Mercurial > repos > iuc > stacks_ustacks

diff test-data/genotypes/PopA_02.tags.tsv @ 0:7c5004f8cd49 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/stacks commit f3a59c91c231cc1582479109e776d05602b7f24d-dirty
author iuc
date Tue, 14 Jun 2016 14:06:23 -0400
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/genotypes/PopA_02.tags.tsv	Tue Jun 14 14:06:23 2016 -0400
@@ -0,0 +1,67 @@
+# ustacks version 1.37; generated on 2016-04-18 07:36:21
+0	2	1		0	+	consensus			AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC	0	0	0	-7.08958
+0	2	1				model			OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOEOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOEOOOOO				
+0	2	1				primary	0	lane1_fakedata7_7 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC				
+0	2	1				primary	0	lane1_fakedata7_8 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC				
+0	2	1				primary	0	lane1_fakedata7_9 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC				
+0	2	1				primary	0	lane1_fakedata7_11 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC				
+0	2	1				primary	1	lane1_fakedata7_0 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC				
+0	2	1				primary	1	lane1_fakedata7_1 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC				
+0	2	1				primary	1	lane1_fakedata7_2 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC				
+0	2	1				primary	1	lane1_fakedata7_3 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC				
+0	2	1				primary	1	lane1_fakedata7_4 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC				
+0	2	1				primary	1	lane1_fakedata7_5 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC				
+0	2	1				secondary		lane1_fakedata7_10 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTTTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC				
+0	2	1				secondary		lane1_fakedata7_6 1:N:0:_1	AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAACCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC				
+0	2	2		0	+	consensus			AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA	0	0	0	-2.07
+0	2	2				model			OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_0 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_2 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_3 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_4 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_5 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_6 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_7 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_8 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_9 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_10 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_11 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_12 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_13 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_14 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_15 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_16 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_17 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_18 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				primary	0	lane1_fakedata2_19 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	2				secondary		lane1_fakedata2_1 1:N:0:_1	AATTCTCTACACCACTGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA				
+0	2	3		0	+	consensus			AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT	0	0	0	-4.16
+0	2	3				model			OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_2 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_3 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_4 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_5 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_6 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_7 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_8 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_9 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_10 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_11 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_12 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_13 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_14 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_15 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_16 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_17 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_18 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_19 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_20 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_21 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_23 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_24 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_25 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				primary	0	lane1_fakedata0_27 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				secondary		lane1_fakedata0_26 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTATCTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT				
+0	2	3				secondary		lane1_fakedata0_22 1:N:0:_1	AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCCCGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT