Mercurial > repos > iuc > tooldistillator_summarize
diff test-data/plasmidfinder/genome_hit.fasta @ 0:05c1bcba20c9 draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/tooldistillator commit 491c6fc94851aab68cb7529dd6b6fbc6caa84bf2
author | iuc |
---|---|
date | Tue, 30 Apr 2024 08:41:54 +0000 |
parents | |
children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/plasmidfinder/genome_hit.fasta Tue Apr 30 08:41:54 2024 +0000 @@ -0,0 +1,94 @@ +>repUS12:WARNING ID:100.0% COV:88.01% Best_match:contig00051 len=2083 cov=17.5 corr=0 origname=NODE_51_length_2083_cov_17.526074_pilon sw=shovill-spades/1.1.0 date=20230213:127..897:repUS12_2_repB(SAP014A)_GQ900379:88.013699 +ATGTGTCCTAATAGTAGCATTTATTCAGATGAAAAATCAAGGGTTTTAGTGGACAAGACA +AAAAGTGGAAAAGTGAGACCATGGAGAGAAAAGAAAATCGCTAATGTTGATTACTTTGAA +CTTCTGCATATTCTTGAATTTAAAAAGGCTGAAAGAGTAAAAGATTGTGCTGAAATATTA +GAGTATAAACAAAATCGTGAAACAGGCGAAAGAAAGTTGTATCGAGTGTGGTTTTGTAAA +TCCAGGCTTTGTCCAATGTGCAACTGGAGGAGAGCAATGAAACATGGCATTCAGTCACAA +AAGGTTGTTGCTGAAGTTATTAAACAAAAGCCAACAGTTCGTTGGTTGTTTCTCACATTA +ACAGTTAAAAATGTTTATGATGGCGAAGAATTAAATAAGAGTTTGTCAGATATGGCTCAA +GGATTTCGCCGAATGATGCAATATAAAAAAATTAATAAAAATCTTGTTGGTTTTATGCGT +GCAACGGAAGTGACAATAAATAATAAAGATAATTCTTATAATCAGCACATGCATGTATTG +GTATGTGTGGAACCAACTTATTTTAAGAATACAGAAAACTACGTGAATCAAAAACAATGG +ATTCAATTTTGGAAAAAGGCAATGAAATTAGACTATGATCCAAATGTAAAAGTTCAAATG +ATTCGACCGAAAAATAAATATAAATCGGATATACAATCGGCAATTGACGAAACTGCAAAA +TATCCTGTAAAGGATACGGATTTTATGACCGATGATGAAGAAAAGAATTTGGGTTCTGTT +GCAAAGTTTTAAATAAAGAATAAAATCCCTTACGGTATCTATGATTTAAGCTGGGATTCC +CAATAATACCTTGATTTCAGTACAGACCGAAAACCC +>repUS40:WARNING ID:100.0% COV:100.0% Best_match:contig00026 len=35051 cov=66.2 corr=0 origname=NODE_26_length_35051_cov_66.162954_pilon sw=shovill-spades/1.1.0 date=20230213:21156..22313:repUS40_1_repB(pE394)_KP399637:100.000000 +ATGCTCAATTCTAGTATATCACGAAAGGTACTTATGATGAATGACATTCAAAACAAAAAA +ATAGTTCAAGACAATGATTTAATTGTAAGTGTCGCAAAAATGGATAAGACACCCATGAAA +TTTTTTGAATTAGCAGTCGCCAGTTTAGATATTAAGAATATTCCTGCTGATCGAACTGTT +CATGTTTCTAAAGAATTATTGTATTCCTTCTTTGACGCAAAAAGTGAAAATAAACATACA +CGCTTTAAAGACGCTGTTCTAACTGTTCATGAGCAAGCAGTGTTTCTAATGCGAGAATTA +AATGAGCGCAAAGGAAAATATGAATATCAAGTGATTAGTCCATTGGAAAGAACTTCTTGG +AATGATTATGAAGATATTGTTTCTTTTAAGTTTACTGAATCTATTTTTCCGTATCTGATA +GATTTAAAAGGAACATACACGCAATATTTATTGTCAGACATTGCACAACTAAATAGCAAG +TATTCCATCATTATTTATAAATGGTTAAGCATGAATTATAACCAGTATGACTATTATAAT +GCAAAAGGTGGGCGCAGAGAAAAACAGTTAAATGAATATAAAAATCCAATTATTCCGATT +GAAGAATTACGAAGAATAACTGATACAGAAAAAGAGTATTTAAAATTTTCCAATTTTGAA +GCAAGAGTTTTAAAAAAAGCTGTTGAAGAAATCAACCAATTTACAGTTTTAAATGCGACG +TATGAAAAAATAAAAAAAGGAAACCGAATTGGTTCGATTCAGTTCCATATTACGAAAAAA +CAAATTGCTCCTAATCCTTCTTACAAAATTGGCGATTCTGTGTATGAAGCGCAACAAGCA +GAAAAAGAACAAAATCAAATTACTTTATTTGCGCAGGCAATGCAAAGTCAATACACTACC +ATTTTGATGGAAAATATGTTGATTGGGTACAAAGATATGCAAGATATTGAATTAATGGCA +AGCTTGCAAGAAATGGTTTATCCCTTGTATGACGAGTTGAAAACTCTTAGAGGATTAGAC +GGTGTGAGAAATCACTTAGAATACGTTTCAAGAAAACAAATAGGCTATTCTAAAACTAAT +ATTGTCAAGTATTTAAAAACAGCTATCACACAATATTTGCCAACGGTAAAAATGATGGAT +ATGGATAATAGAGTGTAA +>rep9b:WARNING ID:100.0% COV:100.0% Best_match:contig00023 len=45935 cov=46.6 corr=0 origname=NODE_23_length_45935_cov_46.624847_pilon sw=shovill-spades/1.1.0 date=20230213:3630..4643:rep9b_2_prgW(EF62pC)_CP002494:100.000000 +ATGAACGATTTTCAATTTATTTCAGCTAATGAAACCTATAGAAATTTGTATTACCAATTA +CCTAAAGTACTTTTTACATCAGAATTTTATAAGACTATGTCTAATGATAGTAAAATAGCT +TACGCAATGTTGCAAGACCGATGTGAATATTCAATACAAAATAATTGGATTGATCAAGAT +GGGCATATATATTTTATCTTTACACGAAATGAACTGATGGATATTTTAGGGTGTAAAGAA +AATAAAATTGCAAAAATAAAAAAAGAATTAAAAGACAAAAATTTACTTTATGAAAAACGT +ATTCCTCCGAAAAAACTCTCTACTGGTGAATTCAAAAACTATCCAAACAGATTGTATTTA +GGTAAGCTGGAAGTTTCAGCAACAGATGTTTACGCCATCAGTAATGCTAGCTATACAAAT +GAGTTTCCCGAAAGTGGGAAAAACCAACCTTCGGATAAACATGATAAAATCGGCATTTCT +TTCGAAAGTGGGAAAAACCAACGTCCAGAAGAATCCAATAATACCAGTACTTTGTTCGAA +AGTGGGAAAAACCAACCCAATCTATATCTAACTAATTCTTTAGATACAATAGATACAATA +GATACTGAAAAAGAACGATTGCAACAACAATTATTGCTCGATCAATTTTCAGAAGTTCAA +GAGCATACATTTCTTAGCAAAAATAGCTTAAAATTTATTGCTGCCTTTTCTGATACTATT +CAAGAAGCACATGAAATGGTTGGAACAATTATTCGTGCTAAAACTAAAGTAGAAAAAGAA +TACAATATCGTTCTAATTGGTGAAGATTATCAAGAAGAAATAGACAAATGTTTGCGTCGT +GTGATGCATAAAATCAAGACAGATTCTACTGTAAAAAGTCCAAAAGGCCTATTCTACAAG +TCGTTTTACAATTTATTTGTTGAATGTACAATAGAGAAAAAAAGTCATTTAAATAAAAAT +AGTACGGACAACACCCCAGAAATAACTACACATAACTGGATTGAGTATCAATAA +>rep7a:WARNING ID:100.0% COV:100.0% Best_match:contig00048 len=5336 cov=19.5 corr=0 origname=NODE_48_length_5336_cov_19.468228_pilon sw=shovill-spades/1.1.0 date=20230213:3276..4214:rep7a_8_ORF11(pRE25)_X92945:100.000000 +ATGAAGAAAATTGATGAAAAATTAGCTGCAGAAATCTCACTAAAAAAACCGGCCGTCTCT +AATAGCCGGTTAAGTAATAGCCGGTTAAGTGGTCAAACTTTGGGAAAATCTCAACCCGCA +TTAAGTTTTGATGCCATGACAATCGTTGGAAATTTGAACAAAACTAATGCTAAAAAGCTA +TCTGACTTTATGAGTGTAGAGCCACAAATACGACTTTGGGATATACTTCAAACAAAGTTT +AAAGCTAAGGCACTTCAAGAAAAAGTTTATATCGAATATGACAAAGTAAAAGCAGATACT +TGGGATAGACGTAATATGCGTGTTGAATTTAATCCCAATAAACTCACACATGAAGAAATG +ATTTGGTTAAAACAAAATATTATCGACTACATGGAAGATGACGGTTTTACAAGATTAGAC +TTAGCTTTTGATTTTGAAGATGATTTGAGCGATTACTATGCAATGACTGATAAAGCAGTT +AAGAAAACTGTTTTTTATGGTCGTAATGGCAAGCCAGAAACAAAATATTTTGGTGTCCGT +GATAGTGATAGATTTATTAGAATTTATAATAAAAAACAAGAACGTAAAGATAACGCAGAT +GTTGAAGTTGTGTCTGAACATTTATGGCGTGTAGAAGTTGAATTAAAAAGAGATATGGTT +GATTACTGGAATGATTGTTTTAATGATTTACACATCTTGAAACCTGCGTGGGCTACTTTA +GAAAAAATTAATGAGCAAGCTATGGTTTATACTTTGTTGCATGAAGAAAGTATGTGGGGA +AAGCTAAGTAAGAATACTAAGACTAAATTTAAAAAATTGATTAGAGAAATATCTCCAATT +GATTTAACGGAATTAATGAAATCGACTTTAAAAGCGAACGAAAAACAATTGCAAAAGCAG +ATTGATTTTTGGCAACGTGAATTTAGGTTTTGGAAGTAA +>repUS43:WARNING ID:100.0% COV:100.0% Best_match:contig00040 len=12074 cov=69.2 corr=0 origname=NODE_40_length_12074_cov_69.205993_pilon sw=shovill-spades/1.1.0 date=20230213:8225..9430:repUS43_1_CDS12738(DOp1)_CP003584:100.000000 +TTGGAGGGATTTTTACTGAATGAACAAACTTGGTTACAGCATTTAAAAGAAAAACGCTTG +GCTTATGGACTATCTCAAAACCGTTTAGCTGTTGCGACTGGTATTACAAGGCAGTATCTA +AGCGATATTGAAACAGGAAAAGTCAAGCCATCAGAGGATTTACAGCAGTCCCTTTGGGAA +GCTCTGGAACGCTTCAATCCCGACGCTCCCCTTGAAATGCTGTTTGATTATGTAAGAATT +CGCTTTCCGACAACAGACGTACAGCAGGTGGTCGAAAACATCTTACAACTGAAACTGTCC +TATTTTCTTCATGAGGACTATGGTTTCTATTCTTATTCAGAGCATTATGCTTTAGGCGAC +ATATTCGTCCTTTGCTCCCATGAACTGGACAAAGGAGTTCTGGTGGAATTGAAAGGTCGT +GGGTGCAGACAATTTGAAAGCTATCTTCTGGCACAACAAAGAAGCTGGTATGAGTTCTTT +ATGGACGTTTTGGTGGCTGGCGGTGTGATGAAACGCCTTGACCTTGCCATTAACGATAAG +ACAGGGATTTTAAATATCCCTGTACTCACTGAAAAGTGCCAACAGGAAGAATGTATCTCC +GTCTTCCGCAGTTTTAAAAGCTATCGCAGTGGCGAACTGGTACGCAAAGAGGAAAAGGAA +TGTATGGGAAACACCCTCTATATCGGTTCATTACAAAGTGAAGTTTATTTCTGTATCTAT +GAAAAGGACTACGAGCAGTACAAGAAAAATGATATTCCCATTGAAGACGCAGAAGTAAAA +AACCGTTTTGAGATTCGATTGAAAAATGAGCGTGCCTATTATGCAGTCCGTGATTTACTC +GTCTATGACAATCCAGAGCATACCGCCTTTAAAATTATCAATCGGTATATCCGTTTTGTA +GATAAAGACGATTCCAAACCTCGTTCTGATTGGAAACTGAATGAAGAATGGGCTTGGTTT +ATTGGGAACAATCGTGAACGATTAAAACTAACCACAAAACCAGAGCCTTACTCCTTCCAA +AGGACGCTGAACTGGCTATCTCATCAAGTTGCCCCGACCTTAAAGGTTGCGATTAAACTT +GATGAAATCAACCAGACGCAGGTTGTAAAAGACATTCTCGACCATGCGAAACTGACAGAC +CGACACAAGCAGATTTTGAAGCAACAGTCAGTAAAAGAACAGGACGTGATAACAACAAAA +AAATAA