_6468_6879_3:1:0_3:1:0_12
302 CTATCAATGGGAGCGGTGTATGCTATCATATCAGGATTTGTTCACTGATTCCCATTATTATCAGGCTTCA 318 CTATCAATGGGAGCGGTGTATGCTATCATATCAGGATTTGTTCACTGATTCCCATTATTATCAGGCTTCA
303 + 319 +
304 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 320 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
305 @chrM_6123_6649_2:0:0_2:0:0_b9 321 @chrM_6618_7072_3:0:0_2:0:0_88
306 GAGTAGCGTCGAGTTATTCCTGAAAGGCCCAGGAAATGTTGAGGGAAGAATGTTATGTTTACTCCTACGA 322 TAGCTCTTCTATAATAGGGGAAGTGGCGTCTAGTAGACCAAGTTGGAATGGGTAGGCCATATAAGATATA
323 +
324 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
325 @chrM_6660_7121_1:1:0_0:1:0_b6
326 AGGAGCTAATTAGGAAAACAACTATTAGTGTGTGATCATGGAAATTTATTAGCTCTTCTATAATAGGGGA
327 +
328 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
329 @chrM_6680_7101_1:1:0_2:1:0_c
330 ACTATTATTGTGTGATCATGGAAATTTATTAGCTCATCTATAATAGGGGATGTGGCGTCTTGTAGACCAA
307 + 331 +
308 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 332 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
309 @chrM_6686_7208_1:1:0_0:0:0_3 333 @chrM_6686_7208_1:1:0_0:0:0_3
310 CTCTTCTATAGTATCATTTAATTCACTAACAGCTGTTCTCATCATGATCTTTATAATTTGAGAGGCCTTT 334 CTCTTCTATAGTATCATTTAATTCACTAACAGCTGTTCTCATCATGATCTTTATAATTTGAGAGGCCTTT
311 + 335 +
312 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 336 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
313 @chrM_6242_6759_1:2:0_2:2:0_9b
314 TAGCAAAGGCCTGTCAAATTATAAAGATCATGATGAGAACAGCTGTTAGTGAAATAAATGATACAATAGA
315 +
316 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
317 @chrM_6696_7251_0:2:0_1:2:0_16 337 @chrM_6696_7251_0:2:0_1:2:0_16
318 GTATCATTTATTTCACTAACAGCTGTTCTCATCATGATCTTTATAATTTGAGAGGCCTTTGCTACAAAAC 338 GTATCATTTATTTCACTAACAGCTGTTCTCATCATGATCTTTATAATTTGAGAGGCCTTTGCTACAAAAC
319 + 339 +
320 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 340 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
321 @chrM_6717_7185_3:1:0_2:0:0_71 341 @chrM_6717_7185_3:1:0_2:0:0_71
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327 + 347 +
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351 +
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331 + 355 +
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375 + 395 +
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379 + 399 +
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391 + 411 +
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395 +
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399 + 415 +
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403 + 419 +
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423 +
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407 + 427 +
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435 +
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415 + 439 +
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419 + 443 +
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423 + 447 +
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427 + 451 +
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431 + 455 +
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447 +
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515 + 539 +
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519 + 543 +
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523 +
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527 +
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531 +
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535 + 547 +
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539 + 555 +
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547 + 563 +
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551 + 567 +
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559 + 575 +
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563 + 579 +
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595 +
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579 + 615 +
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587 + 627 +
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595 +
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599 + 635 +
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607 +
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611 +
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619 +
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635 +
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639 + 651 +
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671 +
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659 + 675 +
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679 +
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667 + 687 +
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671 +
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677 @chrM_13353_13784_0:0:0_1:2:0_33 693 @chrM_13815_14395_0:0:0_0:1:0_9e
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679 + 695 +
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683 + 699 +
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687 + 703 +
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707 +
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691 + 711 +
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695 + 715 +
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699 + 719 +
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723 +
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703 + 727 +
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707 + 731 +
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735 +
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711 + 739 +
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715 + 743 +
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719 +
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723 + 747 +
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727 + 751 +
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755 +
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759 +
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731 + 763 +
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735 + 767 +
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739 + 771 +
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743 + 775 +
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747 + 779 +
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755 +
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759 + 783 +
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763 + 787 +
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771 +
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775 + 791 +
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