# HG changeset patch
# User iuc
# Date 1518806416 18000
# Node ID c9a8ef2aa380f28cd00400f4dced8d7c96e71e0f
planemo upload commit b288d4f48e58e291bda17c5945c281348ee072c7
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 macros.xml
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/macros.xml Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,25 @@
+
+
+
+ snippy
+
+
+
+
+
+
+
+
+ 3.2
+
+
+
+ @UNPUBLISHED{Seemann2013,
+ author = "Seemann T",
+ title = "snippy: fast bacterial variant calling from NGS reads",
+ year = "2015",
+ note = "https://github.com/tseemann/snippy",
+ url = "https://github.com/tseemann/snippy"}
+
+
+
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 snippy-core.xml
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/snippy-core.xml Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,76 @@
+
+
+ Combine multiple Snippy outputs into a core SNP alignment
+
+
+ macros.xml
+
+
+
+
+
+
+
+
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+
+
+
+
+
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+
+
+
+ outputs and 'outaln' in outputs
+
+
+ outputs and 'outfull' in outputs
+
+
+ outputs and 'outtab' in outputs
+
+
+ outputs and 'outtxt' in outputs
+
+
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+
+
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+
+
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+
+
+
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+
+
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 snippy.xml
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/snippy.xml Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,246 @@
+
+
+ Snippy finds SNPs between a haploid reference genome and your NGS sequence reads.
+
+
+ macros.xml
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+
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+
+
+
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+
+
+ outputs and 'outvcf' in outputs
+
+
+ outputs and 'outgff' in outputs
+
+
+ outputs and 'outtab' in outputs
+
+
+ outputs and 'outsum' in outputs
+
+
+ outputs and 'outlog' in outputs
+
+
+ outputs and 'outaln' in outputs
+
+
+ outputs and 'outcon' in outputs
+
+
+ outputs and 'outdep' in outputs
+
+
+ outputs and 'outbam' in outputs
+
+
+ outputs and 'outzip' in outputs
+
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+
+
+
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+
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+
+
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 snippy_core_wrapper.pl
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/snippy_core_wrapper.pl Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,82 @@
+#!/usr/bin/env perl
+
+#--------------------------------------
+#
+# snippy_core_wrapper.pl
+#
+# This is an intermediary script between snippy-core.xml and snippy-core
+# It:
+# - Copys the supplied zipped snippy output files to the working dir
+# - Untars them to their datafile name
+# - Builds the snippy-core command
+# - Runs the snippy-core command
+#
+#--------------------------------------
+
+use warnings;
+use strict;
+use File::Copy;
+use File::Basename;
+
+my(@Options, $indirs, $noref);
+setOptions();
+
+my @list_of_dirs = split /\s+/, $indirs;
+
+#The list of final directories to be passed to snippy-core will be stored here.
+my @snippy_outs;
+
+foreach my $d (@list_of_dirs){
+ print STDERR "$d\n";
+ my $bn = basename($d);
+ my ($name, $dir, $ext) = fileparse($d, '\..*');
+ copy($d, $bn);
+ print STDERR "$d, $bn, $name, $dir, $ext\n";
+ `tar -xf $bn`;
+}
+
+my $test_list = `ls -d */`;
+$test_list =~ s/\///g;
+print STDERR "$test_list\n";
+
+@snippy_outs = split /\s+/, $test_list;
+
+
+my $commandline = "snippy-core ";
+
+$commandline .= "--noref " if $noref;
+$commandline .= join(" ", @snippy_outs);
+print STDERR "snippy-core commandline: $commandline\n";
+
+my $ok = system($commandline);
+
+#----------------------------------------------------------------------
+# Option setting routines
+
+sub setOptions {
+ use Getopt::Long;
+
+ @Options = (
+ {OPT=>"help", VAR=>\&usage, DESC=>"This help"},
+ {OPT=>"noref!", VAR=>\$noref, DEFAULT=>0, DESC=>"Don't include the reference in the alignment."},
+ {OPT=>"indirs=s", VAR=>\$indirs, DEFAULT=>"", DESC=>"A whitespace delimited list of the snippy output zipped dirs."},
+ );
+
+ &GetOptions(map {$_->{OPT}, $_->{VAR}} @Options) || usage();
+
+ # Now setup default values.
+ foreach (@Options) {
+ if (defined($_->{DEFAULT}) && !defined(${$_->{VAR}})) {
+ ${$_->{VAR}} = $_->{DEFAULT};
+ }
+ }
+}
+
+sub usage {
+ print "Usage: $0 [options] -i inputfile > ... \n";
+ foreach (@Options) {
+ printf " --%-13s %s%s.\n",$_->{OPT},$_->{DESC},
+ defined($_->{DEFAULT}) ? " (default '$_->{DEFAULT}')" : "";
+ }
+ exit(1);
+}
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/S1.tgz
Binary file test-data/S1.tgz has changed
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/S2.tgz
Binary file test-data/S2.tgz has changed
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/core/core.txt
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/core/core.txt Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,3 @@
+ID Aligned Bases Reference bases % Aligned Bases
+S1 2732313 3000464 91.06
+S2 2731269 3000464 91.03
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/fna_ref/snps.gff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/fna_ref/snps.gff Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,16 @@
+##gff-version 3
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 24388 24388 . . 0 note=snp A=>G G:22 A:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 29479 29479 . . 0 note=snp T=>G G:21 T:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 47299 47299 . . 0 note=snp T=>A A:24 T:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 102969 102969 . . 0 note=snp G=>C C:16 G:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 103048 103048 . . 0 note=snp T=>A A:20 T:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 103379 103379 . . 0 note=del GAA=>GA GA:11 GAA:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 106602 106602 . . 0 note=snp T=>G G:21 T:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 109833 109833 . . 0 note=snp T=>A A:16 T:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 114540 114540 . . 0 note=del ATT=>AT AT:25 ATT:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 129881 129881 . . 0 note=mnp GT=>AA AA:18 GT:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 138877 138877 . . 0 note=snp G=>C C:14 G:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 138920 138920 . . 0 note=snp A=>G G:10 A:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 160547 160547 . . 0 note=del GTC=>GC GC:18 GTC:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 160552 160552 . . 0 note=del CTA=>CA CA:20 CTA:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 190866 190866 . . 0 note=del GTT=>GT GT:18 GTT:0
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/fna_ref/snps.txt
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/fna_ref/snps.txt Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,9 @@
+DateTime 2017-07-12T04:51:24
+ReadFiles /home/ubuntu/snippy/test-data/mutant_R1.fastq /home/ubuntu/snippy/test-data/mutant_R2.fastq
+Reference /home/ubuntu/snippy/test-data/wildtype.fna
+ReferenceSize 200694
+Software snippy 3.2-dev
+Variant-DEL 5
+Variant-MNP 1
+Variant-SNP 9
+VariantTotal 15
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/gbk_ref/snps.gff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/gbk_ref/snps.gff Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,16 @@
+##gff-version 3
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 24388 24388 . . 0 note=snp A=>G G:22 A:0 CDS + 1/702 1/233 initiator_codon_variant c.1A>G p.Met1? WILD_00022 walR Transcriptional regulatory protein WalR
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 29479 29479 . . 0 note=snp T=>G G:21 T:0 CDS + 39/792 13/263 synonymous_variant c.39T>G p.Gly13Gly WILD_00026 yycJ Putative metallo-hydrolase YycJ
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 47299 47299 . . 0 note=snp T=>A A:24 T:0 CDS + 54/1758 18/585 stop_gained c.54T>A p.Cys18* WILD_00043 mecR1 Methicillin resistance mecR1 protein
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 102969 102969 . . 0 note=snp G=>C C:16 G:0 CDS - 87/1281 29/426 synonymous_variant c.87C>G p.Gly29Gly WILD_00093 spa Immunoglobulin G-binding protein A
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 103048 103048 . . 0 note=snp T=>A A:20 T:0 CDS - 8/1281 3/426 missense_variant c.8A>T p.Lys3Met WILD_00093 spa Immunoglobulin G-binding protein A
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 103379 103379 . . 0 note=del GAA=>GA GA:11 GAA:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 106602 106602 . . 0 note=snp T=>G G:21 T:0 CDS - 993/993 331/330 stop_lost&splice_region_variant c.993A>C p.Ter331Tyrext*? WILD_00097 yfiY putative siderophore-binding lipoprotein YfiY
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 109833 109833 . . 0 note=snp T=>A A:16 T:0 CDS + 1/1755 1/584 initiator_codon_variant c.1T>A p.Leu1? WILD_00100 iucC_1 Aerobactin synthase
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 114540 114540 . . 0 note=del ATT=>AT AT:25 ATT:0 CDS + 1717/1737 573/578 frameshift_variant c.1717delT p.Cys573fs WILD_00102 iucA N(2)-citryl-N(6)-acetyl-N(6)-hydroxylysine synthase
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 129881 129881 . . 0 note=mnp GT=>AA AA:18 GT:0 CDS + 55/708 19/235 missense_variant c.55_56delGTinsAA p.Val19Asn WILD_00117 deoD Purine nucleoside phosphorylase DeoD-type
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 138877 138877 . . 0 note=snp G=>C C:14 G:0 CDS + 1119/1545 373/514 missense_variant c.1119G>C p.Trp373Cys WILD_00125 hypothetical protein
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 138920 138920 . . 0 note=snp A=>G G:10 A:0 CDS + 1162/1545 388/514 missense_variant c.1162A>G p.Lys388Glu WILD_00125 hypothetical protein
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 160547 160547 . . 0 note=del GTC=>GC GC:18 GTC:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 160552 160552 . . 0 note=del CTA=>CA CA:20 CTA:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 190866 190866 . . 0 note=del GTT=>GT GT:18 GTT:0 CDS - 28/1356 10/451 frameshift_variant c.28delA p.Asn10fs WILD_00166 brnQ Branched-chain amino acid transport system 2 carrier protein
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/gbk_ref/snps.txt
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/gbk_ref/snps.txt Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,9 @@
+DateTime 2017-07-12T04:52:49
+ReadFiles /home/ubuntu/snippy/test-data/mutant_R1.fastq /home/ubuntu/snippy/test-data/mutant_R2.fastq
+Reference /home/ubuntu/snippy/test-data/wildtype.gbk
+ReferenceSize 200727
+Software snippy 3.2-dev
+Variant-DEL 5
+Variant-MNP 1
+Variant-SNP 9
+VariantTotal 15
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/map_qual/snps.gff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/map_qual/snps.gff Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,16 @@
+##gff-version 3
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 24388 24388 . . 0 note=snp A=>G G:22 A:0 CDS + 1/702 1/233 initiator_codon_variant c.1A>G p.Met1? WILD_00022 walR Transcriptional regulatory protein WalR
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 29479 29479 . . 0 note=snp T=>G G:21 T:0 CDS + 39/792 13/263 synonymous_variant c.39T>G p.Gly13Gly WILD_00026 yycJ Putative metallo-hydrolase YycJ
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 47299 47299 . . 0 note=snp T=>A A:24 T:0 CDS + 54/1758 18/585 stop_gained c.54T>A p.Cys18* WILD_00043 mecR1 Methicillin resistance mecR1 protein
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 102969 102969 . . 0 note=snp G=>C C:16 G:0 CDS - 87/1281 29/426 synonymous_variant c.87C>G p.Gly29Gly WILD_00093 spa Immunoglobulin G-binding protein A
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 103048 103048 . . 0 note=snp T=>A A:20 T:0 CDS - 8/1281 3/426 missense_variant c.8A>T p.Lys3Met WILD_00093 spa Immunoglobulin G-binding protein A
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 103379 103379 . . 0 note=del GAA=>GA GA:11 GAA:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 106602 106602 . . 0 note=snp T=>G G:21 T:0 CDS - 993/993 331/330 stop_lost&splice_region_variant c.993A>C p.Ter331Tyrext*? WILD_00097 yfiY putative siderophore-binding lipoprotein YfiY
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 109833 109833 . . 0 note=snp T=>A A:16 T:0 CDS + 1/1755 1/584 initiator_codon_variant c.1T>A p.Leu1? WILD_00100 iucC_1 Aerobactin synthase
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 114540 114540 . . 0 note=del ATT=>AT AT:25 ATT:0 CDS + 1717/1737 573/578 frameshift_variant c.1717delT p.Cys573fs WILD_00102 iucA N(2)-citryl-N(6)-acetyl-N(6)-hydroxylysine synthase
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 129881 129881 . . 0 note=mnp GT=>AA AA:18 GT:0 CDS + 55/708 19/235 missense_variant c.55_56delGTinsAA p.Val19Asn WILD_00117 deoD Purine nucleoside phosphorylase DeoD-type
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 138877 138877 . . 0 note=snp G=>C C:14 G:0 CDS + 1119/1545 373/514 missense_variant c.1119G>C p.Trp373Cys WILD_00125 hypothetical protein
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 138920 138920 . . 0 note=snp A=>G G:10 A:0 CDS + 1162/1545 388/514 missense_variant c.1162A>G p.Lys388Glu WILD_00125 hypothetical protein
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 160547 160547 . . 0 note=del GTC=>GC GC:18 GTC:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 160552 160552 . . 0 note=del CTA=>CA CA:20 CTA:0
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 190866 190866 . . 0 note=del GTT=>GT GT:18 GTT:0 CDS - 28/1356 10/451 frameshift_variant c.28delA p.Asn10fs WILD_00166 brnQ Branched-chain amino acid transport system 2 carrier protein
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/map_qual/snps.txt
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/map_qual/snps.txt Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,9 @@
+DateTime 2017-07-13T05:37:56
+ReadFiles /home/ubuntu/snippy/test-data/mutant_R1.fastq /home/ubuntu/snippy/test-data/mutant_R2.fastq
+Reference /home/ubuntu/snippy/test-data/wildtype.gbk
+ReferenceSize 200727
+Software snippy 3.2-dev
+Variant-DEL 5
+Variant-MNP 1
+Variant-SNP 9
+VariantTotal 15
diff -r 000000000000 -r c9a8ef2aa380 test-data/min_cov/snps.gff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/min_cov/snps.gff Fri Feb 16 13:40:16 2018 -0500
@@ -0,0 +1,13 @@
+##gff-version 3
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 24388 24388 . . 0 note=snp A=>G G:22 A:0 CDS + 1/702 1/233 initiator_codon_variant c.1A>G p.Met1? WILD_00022 walR Transcriptional regulatory protein WalR
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 29479 29479 . . 0 note=snp T=>G G:21 T:0 CDS + 39/792 13/263 synonymous_variant c.39T>G p.Gly13Gly WILD_00026 yycJ Putative metallo-hydrolase YycJ
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 47299 47299 . . 0 note=snp T=>A A:24 T:0 CDS + 54/1758 18/585 stop_gained c.54T>A p.Cys18* WILD_00043 mecR1 Methicillin resistance mecR1 protein
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 102969 102969 . . 0 note=snp G=>C C:16 G:0 CDS - 87/1281 29/426 synonymous_variant c.87C>G p.Gly29Gly WILD_00093 spa Immunoglobulin G-binding protein A
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 103048 103048 . . 0 note=snp T=>A A:20 T:0 CDS - 8/1281 3/426 missense_variant c.8A>T p.Lys3Met WILD_00093 spa Immunoglobulin G-binding protein A
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 106602 106602 . . 0 note=snp T=>G G:21 T:0 CDS - 993/993 331/330 stop_lost&splice_region_variant c.993A>C p.Ter331Tyrext*? WILD_00097 yfiY putative siderophore-binding lipoprotein YfiY
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 109833 109833 . . 0 note=snp T=>A A:16 T:0 CDS + 1/1755 1/584 initiator_codon_variant c.1T>A p.Leu1? WILD_00100 iucC_1 Aerobactin synthase
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 114540 114540 . . 0 note=del ATT=>AT AT:25 ATT:0 CDS + 1717/1737 573/578 frameshift_variant c.1717delT p.Cys573fs WILD_00102 iucA N(2)-citryl-N(6)-acetyl-N(6)-hydroxylysine synthase
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 129881 129881 . . 0 note=mnp GT=>AA AA:18 GT:0 CDS + 55/708 19/235 missense_variant c.55_56delGTinsAA p.Val19Asn WILD_00117 deoD Purine nucleoside phosphorylase DeoD-type
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+Wildtype snippy:3.2-dev variation 114540 114540 . . 0 note=del ATT=>AT AT:25 ATT:0 CDS + 1717/1737 573/578 frameshift_variant c.1717delT p.Cys573fs WILD_00102 iucA N(2)-citryl-N(6)-acetyl-N(6)-hydroxylysine synthase
+Wildtype snippy:3.2-dev variation 129881 129881 . . 0 note=mnp GT=>AA AA:18 GT:0 CDS + 55/708 19/235 missense_variant c.55_56delGTinsAA p.Val19Asn WILD_00117 deoD Purine nucleoside phosphorylase DeoD-type
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++
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++
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++
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++
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+#A?A?BBBDDDDDDDDGFEFAFHIHHIHIBGI@IIHIHGIHIBFHHHFIIHI8IIHGHIGHFGHIFIIIFHI5HFHIIHHHIHHI5I=HIGICHFIIFHHHFHHHHHHGFFHFHG@HFCHFFHF;4EHE;FGEH>3GGGBCH=FGFGDGG
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++
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++
+?????BB>DDDDBDDDGGGFGGIHFII>FCHIIIHHHHHIIHID.FIIIHIIHHDIHIIIIAIIIFEHIHGIIEIIHIHAGHIICIHHIFHIGAHFGHHCFIHDAH'GFHGHIFF=DHHHD@HFDEGF:EGEEEFEGFG@,DGHF.:GGG
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++
+????ABBBDDDDIGIIHHEIIIHHII+FGIFF,AIHDIIIIFIHHHHEFHDCHHHFGGGHFHHFHHHHGHGFCG,GFFGG,8GFGEGEGEGEG
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+?????BBBBBEDDDDDCGFGGGEIHFHHIHEHIHFHH=EIFDHIHFHIDIGCIHIFHFHHIHIHFFIIFIHH=IFHFIHGHHHD-DGHGIFCHFHHHHHHFI:GHFI:IFFGHHGHHHGCHHDC=GGFCDCF8DGGFGGE6EGGGEGGCE
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
+?????B9BE@DDDDDDFGFGEGHIIIHHIHIHCHDHIEIIFHHF>AIHIHHI9HI5HCHFHGHHHI5HIIGCHIFHIEIHHDHHIDHCFEGIHIH?HHHHFHHHHH?G6H)HHG@HGHHHHAGDGAFICIFIIIHIHFHHDHIGHHIIIICDHFDIGHIHBE>IIHIHIFIIIHFEIECHIEHHHIFHCDIEG6BEHIHH?GGHHHIHHIDHDHIHGEDHFDHGDHHHGEEGGGFF@E*GECEFGEHEFA.GEGF
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++
+A?A??BBBBF??FIHHEEHFHFIIIFFDDHEIFHADIIIIHIIIHH+HHHIAHIIFIBH-HHIII,IIHHIIIHHIDIHHIGHIIHIHH>IEFHFFHB5-HIIFHHDHFHEIHHIHFHCHHIH?FIFH.FHGEHHHDHEFEFEHHEFE;GGHFGHGFEFFFEGG1GFCEG
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++
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+@mutant-no_snps.gff-24544/1
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++
+?????@A>DEBDDDDDAGGFCGHEI/FHIHHHHIIFFFFAFHICIFIIIIHCHIFHIHIIIHDHHAHHGIHHFHHIHHIHHEHIDIHAEFI.HIHII=HFIEHAHF@FHHHD=G@DEFEFG;FEHHEHHGEGHHGGEGG;GGDG,E9EGE
+@mutant-no_snps.gff-24542/1
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++
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++
+???A??BBDDDDDEEDGFFGGGICIIIFIHHHFIHIIIIHHHHGHHIEIHCHEIIEHGHAIHHIHIIGHHHBAFHHIFIHHIFIHIIIFF?IIHIFFHHHDDHEGDHEGHH+F>HHHHHDHHBHF0@GGGFGGEHCFGEGEDGGEGGEEG
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++
+???B9?DDDDDBBDGGFCFFIHI1DEHHHIIHHIIHIIHHICIIHHIIH9FGHCGHFHIHGIBIHIEHIHIHHHHIEDIIEI=H5GHFIFIFEIIHIABHHIE=HH=HHHFHHFGHHH(GCHHEHG;GGBFE;GEFEFC+DFGGGEGG
+@mutant-no_snps.gff-24536/1
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++
+?????BBABDDDD@--CGFGFGHIHHHIIIHHGIHHHHIIIHGHIGHIDIIHHGHIHIIHHEIIEHEHIIFIHHHEIIIIHHFIIHIHGHCHH8HHHHGHHHFHIH.HGHH.HHHGFH=GDDFHDGGGEH8GEEFEGF=EFGE>EEGGHG
+@mutant-no_snps.gff-24534/1
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++
+??A??7?BDDEADD@DFF?FFGIIHIHFIIIIHIAIIGHGIHHHFHFHIFICIHIHHBHHIHBFED#-HHFEFHHH5IIIIIIIDHCHHHIHIIIDCIDHHGHHICBIH*HHHHGHDGFHDEFCEEEE=EGFGFCGFEGEEE;GGGGBCB
+@mutant-no_snps.gff-24532/1
+AATTAACGAGAGTGGAAATTGAAGCATATTTAAGTGAACTAAACATGATGGGGATAAAACCTAGTACAATAACTGGGAGGATCTGTATATTGGAAGGACTATTTAGTACCCTTCATAGGCTAGAATGGGATGATGTTCCTTCCAAATTAT
++
+?????BABD@B?DEDDFFFFGFH8HFIH>IHHHCIIIA?HFGHIGAHHGI0FFHFII0@IIHHFHFICFIHHFFHHFI-HH5HIHIHHIHGHIHIGIHHEH.HHEHFGHFHFFHDHGHFFEHHDFHGFFHGDHA=C2EGGGF???E;FGF
+@mutant-no_snps.gff-24530/1
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++
+???=?IHIFHFFIIGIHIFHIDHHGGHHHHHHHGIHFFFHIGHHEIFHIHDHHICIIHEG-IIH8H+FIEHHHH,HGFF=HGHD7HHIF9FEHEHHHHAHHHGFEG?GGEGEGEFG)EGEEHFDDE
+@mutant-no_snps.gff-24522/1
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++
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++
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++
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++
+,=?B=9DDDDBDDDGGGGGFIIEFCFHHIHHIHFEHFHIIHIGIIIIHIIIIHCIHGHIC?GIHHCIIHHHIHIIHHIIHHIDIICHEHFFHHEICFHHIGFHHHHEGG+HHHHHGHCHGFHCHCB;FHGED?@@IGEECEB7?.GGG
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++
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++
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++
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++
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++
+??A?ABBBDFHHFIHHHIIIHIIFHIFCFGA@5HIHHEHHHIIHIH;HEICIHI@CHFEIHF,HHHAH?GFGFEG?GGFEGGGGE
+@mutant-no_snps.gff-24376/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-24374/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-24372/1
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++
+?????BBBBDBDDDBAFGFCDGIII-CFHIHAIFHHIEF+HHII9I,GHHHII?HI@HDHGHHFH@HHFIHIGGIHFHHICIH5HIGFFIFIIFDHHH?HDEHEHHGHHHHGCHGHHHHHGEHGF0DEGEGGFG52FEFE(EGACFGG
+@mutant-no_snps.gff-24362/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-24360/1
+CTTTTTTACTTCTTCTAGTGTGTCTAATTTTCTTTGATAGGCGTAACCCTTATTATGGACAGCTTCAATGCCAATTTCACGACATTTCCACTTCTTTCGCTGTAACTTCTTCAATATTATCTACCTCAAAATTAAAGTAATCGTTTAAGC
++
+??????BBDDBDDDBB9FCGGGC?IIIHIIHHHIII,HHHIHCDFFHFHH8CGDEIIIHIHIEIIIHIGICIHFCHHHIIIIICI=CHIHHFGHIBHHHIEIIHBIIGFHFDGDEFEF*,HGECCDEGG8GGHGE7GDFGGG>EGEGBGG
+@mutant-no_snps.gff-24358/1
+TCATAGGTATTTATAGGAGGTAAGTATGGAACAATACAAAGAAGTACACATTAATTCATTAAACAAAGAAGAATTAGAAAAATTGGCAAAAATGGGTCAATTGATTGATGTTAGAACAAAAGAAGAATATGAATTAGGACACATTAACGG
++
+5?A??BABBD@BBDDDGGGGGFIIIHHHII@IFIDHIHHCCHGFIIHIIHHHIFHHHIIHHIBIIEGIHHIHIEIIIHHIIIHHFI=IIIFHIFEIHHHI=HH9HFHHHFEGFH9GG?FE,GGHHHGEEEEEGGEEGGFF?;IIIEHIIIIHFHFIGIHHIHGCIHDIIHFIHFHCGDI/IHHEIH?FFHIFI5GIHHHFIICF-IHGICGIHH+HF=HHHHHHHHGHF59AHDFHHGDHHGGEDGGFGFGEGFGEEECGEDGEE??E
+@mutant-no_snps.gff-24354/1
+GCTGTCTCGATGGCAGTATCTGTTCCAGCACCGCCCATTGCAATGCCAACAGTGGATGCAGCAAGTGCAGGAGCATCATTGACGCCATCGCCAATCATAGCTACATTACCATGCTCGGCTTTCATTTTTTTAATATAGTCCAACTTATCC
++
+?A?A??BADDBDDEDD.FGFGFE>HHIHIFI@FFIHHIIFHI9IIHHIIIHHGHHIIGHHHGHIHHFIGI=HIAHIIIIHIEDDHIIHIE=HHHFIDHHHGH,FHHDHHH=F?DGHHFCHGDFHHGHH8GEFFEGEIGGFGGGGHHIEIIIHFHFIHHI9HH-HHF80IIIIIEIHHHHFCHIGCIIHHIHIGHHIHHIHHIFDIIHHF-HHHGHHEH-HHHHHIFGHH?,EHEFHCHHFHGHFHFHHHHGEEEHEGEGFEGG@HGG@GGFG
+@mutant-no_snps.gff-24346/1
+TTAAAAGAAAAATCATTTTAACAAATCGTCTTCAACGTCCTCAAAACCCTTTAACAGAGTCTTTGACAGCACTAATTCATCACTTCCAATACACAAACTTAACATATATCAACCCGTTCAGAACAAAATAAAAACCGTACAATTTTATCA
++
+?,?????BDDBDD6DDFGGGGFBICIIF8HIHHICIBGGHEHIIHHHIHEIFHIIHIHIIFHGIHHHHHI5IHIHIHIII4HIHHIA?HIIHHCHIHIHBHHH?HEHHAHHBEHHGFHGHGFFHFHHHGF6FHGFF4FE@C)DEGGHCHIIHFHHEIHIAIHHFH/GHHIHICIGHFHIHFHDHCHH?IHCHIHIHHIIFIGFAFHHHIH=,IEHIHI5HFDIDHHHGHHHHHHHHEFF;HF=GGFG,EGFGGFGFAEGGGEFEADEEGGEEGF
+@mutant-no_snps.gff-24342/1
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++
+????ABB/DDBDDB-DEFGEGGFFI-HHHFHF,IIIHFICIDIIGIIHCHHIHIIHIGIEHHHHFFHHHHIHHHDIFIFHHI?IHIDHF.HIHIGHIHHHDEHHHHGHHHFHGFH,EHFGHHEFGGBGEG1FGG2FGEED:GCFGGFCGG
+@mutant-no_snps.gff-24340/1
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++
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++
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+@mutant-no_snps.gff-24310/1
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++
+AA??ABBBD9BDDDDDFGGFGFIHHII?HIIHIIIHIHIHHFIGIIIGHIHFFHIIFHIIGHHIGFHEIHHEIHHHGGIICFAHHIAIFIHHF@HHF:HIHFBFHHH?HHHHHHEFHEAH@HFEHHH?'F4GGAGGGGGEAFCGFEBEGE
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++
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++
+AEGGE
+@mutant-no_snps.gff-24302/1
+ACTCACGAACCTTTTCACAAATATCATATAACTCTTCTAATGGGATAATGTCTTCATGTGCAGCAATTTGCAATACTGGGTCTGCACTTGTATAAACAATTAAGTCACCAGTTTTCATTTGGTGCTCGCCCCACTCATCGATAATTTGCG
++
+???A?BBBDDDDDDD?FGFFFFII>HHHFIICHIIDIHIIIFFIIHIHFEIHHHFHIHIEHIFIIFIHHIHHIHHI-HGFHFI)ICHIHHI=FDIAGHHIHBHGHHFHFHHHHHHHHFFGHEG8EFAGAGGGGHHFGEDBG@GGGGDGGF
+@mutant-no_snps.gff-24300/1
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++
+?????BBBDDDDDBADFGGGGCHHIEIIHFAIHHGIDFIHIHIHHIHCHIIHIEDHFIHIIHIH?5FEFAHIHHHIGHHI?I.IHHIHHIFHHIHFII9AIIIIGIIHFFGF=HIHIICGHGIIFFEFIEFIICIEIHHEIIH+GFHFDHHHHEH:GHEFHGEHG=HGHGGGG@GHFDBFGGCGGGGEFGGFEGEG
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++
+????=?B?DDDB.DDDF;GGGGHHHHICHHHIGDIHGHHIHHIHEHIHHIF9IHHCIHFF5HFFHIHIHDIIHHEIDAFHIHHHIEIIHIFHHHIDEH=HHHGEGHHHHBCGGHDGHHFGHGDE0@FEGFGDDCFFGE5DEBGGGGFGGG
+@mutant-no_snps.gff-24290/1
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++
+AAA??B?BDDDDBBDBGFGGGGFIIFHFFF@DEIGIHHHFHH9HHHIHIHAHFG@IHHCHIDI5,=HHHHHIIHHGICIHHIIID,HHHHFHI+HI=FDHHHGFDHHDHFHGDHDEHHHFF@HE@F8CGDGEG0FIG=;GEG8FFDGEGG
+@mutant-no_snps.gff-24288/1
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++
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++
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+@mutant-no_snps.gff-24284/1
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++
+?????BBBDDDDDDBBGGCF>FIIHIHICIGFEIHIIIFHHHDHHGHB@IHC@HIHGD*HBFHFFB-=IFHHIIIGIHH5IID=HIHHIHI=HHFIHFHHHHIFDHHC+HDIHE8?@FHDDDDEEBDAGGGGGHHIIFHHH=IH@HIIIIDDHICHIHHIHHIGI5FIFIFII?GIH@HEIHFHFHI@IHIHIHHIHIHIHIHHIIDGIHHHCHEF.EFHHEFHH-GFH@BGHGHGF;HFGFCGBEICFE=EEE:CFGFEG
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++
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++
+=???GHHEIHIEFFCIHH-HIHHFIAHFIFIIHHIHIHIHIHHIHIIEFIHIHDFDEHGIIDHFHHHE4HHHAFGHDGHFFGEGGFHHEDGCEGEGEE2EGG9(BGG
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++
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++
+?????BBBDDDDEDDBGFFFGGIIIIHHHHIIHHIIFHFHHI7HAIHIGIDDHCIHIFIFIIIEEHIHE5IHIIIIIHH@FIEHII*HDIIIHH?IGIEHIBIH+HHHDDHFH-IHHIG*HFHG5HFEGGGGGGEGGGFGHEAGEAGEA:
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++
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++
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++
+?5???BBBDDDBDDDD.CFFCGHHHHF+IEIIEHCHIIHHFHHHH=FHEHIGFEHHHIHHIFFBHFHHEIIGHFIIGIGHHIIIEGFHCIF7*HCHHHIHHHAIHHH?H=GF:E+EGEHG;BG;GGGDDF*GH>FGGEGGEEGEFGF*EE
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++
+?????BBBBDDDDDDDFEGGGGIHHIHEHECHIHIAHHIHFII,HHHIIHIH?HIHFFHHHHBFBIGHGGIHIIHHHIGHH=IHHHIIIHGGIHHIFIHHDH,CGHH,GHGHHCFGHCDGGGHFHFFEEGGFEGFGE8GGG=FGCGCGGE
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++
+?A?F=FHEGFFBE*ECHGFGG=E@G2G
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++
+A?,?ABBBBDDEDD9DFGGGGF9HIHHHIIHIHHHHIIFCHIA@HCIDIHIHIIIHFH-CDHIIEGF@FHDIEFIIFIIDEIHIHHHIIHIIBIHFFHFHEHFFHF?HIHHBHGAFHGEH?DGD>CFEHGG@>;FGEFFDEEE*GEEGGF
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++
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++
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++
+A????B?BBICHH-HHIFIIHGHGI+=HHIGH@HHIGHHGHHHHHFHFGGFAHHFGHFCFEFHEHFEEBGGGFFFEG;GEGGEFGG
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++
+???=?BBBD?DDEDDEFGFFFFH8IIHCHE=IHIICGHHIHEDH>HHHHII+HF5F>HFHHGGIDF+HIHBHIFIIIHEHHIHHDHIEIDHHHIGHDGIIIIEHCCFHHGFHFHGFCFGHGDFH9GFD=E9HEEFEEGDGBFGEDEGEGE
+@mutant-no_snps.gff-24238/1
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++
+??A=?BBBDDDDDBBBGGGGAGF;CHHAIIHIGGIIIHDGIHAIIFIHDHHEFHFGIHHIHHHII?HIHI>FHCICFIHHHIHIHHIFGGIIIHHIHGHH7HIGHHG2HHFEHHH?GHFHEFHEGFB;GGGGFGBEGFEEFGGDFGE?FG
+@mutant-no_snps.gff-24236/1
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++
+?A??ABBBDDDICHGFHGHHCGEIIHBI@FHDIHIIGIIFHIHIHHHHHFHHHHIIIIIHIIICIIFHIFIFIHFHIHIEIDHCHHIFHIHFHHGHHHIDHIGH8HIIIHIHHHHH=HHHFFHHHHIBFHEHGGGGHFFH;EGHHFDHHGEE9IGGGGGCG?B@GGGF
+@mutant-no_snps.gff-24216/1
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++
+??,??/>GEG
+@mutant-no_snps.gff-24214/1
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++
+?????BB>?A?DBDDBEFFCFCIIHHCIH/HIGHIIIIIIIIHEIFGIHH.IIIIIFIIIIFH5HHIHHIFFHIHGIHFHEFHIIAIBIHIHHHHF-HHGCHHHHIIHHDIHFFGEFFEEHDHGGGHGHFH=EGGGFGE?GEGEGEF,GG
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++
+???AHHHHDHHHFHHHHHGHHHHEGFGH)HGEFHEDG=GGI@GDGE?EEGEGE8C
+@mutant-no_snps.gff-24210/1
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++
+?5?AAB?BD?DD@BBDCGGGCCHIIAIHHIFHIIHIIHIFHGHIHH=HHIFH?HHIHFHF@HHIHIHHHHHIIEHCIHHGHIIHHHH*HIFHHHHIHDHIH*IFDHGHBHEHHCD9GH:EGEHHHGHGGEGEDFGE4IDAGEGFFGG?FG
+@mutant-no_snps.gff-24208/1
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++
+?????BBBDDDDBDEDGA?CFGIIEIHIHHFIIHFIFDIIHHHHIHHHHHIIFHIHIFFHIHHHIHFDIBIFIEIHHFFIIII*GHHFIHHHIDIIHF?HFHHIIGHHHHGFHEF'HHEHFHEF;EEGFEDGCGGBDEGG@7CGEGGCE;
+@mutant-no_snps.gff-24206/1
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++
+?????B?BDDDE5BDDFGFFFFFBFFCIII>IEFHIEHHIDEHEGIIHICIHHEHIHHHDHHCHHHHIIIHIIACE:IHIIHHHHIDIFHDHIFFHHHFHHHHFHHGHGAHFHDHFHHFCFFHEGHHDGBG7GBEGGGF>GEEFEEGEA;
+@mutant-no_snps.gff-24204/1
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++
+???A?BBBDBDD@DBDGFFCGFIIIIHFIHIHIGFEHCIFHHDHFFDAIHFHIEHIIIFHEIIIFE-IFIIHH5IHGIHIHIHHIIHIHHHHHFHIHHHHHHFIHDHHCEHHHFDHCHHHE+FHEAGGGEFEGGEEGG:G;GF3;GGCEG
+@mutant-no_snps.gff-24202/1
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++
+?????BBADB?BDDDBDDDDFGGGFFCIHECHIII@7HIGH-IGIHHHHH.IAIHHIICHIFIHBIICHHGDHHHHII?FF@FGIIIHHI7FI.I=IHDHDHHHHIEGHEH@FHFIH>H8HHEHGCHGG*CHFGGDGGGFGEGC?GCG,GGGF(
+@mutant-no_snps.gff-24194/1
+AAACTTTATATAAGTCATACACAATGATTATAAATACATGAGCCTTCTATCTTTATTGGTAGGAGGCTTTTGTTATGTTTGCTTCTGTATCGATTCGATTATTTAGATAAAAAATACTAACGTAAAGGTGGTCTTTGCTAGTCATAATTT
++
+?I0AHC@DIIDHHIIEGHHHDI?IFEFHHIIHIIHFIHGIHHHIHADHHHFHHFFHHHFIG=HCI@GHHHHF=IEG-FIGHDHFGDHHHEHHEC*?DEHHHF@HFEEFGEGFEGGGGGGFGEE
+@mutant-no_snps.gff-24192/1
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++
+???BBBDIHHGHHHCHE=BHHFDHFGH@DFHEHIG?8GHFHDDFGEHHEIG;EGGFEGGEBEGG
+@mutant-no_snps.gff-24190/1
+TACCGATGACAATTTAACAATGATACTTCATGAATTTCTGCCTTTTATTGAGATAAAACAAGTTCCATCTTCTTCCGCAAACTATGATTTAGAAGCTTTTTTTAAGCAAGAATTAAGTACTTACCATTTTAATGATTCACCTTTATTCAA
++
+?5=?ABBBD5DDDBDDGEGGG8HIFHHHHF+IGCEGIIEIIIDHAIIIIIHIIFH?HEHCHHCHHFIHEIG=IHHIDHIIDHHIHFIFHHGIEHHIHFHHEHHI-DHCHHCHCHGH4GHF?EDEGGBDGFHHCGHCGGEEFEGGCFED*D
+@mutant-no_snps.gff-24188/1
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++
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++
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++
+???>=?DBDDDDDDGGFGFEIIH>8HHIFHIHGEHHGHHIIIHDIHHBFEFFIHF'EHIHCHIHIFIIHFIHAGHII5IIEDGGFGFIFIHIHIHHIGIIACGG=HH,IIDEIIIIH@IIIDH=I8HIFAHGEIHFH5FAIGFHICGHECHIFIIEIGIFGHHHDDHHDHHHCHE@HGHIGDHH=GH*HHEEDGGEGFG)EEGFA*FHFEG@EG
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++
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++
+?AA?A>@BDDDD?DDDEFCCGCHFIEHFEHIIHIAGIGIFIDIIIFBDHFFFGIHIIIFIHDIIIIBICI@IIIHICHIHIEIBIG7HGFHHHGHGDHEEGFIEDHIECHHH?HHH+IGFE'*GEGHF?;GFEGGE@FGDFF?FD=FD;G
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++
+????ABB?DE>EC*EGGGG
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++
+?A??ABBBDEBBE?DDGGFCG/IIIHFFIHHFGEIDHIIFIFHIFIGIHHIEHHIHCFIIHGFIH?IIII5H@HGGHHDCCIFHHEFIGIHIFIHHIHHHHHFHIHHGCHHEHHHGH?EE6HBEHH*GFFF.8GG5EFFEE*GEGFGGFC
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++
+???BB?DDDBDDDD8FFG/FHHFICEIII/I0IHHIHIHIEICIECAHIBIDHI>ICIH@IHAHIHAHHHEHHFHHHHDEHIFFIGII?HIII7FHHF))HDHFGAHHHHHEHBGGFFGFHGEGGFE:GE:GFGGGGGFEFEFEF*GG
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++
+?A????.BDDDDBDDDGFFFGGHHHFH7CIHIIIIFCIE@GHIHCHFIIHFHHHIIIHIIHHHHHHHHHHHHEFBFHFIHI?IHHHGHIFGHHIHBHFHIIBHBFHFHHEEHEHHHGDFFFGHBGGD=HGHGGEHBID,GEDEGCDFGEG
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++
+???BBGGGFFIHIIIF+HHHICIH@IIHFIEHIIHIHHHIHEHHIGIII-HICHGEHCHHIHIHHHE-HHIFHHHHHHGHHHEHEHHHH/DGH,HDFHD0G?ECGHGEEHGGGH)HEGFGGFECF=EG3EGFFDGH=
+@mutant-no_snps.gff-24048/1
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++
+??A??B=BDDDEDEDBGGGFGFHIHHIEIHDFIIHHHHIIGHIIHAIGHIHF=IIHDIHIHIEFHHH@FHIH=HEHHDIFIHHIEHHFHIFIHHIF=HFFECHFHHHEHGGHHHHHE+EGHFFGHEHHHC@CEGEGF@:EGE@EEGEFGF
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++
+??=BB?DDDDDDBDGFFGFGAIIHICHCIHHHIHIIIHHFIIIFHHHHFIDGHIHHIIHIHICHFIFIHHCHHIIIEFHH@HHHHGIHGHDHGEBHEFHHIHFHGBFHFHHFCH,GH*HEFHHGDIEEEG@DFFGGFGEGFEEGGECG
+@mutant-no_snps.gff-24044/1
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++
+9?<@?BDDDD@BBDGGGFGFHIFIHHIIDIAFIIHIHFHBIHF9GIIDHIHIHHIIIHI-DIEIHHIAIGDHIGHCEHFHFHFIEII=GH?HHFGFHDGHHHDFHHFHFHFH@GFEGEEHHEEGGGGEGBGAGGEEGGCHCFGE0*FF
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++
+A????BBADDIIHHIHHIIAHHEHHIFHHIHHHIHHHFHHFHHHDHFHHDHIHHHEHHGDH*HDHFHGGGEHF9GFG?CEDGEGG0BEGG
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
+?????BBBDDDBDDDEGG8GFFHIHIHFFHHHDIIHHIHHHFICIH=H=@HHFIHIIH8I5HFDFEIIIFFHHIHGHHIHHHIIHGIDII5IFF:HHHFHIHIFFHHH?GDHHBHEFFFECFEFGEH9H:FHFEDGGGFGDGF3GCEBFF
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++
+??AAAB=BDDDDBDDCHHEIIFEHI>IIIEEHHIIGIEHIHHIIIIIHG6HFFHHIHGHHHHHCHHGFHHEEFH9DHHG@H;FCG:0EFGGGEG*GEEEBEFEGE
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+@mutant-no_snps.gff-23882/1
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++
+??AA?B??DDD@DDDDGEGGGFIIHHIIFIIHHIFFHHHIIEI,HHHEID=HHIGIFFHH=HIHFIHHFIHIDHIIIHIHHI,FHGEIHHDHDIIGHHI)HGIHHHGHGEE=@EEHGFFHAGGEFGGDCFDGGBFF*G>E=EFCFGGG?E
+@mutant-no_snps.gff-23880/1
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++
+?????ABBDD@DDDDDFFFFAGIFHIEAHHHIHHCIIIAHHEFIIHHFCEHEDHHIFHIIIBHHHIDHHFIIHFIEIHGIHIIHHGHHICHHE>IHHAFFFFFHG@HEHI;CH4HDFDHBEDHFEGDHGFEHGFF*GDC@CDD*E4DGDG
+@mutant-no_snps.gff-23878/1
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++
+?????@BBDBDBDDDDGCFGCFHHIHIIHHIFGFHIHIIIFHIHIIEIIHH8IIGHHIHIHF@HHHHIHEHHHHDHHFHGHIGHHH+IHHIIHIHIG?HHEEFHHGFIHHFEFGHHBGHG3HGGGDG8EEGFF(DAEE@G3EBEGGEGEE
+@mutant-no_snps.gff-23876/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23848/1
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+@mutant-no_snps.gff-23846/1
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+@mutant-no_snps.gff-23836/1
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+@mutant-no_snps.gff-23822/1
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++
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++
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23762/1
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++
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++
+?AAB9GFHHEG?DEGHAHEFFD*BEEGE=ED>GF
+@mutant-no_snps.gff-23758/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23756/1
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++
+?????BBBDBDBDDBBGGGFGGIICFIEIIFCHIIFHHIFIHHGAHHIHII=IIHIIH-IGFIICIIHGHIIFDFFHHIDHIEFHIDHEDHHGFEH7DIFHHFIHGDHH4HGHHHGHHHHHFEEGFGGGGHEECDEFEGFEEGEDFGGEG
+@mutant-no_snps.gff-23754/1
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++
+A??5AB?BDDDDHIHF?IEHHEGIGEHCIIEHIHIIFGHIF>IHHFHIIIIGCIHDCIIIIHIIFIIHHFHIF9HHFIHIHEFI-IICHH?HCIHGIFIHHDHHDIFHHHGEIHIIFHIHEIFFIHHHHFDFFGHGEEHHHDHGGHG0FGGGGCHFGFEGGFGEGG
+@mutant-no_snps.gff-23748/1
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++
+????ABBBDDDDD@DDGGF8FGHHIHHHBHIHBFIAHHHECIHHCECIIHIGIFHIHEEHHI@H-IHHGDIHDGIFH=IGHHHHIDEHGGIIDIHHIHHIHIHHIII0HIIHH)>GDIIHIIEIHHFH?IGHHIIDHHEI-DHHDHIFHHIEHIIAHFHHIIIFHHHFIHEIHHHHGG*HIH*FHHFEDCG>BGEHEGCEEEE,CGGGEGFEG
+@mutant-no_snps.gff-23742/1
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++
+??AA?AB8DD@5BDBDFFFGFFIHHFCHIIFFHF?IHIIIHIIHFIIIFFGHHIADFEHCAIFH+FHHEFCHDIFHHF+IHGH7FHEHHIHHHHFHIH3DHCHIHIFGEFEHHGHHHHDGGGFFGIIIEIIEFHGHIHHDFFIHHIFHHIHEIIHGIF@II7-9HGHFIAHIFFHHDHIHGHIIDAFIFGHCHHDIIHAHHHHIHFHHHGFDHHDH*FHEHFF6CFHB?HHGEGGHGDGGGGGEG,DGEGBAE
+@mutant-no_snps.gff-23738/1
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++
+????A<4?@DDDBDDDFGGGGGHIFFIII8IIFIFFIFHCHHIIFHHHIHFIIHHEIFCHFIFHIHHIIIIFHHIIIHFIIHHHIEIHHI-HHFAHHHHGHFHCHHHH-?HHGFGFGEHH?HGHEGFHEGEH0HHGFGGFGFEEGGGEGG
+@mutant-no_snps.gff-23736/1
+CAAATGAGCGGTATTTTATTATGGATATACATTATTGTTATCATATGTTTATTATTTACAGGTCAACCGAGTGTGTTCCAGAGCATTCTTTTAAATTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTGATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCAT
++
+???A?BBBDDDDDD6DFGGFGGIIHIHHHIIGHH@HIHFHFIDIIEHFIIHHHF-EIHIHFHIHAIIIHFEHCGHIHIIDIHHGIHHIIFFAI*HIHHHDHHHHC.HHHHHGE.H+GCHEF,F@-HHHGGHEFGDGGG@EFGGGGFGCGF
+@mutant-no_snps.gff-23734/1
+TCAGGATATTTTTGATGATTATTCAGATATTCATAATCCAAATGGGACACACTGTTATGGTTACACATTTAATATAGATAAACACGGTCAAGTGATAGTTGATTCTATACATATTCCGATGATTATGAGTGCATTGAAATAAATTGAAAA
++
+???>?9D@DBDDDECGGF>GFIIIIHHHIIH-HIDHIHIIH@HHIIHIIHHDEHIDIFHIIIIHHIIFFHFIIIEIHHHHIEHDHGFHHHDHHIIFHIHHHHHEHHH,FGGEH=FBFGGHEGFHFEC8DGGGDEGG?GGEDDGGEGGG
+@mutant-no_snps.gff-23732/1
+GAGTAATGTTAGATATCGACCATGGTACATATCCATTCGTTACATCAAGTAATCCAATTGCAGGTAACGTTACTGTTGGTACAGGTGTAGGTCCTACATTCGTTTCAAAGGTAATTGGTGTATGTAAAGCTTATACATCACGTGTTGGTG
++
+,,??ABB?DDDEEDD?GCGGEGECFFIICHHCIIIHIDIHIHGIIIIIIIIAIIEIEIIFHDGBA,HIDFFIIHIIHHIFHHGCFHBHFIHH,IHAIGIIHFIGHH@?DHFGCHHFHHHEGFHGEGG@HG=FGHGGFGGGGGCGFGAFFG
+@mutant-no_snps.gff-23730/1
+GTATGATTGATGCTGAATCATTCAGAACACAGACTCATTTGATGAATCAAAAGCACAAAACCATATCCTCCATAAGTGATAATCAGTTACAAACATCACTACAAAAGGTTATACAGAAAAGTTTCACGTTAAACATGCTGCATCCCTATA
++
+???=?BBFGECGCFGGEE
+@mutant-no_snps.gff-23724/1
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++
+?A???BB/DDDEDEDBGFFEFGIHHIIHHCGGIIIIHHIIIHIHHFHGH,H=IHHFDHHHHIIHHHCIIIIIFHFHIIIHIHHHHIHIFGGHDDCHHEHHIFHDHHHHFHH+HEGH@DFFGHHGH8EGDGDC'GEGEIEGGBGFEBCFEG
+@mutant-no_snps.gff-23722/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23602/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23600/1
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++
+?????BBBDDDDDADDFFFFCFFAI-FHH@I/IHFEIIIHHEIIFHCHIHICI=DH=HIHHHHIIIDIIIECCIIGHIIHGIH+IIHIBFHHICHIIHHHHIHHHHHGGHHHGHHEFD+FFFHFGEEFG9=EHGHGEGCGF>E8GCEGEE
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23596/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23594/1
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++
+??=??BB?@DDD.@DDGFGGGFIIHHE.EIFIFGHHFFHHDHHDHE#HHIFFGIIIH+IIIIH,F=HHFAIHHGHIHHG-HHFHHEH4EEHIDGIGGHHHHHIHHFHDHID@GFHHGDHHFGGFHGHEHGHEHGDG;GGGGGGEEGEGGE
+@mutant-no_snps.gff-23592/1
+ATGCAGTCACCATCGCTTTCTGTTACTTTATAATTTCACCTTGATTAATACGATACAATTTAGCGTTATTCATGATTTCATGATCAATACCATCTACAGATGTCGTAGTGACAAATGTTTGTACTTTATGCTGAATCGTACTTAATAAAT
++
+??9??B?BBDDDDEDDGF>GGGHFIHIIIIHEIHHHEHFH5IIHIHDHIDCHIHIIIHHHHAIGH5IIH,5HIIIHFIIIDIHIGFIIIFH@GGHIGEHHEHGHHFEHFIHFHDF@F:=@EGDGHGGEGDBGGFGEGGGGGFEGGGGIIICIGHHHFFIFCIIHI*EHHHFE.IIF5IDIHFHHHFFHG7IGHHEHHFFEHGFHGECGDEGGFEG?FHG9*GGGGGG
+@mutant-no_snps.gff-23588/1
+ATCAATCAAATACGTTTGATATAAAGCTTGCTCAAATGGATGCTTAATTGGTAAATAACTATCGATATGGATGTCAGAGTTATTCTCTAGCCGAAAATAGTTTGAGTCTAATGCTACATGCGATGCATCTTGATTGTCTTTATCATCATT
++
+????AB?=@BDDDDEDFGGG.GIHFIIIIIHEFIFIFHBHHHFGIFDHI?BIIIGAH9IGIFHIAHIGIIHHHIIHIIIIIIIIH4II?HFHIHHIFHDFHHHHHHDGFHFFHI.@*H.;FEHDHF+DHBFEGBBEGEGH?GDGGEGG?G
+@mutant-no_snps.gff-23586/1
+CCCTCAACGCCTGCTTGAGATGTTGCATTGATAATTTTACCGCCATGATTGAATTTTTTAAATTGTTCATGTGCGGCTTGAATACCCCATAGCACACCTGCAACGTTCACGCCATATACTGTTTTAAACTGTTCTTCAGTAATTGTATCG
++
+A??=?BBBDDHFHEGGFGGG*GFFFGGFGF,GGGGC
+@mutant-no_snps.gff-23582/1
+GGGTGGATTTATATCTGGATTAATAGGTATTGGGGGCGCAATTATTATTTACCCAGCTATTCTTATATTGCCACCATTAATAGGTATACCTGCGTATAGTGCATATATTGCTTCGGGACTTACCTCTAGTCAAGTATTTTTCAGTACACT
++
+????A?BBDDDDDDDDGFEGFFHFIHHHHHIIGHHDIIIHHHGIIHIHIIFFGHHIDIHHFEHHHIHHIHI??5IIHICFEEHHIHHIH@HHHIHHGIHHCHHHHHH=HHFHIIIHDFHHF8FIIIHGH7IHHHHFIIFFHHHCEHHFHCHID@HCHDFGDFEHGG?GFEHHGG;GCGDGGAG-DGB
+@mutant-no_snps.gff-23578/1
+TACTATCAAAAACAACTTATTGCGATTGGTTATATTGATGAAACAAACGATATGGACTTCTTATATCTTCATAACACAGTTATGCCACTACTAGATCAAAGACACTTACTTGAAAAGGAGAATTATAATAATGAATAAATGGATACACAT
++
+=????BBBDBDDEDDDCGFFGGIIHHHIBIHFHFHIIIHI0EIIIIHIHHFHEIHHGIFHHIHIIIIHHDGIFFH#I)IHH?IIIGFGEHHIFFHFAHIHHDGHG4HG4HHHHHFHEGHF@GDFHHGHEFGHGHGIIFE*=DGGB*EEGE
+@mutant-no_snps.gff-23576/1
+TCGAATCCACAAGCATTAGGATTAGATTTTGCTATCACGGCTATGTTTATCTTTTTAGCCATTGCACAATTTGAATCAATTACTAAATCGCGTTTAAGAATTTACATAGTACTCATTATTGCCGTCATAGTAATGATGTTATCGCTAAGT
++
+=A???B?BDDD5DED5FGFDFFAEIEHHHHHIHDIIHIFIHIIGIHGE@HGHIGHHHII.HGIIHHIIHIHIIGEIIHIIIEFIHHHIHFIIHHIIDHHHHGHGHHCHDIFCCHIGEFFHHFHEHGE+D,GGEC?0GDFHCG=EE?GGFE
+@mutant-no_snps.gff-23574/1
+TTAATGTGTCATTTAATTGTGTAATAAAATAATCTCTTTTAATAGTGAATTCCATCATTAATTAAAACTCCTTCCAGTCGTTTATATATAATTATATAGGTTTTAAGTTCTTAGTAATAGTAGTAGGTGCTGTGGATTGGTGGATAAGTC
++
+A?AA?BBBDDDDD?DDGG8GFGHIHHIIIIGI=FIHIGHHIICIIHHIGHHHHIF/HIHFIIAICIH?@BHIIHHIFIHHHI5IIFIHFHHBHHIHHHHHHFGHHHD=HHHFGGFFHFHHHFHG@HEGFHA2DFF=EGACCGFGBG@GDG
+@mutant-no_snps.gff-23572/1
+CATGCCTAGCATTTGCTCCGTGCCTTTATGCATACGCGCACTCATGACACTACCGACAACAACATCATCTTTTCGAGCATATCTGCTTAACAACGTCATGACCACACTCATAAAGAACATAAAATCAGTAATTTGATGCTTTTCTACATA
++
+?A=A?B?BDDDD?EDDFBFBGF@HHFHCHCIICIIIEIFHHIFHIHHFHHGGIHIHHAHIEFIFIH=AHFH5,IHIFI=IHHDHHIIEIHC@IIFHHGHIHFIHIHFEGF7HHDFF+FGHHGHGFEFHGBG=EGGEEGFGDGGGG*EGEG
+@mutant-no_snps.gff-23570/1
+TAGGGTTTACAATAGGTGAAGATATTTATTTAGTGCATTGTCCAGAACGTGTACTGCCAGGAAAAATTTTAGAAGAATTAGTTCATAACAATCGCATCATTGGCGGTGTGACTAAAGCTTGTATTGAAGCGGGGAAACGTGTCTATCGCA
++
+???A?BB>@E8GGFFH8GGB*
+@mutant-no_snps.gff-23554/1
+ATCCTTGTCCCATTAACGCATTTTAAGCGCGACTTTCATAACAACCAAACTATTTAATGAGAATTATTCTCAAGTATTATAGTTATATTATGTGTTTTATTTTTGAAAAGTGCAATATGTTTTCGAAAATAAGATTATTTTTATGTGCAA
++
+A?5?A>BBDDDD?DDDFGGDGEHHFFI>HFCHHDHHFHIHIHE;@HGHIFHIHIFHEIHHCHIHIGIIHIHHFHHGIIIICGHHFI'HIHIIFHG=IFIH@H7FIHHHHFHHHF*HC*EHG3GHGHHFEHHEEHGEGDAHIIIIICFGFIIFIDFHHHEHIHG@HIGEIGHHDHF)HHFHGCHFEDHHHHEGGGGEFHEEEG)FEEFGGGGEGGG@G
+@mutant-no_snps.gff-23550/1
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
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++
+???=AB?BBDDDD??DFC8GFGHHIIIHIHFIIHIIHICIIHHHHHHAHHHIFIF-IIHHHHFGII5HIDFHII-GEHHIHIIIIIIHIEGHHHHHHHIGIDIHH,HIFCH*=GHHFHHFHHHGGG:AEHFDBFGIFFGGFGGG@GGFEE
+@mutant-no_snps.gff-23446/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23444/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23442/1
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++
+?????BBBDDDDEDDDGCFDGGHI>IH>HIEFFIHHIEGGIHIIIHHIIH9HHHHHHIHIHH8IHHFEIHHH?GFIIHIHFIAHHHCIHHHIEHHHEIHIFDFFGHFFCEIFC;IGG?EHGHHHGFFGE=GGDGHGEEHFFGGGHGAFGE
+@mutant-no_snps.gff-23440/1
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++
+????AABADDDBDDDDG>F6GGEHII>IHIIHHC7HHHIIIHDFIIIHICHHIHIHHIHIICGHFGIHIHHHIHIHHH=FIHIH.IDHHHGHHH+HIIFHHHGHGD=HHBHGHHHGG@HDGEHDHGHGGEFA+GFEGF;GGG@DG?GCCG
+@mutant-no_snps.gff-23438/1
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++
+???A?BBBDDDDDDBDFGG,FF+FHHIIHEIIIFIHIHIDIFIAIIH@IG@FI@HEHAIIFIIEIHHHIBIIFHI5HEBEHDHFEIHHIGHI?HDIBHH?HGHHHHHCHHFD;HFEFHH@=G=B'D@?GGBE8HCGF,GEGCEHGGD?G8
+@mutant-no_snps.gff-23436/1
+TAATCCAATCGTTTCGTACATGTCTTGTTTCTGTAAAATTTCATTAAATGATTCATCGCTGACGAGTTCAATTTCTTTGCACTTAACACATTCTAATAAAGATTTCACCGGCATTTTATTAGGTGATAACACATGGCAAATGATTTGTGG
++
+??????BBBDDDDDDD;GEGGDHFIIIHHEH8IFIHHIHH?IHHIIDIHGH=HBFFIIIF,EFIGIFHHH@HHHDHFFDIHHIIII@HIIHIIIHFHHHEGHHHFHDH?FEHHHFHHGBHEHGCGBFEHCFC'C.E'CG:EHFEGH;GEC
+@mutant-no_snps.gff-23434/1
+AGAACTTAAAAGTAAATCATTAGAAATCTTAAAATCCATATTCAGCGGATTATTCCATCCTGATATCAGCTATATCTATATACCAGATGGCGAAGACTTATTACGTGGTTTACTTGAAACCTTTGCGATAGCCGTTGTAGGTACTTTCAT
++
+?????BBBDDDDDDDBEGFFEGHFFIHHHFIIHIHIHFIIIHHEIEGDIIHDHIGIIIEFIIIFIHIFHHIFCHH>HHEHHHHIHIIAHIGHIFHHHH:DBIGEFHEHFFEHHHHFGGF>GGFFH5DFGDGGDHGFG,EHEFGEEEGGGG
+@mutant-no_snps.gff-23432/1
+CATTGCAGACGTTAACACTGCATTAGTAGCTCAATTTAACCAGCAGCAATGTTCTGCAATAGGCTTATGTGGTTTGGATGCTCAATTATTTGAAATTAAACGTTTTGATCAACAATATGGATATGTCGGGGTTCCAACCACTTTAAATAT
++
+?A??AB??BDDDDDDDFGEGGGHI+IAAHI>IIHIIIIIDHGIICGIHFIDFHIBHHDHI?HHI>FIIFI/IIII=IHHFHHHIHHFIHIHHGIHGFFFHIFEH+HHIFHEHDHGG?HEGFHEHGHBH1FFHGGGGFGGGDGFEFGGFGC
+@mutant-no_snps.gff-23430/1
+GTTAATTATGGATGCAATTACCGAAGATGTGGAACATTATATTTACAAGATTAGCTATTGGATGACGAACTTATCGGTAGCTATTGGAGCATTGTTAGGTGGCTTGATGTATGGCTACAGTATGTTACTGCTTTTCTTAATAGCAGCTTG
++
+?????BEIIEHD9DDDB?@GCGFGGCIGHIHHIHI>HHIHII?IHIHIIHHIFAIEEHHHHI,FHIFHFIDAIEIEIGIHIHFIHIAHHH?IH?BHIGHEFHFIHE=GHHHEEE8CFIH8II+IHHIIFHIHIHHIHIIGIHIIHIIIIFIHIIHHFGHHHFIHIHHDHEHIHGH5FHIIHHHHHDIHHGIDHIHHH?HHEHHHDFHGHGFGDH*G@HEGEEGHBEEFEGEFGHEGE*ECGGGGG
+@mutant-no_snps.gff-23410/1
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++
+?????B,EG9DGGFGAFEE
+@mutant-no_snps.gff-23408/1
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++
+=??A?B9BDDDD@DDEGCGGFF>IFHHIH>HHHFHIIHHGGIIHHHHDHEHIHIHIGIIHIEIHGFFGHIHIHHE?5HEHHIHFHI/IIHGHIF4EHFHAIIHHH6HHHHCCHHF3GFHF?@HHF*AHEGHEFGGIGEFEBFFGCGGGCF
+@mutant-no_snps.gff-23406/1
+TTGATCCATCAATGTTACAACATCAATTTCTTTATTATCTTCATTTAAGTGCATCATTGCACGGAAAATATGTTGATGGGCACCCCTATAAAATGACTCAGGAAGCAACACTTCCTGAGTAGTATTAATCAATTCTGGATCTATAATAAT
++
+,?=9??BBB.ADHFHFIIHIH4IIEHHHI-IHFA?FIIEIHEIIGFDFEH@HHHHHEEFHECGGDGG;GHHEBGEFBEGEHGCFGGE*=G(E
+@mutant-no_snps.gff-23404/1
+AAGAAAAAAGAGGATTAAGAGAAGCGGATTATCAAGTGTATCAAGCTGAATTAAATCAATCATTTCCTTTAATGGTTGCAGCAGTTAAAAAGACACAAATGATTCATGGCGATACTGCAAATATTGATGAATTAGAATCATTGACAGCAC
++
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+@mutant-no_snps.gff-23384/1
+AACGAGATTGTATAAAAAGGGATTTATAGATCGTAAAAAAGACAATAAAATTTTTCAATATTACTCTCTTGTAGAAGAAAGTGATATAAAATATAAAACATCTAAAAACTTTATCAATAAAGTATACAAAGGCGGTTTCAATTCACTTGT
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+@mutant-no_snps.gff-23382/1
+TATAAGCTAATTTATTTAATTCGCCTCTAAATGTTTCTTGTTTTAATGGCGATCCATCTTTTCTTGGAAAGAGGTATTCACTATCTGGAAATTCCTCTGAAACTTTATCTTCCCGAACTTTAATAAGTAAAACTACCTCTTTAGAAATTG
++
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+@mutant-no_snps.gff-23380/1
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+@mutant-no_snps.gff-23372/1
+AAGGGTTTTCAATACTTTAAAACACATACATACCAACACTTCAACGCACCTTTCAGCAACTAAAATAAAAATGACGTTATTTCTATATGTATCAAGATAAGAAAGAACAAGTTCAAAAACATCAAAAAAAGACACCTTTTCAGGTGCTTT
++
+???=??BFEEEBDFG?GECGEEG9EDFGAGCGC6CFAE
+@mutant-no_snps.gff-23366/1
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+@mutant-no_snps.gff-23364/1
+TTTTTGATCATGTGCTAATGTGTATGCCGTTGGTGGTAAGAAACCAACATCAACTTTTTTAGACTTCATAGCTTCAACAATTGTATTGTAGTTAGTTGATACAGACACTTTAACTGGAATCCCTAATTCTTTAGATAGTAATTTTTCTAA
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+@mutant-no_snps.gff-23362/1
+TGTAATAGCTATCACTCCCAAATTTTATATATATTAGTAATCTGAATCTGCTTCTAAACCTTGCATAATTTGAACGCCTGCGCTCGCACCAATACGTGTCGCACCCGCTTCAACCATTTTATTGAAATCTTCTAAATTACGTACGCCACC
++
+?=?5ABBBDDDDBD9DGBFGFFHIFFFEFIEIAIIIHHIC9GHFEHHIHIHI.FIFHFGHEHHFFEEHIIIIAFIFIHFHFF9HHGHHG>EGHGGFFEGGECEGDCGG
+@mutant-no_snps.gff-23354/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23352/1
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++
+?=???BB?DDDDDBD?EGFGCGIHIHCIHFHIHIIIGHIHIICFIHGIIHH?FFHIIHHEIFDGEICHF>III5CHHHHGI5HEFIAIHHAHIEID+IHEIHAHHEFHHHDGHGHIFHH,FHGFCFFCE8EEFF5'GEGA;HGGFEGGGG
+@mutant-no_snps.gff-23350/1
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++
+??A??BBABDDBDDDBGFGGFFHF,HFHFIFHIDFHIEIFIIHIHIIFHHIHHGIHI5F=IHHIHHFHIIIHICHH5FIHHH@GIIIHIEHIHEHEIHHHHHFHHH@HHHHHFHHDHHHHHFGGG6GFGEAFGEHD2*GGGGE>GEEEG)
+@mutant-no_snps.gff-23348/1
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++
+?=??FFHHHHAHHHEFIIIICHFIIHECGEEGIGGEGEGFEEGEE
+@mutant-no_snps.gff-23344/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23342/1
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++
+?????B@BBDDDDDDDGGGFFFIIIAIHHHIHCGDHEHIGIHDIHHFEIDHHHHCHHI5DGIHHEHIGIHHIDIHHCIHAIFHHHHIEHIGIHIFIHIDHHHEHGHEGHHHFHIHHGGHDF=HAHEHEDBGGGHGCGGG?F@EEAD8GGG
+@mutant-no_snps.gff-23340/1
+TCTGAATTCATTATTATTTGTCGTTAAATACAATAGAAAATACTATACCTGTATATGCAATTCGTCAATAGATAAATTATTAAATATGCTTACAACAATCTTAATATCCTTTAACGCACTACAATAGTGCTCTGATAATAGGTTATAAAT
++
+A??=?BBBEDEDADD5FGGGGEBHIEFFCFHIIIAHGHHGIHHDFIDHHIHHIIIII,=IFHIDFIHHF=IFHHGIFHGIFIDFHI+HI=FDH=FHIIFEIIGGFH2G?FEFEFGHFGCEGFF@FGHEF?FFHGGDFGGF=GGECEHHICHIH5IGIHHIHHDIHIFHIHFIHIGHIHEHHHHGHHHHCDFGHGGFFHGEFHDHGGGGEHFDGEFEHCG?EBGGGC
+@mutant-no_snps.gff-23336/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23330/1
+GGATTCCTACTAAACTTTAGTACCTGGGCACCTAACTTATATCATTTCTTAAATTTAAAGCATTTTAAGCGCAAGTAATAATGTATATATTTTCAAAGAATGAAGCCACTAAATCACAGTTTTCATATTCAAAAACATCTAGAGTACATG
++
+???A??BBBBDDED?DCGFGGGHIIHIIHH9HIHHFIHIIHIIHEIFFIHFHBHGIFFHIIHDHEHHIIHIGFHIHFIHIHIHHHIFHIIHHHHFH,IHHHDBHHH;HHHHFGFHH4+GHH*GEGHHGGEEDFFGIEGGAFEE,GBGGCF
+@mutant-no_snps.gff-23328/1
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++
+?A?BBBDBDDEDDDGEFGFGHFHHHHF>IIIIBIEIIIEHFEFII.IDIFIAHDHIIHIHHIFHHHHHAHIFHIIGIIHHIEIGGCFIHEHI=HHHCHIDFHGHHFDHIHFHH;EHDFHHGFGG@DDDHBEDGG;FHDBGGFGFF?EG
+@mutant-no_snps.gff-23326/1
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++
+??AB@BAFHHHHICHIIHEHHHBHHGHGDDHFHIGFIGHHIIIHIHFHCH@HIDDGHHHHHIIEIIHHFI8CI7HHHIGHFHEIHFFHHHFFHIGGHH3CH=EF@HCGGFDHHEHEGDEE1FGGFH@EGCFEDG
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++
+????ABBB:D5@DDDDFFGFFFIHF>HFIF+HIIIHHFHHIHHHG=HHGIIHHIIHIFIHHIIDHHIII5EHHHGHHIEIHCHIIEHHHH.IFIIHHHHFHHI;FEHHHHHGH?FHEHEGEEFFDFDGBGHGFGGG;FGGEEECEGGGGB
+@mutant-no_snps.gff-23322/1
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++
+?A???BB-BDDDDDD9FFFFFGHHEFFFFHIIHHHIIIIEGFIFHHF-IHG>BHHFIIHDF8IHHCFHIIHEIHHHIHHIBIIEHFHFIHHEHCHEEIH?HDEHHHEHCHFDGIFHDHCBFFECGHEGHHGG=HEGFEEGBFGGF?FGGG
+@mutant-no_snps.gff-23320/1
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++
+???HIIHICH?FIGIH'HHHIFHHDIHH?HHGGHBFGGEHFE3FGHHGFGDEHGC?GG,GFGE*
+@mutant-no_snps.gff-23316/1
+ACATTGCGTTGTATACCACAAATCCATGGCGCGAGTTTTCAAGTATTCAATTATGTTAAACAGCAATTAGAATTTGAAATGAATGCGGCTAATGATAATCCACTTATATTTGAGGAAGCAAATGCAACGTTTGTTATTTCGGGTGGTAAC
++
+?????B?B@DDDEDDDCFFFCFFCIHIIIHIHGHHIIIGIHIHHHIIIFEIHHFHGHDIHHIIICGIIACIHAEIH5IHFIGHHHIII=HGHHAHHHGGHH=IHEIDFHGGHHHDEHHCHGFGHGCFHFGEHGEF)EGD,IIHFIHFHEH?IHF7DEH>BIIIFIFFADICIHHCDIGHAHHIBIIF5HFCH-IHIEIIFHIEDHFFHHHHDHGEFFFFHHGDGFHFGGEHFD*FGEGDGGGG7;;EEEG;0EEGG
+@mutant-no_snps.gff-23310/1
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++
+????G*GGF
+@mutant-no_snps.gff-23308/1
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++
+??5II@AIHIHHIHEIIIGIGHGA?IIHIHFHEFH=GHIHCHFIAHI9EFIHIEHIIFFHHHGIHHIIDHHEGHDGD@GFEFHBGF+FGEEEGGEFFDEFBGGGGG?G8G
+@mutant-no_snps.gff-23306/1
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++
+?A???BBBDDDDDGHGHEHHHHD7HFGH8HHEFGEHFEFGFFIGGF=GGGFGGGG
+@mutant-no_snps.gff-23302/1
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++
+,??A?B>BDDDDD@DBGGGFFGHIHFHHHIGHCIHHGHDHI>HHDBHDIFHBIAIFFGIIDIHFIIIEFIIIIEH)FIDIEH-AHIFI=IHEI.HIHEII5HIIHFHAF33GH;GEHHBHHH+GHFFGGFFGDFF8GEA5EBE8DGE)GE
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++
+??=??BBADBDDDDBEGGGFGGHHHIIIBHEFFF-HHHIIIHHFHHFFH@H@IIHGIEIIHAIHGIFIHEIHHEHAIIFEIIFHIHIHHIGFIFIEFE+HFHEHIHHHH=HFHIHHGHEEHGFGHEG:FGHGG9FFGEDEE8GE8FHGEE
+@mutant-no_snps.gff-23298/1
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++
+?A??,7??DDDDDDDDGGGFFFHHIIHIIIFIIIIIIIIHHHIHEGGIC--HHHI5IHHIHIHFIFDIFEDHHIBICHHEHHHIIHII=HHHFEHIHIHHIHBHHDFHHHHHDGHH-FH=HFGHFEHHCGGBFGGBGGGEGGBGCGGD?E
+@mutant-no_snps.gff-23296/1
+AATAAATCTCCATAACTGATGCATCAAAAACAATATTTGCATGTTGCAAAAATACTTCATTGTCGCCTAATTGCAATTCAGTTGACCATGCATGCACTAAATTCAACAAATTTCGTTGTCGTATGGCAACCCCTTTAGGCATCCCGGTCG
++
+=A???B>?EDBDDDDDFEGFFG;HIEHHIEEIAHHIHHIHIIHII8DIFIGIGHEFHHIFIIEIFHHIIEHIEIHIIHI=F5IHHIIIHH8CHEIHHEHHGHGHHHFHG3HHHGGHEHGDG(DGGFGG:;DEFF@G9AG
+@mutant-no_snps.gff-23290/1
+TAGTTGTCTAAAAATAATGTCGCAATGATTGGTTTAGAATTTTCATATAGTTCATTTGTTTGTACTTGTTCAGTTATATCAAAGAAATAGAGGCAGTGATCATTCTCAGAATAACGTACTTGGAAATGATACTGATTATATTCTATTTCA
++
+????ABBBDDDBDDDDGFGFGGHIIHHIHHHIIGHIIFHGIIHHHGIGHIHGH@IHHHFIIIIIIFHHHIIFIHHEHHHEFIHIIHHHIHHIHFHGH7)HIIIHFHIHIFIEFF@FHGHGCDFFF?GHBGG?GGGIDGGCCGEFAFGGGF
+@mutant-no_snps.gff-23288/1
+TAAGTGAAAATATAGACAATGCACATCATCCAACTTGTCTGCTAAATATTTCATTTGGAATTGGATATAACATATGATGCCATCTTGTTGAAGTTGAAATCGATACAAGTCGCGGTGGTTAATGATGAAAATGTCGCCACTGTTGCATTG
++
+??AA?BBBDBE9DBBDGGFGFGIIHFHHIE-FIICHIIHHIHHHHHHHHIIIIHHGIIIIII+IIAFHIIIICGGIIIDHI5@HHHIHGHGEEGIIHFHFIFE)HHHHGHHCHHGGFFHHHEHHGHHH@EE*FF*AGGGEFEEEEGGGEG
+@mutant-no_snps.gff-23286/1
+ATTAGTTTCTCTCATGGAATTTTTATTAAATAATGCAAATATTGTAAAAGGATCTATGTCCATCAATACATTATCACTTGCTAAAGTAGGGAATTTTATTCCCGTTTTTTTATATACTTCCTTCACTATTTCAATTAATTCATAACGTTT
++
+?A???BBBDE=ED@DDFFGGGFEFFII/HIIEICIIHIHFIHFHHIAIEIHIGHFHHIHIIFIHGHGIHIIEBBIHIIHAII;IHFHIDIHIFHFHDHFHEEHFFGHEDEFHAFHHGEGGEDFFGGHGDEEEFHGGEFGEG@DGE*EGEG
+@mutant-no_snps.gff-23284/1
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++
+??=??BBBDDDDBDDDGDFEGFFIIIFIIIIFHIHCHIIAHDIIIHDHHGHHIIFHHHFHFIHHIIHGHHHEHDIHHIIEGHHIHIHIGHGHHI7HHHHHAEHHFH4HHH*HGHHHGEHHH@EGHE@GHHC/?GGEEGDGFDFGGEGEFF
+@mutant-no_snps.gff-23282/1
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++
+?????BB/DDEDBD-DCGFFGFIFIBIHICIHIIIIIIICEIIHGIIHIEIIHHFCH=HHDBIIAIIIHIIHHIIIIHGIIIIFHIGFIIICIHIIGHHHHHFAFEIDHFHGEHHHHIHGHHGGFGFGF=EGGGGGGG9F@HHEGG?EG;
+@mutant-no_snps.gff-23280/1
+ATTTATCAATGTACCATTTTCTTTACAATGATTGCTGCATTAGTAGATGGATTAAAAGCTAGTCCAGAGTTCATTTCAAGCACATCATTCTCACAAACTTTGATTAATTTCAGCCAAAAATATTTACCATTATCAGACTTTGGTATGGGC
++
+=???A/ABDDDDBDDEFGGCECIIFIIII/HII95H>GGIHIIIHEIH@HIFIHIIGIIIIEIHFIFFIHCHDIHHIB@IIIEHE@HHI=HIFCHHIHHHCHGEHHHFHHFGGGHHGE7FFFDGFGHEDFAEDFFGDD',GEFEGF*DG8
+@mutant-no_snps.gff-23278/1
+GTCGAAGATTTTAATAATTGATGAAGTGTATTCGATTCAATTGATGCATCGGTTGTTATAAAAGCAAGCATGGTAGCCATATTTGGGTGAATCATACCTGATCCTTTAGCACTGCCACCAATTGTAATGGTATTACCATCAATATTTAGT
++
+?9?ACIBHFIIHHHHCIIFHIFHIHI7HIFDHHIHHIHGDFDHHHEIG8DHHGDHHHHFHHGFGFHEEFGEGG,GFDFGDGG==GGGGGEGF
+@mutant-no_snps.gff-23276/1
+GGTCGTCAGACTGATGGGCCCTATTCGGATATTGAGATGATGTGTGTCATGTCAACAGAGGAAGCAGAGTTCAGCCATGAATGGACAACCGGTGAGTGGAAGGTGGAAGTGAATTTTGATAGCGAAGAGATTCTACTAGATTATGCATCT
++
+??A=?B=BDEDD@DDDFC+GGEHIIHIHHF9DIIFDGFHIF?HGHIHIIHHIIIHIDHFHHGHFDIGHIIGEIIHFH=-HHHFHFHCH+HIHHHHHECED+HFIEHEHHEDGHFHHHHEHE=GHFEGGFGGFE@EEGF@GGD.EGGEFGF
+@mutant-no_snps.gff-23274/1
+CAAAAATTTGCAACAACTTAAATATTAATGTATTAGATGTGATTGAAATGGCAAACAAACATCCGCGTGTTAATATCCATCAACCTGGTCCAGGTGTAGGCGGTCATTGTTTAGCTGTTGATCCGTACTTTATTATTGCTAAAGACCCTG
++
+?????BBBDDEDDDDBFFGGFGHHHHIHIHHIFIGHHIIIHIHIHIDIF?IHIGIFHIHHG/EHIHIEFIIIHHHIHIHHIGIHHIHFHGHIGIFEECGGHF@FHHDIGHHE*FHGBFHGHFFHDGDFGFGFGGGFFGEGFGCFEG=EEG
+@mutant-no_snps.gff-23272/1
+TTTTAATTAACGTAACTGTATTATCACATTAATCGCACTTTTATTTCCATTAAAAAGAGATGAATATCATAAATAAAGAAGTCGATAGATTCGTATTGATTATGGAGTTAATCTACGTCTCATCTCATTTTTAAAAAATCATTTATGTCC
++
+=??A?BBABEDDDDD@GFGG?GIBHIHFFIFHHHFHIII,IHIHGHHFIEIIIIIDHHHHDH:HAFIICHIICHHHEIH4CHIIFIIHGHGHIGIIHHIHGHHHGHHHHFHHHGH:FHHHDH@=FH*HGHG@G@FI,EFGG'GFFGFGFD
+@mutant-no_snps.gff-23270/1
+AAAGATAAATCTTGGGGTGGTTACAACGTTACAAGATATGAAGTGGTAAATGGTAATATCGACTTAAAACAAGCAATAGAATCATCAGATAACATTTTCTTTTCTAGAGTAGCACTCGAATTAGGCAGTAAGAAATTTGAAAAAGGCATG
++
+??A??BBBBDDDEDDBGFGFGGHFIFHIIHIIHIAIEIGGHDIHHFIHIHIHIFIIHFHHHFFFIG.IIGFHHIAIBIGICAFIFIIHEH+IHFIHHIGHFH.HHAHHHHFHHGHEGHHG*HFG?FHGEEBGHBEFDG,;GEHGGGGEFG
+@mutant-no_snps.gff-23268/1
+CAAGCTATCATAGGATGTTTTTGTAACTTTTGAAGCTAATTCATTAAATAGTTCTAAAAATTTCTTTAAATCCTCTAGCATATCTTCTTCTGTGAATCCTTCATTCAAATCATAATATTTGAATCTTATTGATCCATGAGAATATCCTGA
++
+?????BBBDADDDEDBGGFFGGIFFHHHIIFFIIIHHHICIIIGI=HHHIIFHHHI?IC5HFFHIIIHHIHEHHHCHIHIIEFFHHIHGIHHFIDFI)HHHGHEHIFHHHIIHHHIFGIIHIHIHHHIHHHIIHI>DIHHFGHHHCHIH?IIIHHGI=IGHHDHIIHIHIHHG,DIDHIHHHDHIHHHHHIF9@HHHDHFBCHFC@EEGAGAGGFGFCEEGEGGEEGCEEFFEFG
+@mutant-no_snps.gff-23254/1
+ATTGAAACAATGGTTTTACGTACATTTATAACCTATTATCAGAGCACTATTGTAGTGCGTTAAAGGATATTAAGATTGTTGTAAGCATATTTAATAATTTATCTATTGACGAATTGCATATACAGGTATAGTATTTTCTATTGTATTTAA
++
+?=A??BB?DBDDDDDDDDFGFGFGHIFFIHHHHHHGIIIIFGHHIIHGIHI+FFHIIIIHGGEIHHIHFIHHEI->IHHH,FHEHEIFIHIFIIIHHI.IIHF3GF?FHGHHHFHHFHDFFHGFHGHFGHDFFFFGGF'FGGDF)@FEGGGE
+@mutant-no_snps.gff-23250/1
+TTTTTGGCTAGCACTTCGGGATATTTTCTTAGCTGAACAGTTAAATGACCTAATTGATCTTTGAAAATATCATTATCTTGACCCATATATGACCACCAAGCTGTTTCATCACAAACTGTGACATACTTAGCTAACATGGCATCTTTTTCT
++
+??AA?B?BDDB@D?@FHHHFHFIHBEIFIIII@DBEEIAGHIFIEGFIHII?IIHIAHEIHIIHIIHCIHHHHHHHIHHHGHHFFIFGFGFHEDHDCGEIHHFFEH5BDFGGHBG=*HFEEGGFGGGG>GGHECEGGEGG
+@mutant-no_snps.gff-23248/1
+GATATCTTCAAATAACGTCATGACATCTTTTTTAGAAATATTATCTTTTCCACAAATCATTTGATATAAGGTGCGATCATTTGCCGCGAGTGCTGCCATTGACACTAGCTGTTGCGTATCATTTTTGGCTAGCACTTCGGGATATTTTCT
++
+?5???BBBBBBDHGFHGGGGGHGCEEGGG@@GE
+@mutant-no_snps.gff-23246/1
+CTGGTTTCAATAGTGATATTAAAAGTTGGGCGAAACAAACAGGGAATACCCTTGTAAATCTTACTGAAGAAGCAAATGTAATTAATGCAATTATTCAAAAAGAAAAGCCAAAAGAATTTGAAATCAATGACACTGCTACAGGTACAACAA
++
+?<,?5B?BEG8GGGGG
+@mutant-no_snps.gff-23244/1
+ATTTAATGTTGTGAAATTTGCTTCTTTTAAATCTAGATACTTTGTTAATATAACATTGATTTTATCTCGCACGGGCCACTGTGTATTTTCCGCTAAAATATCTTCTATTTCTATAAACATTTGATCGACTTTTTTATCCATAATAGCCTG
++
+???A?BBBBBBDDDBDFGFGGEIHHHIIFIIHEHHIEIIHICIIHICIHGH5HHHIIHIEHHHHIIGIIFFIFIHIIHHGIFEEGEEGGGFGGG
+@mutant-no_snps.gff-23242/1
+ATGGTACCACCTATTGTTTCGGCAACGAAATATGAACATGCTCAAGCAATCCGTAATAAGAAGCAACTTCACTGTATACCTTCAGAGAATCAGCTGAAACAAAAGATCAAATGTCCTTGTTGTGACTCAACACTGACAAATTTGACAATA
++
+A????BBB=DDBDDFGF/HCCHCHIIIHIHIHEIIHFIHII=IHAEFHEHHFIHHIGGGFIFIIAHHFFIDFIIHIDIHGH=HGHEFIHHFGH@GHHI=HHEHHDHHFFBGHD;@HEEHGH36G@EFGEFE*GDGGGE8=EGGFGG
+@mutant-no_snps.gff-23236/1
+TACGTAAAACCATTGTTTCAATAAAAATGAAAACGTATACTTCAAGAAGGATGGGTTACTTAATATAAACAAGGGGGTAACATATATGACTTTATATTTAGATGGTGAAACACTAACAATTGAGTATATTAAATCATTTTTACAACGACA
++
+??A??B?BDDDDBDDDCFFGGGIHII>III@FIIIHHAGIIIHFI5IIHFIIEHHIFHHIAIFIH=HFCIDBHHFHHEHIHFIHHGGIIIIIH+HGFEBIHHHDHIHHIHHIIIEHFHFDHEHIAHIFIIFEHHFIGHHF@IFIIHHAIIEHIHHIEHEIHH?IIGHFIEHIDHHIDG.C?EHHHEHHHHHCEH*EBGFHHHH5GG)G9,G@DG/GGGGFGFG
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++
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++
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++
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23128/1
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++
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++
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++
+9???AB7BDDBDDDDBG@GGGFFHHHHHFIIHIHIIHIHFHIIIIF@IGIHIFHHH?IIGHIHHFGHIDIIIHIHH=HGHGHFHFIIFHIHGHDIHHFHHDGFHEHEFGHHHDHCFGCGAHDFFEEEGFGEGBGEEEFFG'?EAGFFEG?
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+@mutant-no_snps.gff-23112/1
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++
+A??BBBDDDDD?DDGFGGGGHEFHFHHHGHIGIEGHH5EHIIHHAAIIIIHGIHIE:HHFIFHHHIIIIAHHIIIIIIHHIIIIHIIHFHIIHGHIDHIIHFGH?GFIFHHCHGHFFHHG@GGGHEGAGF:FGFGGGDGDBEE7HCEF
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23106/1
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++
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+@mutant-no_snps.gff-23104/1
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++
+??,BBBDDEBDDDDGGFDGFIIHIFIIEHIIHHIHHHHIHHIG+HIIICIHIIIIIIIDFIIIHIGHHHHADFGDIFDIGIEGHIFHHEHIIHHGHIIIHH4HHFHGHHDHHFCEEFHHGEGFHEHEDGEGEEE*G'FDGG:FHCGDF
+@mutant-no_snps.gff-23102/1
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++
+,=5??BBB6DDDDDDDFCDDGCHFIIFCHCHHFHCHI,HIIGHBIDIGFIHFIIHIHIIAIHHIIHHIHIIGIGHIHIIHIHIHCFHIIHIHIFHHICHHHHHHH.GD+GHHHGGHHHGGFFF@G.HFBFHHHGGGG;GGFFEE0GBGGG
+@mutant-no_snps.gff-23100/1
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++
+????A?BBDDDBDBBDFGGCFGIHFIHIHHHIIIHHIFHHIHIIHIHIHHIIHHGHHIHBBIAIIHHHHIBFHIDIHIH-EHIHG:?IIHIIHIHEFAHH@IIGHCDEHHEIGHGHHGGH3EGFCEGFFFDFEDGIEIC>GE;EEGHE?F
+@mutant-no_snps.gff-23098/1
+GTAGCCATACATCAAGCCACCTAACAATGCTCCAATAGCTACCGATAAGTTCGTCATCCAATAGCTACTCTTGTAAATATAATGTTCCACATCTTCGGTAATTGCATCCATAATTAACGTGTCCATAACTGGAAATTGCAATCCCCAAAC
++
+A?A?ABBBDDDDDDDBFGGFGFFHHHHHIIFIIDIIIHHHHIFI@ICHHIIHHIIIGH*@DEIAFH+-FHHIFIHGIIHHHHIIHHHH8HHDIHF?IF@DHHHIHGEECHGHDEHGHFDHHHHHEDHEFHE>GC(IGDCGHGECG:GGEG
+@mutant-no_snps.gff-23096/1
+GAAGAAGGGGCAAAAGCAGCTGCACTTAAATTATCAAGTGATGGTACAAAAGCTATTGCTATCAAAGCAGATGTATCAAACCGTGATGATGTATTTAATGCAGTAAGACAAACTGCAGCGCAATTTGGCGATTTCCATGTCATGGTTAAC
++
+A????BBBBB@DDBDDFFFCFFBAHHIIFCHFIHHIAIFGEHI=HBHIHIIIFIIHHHFHIIIH=FHCFHHHIAHHDIFHHDHICFEHIHEHC7EDFHFHBHHIHAFHHHEGHHEHHFDGHF?HFEHGGA8GGGGEG@HGGCDDGFGFG:
+@mutant-no_snps.gff-23094/1
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++
+?5??ABBBDDDDDEBDFFGFGGFIHHIHIIHHIIGIHCII.AIH?IDHIIHIHIIIFHHFHIIGH@EIEIIEIHHIHHGHHIEEHICIHH7IFIFHIHHIFHDDEH=HEFHHD@HH8HGGGGGGFHFEEDEFGFGI;GFEHE*AFGGGGF
+@mutant-no_snps.gff-23092/1
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++
+?9?5?BBBBDDDDEDBGCCGFGAIHCIIIAIID=IFIIIIIIE,IHEGHFI9IIIEBHE8HIHHIFIHFHHIGHI)IIFHFFHIFHEFIGGHFI,DFIHHH=FHHDHHCIDFDHFFDGG,HHFHHFA?EGFGGGEEG>G*:,EDGGGG?E
+@mutant-no_snps.gff-23090/1
+TTGAAATTAAAACATCTACATCTTCTAGTATTGAGGAACCATTTTTTATGTCGCTAAATGAAATGTTTGCTATGAAAGAATATAAGCAGAAATATTTAATATTAAGAATATTTAATGTTTCCGGTAAAGAACCACAATTTTATTTTATAG
++
+?A=?AB9BDD?DDBDDFGFCFFHIIIIFIEHH-HII@>HIHHH>IFGDIHFHIH@IGIIIIHFIIFI,FHIHEHHIHI-HHF?FICIDII?IDFICHICHHIFHFHHIHGHDHHFGHEHG)HGCHFEFFE@GEEEFEGF-E=C*GFFEGC
+@mutant-no_snps.gff-23088/1
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++
+???AAB?=DDDDDDDBFGC,GFHIIBHCEFEHIHHI;HIICIHHGBHH@HHIIIIHIGIBHIHHHIFHHFHHIIIGIHII?FIIDHH@IHDHFHIHHHGIIIIIH+HEFIHHFHFIGHHHH5IFIIIIHFHDIFIHFGHH.=HEHIDHGHDHHI:FHHBFDGF:HEFCG1GG>EGFE9EGGEFDEGFEFG
+@mutant-no_snps.gff-23072/1
+AGAACGCTCAACTGAAGATGAAAGAAAAATTTTAATTCATATGAATGACGCGCAGCAAGACCATGCTGAACAATTATTAGCTCAAGTGAATCAATTATTGGCAGATAAAAATCATTTACATCTTGTTTTTGAATAATATCTCTATTACGC
++
+?A?<<>B>DB?BDDDBFCGFFGIIIIIHAIHFIFGIHHIHIIIEIHGCHGHHIHHIFHGGFIHI-IIGHHI=HIEE-HFHHIFFHFHFGDGFH@GGGGIEGEFGBE6HGFEEG
+@mutant-no_snps.gff-23070/1
+CCCTTTGATGAGTAACATTGAAAGTACGGCAACGATGATTGAGAAGATGAAAATCCATCTCCAACCCATAGTTGTCGCAACTGCCCCACCGAAGAGTGAACAGATACCACTTCCACCCCAAGAACCGATAGACCAATAGCTTAAGGCACG
++
+???AABBBDBDEHGIFIHHHHFHE0FEGH;DEEGHHGHGHCGCG7@H*GGFEGEFGGGFEGG
+@mutant-no_snps.gff-23066/1
+TTTATTCGAGATATTCCGAAAAAGACGATTTTCACAGAATTTGATCCTGATAAAATGACGCAAGTATTTGATAATGTCATTACAAATGTGATGAAATATTCTAGAGGCGATAAACGTGTCGAGTTCCACGTGAAACAAAATCCACTTTAT
++
+?????BBBHIIH@5GHGGIIHHAHHHH8IHIHHHHIIHIGHHHHHCIEFHHHEIEHHHHGEHDGFGGFEGGGFG>EG9F,GFG/F;GBG
+@mutant-no_snps.gff-23060/1
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++
+??=A?BBBDDEB.@DDCFGGGGIIHIIIICIHI9HHHGIDIIHIIIHACHIIAHIHAIHIIGEHHHIIIIIHIFHIIEIIHHIHIHEIGHHCIIHEFHIIHHHFIBHHEHHHBHEHDFHFHFGGCEHFHHEFGGGGIGEBEBGEG8EGE;
+@mutant-no_snps.gff-23058/1
+TTGATCATGTGCTAATGTGTATGCCGTTGGTGGTAAGAAACCAACATCAACTTTTTTAGACTTCATAGCTTCAACAATTGTATTGTAGTTAGTTGATACAGACACTTTAACTGGAATCCCTAATTCTTTAGATAGTAATTTTTCTAATGG
++
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