Mercurial > repos > iuc > tracegroomer

diff test-data/rawAbundances.tsv @ 0:3cb0128a59a6 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/Tracegroomer commit 6a049d6fe2f2975403086e17f97fab041c311590
author iuc
date Thu, 28 Mar 2024 13:19:21 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/rawAbundances.tsv	Thu Mar 28 13:19:21 2024 +0000
@@ -0,0 +1,34 @@
+ID	MCF001089_TD01	MCF001089_TD02	MCF001089_TD07	MCF001089_TD08	MCF001089_TD19	MCF001089_TD20	MCF001089_TD25	MCF001089_TD26	MCF001089_TD37	MCF001089_TD38	MCF001089_TD43	MCF001089_TD44	MCF001089_TD55	MCF001089_TD56	MCF001089_TD61	MCF001089_TD62
+3-Phosphoglyceric_acid	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+Citric_acid																
+D-Glyceraldehyde_3-phosphate	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+Dihydroxyacetone_phosphate																
+Fructose_1,6-bisphosphate		162935.97333333333	94989.17333333334	977244.4733333333	77200.80333333333			217163.87333333332								
+Fumaric_acid	2648793.2333333343	4700203.413333334	1696830.2833333388	3272290.323333338	2781852.883333333	5501278.903333336		4164455.0233333334								
+Glycine	47009772.21666667	39907004.71666667	45033211.11666667	53735758.81666667	50433589.71666667	49423644.81666667	47224484.31666667	51463639.71666667	21082398.016666666	20528546.116666667	19650482.416666664	19152242.516666666	35768152.41666667	21132662.81666667	21540901.71666667	22233782.916666664
+Hexose	22895288.373333335	21306408.843333334	22860798.743333336	24388352.143333334	23211597.943333335	24961340.313333336	20107687.483333334	23348729.473333333	23812934.643333334	24242428.643333334	22336054.643333334	22906432.643333334	23957348.643333334	23850557.643333334	26889340.643333334	25837975.643333334
+Hexose-phosphate	835186009.5666667	821409929.5666667	646107269.5666667	915363979.5666667	843870509.5666667	818259399.5666667	688064609.5666667	833172229.5666667	1792538.5666666667	1790949.5666666667	1218328.5666666667	1457111.5666666667	2069691.5666666667	1915534.5666666667	1684708.5666666667	1734938.5666666667
+Ile_Leu	1085543492.1333334	1742235058.1333334	1299634032.1333334	1349865884.1333334	1364458522.1333334	1545744172.1333334	1062112159.1333333	1266905279.1333334	2111708660.1333334	2203285239.133333	2037012929.1333334	2023660803.1333334	2311992779.133333	2210982973.133333	2389754947.133333	2339735205.133333
+L-Alanine	21872810.7	15633126.799999999	21168503.7	29253021.3	24452809.599999998	22135270.189999998	24185570.0	26552869.2	1548485.77	1701510.73	1309197.7400000002	1820745.4700000002	1935085.62	1763954.77	1931224.9000000004	2282473.1300000004
+L-Arginine	8520549.7	14932662.400000002	12547158.600000001	8138626.600000001	12848074.600000001	13019470.600000001	8830924.400000002	8993576.3	76704557.1	76562817.1	74284491.1	72162535.1	76269336.1	76291863.1	74652772.1	74944609.1
+L-Asparagine	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	3617749.87	3435790.2	2756887.13	2910381.68	3513705.7	3293797.9	3311566.8	3892175.2
+L-Aspartic_acid	107230174.01	110752624.0	25085218.509999998	40471356.010000005	85804028.48	80919141.14	22993878.009999998	31233419.71								
+L-Glutamic_acid	208787069.89000002	208710973.69	140917516.99	213909793.99	205653213.29000002	195563405.39000002	143617980.99	190106133.99								
+L-Glutamine	27909494.383333337	19726522.883333337	13536124.283333335	17913920.783333335	21753742.583333336	18810914.783333335	12284238.233333334	13716599.583333336	1098507.4833333334							
+L-Histidine	24630581.03333333	30222238.633333333	24647318.53333333	23434135.833333332	30638205.633333333	28288641.633333333	21809509.233333334	22700730.233333334	66137818.63333333	67607708.63333334	63420421.63333333	61687625.63333333	64943662.63333333	66958084.63333333	67970373.63333334	69607422.63333334
+L-Lactic_acid	1610410544.0933332	3445168544.0933332	2919903764.0933332	1983632154.0933332	2199680624.0933332	2542765424.0933332	1843083224.0933332	1902389044.0933332	9322737799.093334	9302697744.093334	9196079213.093334	8719390692.093334	8901197393.093334	8704911808.093334	9400722189.093334	9863466762.093334
+L-Lysine	17306605.213333335	27612732.113333333	25001333.713333335	17627879.713333335	22933518.813333336	23028350.513333336	19929114.283333335	18884558.213333335	117443154.71333334	121027940.71333334	115723826.71333334	115850611.09333333	119744345.59333333	119004184.71333334	118584270.71333334	117133694.71333334
+L-Malic_acid	125152779.87999988	168222179.57999992	85536019.07999992	153093796.07999992	199415044.87999988	209808502.53999996	111048528.07999992	168084959.07999992								
+L-Methionine	76429637.58666667	98173993.58666667	84143963.58666667	90434705.32666667	96650857.58666667	103577905.58666667	76103044.58666667	89472771.65666667	111550662.21666667	114041484.58666667	102236906.58666667	107705253.05666667	118873593.96666667	116214414.89666668	118851523.58666667	123449681.58666667
+L-Phenylalanine	370126893.4666667	588622197.8666667	421973046.1666667	444230948.8666667	473599834.8666667	525083162.8666667	347373413.3666667	417141280.8666667	636990553.8666667	649933157.8666667	607515203.8666667	606053781.8666667	685784788.8666667	665904616.8666667	714741480.8666667	705881485.8666667
+L-Proline	9599080.903333332	9653640.033333333	10532847.213333333	13935072.823333332	10491525.033333333	12535154.033333333	12320625.353333334	13734070.333333334	6433495.033333333	6609824.833333334	5540393.533333333	4245151.533333333	7152407.533333333	6966378.033333333	9268074.033333333	9909521.833333334
+L-Serine	51886840.156666666	55687429.156666666	60878065.156666666	61566987.156666666	60262908.156666666	64646815.156666666	55146456.156666666	61235459.156666666	85713015.15666667	86442185.15666667	80830195.15666667	77735867.15666667	87723164.15666667	84905739.15666667	90456917.15666667	93913089.15666667
+L-Threonine	243276910.8	244437112.15	239746844.79	260796044.54	283078723.92	289486426.92	226742219.26	250548515.2	285717399.29	278341478.49	261018102.39	262753775.69	287841134.94	283733608.09	296904540.79	288355169.29
+L-Tryptophan	6151602.633333334	9627805.133333333	7714718.933333333	5221846.633333334	7438842.333333333	7276985.333333333	6471170.333333333	5357077.223333334	23656601.733333334	24177093.733333334	23401859.733333334	19146747.733333334	22572464.733333334	20887438.733333334	20532655.733333334	21681238.733333334
+L-Tyrosine	324490904.90666664	466056869.90666664	353168947.2066667	378269079.3066666	396880514.3066666	445171883.90666664	296338856.50666666	356363844.90666664	526242843.90666664	541860987.9066666	489041215.90666664	498219681.90666664	554116402.9066666	532238404.90666664	568375310.9066666	574309133.9066666
+L-Valine	307200691.89666665	359678830.37666667	372899784.59666663	366829310.99666667	383925888.89666665	426836324.39666665	308762091.34666663	357769753.69666666	577225423.9966667	578990937.1966666	545903388.7966666	557138987.7966666	606569154.8966666	603361959.6966666	611454433.5966667	621103613.1966666
+Oxoglutaric_acid																
+Phosphoenolpyruvic_acid																
+Pyruvic_acid	944306.6333333333	2936758.6333333333	3644797.6333333333	5342829.633333333	1875311.6333333333	2239637.6333333333	2881917.6333333333	4024104.6333333333	1917193228.8333335	1800847679.2333333	1898133517.2333333	1831205498.1333334	1954504808.4333334	1917436849.8333335	1873057071.1333334	2047218329.5333335
+Succinic_acid																
+cis-Aconitic_acid	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0