Mercurial > repos > iuc > seqkit_sort

comparison test-data/locate_output1.tabular @ 0:1f08834f987e draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/seqkit commit d3d2bb547caccd2d217e5b77d62ea181f8e870c7
author iuc
date Tue, 26 Mar 2024 21:49:37 +0000
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:1f08834f987e
1 seqID patternName pattern strand start end matched
2 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 251 256 ATAGAT
3 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 435 440 AGAGAT
4 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 660 665 ATAGAG
5 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 741 746 AAAGAT
6 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 852 857 ATAAAT
7 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 1142 1147 AAAGAT
8 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 1320 1325 ATAGGT
9 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 1621 1626 ATAAAT
10 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 1778 1783 AGAGAT
11 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 1784 1789 ATACAT
12 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 1810 1815 ATAAAT
13 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2038 2043 ATGGAT
14 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2120 2125 CTAGAT
15 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2235 2240 ATAGTT
16 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2243 2248 ATAAAT
17 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2318 2323 CTAGAT
18 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2527 2532 ATAAAT
19 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2549 2554 AAAGAT
20 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2603 2608 ATATAT
21 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2651 2656 ATGGAT
22 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2726 2731 ATAGTT
23 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2744 2749 ATAAAT
24 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 2902 2907 TTAGAT
25 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 3041 3046 AAAGAT
26 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 3488 3493 ATGGAT
27 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 3539 3544 TTAGAT
28 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 3675 3680 AAAGAT
29 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 3739 3744 ATGGAT
30 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 3770 3775 ATAGAT
31 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 3825 3830 AGAGAT
32 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 3862 3867 AAAGAT
33 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 3870 3875 ATAGGT
34 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4052 4057 ATATAT
35 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4068 4073 AGAGAT
36 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4080 4085 ACAGAT
37 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4388 4393 TTAGAT
38 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4446 4451 ATAGAG
39 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4500 4505 AAAGAT
40 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4563 4568 ATAGAA
41 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4607 4612 ATAGAA
42 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4675 4680 ATGGAT
43 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT + 4692 4697 ATGGAT
44 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 4603 4608 ATAAAT
45 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 4459 4464 TTAGAT
46 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 4223 4228 GTAGAT
47 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 4072 4077 ATGGAT
48 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 4052 4057 ATATAT
49 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 3634 3639 ATAAAT
50 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 3566 3571 ATAGAC
51 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 2918 2923 ACAGAT
52 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 2778 2783 ATACAT
53 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 2709 2714 ATAAAT
54 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 2644 2649 ATAAAT
55 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 2603 2608 ATATAT
56 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 2531 2536 ATTGAT
57 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 1734 1739 ATTGAT
58 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 1601 1606 ACAGAT
59 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 1438 1443 ATAGAA
60 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 1422 1427 ATAGGT
61 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 1329 1334 ATAGAG
62 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 1146 1151 ATACAT
63 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 1121 1126 ATACAT
64 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 811 816 ATAGCT
65 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 764 769 GTAGAT
66 ENA|AB011145|AB011145.1 ATAGAT ATAGAT - 656 661 ATAGTT
67 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT + 250 255 ATGGAT
68 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT + 664 669 AAAGAT
69 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT + 1987 1992 ACAGAT
70 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT + 3540 3545 AGAGAT
71 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT + 3561 3566 AGAGAT
72 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT + 3886 3891 ATGGAT
73 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT + 4400 4405 AGAGAT
74 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT + 4413 4418 ATACAT
75 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 3688 3693 ATAGAT
76 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 3065 3070 ATAGAT
77 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 3061 3066 ATAAAT
78 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 3025 3030 AAAGAT
79 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 2956 2961 ATAGGT
80 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 2828 2833 AGAGAT
81 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 2719 2724 AAAGAT
82 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 1975 1980 ATAAAT
83 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 1951 1956 ATAGGT
84 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 1909 1914 AAAGAT
85 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 1659 1664 AAAGAT
86 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 1417 1422 ATAGAA
87 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 1319 1324 TTAGAT
88 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 802 807 ACAGAT
89 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 691 696 ACAGAT
90 ENA|M10051|M10051.1 ATAGAT ATAGAT - 415 420 ATAGAC
91 ENA|BC112106|BC112106.1 ATAGAT ATAGAT + 386 391 ATGGAT
92 ENA|BC112106|BC112106.1 ATAGAT ATAGAT - 1000 1005 ATAGAT
93 ENA|BC112106|BC112106.1 ATAGAT ATAGAT - 985 990 GTAGAT
94 ENA|BC112106|BC112106.1 ATAGAT ATAGAT - 742 747 AAAGAT
95 ENA|BC112106|BC112106.1 ATAGAT ATAGAT - 700 705 GTAGAT