Mercurial > repos > iuc > transdecoder
comparison test-data/strand/test.fa.transdecoder.mRNA @ 0:8aef9a17faae draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/transdecoder commit 993ba7c18dcabb15aa76bca2fcc9211a5f58bf1d
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22 AAAGACGGGCGTATTTCTTTGATCGATGAGTTGACGTACGTTCTTGAAGGTGGTAATGCA | |
23 GACAGAGAGCTTGGATCAGTACAATGACTTCAATTACCTTGACACTGCATTGCCCACGTT | |
24 ATTCAACGTCCATCAGGAACCGGACAAATTATTCAGAGTCCTTTTGAACTACTTCATAAT | |
25 TTTACAAATATTCAAGTGTAATTCGTAATATAATCAGTTTTATTCATCTTCGTTGTCTAA | |
26 AACTTTTATGTGCTGCAATATTTGGGGAATCTCGATTTGACATAATGATCCCAGTGCC | |
27 >CUFF.4.1|m.5 CUFF.4.1|g.5 ORF CUFF.4.1|g.5 CUFF.4.1|m.5 type:3prime_partial len:120 (+) CUFF.4.1:199-555(+) | |
28 CTCTTTTTAATATTTTACCGATGAGATTGCTATTATTAGTTACGTTGCTATCTATCGTTG | |
29 GTTACACTAATCAGTTGCTTTCCAACTGACCTCGAAGACGCTCCAGCTGTAATCTGGGTA | |
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33 AATGACGGAGAGATTTCCAGGATAGTTCTACTCAGAACTTTGGTAACTCAATCTGCGGAT | |
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39 CGACGTTAATAAAATATTTAACAAAGCCTTTAAAAAATTAACGATAGCTAGTCAAAGGAA | |
40 GCTTAACGCGTATTCAGCCTCATTAAGACAATCAGGAAGCTTTTTTTTACCATCAGCATA | |
41 TACCTCTAACCCTTTGATTTATTTTTATATCTCGAGATTTCGTTCGTTATTTTATAGGTC | |
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49 TCCTGCCAGTCAAAATATTGTCTTATTACTAGTTAGTGATGGACACACTTCTTACAATAA | |
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51 CTACAACTTTGAGTATGTCAATGTTACTGGCCTCCCTATTCCCGCCGTTTGGTCCAAGAT | |
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53 TCAGGATGCAATTATTACTAATACCCATCTTTCCCTTCAAGACTCCTTTTTGAAACCTGA | |
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55 CGGGGATTTGCGTTATACACCAAGTAATTATAGTTTAAAAGATATCGAAAATCTCATGGT | |
56 CATAATCTCACAGGATCACAATGGATTAAACGCAGGTAGTATCTTGTTCCGTAATTCACC | |
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61 TGAACTATGGCAAAAGTTTTACGCCTTGATTGACTAAGTTGCTTATTCATTATATCCGTC | |
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89 TTTCGAAAGGATGGTGCTTCTGTGATTGTTATAGACCCCATTGCTTCATCGGATATTGTA | |
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126 GCCCGCCGTCTTACAAACTATGAAGAAATACCCCAAAGCGGAATGGATCTGGTTGTTGGA | |
127 TCAGGATGCAATTATTACTAATACCCATCTTTCCCTTCAAGACTCCTTTTTGAAACCTGA | |
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131 TGCTACTGCCTTGTTTTTGGATATTTGGACAGATCCTGTTGTTGCAGAATGTGCGAAAGC | |
132 CAATAATGAACAAGACATGCTTGGATATTTGATTTCTAAGCATTCACAACTTGCTTCGCT | |
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134 ATGGCAAAAAGGTGATTTGGTAATTCACTTTGCTGGATGTTGGGTTGAAAACCGCTGCGA | |
135 TGAACTATGGCAAAAGTTTTACGCCTTGATTGACTAAGTTGCTTATTCATTATATCCGTC | |
136 TGTTTAATTTGTTTGTGTTTTAAAAAATTTTATATATATAAACAAAGCGCCGTATAATTT | |
137 TCCGTCAATCTTCCTTTCTTTATCTGAATCTCTAATAATGTTTACTATTTTTTAATCTTT | |
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141 TTTACCAATGCAATATTGAAGATTGGAATAACAGTTTGGCGTTAATAAATCTTTTTAATA | |
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157 ATTTCACTTTCAAATTTTTTATCTCTTCCGCGTTACAAATTCCTGTTGTTTTCTGTGGTT | |
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163 TTTCGAAAGGATGGTGCTTCTGTGATTGTTATAGACCCCATTGCTTCATCGGATATTGTA | |
164 TACGATACATCCTCATTTAGTCAAGAAATATCTGCTAGATATGAACAAATGTTTTCGAAG | |
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166 ATCATGAAGAACATTGATGATATATTTGATACTCCTTATATGTACCAACAAATTAATACC | |
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170 GCTGGCTTAATGCTTATACGTCCAAGCGAGCTTCATTTTAACCGTATACTTAAAATCGGA | |
171 AGGTTTCCTTATATGTATGAGAATGCCAAAATGATGGAGCAAAGCTTGTTGAATCTTGCA | |
172 TTTTCCTTGGACGGATGGTTTCCCTGGACTCGTCTTGATCCTTATTACAATGGCGTGTGG | |
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174 AGCTCAGAATTTGCACCAGTATATTTAGCTGACTGGTATGCTGCTTATGGCGAAATGCTG | |
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176 CCTTATTTTACAATTAGAAGTTAAAATCTAATTGTATGTTATATATTTGAAAATTTCTTT | |
177 AACTTATTACCATAATTTTATTTTAGACTTGCTATCCTTATTGTCTAAACGCACATTGTT | |
178 TAGATCTCTTCAGCTTTCTTTGATTGCTGGCTATGTATACAACTTTATTACCTGCGTCTG | |
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182 ACTAGCCTGAGGTCCAAACAGGATAGTTTAATTAGTGTTAGACATTAATATTTTTTAGAA | |
183 AAAGATACTTTATGTCTAGAGGGTTGTTTTTGAAGCATTTTATAGAATTTATTCTTTTTT | |
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187 GAATTTCTGAGCTACTTTAGGTAGTAAAATAAGAGGTGAATTGTGAGCCCCGGTTTGCTT | |
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190 CATTGTTAATGTTCGATAGCTTTATGAAGAGAAATCAGCTAGCCTTAATCATGTTTCGTG | |
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192 CTAAAAGAAATTTATCCATTTCTTCAGCTTGTCTAGAAGCTAAAAACTCCCAAAAGTTTC | |
193 CTGCTCTTGATACTTTTGAACCTCGACACATTGGACCTTCTAAAACGGATCAACAATATC | |
194 AATTGGAGTCACTAGGGTATAAGGATTTTGATTCTTTCCTCAAAGATGTAATTCCAGATT | |
195 CTGTGCGAACACCTGAGAGCCAATTGATGGCTTTTGGGTCTGTGAATCCCAACGAAAAAA | |
196 ATCCTCCTGTTAACTACTCCGAAAGCGAATTTACGACTCTGGCAAACAATGTGGCTAATC | |
197 AAAATAAGCTGATTAAGAGCTTCATTGGCATGGGATACTATAATGTAAAGCTTCCTGCTG | |
198 CTATTCAGCGTAATGTTCTTGAGAACCCTGAATGGTATACTCAATATACTCCATATCAGG | |
199 CTGAAATTTCTCAAGGGCGTCTGGAATCTATGATGAATTATCAAACCATGATTGCTGATC | |
200 TCACAGGTCTCAGCATTAGCAATGCTAGTTTACTGGATGAAGGAACTGCTGCTGGAGAAG | |
201 CAATGGTTATGTTGATGGCCAACGACAAAAAGAAGCGCAAAACGTTTTTAGTGGACAAGA | |
202 ATATATACCCCAATACTCTGTCTGTTTTACGTACTCGTGCTTCTGGTTTTGGTATCAAAA | |
203 TTGAATTAGACAATATCACTCCTGAACTCATTACGAAGTCTGCTAAGCATGTTTTTGGTA | |
204 TCTTTGTGCAATACCCAGCGGCGGATGGCTCTATTTTTGACTATGGTCATTTAGCTGCTA | |
205 CAGCACGCTCTTTTAATATGCACGTCGTAGCTGCCACCGATTTACTAGCTCTCACTATTT | |
206 TGAAATCGCCTGGGGAATGGGGTGCCGATGTTGCTGTTGGTTCCACTCAGCGCTTTGGTC | |
207 TGCCCATGGGCTATGGTGGCCCCCATGCCGGATTCTTTGCTTGTAGTGAAGAATTTAAAC | |
208 GAAAGATACCCGGTCGTCTTATTGGTCTCAGCAAAGATCGTTTAGAAAATCCCGCATACC | |
209 GGTTGGCTCTTCAAACAAGAGAACAACATATTCGTCGTGAAAAGGCTACAAGTAACATTT | |
210 GCACGGCTCAAGCTTTGTTAGCCAATATGTCTGCATTCTATGCTATTTACCATGGGCCAA | |
211 ATGGTCTCCAAGAAATTGCAAACCGTATTTACGCTAGTACCTCCTTCTTAAAATCTGCTT | |
212 TGGAATCTTCAGGATATAAAATTGTTAATAAAAGTCATTTCTTTGACACATTAACTATCG | |
213 AAGTTGAGTCGGCTGACAAAGTTCTTGCGAAAGCACTTGATCACGGTTACAATTTAAGAA | |
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215 AAGCTTTGTTTAGCATCTTTAATATAAATAAGAGTGTTGATCAGTATTATATGGAAATTG | |
216 CAACGTCGGAACCTAATGGAAATTCTGCTTCAACAGTCGATAATCTCAGCATTTGTTCTC | |
217 TTCCTGAAAACTTTAGACGAACAACCCTCTATTTACAACATCCCGTGTTTAACAGATACC | |
218 ATTCGGAAACTGAACTTATGCGTTATATTCATCATTTGCAGTCGAAGGATCTATCTTTAG | |
219 CTCATGCCATGACCCCATTGGGTTCGTGCACAATGAAGTTGAATGCTGTCACCGAAATGA | |
220 TGCCAATCACAAATCCATTATTTGCCAACATTCATCCATATGTTCCAGAGGAACAAGCTA | |
221 AAGGTTATCGTCATGTTATCGAAGATTTGCAGTTAATGTTAACGACCATCACCGGCTTTG | |
222 ATGCTGCATGCTTTCAACCAAATTCGGGAGCCGCTGGAGAATACACTGGCTTAAGTGTTA | |
223 TTCGAGCATATCAGCGGTCTATTGGTCAAGGTCATCGCAATATTTGCTTAATTCCTGTTT | |
224 CGGCTCACGGTACTAATCCAGCTTCAGCTGCTATGGCTGGGTTTACTGTTATTCCTGTAA | |
225 AATGTCTCAATAACGGTTATTTGGATATGCAAGACTTAAAAGAAAAGGCCTCTAAACACG | |
226 CCGACAAGTTAGCTGCCTTTATGGTAACTTATCCTAGTACTTTTGGCATTTTTGAGCCTG | |
227 ATGTTAAGGAAGCTTTGGAAGTAATTCACGAACATGGTGGTCAGGTTTACTTTGATGGTG | |
228 CTAACATGAATGCAATGGTTGGTTTATGCAAGGCTGGTGATATTGGTGCTGATGTTTGTC | |
229 ACTTAAATCTTCATAAGACATTTTGCATTCCTCACGGCGGTGGCGGTCCTGGTGTAGGTC | |
230 CTATTTGTGTAAAAAAGCATCTTGCTGATTTCCTACCATCTCATCCTGTAGTTTCATGCG | |
231 GCGGTAAGAATGGTATCACATCTGTTAGCTCTTCTCCTTTTGGCTCTGCTGGTATTTTAC | |
232 CTATCTCATGGGCATACATGAGAATGATGGGACTTGCCGGTTTGCGTGACGCTTCCAAAG | |
233 CCGCTCTGTTAAATGCCAATTATATGGCCAAGCGCCTGTCATCTCATTATAAACTTGTTT | |
234 ACACTAATAAGAACAACCTCTGTGCTCATGAGTTTATTCTAGATGCTCGCGAATTTAAAG | |
235 CTACTGCGGGTGTAGATGCAACTGATATAGCTAAACGTTTGCAAGATTACAGTTTCCATG | |
236 CACCAACTCTTTCCTGGCCTATTGCTAATACACTGATGATTGAGCCTACCGAGTCTGAGA | |
237 GTATGTATGAGATGGACCGCTTCTGTGATGCTTTAATTTCTATTCGACAAGAAATTCGTG | |
238 AAATTGAAGAAGGTCTCCAGCCTAAGGACAATAACCTGCTCGTTAATGCTCCCCACCCTC | |
239 AAAAGGACATTGCATCTGAGAAATGGGATCGTCCTTATACTCGAGAGCGGGCTGTCTATC | |
240 CTGTGCCTCTTTTAAAGGAACGGAAATTCTGGCCTAGCGTTGCTCGATTAGATGATGCGT | |
241 ACGGTGACAAGAACTTATTTTGTACTTGTTCCCCAGTTGTTTAGCGGTCAAAAAGAGCTC | |
242 ACCTGCTAGATTACTTCAACCTTTTCCCAGTTAAGTTCAACCTAATTTTTACTCCATTTG | |
243 GTAGTTCGTTCAACACCAATTCCCACGTTTATATATAGACCAATTTTTTACTACATCTTG | |
244 TTAGACAATTCTTTCCGTTATCACTTTTTCGAATTTTTTTTAATTACGTTTTAATTTTGA | |
245 AGGTTAGAATTATCCTTTGCTGGAACATGAGGTTTTCAACAACCTTTTTTTAATCTGATA | |
246 ATCTAATTTTGCTAGTCATATAATTGCGACTTTCTGATAAAAACATTACCTATACTTTAT | |
247 AAATATGTCGTTTTTAAATATTAACTCCTATGTCTTACTTGCATCCTTGAAATTTACGAC | |
248 TAGAAATTTGGTGCTTTGGATTTTCGTTACATTAAGTAAGGCCATTGAATCGATATGACA | |
249 CGTAAATGTTAAATTTCAAAATATTTTGGAGAGCACCATGTATAATTTAAATATACGAAT | |
250 TTTTTCCTTTAAATTTGTGGTTCTTTTTTAAAAAATATCAAGACGAGTACTCGATTACTC | |
251 GTAAGTATTCAAG | |
252 >CUFF.9.1|m.6 CUFF.9.1|g.6 ORF CUFF.9.1|g.6 CUFF.9.1|m.6 type:complete len:156 (+) CUFF.9.1:173-640(+) | |
253 AGCGAAACAAACAAATCACGTTATAGACGGTGGCAGGGCCATAAAAGGTATTCCCTCGCT | |
254 TTAAAAAGAAACAATGTCAAAAAGCTTTCTTTATAAACTATTGGAAGATTGAAGACATTA | |
255 AAGAAGAAAAGTCCTGCTTACCCTTGGACTTTTTTCAGCAGTTTTCATTGCCATGCCTAT | |
256 CAACCAAAAGTTTTATTCATATCTGGTAAAGCGAAATGGTGGTGAAGGTGAACCTGAATT | |
257 TCGACTTCCTATGGGTTTTATTGGAATCACACTTTTTGAAATAGGAATTTTACTTTTCGG | |
258 TTGGACTGCAAGATATAAGATTTTTTGGTTTGTGCCAACAATTGGATCAGCCATTATGGG | |
259 TGGTGGGTACATTATGACTTCCAATCCCTTAAACATGTATGTGGTAGATTCATATGGAAT | |
260 TTACTCAGCCAGTGCGTCAGCGGGTGTAAAAATATTTCAACTATTATTAGGAGCCATCTT | |
261 TCCATTATTTGCTGAAAGTCTATTTCGTCGACTGAACTACGGATGGGGGTGTACTTTACT | |
262 TGCCTTTATTTTATTAGCTTGTGGCTGTAGTCTTCCAATCTTATTCAAGTATGGAAAACA | |
263 AATTAGAAATCTACGACCATTTGACCCCTCAAAATACTAGTTGATTTAACTGATCAAAGT | |
264 GAGGATTTTCACACACATTTTCAGAGTACTTGGAACGTGCCGAGCTGATTAAAAAACACC | |
265 GGTATTAACAAAAAATTTTATTTATGAAGCAATACGCTATTTCGTTATGAGAAACTTGAT | |
266 TCAATGAAACTATTATAAACCTTA |