diff test-data/integronfinder2/results.summary @ 0:05c1bcba20c9 draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/tooldistillator commit 491c6fc94851aab68cb7529dd6b6fbc6caa84bf2

--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/integronfinder2/results.summary	Tue Apr 30 08:41:54 2024 +0000
@@ -0,0 +1,93 @@
+# cmd: integron_finder --cpu 4 --local-max --eagle-eyes --promoter-attI --pdf --gbk --keep-tmp --outdir /storage/scratch/piemari/60579123/integronfinder/integronfinder_10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 /storage/scratch/piemari/60579123/integronfinder/10_Enterococcus_faecalis_S17_L001.fasta
+ID_replicon	CALIN	complete	In0	topology	size
+contig00001	0	0	0	lin	436224
+contig00002	0	0	0	lin	252900
+contig00003	0	0	0	lin	206370
+contig00004	0	0	0	lin	168397
+contig00005	0	0	0	lin	132811
+contig00006	0	0	0	lin	115359
+contig00007	0	0	0	lin	113419
+contig00008	0	0	0	lin	99915
+contig00009	0	0	0	lin	97190
+contig00010	0	0	0	lin	92075
+contig00011	0	0	0	lin	86662
+contig00012	0	0	0	lin	82418
+contig00013	0	0	0	lin	81741
+contig00014	0	0	0	lin	81694
+contig00015	0	0	0	lin	71911
+contig00016	0	0	0	lin	66886
+contig00017	1	0	0	lin	64537
+contig00018	0	0	0	lin	62649
+contig00019	0	0	0	lin	55461
+contig00020	0	0	0	lin	52826
+contig00021	0	0	0	lin	48115
+contig00022	0	0	0	lin	47790
+contig00023	0	0	0	lin	45935
+contig00024	0	0	0	lin	44497
+contig00025	0	0	0	lin	35306
+contig00026	0	0	0	lin	35051
+contig00027	0	0	0	lin	29358
+contig00028	0	0	0	lin	27780
+contig00029	0	0	0	lin	24296
+contig00030	0	0	0	lin	23952
+contig00031	0	0	0	lin	18776
+contig00032	0	0	0	lin	17346
+contig00033	0	0	0	lin	16026
+contig00034	0	0	0	lin	15602
+contig00035	0	0	0	lin	15587
+contig00036	0	0	0	lin	15306
+contig00037	0	0	0	lin	13750
+contig00038	0	0	0	lin	13168
+contig00039	0	0	0	lin	12357
+contig00040	0	0	0	lin	12074
+contig00041	0	0	0	lin	11206
+contig00042	0	0	0	lin	9892
+contig00043	0	0	0	lin	8939
+contig00044	0	0	0	lin	7812
+contig00045	0	0	0	lin	6929
+contig00046	0	0	0	lin	6828
+contig00047	0	0	0	lin	5969
+contig00048	0	0	0	lin	5336
+contig00049	0	0	0	lin	3276
+contig00050	0	0	0	lin	2262
+contig00051	0	0	0	lin	2083
+contig00052	0	0	0	lin	1817
+contig00053	0	0	0	lin	1775
+contig00055	0	0	0	lin	1578
+contig00056	0	0	0	lin	1526
+contig00057	0	0	0	lin	1515
+contig00058	0	0	0	lin	1299
+contig00059	0	0	0	lin	652
+contig00060	0	0	0	lin	607
+contig00061	0	0	0	lin	534
+contig00062	0	0	0	lin	525
+contig00063	0	0	0	lin	442
+contig00065	0	0	0	lin	405
+contig00066	0	0	0	lin	398
+contig00067	0	0	0	lin	378
+contig00068	0	0	0	lin	372
+contig00070	0	0	0	lin	332
+contig00074	0	0	0	lin	256
+contig00075	0	0	0	lin	255
+contig00076	0	0	0	lin	255
+contig00077	0	0	0	lin	255
+contig00078	0	0	0	lin	255
+contig00079	0	0	0	lin	255
+contig00080	0	0	0	lin	255
+contig00081	0	0	0	lin	255
+contig00082	0	0	0	lin	255
+contig00083	0	0	0	lin	255
+contig00084	0	0	0	lin	255
+contig00085	0	0	0	lin	255
+contig00086	0	0	0	lin	254
+contig00088	0	0	0	lin	253
+contig00089	0	0	0	lin	252
+contig00090	0	0	0	lin	250
+contig00091	0	0	0	lin	246
+contig00092	0	0	0	lin	235
+contig00093	0	0	0	lin	231
+contig00094	0	0	0	lin	206
+contig00095	0	0	0	lin	205
+contig00096	0	0	0	lin	161
+contig00097	0	0	0	lin	151
+contig00098	0	0	0	lin	138