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comparison test-data/hmm-sites1.txt @ 0:e4f44f327cf1 draft

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"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/transit/ commit f63413d629e4de3c69984b3a96ad8ccfe0d47ada"
author iuc
date Tue, 08 Oct 2019 08:24:46 -0400
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children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:e4f44f327cf1
1 #HMM - Sites
2 # Tn-HMM
3 #Console: python /Users/delphinel/miniconda3/envs/transit_test/bin/transit hmm transit-in1-rep1_smol.wig,transit-in1-rep2_smol.wig transit-in1_smol.prot hmm_smol
4 #
5 # Mean: 257.30
6 # Median: 132.00
7 # Normalization: TTR
8 # LOESS Correction: False
9 # pins (obs): 0.473974
10 # pins (est): 0.633445
11 # Run length (r): 5
12 # State means:
13 # ES: 1.0101 GD: 3.9520 NE: 195.2002 GA: 976.0011
14 # Self-Transition Prob:
15 # ES: -3.5286e-12 GD: -3.5286e-12 NE: -3.5286e-12 GA: -3.5286e-12
16 # State Emission Parameters (theta):
17 # ES: 0.9900 GD: 0.2530 NE: 0.0051 GA: 0.0010
18 # State Distributions:# ES: 24.47% GD: 4.70% NE: 70.82% GA: 0.00%
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