annotate test-data/hmm-sites1.txt @ 2:32da07a53d3b draft

"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/transit/ commit f63413d629e4de3c69984b3a96ad8ccfe0d47ada"

#HMM - Sites
# Tn-HMM
#Console: python /Users/delphinel/miniconda3/envs/transit_test/bin/transit hmm transit-in1-rep1_smol.wig,transit-in1-rep2_smol.wig transit-in1_smol.prot hmm_smol
# 
# Mean:	257.30
# Median:	132.00
# Normalization:	TTR
# LOESS Correction:	False
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# pins (est):	0.633445
# Run length (r):	5
# State means:
#    ES:   1.0101   GD:   3.9520   NE: 195.2002   GA: 976.0011
# Self-Transition Prob:
#    ES: -3.5286e-12   GD: -3.5286e-12   NE: -3.5286e-12   GA: -3.5286e-12
# State Emission Parameters (theta):
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# State Distributions:#    ES: 24.47%   GD: 4.70%   NE: 70.82%   GA: 0.00%
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