Mercurial > repos > iuc > umi_tools_dedup
view test-data/group_in1.sam @ 3:fda15c620969 draft
planemo upload commit 57e3e460a740aa7aad217c8365527c49e88c9a30
| author | iuc |
|---|---|
| date | Tue, 05 Jun 2018 19:44:14 -0400 |
| parents | a6477bafd522 |
| children |
line wrap: on
line source
@HD VN:1.0 SO:coordinate @PG ID:Bowtie VN:1.1.2 CL:"bowtie --wrapper basic-0 --threads 4 -v 2 -m 10 -a /ifs/mirror/genomes/bowtie/mm9 /dev/fd/63 --sam" @SQ SN:chr10 LN:129993255 @SQ SN:chr11 LN:121843856 @SQ SN:chr12 LN:121257530 @SQ SN:chr13 LN:120284312 @SQ SN:chr14 LN:125194864 @SQ SN:chr15 LN:103494974 @SQ SN:chr16 LN:98319150 @SQ SN:chr17 LN:95272651 @SQ SN:chr18 LN:90772031 @SQ SN:chr19 LN:61342430 @SQ SN:chr1 LN:197195432 @SQ SN:chr2 LN:181748087 @SQ SN:chr3 LN:159599783 @SQ SN:chr4 LN:155630120 @SQ SN:chr5 LN:152537259 @SQ SN:chr6 LN:149517037 @SQ SN:chr7 LN:152524553 @SQ SN:chr8 LN:131738871 @SQ SN:chr9 LN:124076172 @SQ SN:chrM LN:16299 @SQ SN:chrX LN:166650296 @SQ SN:chrY LN:15902555 SRR2057595.10000392_AAGTA 16 chr19 31326011 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:23A33 NM:i:1 UG:i:512 BX:Z:AAGTA SRR2057595.10000468_GCTAT 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:706 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10000704_TGATG 16 chr19 3544146 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:1 BX:Z:TGATG SRR2057595.10000838_TAGTA 0 chr19 10274608 255 34M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:34 NM:i:0 UG:i:324 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10001118_TCTCA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A6 NM:i:1 UG:i:36 BX:Z:TCTCA SRR2057595.10001329_CGGTC 16 chr19 28083193 255 60M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:60 NM:i:0 UG:i:497 BX:Z:CGGTC SRR2057595.10001382_CTGCC 16 chr19 3957282 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:17C1G2 NM:i:2 UG:i:9 BX:Z:CTGCC SRR2057595.10001382_CTGCC 16 chr19 3970897 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:17C1G2 NM:i:2 UG:i:10 BX:Z:CTGCC SRR2057595.10002047_ATTAT 16 chr19 7546213 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:278 BX:Z:ATTAT SRR2057595.10002219_ATCAG 16 chr19 5796783 255 34M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:34 NM:i:0 UG:i:234 BX:Z:ATCAG SRR2057595.10002597_AATTA 16 chr19 50733887 255 64M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:58C0C4 NM:i:2 UG:i:645 BX:Z:AATTA SRR2057595.10003084_GTCTA 16 chr19 4078420 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A44 NM:i:2 UG:i:124 BX:Z:GTCTA SRR2057595.10003230_ACATT 0 chr19 8799370 255 64M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:64 NM:i:0 UG:i:297 BX:Z:ACATT SRR2057595.10003317_CGGCC 16 chr19 52641725 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1C13A4 NM:i:2 UG:i:648 BX:Z:CGGCC SRR2057595.10003567_ATGTC 0 chr19 37052811 255 64M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C52 NM:i:1 UG:i:542 BX:Z:ATGTC SRR2057595.10003576_AATCG 16 chr19 4078303 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:38A21A6 NM:i:2 UG:i:88 BX:Z:AATCG SRR2057595.10003630_GTGTT 16 chr19 4078298 255 52M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A8 NM:i:2 UG:i:45 BX:Z:GTGTT SRR2057595.10003869_TCTTG 16 chr19 4078423 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:19A47 NM:i:1 UG:i:111 BX:Z:TCTTG SRR2057595.1000404_AACTT 16 chr19 4078420 255 64M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A41 NM:i:2 UG:i:55 BX:Z:AACTT SRR2057595.10004161_TTCGC 16 chr19 4078428 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:14A24T27 NM:i:2 UG:i:74 BX:Z:TTCGC SRR2057595.1000475_TCTGG 0 chr19 13129234 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:22T5 NM:i:1 UG:i:383 BX:Z:TCTGG SRR2057595.10004845_GGATA 0 chr19 24394180 255 29M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:11C15T1 NM:i:2 UG:i:481 BX:Z:GGATA SRR2057595.10005100_TTAAA 16 chr19 4785463 255 21M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:21 NM:i:0 UG:i:196 BX:Z:TTAAA SRR2057595.10005761_CTAGA 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:43 BX:Z:CTAGA SRR2057595.10005808_CAGTA 16 chr19 7545872 255 24M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:24 NM:i:0 UG:i:276 BX:Z:CAGTA SRR2057595.10005955_GACAT 16 chr19 4078302 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:39A21A5 NM:i:2 UG:i:82 BX:Z:GACAT SRR2057595.10006011_TCTCA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A6 NM:i:1 UG:i:36 BX:Z:TCTCA SRR2057595.10006546_GCTAC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:97 BX:Z:GCTAC SRR2057595.1000663_ACGCA 16 chr19 51217013 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:3A46A16 NM:i:2 UG:i:647 BX:Z:ACGCA SRR2057595.10006870_GTCCA 16 chr19 4078431 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11A55 NM:i:1 UG:i:107 BX:Z:GTCCA SRR2057595.10006926_GGATA 0 chr19 24394180 255 29M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:11C15T1 NM:i:2 UG:i:481 BX:Z:GGATA SRR2057595.10006986_GCGGA 16 chr19 4078298 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A4 NM:i:1 UG:i:19 BX:Z:GCGGA SRR2057595.10007554_TATTG 0 chr19 13129322 255 28M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:28 NM:i:0 UG:i:404 BX:Z:TATTG SRR2057595.10008217_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10008433_AGAGT 16 chr19 24180225 255 55M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:41C13 NM:i:1 UG:i:474 BX:Z:AGAGT SRR2057595.10008484_GGATC 16 chr19 4078298 255 61M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A17 NM:i:2 UG:i:61 BX:Z:GGATC SRR2057595.10008523_TATGG 0 chr19 13129322 255 56M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:33C5A16 NM:i:2 UG:i:405 BX:Z:TATGG SRR2057595.10008761_AGCTG 16 chr19 4806926 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:201 BX:Z:AGCTG SRR2057595.10009130_CGGCC 16 chr19 52641725 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1C13A4 NM:i:2 UG:i:648 BX:Z:CGGCC SRR2057595.10009213_CCCCG 16 chr19 4078298 255 38M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:35C2 NM:i:1 UG:i:184 BX:Z:CCCCG SRR2057595.10009394_TAGAT 16 chr19 5797239 255 48M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:48 NM:i:0 UG:i:229 BX:Z:TAGAT SRR2057595.10009607_TTGCA 0 chr19 41640185 255 61M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:61 NM:i:0 UG:i:581 BX:Z:TTGCA SRR2057595.1001008_TATCA 16 chr19 60837460 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:691 BX:Z:TATCA SRR2057595.10010444_AGTGC 0 chr19 8798525 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:296 BX:Z:AGTGC SRR2057595.10011106_CGGTC 16 chr19 28083193 255 60M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:60 NM:i:0 UG:i:497 BX:Z:CGGTC SRR2057595.10011603_ATGAA 0 chr19 56177103 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:12G0T6 NM:i:2 UG:i:667 BX:Z:ATGAA SRR2057595.10011612_GTTTC 0 chr19 58015463 255 56M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:56 NM:i:0 UG:i:683 BX:Z:GTTTC SRR2057595.10011924_CCCCG 16 chr19 4078298 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:184 BX:Z:CCCCG SRR2057595.10012143_ATGAA 0 chr19 56007800 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:666 BX:Z:ATGAA SRR2057595.10012487_TGGGT 16 chr19 4917801 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:202 BX:Z:TGGGT SRR2057595.1001256_TGATG 16 chr19 3544146 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:1 BX:Z:TGATG SRR2057595.10013018_GGGGC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:66T0 NM:i:1 UG:i:98 BX:Z:GGGGC SRR2057595.10013156_GTCAA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A13 NM:i:1 UG:i:52 BX:Z:GTCAA SRR2057595.10013642_AATTC 0 chr19 13129322 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:403 BX:Z:AATTC SRR2057595.10013703_ATGTA 0 chr19 39042685 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:558 BX:Z:ATGTA SRR2057595.10014121_ATACC 16 chr19 35673152 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:7T2A10 NM:i:2 UG:i:534 BX:Z:ATACC SRR2057595.1001419_CAGTA 16 chr19 7545872 255 24M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:24 NM:i:0 UG:i:276 BX:Z:CAGTA SRR2057595.10014588_AAGGT 0 chr19 8798514 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:294 BX:Z:AAGGT SRR2057595.10014904_GCGAC 0 chr19 13129553 255 26M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:3A0T21 NM:i:2 UG:i:399 BX:Z:GCGAC SRR2057595.10015153_ATTAT 16 chr19 7546213 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:278 BX:Z:ATTAT SRR2057595.10015867_ATCCG 16 chr19 37369602 255 35M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:35 NM:i:0 UG:i:544 BX:Z:ATCCG SRR2057595.10015949_CTTTC 16 chr19 4078298 255 53M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A9 NM:i:2 UG:i:47 BX:Z:CTTTC SRR2057595.10016080_TATCA 16 chr19 60837460 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:691 BX:Z:TATCA SRR2057595.10016534_ACGCA 16 chr19 51217013 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:3A46A16 NM:i:2 UG:i:647 BX:Z:ACGCA SRR2057595.10016692_TGGAC 16 chr19 4078420 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A44 NM:i:2 UG:i:127 BX:Z:TGGAC SRR2057595.10016737_GTTGT 16 chr19 12564367 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0A12A7 NM:i:2 UG:i:380 BX:Z:GTTGT SRR2057595.10016874_TTGCA 0 chr19 44434953 255 43M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:43 NM:i:0 UG:i:602 BX:Z:TTGCA SRR2057595.10017358_AGATC 16 chr19 24352786 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25C41 NM:i:1 UG:i:479 BX:Z:AGATC SRR2057595.10017433_GGCAG 0 chr19 13129322 255 22M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:22 NM:i:0 UG:i:409 BX:Z:GGCAG SRR2057595.10017742_TAGCG 0 chr19 25429456 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:5A9A4 NM:i:2 UG:i:485 BX:Z:TAGCG SRR2057595.10018091_TAACA 0 chr19 8799023 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:299 BX:Z:TAACA SRR2057595.10018143_CCATC 0 chr19 5008676 255 30M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1A23G4 NM:i:2 UG:i:203 BX:Z:CCATC SRR2057595.10018237_GCTTG 16 chr19 5797471 255 50M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:50 NM:i:0 UG:i:226 BX:Z:GCTTG SRR2057595.10018343_AATTC 0 chr19 13129322 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:403 BX:Z:AATTC SRR2057595.10018510_TTCGT 0 chr19 47167097 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:623 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10018668_GAGAG 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A6 NM:i:1 UG:i:35 BX:Z:GAGAG SRR2057595.10018780_CTAGA 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:43 BX:Z:CTAGA SRR2057595.10018930_TGATT 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:41 BX:Z:TGATT SRR2057595.10019300_TTATA 16 chr19 4078298 255 49M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A5 NM:i:2 UG:i:22 BX:Z:TTATA SRR2057595.10019327_TTATA 16 chr19 4078298 255 49M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A5 NM:i:2 UG:i:22 BX:Z:TTATA SRR2057595.10019367_AGTAT 0 chr19 10600420 255 29M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:29 NM:i:0 UG:i:328 BX:Z:AGTAT SRR2057595.10019428_CTAAT 0 chr19 40194243 255 44M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:5T20A17 NM:i:2 UG:i:562 BX:Z:CTAAT SRR2057595.10019544_CCCCG 16 chr19 4078298 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:184 BX:Z:CCCCG SRR2057595.100195_TTCGC 16 chr19 4078428 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:14A24T27 NM:i:2 UG:i:74 BX:Z:TTCGC SRR2057595.10019604_TCCAG 0 chr19 29662201 255 26M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0C25 NM:i:1 UG:i:509 BX:Z:TCCAG SRR2057595.10019935_ACCGT 16 chr19 15980484 255 29M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:12C16 NM:i:1 UG:i:431 BX:Z:ACCGT SRR2057595.10020101_CTAGA 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:43 BX:Z:CTAGA SRR2057595.10020134_CTTTC 16 chr19 4078298 255 45M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A1 NM:i:1 UG:i:15 BX:Z:CTTTC SRR2057595.10020463_GTCCT 16 chr19 59694502 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:8T0A11 NM:i:2 UG:i:688 BX:Z:GTCCT SRR2057595.10020843_TTAAA 16 chr19 4785463 255 21M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:21 NM:i:0 UG:i:196 BX:Z:TTAAA SRR2057595.10020890_AGTAT 0 chr19 10600420 255 29M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:29 NM:i:0 UG:i:328 BX:Z:AGTAT SRR2057595.10021356_CAGTA 16 chr19 61240266 255 26M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:12C13 NM:i:1 UG:i:697 BX:Z:CAGTA SRR2057595.10021429_CACTG 16 chr19 5798673 255 42M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:42 NM:i:0 UG:i:249 BX:Z:CACTG SRR2057595.10021850_AGTCT 0 chr19 13129558 255 37M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:21A15 NM:i:1 UG:i:398 BX:Z:AGTCT SRR2057595.10022647_TTGTT 16 chr19 61240268 255 24M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:10C13 NM:i:1 UG:i:696 BX:Z:TTGTT SRR2057595.10022675_GTGGA 16 chr19 35902240 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:535 BX:Z:GTGGA SRR2057595.10023366_AGCTT 16 chr19 5799262 255 20M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:20 NM:i:0 UG:i:245 BX:Z:AGCTT SRR2057595.10023594_ATGAA 0 chr19 56007800 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:666 BX:Z:ATGAA SRR2057595.10023941_TACGG 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1T43A21 NM:i:2 UG:i:71 BX:Z:TACGG SRR2057595.10023975_TCGTC 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:704 BX:Z:TCGTC SRR2057595.10024016_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.10024824_ACCGG 16 chr19 10924297 255 49M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:49 NM:i:0 UG:i:336 BX:Z:ACCGG SRR2057595.10025477_AGTAT 0 chr19 10600420 255 29M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:29 NM:i:0 UG:i:328 BX:Z:AGTAT SRR2057595.10025641_CGAAC 0 chr19 13129273 255 36M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:25C1T8 NM:i:2 UG:i:386 BX:Z:CGAAC SRR2057595.10025783_GCATA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A13 NM:i:2 UG:i:53 BX:Z:GCATA SRR2057595.10025842_GATCT 16 chr19 4078433 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:9A57 NM:i:1 UG:i:90 BX:Z:GATCT SRR2057595.10026676_GGATC 16 chr19 4078298 255 61M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A17 NM:i:2 UG:i:61 BX:Z:GGATC SRR2057595.1002669_TATTC 16 chr19 5038295 255 24M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:24 NM:i:0 UG:i:206 BX:Z:TATTC SRR2057595.10027010_TGTTT 16 chr19 50526830 255 51M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:51 NM:i:0 UG:i:643 BX:Z:TGTTT SRR2057595.10027016_GACGT 0 chr19 40194275 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:565 BX:Z:GACGT SRR2057595.10027043_TATGG 0 chr19 13129322 255 56M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:33C5A16 NM:i:2 UG:i:405 BX:Z:TATGG SRR2057595.10027109_GGGGC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:66T0 NM:i:1 UG:i:98 BX:Z:GGGGC SRR2057595.10027286_ATGAA 0 chr19 56177103 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:12G0T6 NM:i:2 UG:i:667 BX:Z:ATGAA SRR2057595.10027736_CCGAT 16 chr19 4078300 255 49M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:40G0A7 NM:i:2 UG:i:44 BX:Z:CCGAT SRR2057595.10027811_AAAGG 16 chr19 23347776 255 34M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:9T24 NM:i:1 UG:i:467 BX:Z:AAAGG SRR2057595.10028205_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10028311_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10029121_AGCCG 0 chr19 8799400 255 33M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:33 NM:i:0 UG:i:302 BX:Z:AGCCG SRR2057595.10029169_GGTTC 16 chr19 56896659 255 23M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0C0A21 NM:i:2 UG:i:674 BX:Z:GGTTC SRR2057595.10029364_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10029373_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.10029475_ACAAA 16 chr19 5688438 255 28M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:28 NM:i:0 UG:i:222 BX:Z:ACAAA SRR2057595.10029622_TCAGG 0 chr19 13129322 255 35M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:33C1 NM:i:1 UG:i:407 BX:Z:TCAGG SRR2057595.10029643_TATGG 0 chr19 13129322 255 56M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:33C5A16 NM:i:2 UG:i:405 BX:Z:TATGG SRR2057595.10030278_TATTG 0 chr19 13129322 255 28M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:28 NM:i:0 UG:i:404 BX:Z:TATTG SRR2057595.10030560_ATACC 16 chr19 35673152 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:7T2A10 NM:i:2 UG:i:534 BX:Z:ATACC SRR2057595.10030639_GCGAC 0 chr19 13129553 255 26M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:3A0T21 NM:i:2 UG:i:399 BX:Z:GCGAC SRR2057595.10031002_AAGGT 0 chr19 8798514 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:294 BX:Z:AAGGT SRR2057595.10031358_TAGTA 16 chr19 61240268 255 27M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:10C16 NM:i:1 UG:i:702 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10031368_TAACA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:32 BX:Z:TAACA SRR2057595.10032378_CAGCA 16 chr19 5801892 255 47M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:47 NM:i:0 UG:i:258 BX:Z:CAGCA SRR2057595.10032451_ACCGT 16 chr19 15980484 255 29M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:12C16 NM:i:1 UG:i:431 BX:Z:ACCGT SRR2057595.10032626_CATAA 0 chr19 13129322 255 35M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:33C1 NM:i:1 UG:i:401 BX:Z:CATAA SRR2057595.10033730_AACTG 16 chr19 40362914 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:571 BX:Z:AACTG SRR2057595.10034125_CTCTT 16 chr19 10761035 255 32M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:32 NM:i:0 UG:i:332 BX:Z:CTCTT SRR2057595.1003424_GGATA 0 chr19 24394180 255 29M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:11C15T1 NM:i:2 UG:i:481 BX:Z:GGATA SRR2057595.10034498_ATGAA 0 chr19 56177103 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:12G0T6 NM:i:2 UG:i:667 BX:Z:ATGAA SRR2057595.10034756_ATGAA 0 chr19 56007800 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:666 BX:Z:ATGAA SRR2057595.10034981_TTCGT 0 chr19 47167097 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:623 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10035130_GGATG 0 chr19 13129322 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:402 BX:Z:GGATG SRR2057595.10035284_TACGT 0 chr19 40194308 255 34M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:3A30 NM:i:1 UG:i:563 BX:Z:TACGT SRR2057595.1003559_CCATA 0 chr19 13129322 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:408 BX:Z:CCATA SRR2057595.10035727_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.1003581_TAACA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:32 BX:Z:TAACA SRR2057595.10036346_AGTCG 0 chr19 17767763 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:10A4A51 NM:i:2 UG:i:440 BX:Z:AGTCG SRR2057595.10036388_CCAAG 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:37 BX:Z:CCAAG SRR2057595.10037180_GGTAG 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:177 BX:Z:GGTAG SRR2057595.10037421_GCCGA 16 chr19 7389994 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:47C0 NM:i:1 UG:i:274 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10037481_CATAA 0 chr19 13129322 255 35M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:33C1 NM:i:1 UG:i:401 BX:Z:CATAA SRR2057595.10037635_TTCGT 0 chr19 47167097 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:623 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10037650_GATGA 0 chr19 48194137 255 59M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:59 NM:i:0 UG:i:635 BX:Z:GATGA SRR2057595.10037690_TCCCG 16 chr19 56004832 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:663 BX:Z:TCCCG SRR2057595.10038156_AAACA 16 chr19 4078299 255 49M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:42A6 NM:i:1 UG:i:33 BX:Z:AAACA SRR2057595.10038276_TAGTA 0 chr19 10274608 255 34M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:34 NM:i:0 UG:i:324 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10038572_TGTTT 0 chr19 41595518 255 38M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25G12 NM:i:1 UG:i:579 BX:Z:TGTTT SRR2057595.10038660_CAGAT 0 chr19 13129299 255 32M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1T18G11 NM:i:2 UG:i:396 BX:Z:CAGAT SRR2057595.1003901_AGCCG 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:36 NM:i:0 UG:i:173 BX:Z:AGCCG SRR2057595.1003905_CCTCA 0 chr19 8798505 255 48M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:48 NM:i:0 UG:i:292 BX:Z:CCTCA SRR2057595.10039161_CTTAC 16 chr19 4078298 255 54M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A10 NM:i:2 UG:i:49 BX:Z:CTTAC SRR2057595.10039249_TCTGT 16 chr19 45885126 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:608 BX:Z:TCTGT SRR2057595.10039623_CGCCG 16 chr19 4078299 255 59M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:42A16 NM:i:1 UG:i:58 BX:Z:CGCCG SRR2057595.1004011_GTCGC 0 chr19 12080548 255 51M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:28C20G1 NM:i:2 UG:i:345 BX:Z:GTCGC SRR2057595.1004011_GTCGC 16 chr19 12084189 255 51M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1C20G28 NM:i:2 UG:i:352 BX:Z:GTCGC SRR2057595.10040530_CCTTG 16 chr19 4078298 255 49M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A5 NM:i:1 UG:i:24 BX:Z:CCTTG SRR2057595.10041125_GACGC 16 chr19 32419974 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:514 BX:Z:GACGC SRR2057595.10041133_ACAGA 16 chr19 4078299 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0C0C20 NM:i:2 UG:i:136 BX:Z:ACAGA SRR2057595.10041495_TGTTT 0 chr19 41595518 255 38M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25G12 NM:i:1 UG:i:579 BX:Z:TGTTT SRR2057595.10041520_TGACA 16 chr19 51217013 255 43M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:3A1C37 NM:i:2 UG:i:646 BX:Z:TGACA SRR2057595.10041577_GTCAA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A13 NM:i:1 UG:i:52 BX:Z:GTCAA SRR2057595.10041629_GATGA 0 chr19 48194137 255 59M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:59 NM:i:0 UG:i:635 BX:Z:GATGA SRR2057595.10041662_GGGGC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:66T0 NM:i:1 UG:i:98 BX:Z:GGGGC SRR2057595.10042115_GACAT 16 chr19 4078302 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:39A21A5 NM:i:2 UG:i:82 BX:Z:GACAT SRR2057595.10042422_TCTGG 0 chr19 13129234 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:22T5 NM:i:1 UG:i:383 BX:Z:TCTGG SRR2057595.1004285_CCAAC 0 chr19 8820047 255 33M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:33 NM:i:0 UG:i:315 BX:Z:CCAAC SRR2057595.10042887_AAAGG 16 chr19 23347776 255 34M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:9T24 NM:i:1 UG:i:467 BX:Z:AAAGG SRR2057595.10043446_CAGAC 0 chr19 5493782 255 41M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:41 NM:i:0 UG:i:218 BX:Z:CAGAC SRR2057595.10043768_GGCGT 16 chr19 5797126 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:233 BX:Z:GGCGT SRR2057595.10043877_TGTTC 16 chr19 44470840 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:605 BX:Z:TGTTC SRR2057595.10043959_GACGT 0 chr19 40194275 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:565 BX:Z:GACGT SRR2057595.10044281_GCCGA 16 chr19 7389994 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:47C0 NM:i:1 UG:i:274 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10044428_TCTAC 0 chr19 8798544 255 51M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:51 NM:i:0 UG:i:288 BX:Z:TCTAC SRR2057595.10044882_TTAAA 16 chr19 4785463 255 21M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:21 NM:i:0 UG:i:196 BX:Z:TTAAA SRR2057595.10044970_GTGGA 16 chr19 35902240 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:535 BX:Z:GTGGA SRR2057595.10045235_CGGCC 16 chr19 52641725 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1C13A4 NM:i:2 UG:i:648 BX:Z:CGGCC SRR2057595.10045410_TGGTC 16 chr19 4078419 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:3T19A43 NM:i:2 UG:i:119 BX:Z:TGGTC SRR2057595.10045875_TTGGC 16 chr19 36085526 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:536 BX:Z:TTGGC SRR2057595.10045996_TAACA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:32 BX:Z:TAACA SRR2057595.10046273_TCCAG 0 chr19 29662201 255 26M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0C25 NM:i:1 UG:i:509 BX:Z:TCCAG SRR2057595.10047157_GTGGA 16 chr19 35902240 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:535 BX:Z:GTGGA SRR2057595.10047180_CCTCA 0 chr19 8798505 255 48M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:48 NM:i:0 UG:i:292 BX:Z:CCTCA SRR2057595.10047439_AATTA 16 chr19 50733890 255 61M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:55C0C4 NM:i:2 UG:i:645 BX:Z:AATTA SRR2057595.10047481_ACGCA 16 chr19 5796074 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:230 BX:Z:ACGCA SRR2057595.10047803_TTCGT 16 chr19 40658723 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:53T13 NM:i:1 UG:i:576 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10047915_TCACA 0 chr19 13129273 255 45M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:25C1T17 NM:i:2 UG:i:388 BX:Z:TCACA SRR2057595.10048372_GTCCC 0 chr19 12347657 255 32M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:32 NM:i:0 UG:i:372 BX:Z:GTCCC SRR2057595.10048372_GTCCC 0 chr19 12348043 255 32M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:32 NM:i:0 UG:i:374 BX:Z:GTCCC SRR2057595.10048372_GTCCC 16 chr19 15035071 255 32M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:29T2 NM:i:1 UG:i:428 BX:Z:GTCCC SRR2057595.10048721_CTAAT 0 chr19 40194243 255 44M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:5T20A17 NM:i:2 UG:i:562 BX:Z:CTAAT SRR2057595.10048861_CTAGA 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:43 BX:Z:CTAGA SRR2057595.10048933_GTCGC 0 chr19 12080548 255 51M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:28C20G1 NM:i:2 UG:i:345 BX:Z:GTCGC SRR2057595.10048933_GTCGC 16 chr19 12084189 255 51M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1C20G28 NM:i:2 UG:i:352 BX:Z:GTCGC SRR2057595.10049852_AAAGG 16 chr19 23347776 255 34M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:9T24 NM:i:1 UG:i:467 BX:Z:AAAGG SRR2057595.10049896_TTCGC 16 chr19 4078428 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:14A24T27 NM:i:2 UG:i:74 BX:Z:TTCGC SRR2057595.10050290_AAAGA 0 chr19 42921257 255 44M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:4G9G29 NM:i:2 UG:i:590 BX:Z:AAAGA SRR2057595.10050342_TGAAC 16 chr19 5798677 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:250 BX:Z:TGAAC SRR2057595.10050663_GACGT 0 chr19 40194275 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:565 BX:Z:GACGT SRR2057595.10051008_TTCGT 16 chr19 40658723 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:53T13 NM:i:1 UG:i:576 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10051043_GCCGA 16 chr19 4078298 255 64M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A20 NM:i:1 UG:i:66 BX:Z:GCCGA SRR2057595.1005223_TTCGC 16 chr19 4078428 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:14A24T27 NM:i:2 UG:i:74 BX:Z:TTCGC SRR2057595.10052510_ATACG 0 chr19 13129421 255 31M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11A19 NM:i:1 UG:i:393 BX:Z:ATACG SRR2057595.10052666_ATCCG 16 chr19 37369602 255 35M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:35 NM:i:0 UG:i:544 BX:Z:ATCCG SRR2057595.10053188_CTTTC 16 chr19 4078298 255 45M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A1 NM:i:1 UG:i:15 BX:Z:CTTTC SRR2057595.10053341_TTGCA 0 chr19 41640185 255 61M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:61 NM:i:0 UG:i:581 BX:Z:TTGCA SRR2057595.10053375_ATGAA 0 chr19 56007800 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:666 BX:Z:ATGAA SRR2057595.10053481_CTCCG 0 chr19 11195966 255 44M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0T43 NM:i:1 UG:i:338 BX:Z:CTCCG SRR2057595.10053518_AATCG 16 chr19 4078303 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:38A21A6 NM:i:2 UG:i:88 BX:Z:AATCG SRR2057595.1005354_GAGAG 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A6 NM:i:1 UG:i:35 BX:Z:GAGAG SRR2057595.1005379_CCAAC 0 chr19 8820047 255 33M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:33 NM:i:0 UG:i:315 BX:Z:CCAAC SRR2057595.10053918_AGTAT 0 chr19 10600420 255 29M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:29 NM:i:0 UG:i:328 BX:Z:AGTAT SRR2057595.10053970_TATGG 0 chr19 13129322 255 56M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:33C5A16 NM:i:2 UG:i:405 BX:Z:TATGG SRR2057595.10054046_ATAAA 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:175 BX:Z:ATAAA SRR2057595.10054497_AAAGA 0 chr19 42921257 255 44M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:4G9G29 NM:i:2 UG:i:590 BX:Z:AAAGA SRR2057595.10055409_TAGAC 0 chr19 23806079 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:41T25 NM:i:1 UG:i:468 BX:Z:TAGAC SRR2057595.10055838_CAGAC 0 chr19 5493782 255 41M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:41 NM:i:0 UG:i:218 BX:Z:CAGAC SRR2057595.10055912_TCTCA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A6 NM:i:1 UG:i:36 BX:Z:TCTCA SRR2057595.10055955_AGGAT 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:70 BX:Z:AGGAT SRR2057595.10056203_TGCAA 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:703 BX:Z:TGCAA SRR2057595.10056249_TCAGG 0 chr19 13129322 255 35M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:33C1 NM:i:1 UG:i:407 BX:Z:TCAGG SRR2057595.10057756_CGAAC 0 chr19 13129273 255 36M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:25C1T8 NM:i:2 UG:i:386 BX:Z:CGAAC SRR2057595.10058241_TTAAA 16 chr19 4785463 255 21M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:21 NM:i:0 UG:i:196 BX:Z:TTAAA SRR2057595.10058572_TCTTA 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:705 BX:Z:TCTTA SRR2057595.10058802_TAGTA 0 chr19 10274608 255 34M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:9C24 NM:i:1 UG:i:324 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10058946_AGCCA 0 chr19 43786861 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:594 BX:Z:AGCCA SRR2057595.10059254_GGTTC 16 chr19 56896659 255 23M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0C0A21 NM:i:2 UG:i:674 BX:Z:GGTTC SRR2057595.10059642_CTAGC 16 chr19 4078298 255 62M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A18 NM:i:1 UG:i:63 BX:Z:CTAGC SRR2057595.10060193_ATAGA 0 chr19 38795805 255 62M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:44C1A15 NM:i:2 UG:i:553 BX:Z:ATAGA SRR2057595.10060270_ATGGT 16 chr19 12086074 255 45M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:19T25 NM:i:1 UG:i:361 BX:Z:ATGGT SRR2057595.10060437_TATAT 0 chr19 40194298 255 25M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:13A11 NM:i:1 UG:i:567 BX:Z:TATAT SRR2057595.10060447_CTTAC 16 chr19 4078298 255 54M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A10 NM:i:2 UG:i:49 BX:Z:CTTAC SRR2057595.10060568_GACGC 16 chr19 32419974 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:514 BX:Z:GACGC SRR2057595.10060757_AGCCG 16 chr19 4078299 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:11 BX:Z:AGCCG SRR2057595.10060776_TCTTG 16 chr19 4078423 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:19A47 NM:i:1 UG:i:111 BX:Z:TCTTG SRR2057595.10061005_AGCCG 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:36 NM:i:0 UG:i:173 BX:Z:AGCCG SRR2057595.10061018_CACTG 16 chr19 5798673 255 42M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:42 NM:i:0 UG:i:249 BX:Z:CACTG SRR2057595.10061192_ATCCG 16 chr19 37369602 255 35M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:35 NM:i:0 UG:i:544 BX:Z:ATCCG SRR2057595.10061371_GCCTG 16 chr19 4078301 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:40A21A4 NM:i:2 UG:i:75 BX:Z:GCCTG SRR2057595.10061403_AAGTA 16 chr19 31326011 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:23A33 NM:i:1 UG:i:512 BX:Z:AAGTA SRR2057595.10061424_GCTAC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:97 BX:Z:GCTAC SRR2057595.10061535_ATCAA 0 chr19 20547357 255 23M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:23 NM:i:0 UG:i:452 BX:Z:ATCAA SRR2057595.10061661_ACAAA 16 chr19 5688438 255 28M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:28 NM:i:0 UG:i:222 BX:Z:ACAAA SRR2057595.10061745_ATATA 0 chr19 13129330 255 22M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0T21 NM:i:1 UG:i:422 BX:Z:ATATA SRR2057595.10062673_ATACC 16 chr19 35673152 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:7T2A10 NM:i:2 UG:i:534 BX:Z:ATACC SRR2057595.10062948_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.10063079_GTCTA 16 chr19 4078420 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A44 NM:i:2 UG:i:124 BX:Z:GTCTA SRR2057595.10063521_AGATG 16 chr19 61240273 255 22M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:5C16 NM:i:1 UG:i:707 BX:Z:AGATG SRR2057595.10064036_CAGCA 16 chr19 5801892 255 47M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:47 NM:i:0 UG:i:258 BX:Z:CAGCA SRR2057595.1006417_GATCA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:34 BX:Z:GATCA SRR2057595.10065256_AGGGG 0 chr19 13129331 255 37M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:24C5A6 NM:i:2 UG:i:423 BX:Z:AGGGG SRR2057595.10065460_ATGGT 0 chr19 8798504 255 50M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:50 NM:i:0 UG:i:291 BX:Z:ATGGT SRR2057595.10065656_GATGA 0 chr19 48194137 255 59M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:59 NM:i:0 UG:i:635 BX:Z:GATGA SRR2057595.10065671_ATGAT 16 chr19 61240306 255 36M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:16A4T14 NM:i:2 UG:i:716 BX:Z:ATGAT SRR2057595.10065713_ATGTC 0 chr19 37052811 255 64M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C52 NM:i:1 UG:i:542 BX:Z:ATGTC SRR2057595.10065896_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10066051_AACTT 16 chr19 4078420 255 64M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A41 NM:i:2 UG:i:55 BX:Z:AACTT SRR2057595.10066334_AGCCA 0 chr19 47324044 255 46M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:46 NM:i:0 UG:i:627 BX:Z:AGCCA SRR2057595.10066646_GGTTC 16 chr19 56896659 255 23M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0C0A21 NM:i:2 UG:i:674 BX:Z:GGTTC SRR2057595.10066775_GTCAA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A13 NM:i:1 UG:i:52 BX:Z:GTCAA SRR2057595.10066849_GGTCG 0 chr19 53686815 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:651 BX:Z:GGTCG SRR2057595.10066970_TAACA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:32 BX:Z:TAACA SRR2057595.10067118_TGATT 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:41 BX:Z:TGATT SRR2057595.10067277_TAGAC 0 chr19 23806079 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:41T25 NM:i:1 UG:i:468 BX:Z:TAGAC SRR2057595.10067458_TACGG 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1T43A21 NM:i:2 UG:i:71 BX:Z:TACGG SRR2057595.10067669_GCTTG 16 chr19 5797471 255 50M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:50 NM:i:0 UG:i:226 BX:Z:GCTTG SRR2057595.10067834_GACGT 0 chr19 40194275 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:565 BX:Z:GACGT SRR2057595.1006784_GTCCA 16 chr19 4078431 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11A55 NM:i:1 UG:i:107 BX:Z:GTCCA SRR2057595.10067875_GCCGA 16 chr19 4078298 255 64M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A20 NM:i:1 UG:i:66 BX:Z:GCCGA SRR2057595.1006816_GATCA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:34 BX:Z:GATCA SRR2057595.10068282_TAACA 0 chr19 8799023 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:299 BX:Z:TAACA SRR2057595.1006840_TTAAA 16 chr19 4785463 255 21M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:21 NM:i:0 UG:i:196 BX:Z:TTAAA SRR2057595.10068743_TTGGC 16 chr19 36085526 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:536 BX:Z:TTGGC SRR2057595.10068873_CTTTT 0 chr19 56656380 255 54M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:54 NM:i:0 UG:i:669 BX:Z:CTTTT SRR2057595.10068999_AAGTA 16 chr19 31326011 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:23A33 NM:i:1 UG:i:512 BX:Z:AAGTA SRR2057595.10069428_AACGC 16 chr19 4078298 255 51M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A7 NM:i:1 UG:i:42 BX:Z:AACGC SRR2057595.10070094_TCTTA 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:705 BX:Z:TCTTA SRR2057595.10070448_GGATC 16 chr19 4078298 255 61M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A17 NM:i:2 UG:i:61 BX:Z:GGATC SRR2057595.1007050_TATAC 0 chr19 8799026 255 60M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:60 NM:i:0 UG:i:301 BX:Z:TATAC SRR2057595.10070871_GAAGT 16 chr19 27988575 255 52M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:52 NM:i:0 UG:i:494 BX:Z:GAAGT SRR2057595.10071095_TGCAA 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:703 BX:Z:TGCAA SRR2057595.10071228_CTAGC 16 chr19 4078298 255 62M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A18 NM:i:1 UG:i:63 BX:Z:CTAGC SRR2057595.10071424_CATTT 0 chr19 49059158 255 49M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:30A7A10 NM:i:2 UG:i:639 BX:Z:CATTT SRR2057595.10071487_CACTG 16 chr19 5798673 255 42M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:42 NM:i:0 UG:i:249 BX:Z:CACTG SRR2057595.10072063_CAGCA 16 chr19 5801892 255 47M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:47 NM:i:0 UG:i:258 BX:Z:CAGCA SRR2057595.10072068_GCCGA 16 chr19 4078298 255 64M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A20 NM:i:1 UG:i:66 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10072172_TCTGC 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:36 NM:i:0 UG:i:178 BX:Z:TCTGC SRR2057595.10072478_AGCTT 16 chr19 5799262 255 20M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:20 NM:i:0 UG:i:245 BX:Z:AGCTT SRR2057595.10072601_TTGGC 16 chr19 4078302 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:39A21A5 NM:i:2 UG:i:79 BX:Z:TTGGC SRR2057595.10072627_AATAC 0 chr19 12046308 255 33M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:23A9 NM:i:1 UG:i:343 BX:Z:AATAC SRR2057595.10072909_TCCAG 0 chr19 29662201 255 26M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0C25 NM:i:1 UG:i:509 BX:Z:TCCAG SRR2057595.10072922_TGATT 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:41 BX:Z:TGATT SRR2057595.10072936_TAGTA 16 chr19 61240268 255 27M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:10C16 NM:i:1 UG:i:702 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10073020_TGTTT 0 chr19 41595518 255 38M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25G12 NM:i:1 UG:i:579 BX:Z:TGTTT SRR2057595.10073067_CGTCT 0 chr19 13129329 255 35M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:26C5A2 NM:i:2 UG:i:421 BX:Z:CGTCT SRR2057595.10073092_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.1007313_ACATT 0 chr19 8799370 255 64M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:64 NM:i:0 UG:i:297 BX:Z:ACATT SRR2057595.10073348_CCTTG 16 chr19 4078298 255 49M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A5 NM:i:1 UG:i:24 BX:Z:CCTTG SRR2057595.10073515_GGATC 16 chr19 4078298 255 61M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A17 NM:i:2 UG:i:61 BX:Z:GGATC SRR2057595.10073784_TGATG 16 chr19 3544146 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:1 BX:Z:TGATG SRR2057595.10073896_TTCGT 0 chr19 36922761 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:5C51 NM:i:1 UG:i:538 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10073986_ATCTC 0 chr19 21910875 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:458 BX:Z:ATCTC SRR2057595.10074218_AGTGC 0 chr19 8798525 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:296 BX:Z:AGTGC SRR2057595.10074241_AAACA 16 chr19 4078299 255 49M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:42A6 NM:i:1 UG:i:33 BX:Z:AAACA SRR2057595.10074267_GCTAC 0 chr19 13129281 255 31M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:17C1T11 NM:i:2 UG:i:391 BX:Z:GCTAC SRR2057595.10074447_ATTAT 16 chr19 7546213 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:278 BX:Z:ATTAT SRR2057595.10074845_GTTGT 16 chr19 12564367 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0A12A7 NM:i:2 UG:i:380 BX:Z:GTTGT SRR2057595.10075349_ATGAT 16 chr19 61240306 255 36M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:16A4T14 NM:i:2 UG:i:716 BX:Z:ATGAT SRR2057595.10075433_GGGGC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:66T0 NM:i:1 UG:i:98 BX:Z:GGGGC SRR2057595.10075536_GCATA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A13 NM:i:2 UG:i:53 BX:Z:GCATA SRR2057595.10075745_GTATT 0 chr19 47323072 255 47M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0C46 NM:i:1 UG:i:628 BX:Z:GTATT SRR2057595.10075769_ATTAT 16 chr19 7546213 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:278 BX:Z:ATTAT SRR2057595.10075776_GCTAC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:97 BX:Z:GCTAC SRR2057595.10075922_AATAC 0 chr19 12046308 255 33M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:23A9 NM:i:1 UG:i:343 BX:Z:AATAC SRR2057595.10075965_GCATA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A13 NM:i:2 UG:i:53 BX:Z:GCATA SRR2057595.10076063_AAATC 16 chr19 47891298 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:4C11C4 NM:i:2 UG:i:633 BX:Z:AAATC SRR2057595.10076706_TTGCA 0 chr19 44434953 255 43M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:43 NM:i:0 UG:i:602 BX:Z:TTGCA SRR2057595.1007711_TCCAG 0 chr19 29662201 255 26M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0C25 NM:i:1 UG:i:509 BX:Z:TCCAG SRR2057595.10077136_ATGTC 0 chr19 37052811 255 64M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C52 NM:i:1 UG:i:542 BX:Z:ATGTC SRR2057595.10077390_GATCA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:34 BX:Z:GATCA SRR2057595.10077550_GATCA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:34 BX:Z:GATCA SRR2057595.10078118_AGCGC 16 chr19 27464368 255 52M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:52 NM:i:0 UG:i:493 BX:Z:AGCGC SRR2057595.10078219_GCATA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A13 NM:i:2 UG:i:53 BX:Z:GCATA SRR2057595.10078231_ATGAT 16 chr19 61240306 255 36M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:16A4T14 NM:i:2 UG:i:716 BX:Z:ATGAT SRR2057595.10078601_AATGC 0 chr19 8798773 255 42M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:42 NM:i:0 UG:i:306 BX:Z:AATGC SRR2057595.10079068_TTGGC 16 chr19 4078302 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:39A21A5 NM:i:2 UG:i:79 BX:Z:TTGGC SRR2057595.10079368_GAGTG 0 chr19 8798502 255 51M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:51 NM:i:0 UG:i:289 BX:Z:GAGTG SRR2057595.10079546_CGGCC 16 chr19 52641725 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1C13A4 NM:i:2 UG:i:648 BX:Z:CGGCC SRR2057595.10079549_TCTTA 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:705 BX:Z:TCTTA SRR2057595.10079658_CGAAC 0 chr19 13129273 255 36M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:25C1T8 NM:i:2 UG:i:386 BX:Z:CGAAC SRR2057595.10080019_TATGG 0 chr19 13129322 255 56M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:33C5A16 NM:i:2 UG:i:405 BX:Z:TATGG SRR2057595.10080347_GCAGA 0 chr19 8799844 255 53M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:53 NM:i:0 UG:i:309 BX:Z:GCAGA SRR2057595.10080699_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.10080920_GCTAT 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:706 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10080946_TATAT 0 chr19 40194298 255 25M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:13A11 NM:i:1 UG:i:567 BX:Z:TATAT SRR2057595.10081070_CGCCG 16 chr19 4078299 255 59M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:42A16 NM:i:1 UG:i:58 BX:Z:CGCCG SRR2057595.10081274_AACGC 16 chr19 4078298 255 51M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A7 NM:i:1 UG:i:42 BX:Z:AACGC SRR2057595.10081914_AATAC 16 chr19 4078420 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A44 NM:i:2 UG:i:125 BX:Z:AATAC SRR2057595.10082001_TCTTG 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:705 BX:Z:TCTTA SRR2057595.1008200_TTCGC 16 chr19 4078428 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:14A24T27 NM:i:2 UG:i:74 BX:Z:TTCGC SRR2057595.1008230_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10082591_ACAGA 16 chr19 4078299 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0C0C20 NM:i:2 UG:i:136 BX:Z:ACAGA SRR2057595.10082733_CCTTT 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:180 BX:Z:CCTTT SRR2057595.1008274_ATCAA 0 chr19 20547357 255 23M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:23 NM:i:0 UG:i:452 BX:Z:ATCAA SRR2057595.100827_ACAGA 16 chr19 4078299 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0C0C20 NM:i:2 UG:i:136 BX:Z:ACAGA SRR2057595.10082802_GCCGT 0 chr19 30861987 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:3C2T13 NM:i:2 UG:i:511 BX:Z:GCCGT SRR2057595.10082815_CCTCA 0 chr19 8798505 255 48M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:48 NM:i:0 UG:i:292 BX:Z:CCTCA SRR2057595.1008318_CTATT 16 chr19 56874049 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:672 BX:Z:CTATT SRR2057595.10084177_ATCAA 0 chr19 20547357 255 23M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:23 NM:i:0 UG:i:452 BX:Z:ATCAA SRR2057595.1008424_GATAA 16 chr19 47057431 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:6T10T4 NM:i:2 UG:i:622 BX:Z:GATAA SRR2057595.10084297_CTTCA 0 chr19 13129483 255 30M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:6G16A6 NM:i:2 UG:i:382 BX:Z:CTTCA SRR2057595.10084300_AGCCG 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:36 NM:i:0 UG:i:173 BX:Z:AGCCG SRR2057595.10084403_GACGT 0 chr19 40194275 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:565 BX:Z:GACGT SRR2057595.10084641_ACGCA 16 chr19 51217013 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:3A46A16 NM:i:2 UG:i:647 BX:Z:ACGCA SRR2057595.10084680_CCCCG 16 chr19 4078298 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:184 BX:Z:CCCCG SRR2057595.1008532_CCGCG 0 chr19 8991126 255 28M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:28 NM:i:0 UG:i:318 BX:Z:CCGCG SRR2057595.1008533_AAGGT 0 chr19 8798514 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:294 BX:Z:AAGGT SRR2057595.10085421_CGAGA 0 chr19 6375345 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:10C5G4 NM:i:2 UG:i:265 BX:Z:CGAGA SRR2057595.10085567_TATTC 16 chr19 5038295 255 24M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:24 NM:i:0 UG:i:206 BX:Z:TATTC SRR2057595.10085614_AATTA 16 chr19 50733889 255 62M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:56C0C4 NM:i:2 UG:i:645 BX:Z:AATTA SRR2057595.10085673_GAAGT 16 chr19 8360277 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:10A52A3 NM:i:2 UG:i:285 BX:Z:GAAGT SRR2057595.10086547_TTCGT 0 chr19 47167097 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:623 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10086746_TCTTC 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:27A8 NM:i:1 UG:i:178 BX:Z:TCTGC SRR2057595.1008697_TTGCA 0 chr19 44434953 255 43M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:43 NM:i:0 UG:i:602 BX:Z:TTGCA SRR2057595.10087261_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.10087496_CACTG 16 chr19 5798673 255 42M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:42 NM:i:0 UG:i:249 BX:Z:CACTG SRR2057595.10087607_ATACG 0 chr19 13129421 255 31M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11A19 NM:i:1 UG:i:393 BX:Z:ATACG SRR2057595.10087628_GGCGT 16 chr19 5797126 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:233 BX:Z:GGCGT SRR2057595.10087735_TCTGC 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:36 NM:i:0 UG:i:178 BX:Z:TCTGC SRR2057595.10088373_AAAGG 16 chr19 23347776 255 34M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:9T24 NM:i:1 UG:i:467 BX:Z:AAAGG SRR2057595.1008837_GCGGA 16 chr19 4078298 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A4 NM:i:1 UG:i:19 BX:Z:GCGGA SRR2057595.10088477_AGTCG 0 chr19 17767763 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:10A4A51 NM:i:2 UG:i:440 BX:Z:AGTCG SRR2057595.1008854_TTCGT 0 chr19 47167097 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:623 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10088899_CATAA 0 chr19 13129322 255 35M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:33C1 NM:i:1 UG:i:401 BX:Z:CATAA SRR2057595.10088953_ATACC 16 chr19 35673152 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:7T2A10 NM:i:2 UG:i:534 BX:Z:ATACC SRR2057595.10088992_TATTC 16 chr19 5038295 255 24M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:24 NM:i:0 UG:i:206 BX:Z:TATTC SRR2057595.10089226_AAACA 16 chr19 4078299 255 49M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:42A6 NM:i:1 UG:i:33 BX:Z:AAACA SRR2057595.10089360_ACCTG 16 chr19 4078420 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A44 NM:i:2 UG:i:126 BX:Z:ACCTG SRR2057595.10089372_CAAAC 0 chr19 34304620 255 34M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:34 NM:i:0 UG:i:531 BX:Z:CAAAC SRR2057595.10089645_CATTT 0 chr19 49059158 255 49M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:30A7A10 NM:i:2 UG:i:639 BX:Z:CATTT SRR2057595.10089847_GCCGA 16 chr19 7389994 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:47C0 NM:i:1 UG:i:274 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10090471_ATTCT 0 chr19 3576314 255 23M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:16T5T0 NM:i:2 UG:i:5 BX:Z:ATTCT SRR2057595.10090859_TTGCA 0 chr19 44434953 255 43M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:43 NM:i:0 UG:i:602 BX:Z:TTGCA SRR2057595.10090930_CCTCG 0 chr19 13129273 255 46M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:25C1T18 NM:i:2 UG:i:387 BX:Z:CCTCG SRR2057595.10090939_GATGG 0 chr19 44417644 255 23M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:15T4C2 NM:i:2 UG:i:601 BX:Z:GATGG SRR2057595.10091088_TCGCT 16 chr19 4078298 255 64M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A20 NM:i:2 UG:i:67 BX:Z:TCGCT SRR2057595.10091189_AGCAT 0 chr19 36976220 255 56M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:56 NM:i:0 UG:i:539 BX:Z:AGCAT SRR2057595.10091303_GTCCA 16 chr19 4078431 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11A55 NM:i:1 UG:i:107 BX:Z:GTCCA SRR2057595.10091425_AGCTT 16 chr19 5799262 255 20M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:20 NM:i:0 UG:i:245 BX:Z:AGCTT SRR2057595.10091775_TAGTA 0 chr19 10274608 255 34M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:34 NM:i:0 UG:i:324 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10091818_TCTGC 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:36 NM:i:0 UG:i:178 BX:Z:TCTGC SRR2057595.10092607_CATAA 0 chr19 13129322 255 35M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:33C1 NM:i:1 UG:i:401 BX:Z:CATAA SRR2057595.10092724_CTGAT 0 chr19 42626015 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:587 BX:Z:CTGAT SRR2057595.10092926_GCTAC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:97 BX:Z:GCTAC SRR2057595.1009294_CCAAC 0 chr19 8820047 255 33M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:33 NM:i:0 UG:i:315 BX:Z:CCAAC SRR2057595.10093528_ATACG 0 chr19 13129421 255 31M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11A19 NM:i:1 UG:i:393 BX:Z:ATACG SRR2057595.1009371_GCGGA 16 chr19 4078298 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A4 NM:i:1 UG:i:19 BX:Z:GCGGA SRR2057595.10094012_GTGGA 16 chr19 35902240 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:535 BX:Z:GTGGA SRR2057595.1009415_TTAAA 16 chr19 4785463 255 21M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:21 NM:i:0 UG:i:196 BX:Z:TTAAA SRR2057595.10094858_ATTAT 0 chr19 4755116 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42C11T12 NM:i:2 UG:i:195 BX:Z:ATTAT SRR2057595.10094990_TCCAG 0 chr19 29662201 255 26M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0C25 NM:i:1 UG:i:509 BX:Z:TCCAG SRR2057595.10095705_AACAG 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:174 BX:Z:AACAG SRR2057595.10095797_CGTCT 0 chr19 13129329 255 35M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:26C5A2 NM:i:2 UG:i:421 BX:Z:CGTCT SRR2057595.10095837_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10096002_AGCCG 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:36 NM:i:0 UG:i:173 BX:Z:AGCCG SRR2057595.10096480_TTCGT 16 chr19 40658723 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:53T13 NM:i:1 UG:i:576 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10096536_GCCGA 16 chr19 7389994 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:47C0 NM:i:1 UG:i:274 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10096738_CTAGA 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:43 BX:Z:CTAGA SRR2057595.10096905_AATTA 16 chr19 50733890 255 61M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:55C0C4 NM:i:2 UG:i:645 BX:Z:AATTA SRR2057595.10096962_TGTTT 0 chr19 41595518 255 38M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25G12 NM:i:1 UG:i:579 BX:Z:TGTTT SRR2057595.10096976_AGATC 16 chr19 24352786 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25C41 NM:i:1 UG:i:479 BX:Z:AGATC SRR2057595.10097042_CACTG 16 chr19 5798673 255 42M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:42 NM:i:0 UG:i:249 BX:Z:CACTG SRR2057595.10097390_CCATC 0 chr19 5008676 255 30M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1A23G4 NM:i:2 UG:i:203 BX:Z:CCATC SRR2057595.10097856_TATGG 0 chr19 13129322 255 56M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:33C5A16 NM:i:2 UG:i:405 BX:Z:TATGG SRR2057595.10097927_GCATA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A13 NM:i:2 UG:i:53 BX:Z:GCATA SRR2057595.10098678_CTCCG 0 chr19 11195966 255 43M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0T42 NM:i:1 UG:i:338 BX:Z:CTCCG SRR2057595.10098703_TAGTA 0 chr19 10274608 255 34M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:34 NM:i:0 UG:i:324 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10098714_GCAGG 0 chr19 47903921 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T0T17 NM:i:2 UG:i:634 BX:Z:GCAGG SRR2057595.10098837_AATTA 16 chr19 50733888 255 63M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:57C0C4 NM:i:2 UG:i:645 BX:Z:AATTA SRR2057595.10098952_AAATC 16 chr19 47891298 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:4C11C4 NM:i:2 UG:i:633 BX:Z:AAATC SRR2057595.10098_GCCGA 16 chr19 7389994 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:47C0 NM:i:1 UG:i:274 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10099454_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10099862_TGATT 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:41 BX:Z:TGATT SRR2057595.10099876_AGATC 16 chr19 24352786 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25C41 NM:i:1 UG:i:479 BX:Z:AGATC SRR2057595.10100225_GAAGT 16 chr19 8360277 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:10A52A3 NM:i:2 UG:i:285 BX:Z:GAAGT SRR2057595.10100273_CCTCG 0 chr19 13129273 255 46M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:25C1T18 NM:i:2 UG:i:387 BX:Z:CCTCG SRR2057595.10100361_AGAAT 16 chr19 24246487 255 44M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:44 NM:i:0 UG:i:476 BX:Z:AGAAT SRR2057595.10100419_TCTTG 16 chr19 4078423 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:19A47 NM:i:1 UG:i:111 BX:Z:TCTTG SRR2057595.10100887_ATACC 16 chr19 35673152 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:7T2A10 NM:i:2 UG:i:534 BX:Z:ATACC SRR2057595.10101063_ATGAA 0 chr19 56007800 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:666 BX:Z:ATGAA SRR2057595.10101443_TATAT 0 chr19 40194298 255 25M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:13A11 NM:i:1 UG:i:567 BX:Z:TATAT SRR2057595.10101541_TCTAC 0 chr19 8798544 255 51M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:51 NM:i:0 UG:i:288 BX:Z:TCTAC SRR2057595.10101549_AAAGA 0 chr19 42921257 255 44M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:4G9G29 NM:i:2 UG:i:590 BX:Z:AAAGA SRR2057595.10102419_GGGGC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:66T0 NM:i:1 UG:i:98 BX:Z:GGGGC SRR2057595.10102630_CTATT 16 chr19 56874049 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:672 BX:Z:CTATT SRR2057595.10102792_GCTAA 16 chr19 32596026 255 56M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:56 NM:i:0 UG:i:517 BX:Z:GCTAA SRR2057595.10102901_AACTT 16 chr19 4078420 255 64M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A41 NM:i:2 UG:i:55 BX:Z:AACTT SRR2057595.10102918_ATTAT 16 chr19 7546213 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:278 BX:Z:ATTAT SRR2057595.10103451_GATCA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:34 BX:Z:GATCA SRR2057595.10103512_TCTTG 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:705 BX:Z:TCTTA SRR2057595.10103749_ATCAA 0 chr19 20547357 255 23M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:23 NM:i:0 UG:i:452 BX:Z:ATCAA SRR2057595.10103791_ACGAC 16 chr19 4078298 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:186 BX:Z:ACGAC SRR2057595.10104373_ACAGA 16 chr19 4078299 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0C0C20 NM:i:2 UG:i:136 BX:Z:ACAGA SRR2057595.10104410_GCAGG 16 chr19 8963035 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:317 BX:Z:GCAGG SRR2057595.10104500_GTATT 0 chr19 47323072 255 47M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0C46 NM:i:1 UG:i:628 BX:Z:GTATT SRR2057595.10105258_CGCCG 16 chr19 4078299 255 59M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:42A16 NM:i:1 UG:i:58 BX:Z:CGCCG SRR2057595.10105817_GCGGA 16 chr19 4078298 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A4 NM:i:1 UG:i:19 BX:Z:GCGGA SRR2057595.10105818_AGCCG 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0C35 NM:i:1 UG:i:173 BX:Z:AGCCG SRR2057595.10106002_TTCGC 16 chr19 4078428 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:14A24T27 NM:i:2 UG:i:74 BX:Z:TTCGC SRR2057595.10106174_CTGCC 16 chr19 3957282 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:17C1G2 NM:i:2 UG:i:9 BX:Z:CTGCC SRR2057595.10106174_CTGCC 16 chr19 3970897 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:17C1G2 NM:i:2 UG:i:10 BX:Z:CTGCC SRR2057595.10106212_AGCGC 16 chr19 27464368 255 52M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:52 NM:i:0 UG:i:493 BX:Z:AGCGC SRR2057595.10106528_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.1010661_ATTAT 16 chr19 7546213 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:278 BX:Z:ATTAT SRR2057595.10106731_CCTCA 0 chr19 8798505 255 48M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:48 NM:i:0 UG:i:292 BX:Z:CCTCA SRR2057595.10106761_CCTCG 0 chr19 13129273 255 46M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:25C1T18 NM:i:2 UG:i:387 BX:Z:CCTCG SRR2057595.10106812_CCAAG 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:37 BX:Z:CCAAG SRR2057595.10106892_AGCCG 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25T10 NM:i:1 UG:i:173 BX:Z:AGCCG SRR2057595.10107056_GGCAG 0 chr19 13129322 255 22M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:22 NM:i:0 UG:i:409 BX:Z:GGCAG SRR2057595.1010759_TCTAA 0 chr19 12086447 255 46M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:46 NM:i:0 UG:i:364 BX:Z:TCTAA SRR2057595.1010759_TCTAA 0 chr19 12086782 255 46M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:46 NM:i:0 UG:i:369 BX:Z:TCTAA SRR2057595.10108058_TCTCG 16 chr19 6446235 255 26M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:26 NM:i:0 UG:i:266 BX:Z:TCTCG SRR2057595.10108108_TGTTT 0 chr19 41595519 255 37M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:24G12 NM:i:1 UG:i:580 BX:Z:TGTTT SRR2057595.10108134_TCTTG 16 chr19 4078423 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:19A47 NM:i:1 UG:i:111 BX:Z:TCTTG SRR2057595.10108322_TATTG 0 chr19 13129322 255 28M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:28 NM:i:0 UG:i:404 BX:Z:TATTG SRR2057595.10108355_TAACA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:32 BX:Z:TAACA SRR2057595.10108853_GGCGT 16 chr19 5797126 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:233 BX:Z:GGCGT SRR2057595.10108990_TTGGC 16 chr19 36085526 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:536 BX:Z:TTGGC SRR2057595.10109290_TATGA 16 chr19 4797429 255 49M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:49 NM:i:0 UG:i:197 BX:Z:TATGA SRR2057595.10109512_CTCTT 16 chr19 10761035 255 32M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:32 NM:i:0 UG:i:332 BX:Z:CTCTT SRR2057595.10109901_ATGAA 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:175 BX:Z:ATAAA SRR2057595.10110057_TTGTT 16 chr19 61240268 255 24M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:10C13 NM:i:1 UG:i:696 BX:Z:TTGTT SRR2057595.10110159_GCCGA 16 chr19 7389994 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:47C0 NM:i:1 UG:i:274 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10110319_TAGTA 16 chr19 61240268 255 27M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:10C16 NM:i:1 UG:i:702 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10110664_TATTG 0 chr19 13129322 255 28M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:28 NM:i:0 UG:i:404 BX:Z:TATTG SRR2057595.10110928_ATCCG 16 chr19 37369602 255 35M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:35 NM:i:0 UG:i:544 BX:Z:ATCCG SRR2057595.10111198_TTCGC 16 chr19 4078428 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:14A24T27 NM:i:2 UG:i:74 BX:Z:TTCGC SRR2057595.10111819_CCTTT 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:180 BX:Z:CCTTT SRR2057595.1011210_GCTAC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:97 BX:Z:GCTAC SRR2057595.10112142_GATCT 16 chr19 4078433 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:9A57 NM:i:1 UG:i:90 BX:Z:GATCT SRR2057595.10112493_TCTGT 16 chr19 45885126 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:608 BX:Z:TCTGT SRR2057595.10112719_GATTG 0 chr19 8799830 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:314 BX:Z:GATTG SRR2057595.10113412_TGTTT 0 chr19 41595518 255 38M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25G12 NM:i:1 UG:i:579 BX:Z:TGTTT SRR2057595.1011350_CATGC 16 chr19 42000773 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:584 BX:Z:CATGC SRR2057595.10113554_TGACC 0 chr19 12086441 255 52M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:52 NM:i:0 UG:i:362 BX:Z:TGACC SRR2057595.10113554_TGACC 0 chr19 12086776 255 52M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:52 NM:i:0 UG:i:367 BX:Z:TGACC SRR2057595.10113832_CTAGA 0 chr19 7609388 255 42M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:42 NM:i:0 UG:i:279 BX:Z:CTAGA SRR2057595.10113868_ATGAA 0 chr19 56007800 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:666 BX:Z:ATGAA SRR2057595.10113897_CATGC 16 chr19 42000773 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:584 BX:Z:CATGC SRR2057595.10114178_TTAAA 16 chr19 4785463 255 21M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:21 NM:i:0 UG:i:196 BX:Z:TTAAA SRR2057595.10114345_GCCGA 16 chr19 7389994 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:47C0 NM:i:1 UG:i:274 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10114548_GATGA 16 chr19 55763541 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2C14G4 NM:i:2 UG:i:662 BX:Z:GATGA SRR2057595.10114848_GTTGT 16 chr19 12564367 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0A12A7 NM:i:2 UG:i:380 BX:Z:GTTGT SRR2057595.10115148_CTATT 16 chr19 56874049 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:672 BX:Z:CTATT SRR2057595.10115906_TGGAC 16 chr19 4078420 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A44 NM:i:2 UG:i:127 BX:Z:TGGAC SRR2057595.10116129_GACTC 16 chr19 25016726 255 31M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:31 NM:i:0 UG:i:483 BX:Z:GACTC SRR2057595.10116129_GACTC 16 chr19 60850233 255 31M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:31 NM:i:0 UG:i:693 BX:Z:GACTC SRR2057595.10116527_CTTAC 16 chr19 4078298 255 54M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A10 NM:i:2 UG:i:49 BX:Z:CTTAC SRR2057595.10116529_GTCCT 16 chr19 59694502 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:8T0A11 NM:i:2 UG:i:688 BX:Z:GTCCT SRR2057595.1011687_TAACA 16 chr19 4078298 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A6 NM:i:2 UG:i:32 BX:Z:TAACA SRR2057595.10116904_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.10117105_CGCTT 0 chr19 13129322 255 26M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:26 NM:i:0 UG:i:406 BX:Z:CGCTT SRR2057595.10117768_TATCA 16 chr19 60837460 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:691 BX:Z:TATCA SRR2057595.1011778_TGTTT 0 chr19 41595518 255 38M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25G12 NM:i:1 UG:i:579 BX:Z:TGTTT SRR2057595.10117819_CTAGC 16 chr19 4078298 255 62M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:21C21A18 NM:i:2 UG:i:63 BX:Z:CTAGC SRR2057595.10117947_AATCG 16 chr19 4078303 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:38A21A6 NM:i:2 UG:i:88 BX:Z:AATCG SRR2057595.10118173_TTCGT 0 chr19 36922761 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:5C51 NM:i:1 UG:i:538 BX:Z:TTCGT SRR2057595.10118916_AGCCG 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:36 NM:i:0 UG:i:173 BX:Z:AGCCG SRR2057595.10119454_TGTTT 0 chr19 41595518 255 38M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:25G12 NM:i:1 UG:i:579 BX:Z:TGTTT SRR2057595.10119776_GTCAA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A13 NM:i:1 UG:i:52 BX:Z:GTCAA SRR2057595.10119820_CAGAC 0 chr19 5493782 255 41M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:41 NM:i:0 UG:i:218 BX:Z:CAGAC SRR2057595.10119919_GAATG 16 chr19 33191616 255 28M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1G17G8 NM:i:2 UG:i:526 BX:Z:GAATG SRR2057595.10120218_TGGTA 16 chr19 28085954 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:498 BX:Z:TGGTA SRR2057595.10120257_TCAGG 0 chr19 13129322 255 35M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:33C1 NM:i:1 UG:i:407 BX:Z:TCAGG SRR2057595.10120271_GTCCC 0 chr19 12347657 255 32M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:32 NM:i:0 UG:i:372 BX:Z:GTCCC SRR2057595.10120271_GTCCC 0 chr19 12348043 255 32M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:32 NM:i:0 UG:i:374 BX:Z:GTCCC SRR2057595.10120271_GTCCC 16 chr19 15035071 255 32M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:29T2 NM:i:1 UG:i:428 BX:Z:GTCCC SRR2057595.10120377_TATTC 16 chr19 5038295 255 24M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:24 NM:i:0 UG:i:206 BX:Z:TATTC SRR2057595.10120569_GCATA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A13 NM:i:2 UG:i:53 BX:Z:GCATA SRR2057595.10120734_AGTAA 16 chr19 4078423 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:19A24T22 NM:i:2 UG:i:110 BX:Z:AGTAA SRR2057595.10120758_AACGC 16 chr19 4078298 255 51M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A7 NM:i:1 UG:i:42 BX:Z:AACGC SRR2057595.10120905_ACCTG 16 chr19 4078420 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A44 NM:i:2 UG:i:126 BX:Z:ACCTG SRR2057595.10121117_TGTTC 0 chr19 61241963 255 27M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:20A5G0 NM:i:2 UG:i:719 BX:Z:TGTTC SRR2057595.10121638_AATTA 16 chr19 50733888 255 63M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:57C0C4 NM:i:2 UG:i:645 BX:Z:AATTA SRR2057595.10122214_TATTG 0 chr19 13129322 255 28M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:28 NM:i:0 UG:i:404 BX:Z:TATTG SRR2057595.10122328_TAAAG 16 chr19 61240268 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:10C17 NM:i:1 UG:i:710 BX:Z:TAAAG SRR2057595.10122369_AGCTT 16 chr19 5799262 255 20M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:20 NM:i:0 UG:i:245 BX:Z:AGCTT SRR2057595.10122580_AAGGT 0 chr19 8798514 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:294 BX:Z:AAGGT SRR2057595.101226_AACTT 16 chr19 4078420 255 64M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A41 NM:i:2 UG:i:55 BX:Z:AACTT SRR2057595.10123331_ATTAT 16 chr19 7546213 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:278 BX:Z:ATTAT SRR2057595.10123377_CTAAT 0 chr19 40194243 255 44M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:5T20A17 NM:i:2 UG:i:562 BX:Z:CTAAT SRR2057595.1012355_CAACT 16 chr19 4078298 255 49M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A5 NM:i:2 UG:i:25 BX:Z:CAACT SRR2057595.10123626_TCTAC 0 chr19 8798544 255 51M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:51 NM:i:0 UG:i:288 BX:Z:TCTAC SRR2057595.10124059_GATGA 16 chr19 55763541 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2C14G4 NM:i:2 UG:i:662 BX:Z:GATGA SRR2057595.1012426_CATTT 0 chr19 49059158 255 49M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:30A7A10 NM:i:2 UG:i:639 BX:Z:CATTT SRR2057595.10125107_TATGG 0 chr19 13129322 255 56M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:33C5A16 NM:i:2 UG:i:405 BX:Z:TATGG SRR2057595.1012543_GGATC 16 chr19 4078298 255 61M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A17 NM:i:2 UG:i:61 BX:Z:GGATC SRR2057595.10125580_TGCTA 0 chr19 10830415 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0A10C9 NM:i:2 UG:i:334 BX:Z:TGCTA SRR2057595.1012559_TGATT 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:41 BX:Z:TGATT SRR2057595.10125877_CTATT 16 chr19 56874049 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:672 BX:Z:CTATT SRR2057595.10125930_ATCGG 0 chr19 8799853 255 44M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:44 NM:i:0 UG:i:310 BX:Z:ATCGG SRR2057595.10125966_GATGA 16 chr19 55763541 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2C14G4 NM:i:2 UG:i:662 BX:Z:GATGA SRR2057595.10126475_TCAGG 0 chr19 38669715 255 54M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:54 NM:i:0 UG:i:550 BX:Z:TCAGG SRR2057595.10126817_CAGAC 0 chr19 5493782 255 41M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:41 NM:i:0 UG:i:218 BX:Z:CAGAC SRR2057595.1012699_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.10127386_GCAGA 0 chr19 8799844 255 53M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:53 NM:i:0 UG:i:309 BX:Z:GCAGA SRR2057595.10127482_AAGGT 0 chr19 8798514 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:294 BX:Z:AAGGT SRR2057595.10127633_GGACC 16 chr19 4078298 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:18C9 NM:i:1 UG:i:143 BX:Z:GGACC SRR2057595.10127800_CCTTT 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:180 BX:Z:CCTTT SRR2057595.10127806_TTTTC 16 chr19 4078296 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0T44A21 NM:i:2 UG:i:69 BX:Z:TTTTC SRR2057595.10127925_GCCGA 16 chr19 7389994 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:47C0 NM:i:1 UG:i:274 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10127969_TCAGC 16 chr19 4078298 255 49M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A5 NM:i:1 UG:i:23 BX:Z:TCAGC SRR2057595.10128074_TATTC 16 chr19 5038295 255 24M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:24 NM:i:0 UG:i:206 BX:Z:TATTC SRR2057595.10128154_CTAGG 16 chr19 5798663 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0G0G65 NM:i:2 UG:i:242 BX:Z:CTAGG SRR2057595.10128297_ATAAA 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:175 BX:Z:ATAAA SRR2057595.10128465_TTGCA 0 chr19 44434953 255 43M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:43 NM:i:0 UG:i:602 BX:Z:TTGCA SRR2057595.10128496_AGCCG 16 chr19 4078298 255 39M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:39 NM:i:0 UG:i:11 BX:Z:AGCCG SRR2057595.1012868_AAACA 16 chr19 4078299 255 49M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:42A6 NM:i:1 UG:i:33 BX:Z:AAACA SRR2057595.1012871_TTCGC 16 chr19 4078428 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:14A24T27 NM:i:2 UG:i:74 BX:Z:TTCGC SRR2057595.10128720_CCTCA 0 chr19 8798505 255 48M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:48 NM:i:0 UG:i:292 BX:Z:CCTCA SRR2057595.10128783_TTGCA 0 chr19 44434953 255 43M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:43 NM:i:0 UG:i:602 BX:Z:TTGCA SRR2057595.10128887_ATACC 16 chr19 35673152 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:7T2A10 NM:i:2 UG:i:534 BX:Z:ATACC SRR2057595.10128931_AGCCG 16 chr19 4078299 255 36M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:36 NM:i:0 UG:i:173 BX:Z:AGCCG SRR2057595.10129033_ACAGA 16 chr19 4078299 255 22M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0C0C20 NM:i:2 UG:i:136 BX:Z:ACAGA SRR2057595.10129046_TCAAA 16 chr19 4078298 255 38M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:38 NM:i:0 UG:i:185 BX:Z:TCAAA SRR2057595.10129405_ATGAA 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:175 BX:Z:ATAAA SRR2057595.1012950_GGGAT 0 chr19 13129424 255 25M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:8A16 NM:i:1 UG:i:394 BX:Z:GGGAT SRR2057595.10129521_CGCCG 16 chr19 4078299 255 59M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:42A16 NM:i:1 UG:i:58 BX:Z:CGCCG SRR2057595.10129734_TATTG 0 chr19 13129322 255 28M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:28 NM:i:0 UG:i:404 BX:Z:TATTG SRR2057595.10130199_GGCAG 0 chr19 13129322 255 22M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:22 NM:i:0 UG:i:409 BX:Z:GGCAG SRR2057595.10130333_GTCGC 0 chr19 12080548 255 51M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:28C20G1 NM:i:2 UG:i:345 BX:Z:GTCGC SRR2057595.10130333_GTCGC 16 chr19 12084189 255 51M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1C20G28 NM:i:2 UG:i:352 BX:Z:GTCGC SRR2057595.10130767_ATACC 16 chr19 35673152 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:7T2A10 NM:i:2 UG:i:534 BX:Z:ATACC SRR2057595.10130878_TTAGT 16 chr19 4078302 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:39A21A5 NM:i:2 UG:i:81 BX:Z:TTAGT SRR2057595.10131031_AGCTT 16 chr19 5799262 255 20M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:20 NM:i:0 UG:i:245 BX:Z:AGCTT SRR2057595.10131148_CAGCA 16 chr19 5801892 255 47M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:47 NM:i:0 UG:i:258 BX:Z:CAGCA SRR2057595.10131269_CATGC 0 chr19 13129570 255 22M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:9A12 NM:i:1 UG:i:392 BX:Z:CATGC SRR2057595.10131482_CTTTC 16 chr19 4078298 255 53M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A9 NM:i:2 UG:i:47 BX:Z:CTTTC SRR2057595.10132002_CCCGT 16 chr19 47349292 255 19M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:8A3G6 NM:i:2 UG:i:629 BX:Z:CCCGT SRR2057595.10132034_ATACC 16 chr19 35673152 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:7T2A10 NM:i:2 UG:i:534 BX:Z:ATACC SRR2057595.10132108_TCTAC 0 chr19 8798544 255 51M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:51 NM:i:0 UG:i:288 BX:Z:TCTAC SRR2057595.10132494_CGAAC 0 chr19 13129273 255 36M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:25C1T8 NM:i:2 UG:i:386 BX:Z:CGAAC SRR2057595.10133086_TCTTA 16 chr19 61240268 255 27M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:10C16 NM:i:1 UG:i:705 BX:Z:TCTTA SRR2057595.10133357_GTCGC 0 chr19 12080548 255 51M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:28C20G1 NM:i:2 UG:i:345 BX:Z:GTCGC SRR2057595.10133357_GTCGC 16 chr19 12084189 255 51M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:1C20G28 NM:i:2 UG:i:352 BX:Z:GTCGC SRR2057595.1013336_TTGTT 16 chr19 61240268 255 24M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:10C13 NM:i:1 UG:i:696 BX:Z:TTGTT SRR2057595.10133381_AGAGT 16 chr19 24180225 255 55M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:41C13 NM:i:1 UG:i:474 BX:Z:AGAGT SRR2057595.10133440_CTGCG 16 chr19 61240305 255 36M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:17A4T13 NM:i:2 UG:i:712 BX:Z:CTGCG SRR2057595.10134016_GACAC 0 chr19 12348541 255 26M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:26 NM:i:0 UG:i:378 BX:Z:GACAC SRR2057595.10134016_GACAC 16 chr19 15034579 255 26M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:26 NM:i:0 UG:i:429 BX:Z:GACAC SRR2057595.10134072_GCAGG 16 chr19 8963035 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:317 BX:Z:GCAGG SRR2057595.1013452_ATATA 0 chr19 13129330 255 22M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0T21 NM:i:1 UG:i:422 BX:Z:ATATA SRR2057595.10134979_AGTAT 0 chr19 10600420 255 29M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:29 NM:i:0 UG:i:328 BX:Z:AGTAT SRR2057595.10135304_GTCCA 16 chr19 4078431 255 67M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11A55 NM:i:1 UG:i:107 BX:Z:GTCCA SRR2057595.1013548_TGTTT 16 chr19 50526830 255 51M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:51 NM:i:0 UG:i:643 BX:Z:TGTTT SRR2057595.10135758_TTGCA 0 chr19 44434953 255 43M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:43 NM:i:0 UG:i:602 BX:Z:TTGCA SRR2057595.10135807_CCCGT 16 chr19 47349292 255 19M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:8A3G6 NM:i:2 UG:i:629 BX:Z:CCCGT SRR2057595.1013613_GATTG 0 chr19 55501486 255 31M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:8A22 NM:i:1 UG:i:659 BX:Z:GATTG SRR2057595.1013616_ATAGA 0 chr19 38795805 255 62M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:46A15 NM:i:1 UG:i:553 BX:Z:ATAGA SRR2057595.10136267_TTCGC 16 chr19 4078428 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:14A24T27 NM:i:2 UG:i:74 BX:Z:TTCGC SRR2057595.10136714_ATCCG 16 chr19 37369602 255 35M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:35 NM:i:0 UG:i:544 BX:Z:ATCCG SRR2057595.10136765_GCTAT 0 chr19 57701750 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:34T1T30 NM:i:2 UG:i:677 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10137151_ATTCT 0 chr19 3576314 255 23M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:16T5T0 NM:i:2 UG:i:5 BX:Z:ATTCT SRR2057595.10137262_ACAAA 16 chr19 4078298 255 49M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A5 NM:i:1 UG:i:27 BX:Z:ACAAA SRR2057595.10137317_GATTG 0 chr19 8799830 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:314 BX:Z:GATTG SRR2057595.10137603_GCTAT 16 chr19 61240267 255 28M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:11C16 NM:i:1 UG:i:706 BX:Z:GCTAT SRR2057595.10137788_TAGTA 0 chr19 10274608 255 34M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:34 NM:i:0 UG:i:324 BX:Z:TAGTA SRR2057595.1013793_GCGCA 0 chr19 8798523 255 30M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:30 NM:i:0 UG:i:295 BX:Z:GCGCA SRR2057595.10138029_GTTGT 16 chr19 12564367 255 21M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:0A12A7 NM:i:2 UG:i:380 BX:Z:GTTGT SRR2057595.10138656_CTAGC 16 chr19 4078298 255 62M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:43A18 NM:i:1 UG:i:63 BX:Z:CTAGC SRR2057595.10138697_GCCGT 0 chr19 30861987 255 20M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:3C2T13 NM:i:2 UG:i:511 BX:Z:GCCGT SRR2057595.10138764_GATGG 0 chr19 44417644 255 23M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:15T4C2 NM:i:2 UG:i:601 BX:Z:GATGG SRR2057595.10138897_TGATT 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:41 BX:Z:TGATT SRR2057595.10139239_GAGTG 0 chr19 8798502 255 51M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:51 NM:i:0 UG:i:289 BX:Z:GAGTG SRR2057595.10139499_AGTCT 0 chr19 13129558 255 37M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:21A15 NM:i:1 UG:i:398 BX:Z:AGTCT SRR2057595.10139596_GCTAC 16 chr19 4078446 255 67M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:67 NM:i:0 UG:i:97 BX:Z:GCTAC SRR2057595.10139652_GGATG 0 chr19 13129322 255 27M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:27 NM:i:0 UG:i:402 BX:Z:GGATG SRR2057595.10139674_ATGAA 16 chr19 4078298 255 37M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:37 NM:i:0 UG:i:175 BX:Z:ATAAA SRR2057595.10139952_TAGTA 16 chr19 61240268 255 27M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:10C16 NM:i:1 UG:i:702 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10140058_ATATA 0 chr19 13129330 255 22M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:0T21 NM:i:1 UG:i:422 BX:Z:ATATA SRR2057595.10141122_GTCCC 0 chr19 12347657 255 32M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:32 NM:i:0 UG:i:372 BX:Z:GTCCC SRR2057595.10141122_GTCCC 0 chr19 12348043 255 32M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:32 NM:i:0 UG:i:374 BX:Z:GTCCC SRR2057595.10141122_GTCCC 16 chr19 15035071 255 32M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:29T2 NM:i:1 UG:i:428 BX:Z:GTCCC SRR2057595.10141295_TAGTA 0 chr19 10274608 255 34M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:34 NM:i:0 UG:i:324 BX:Z:TAGTA SRR2057595.10142441_GTCTA 16 chr19 4078420 255 67M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:2T19A44 NM:i:2 UG:i:124 BX:Z:GTCTA SRR2057595.10142482_GCCGA 16 chr19 7389994 255 48M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:47C0 NM:i:1 UG:i:274 BX:Z:GCCGA SRR2057595.10143102_AAGTA 16 chr19 31326011 255 57M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:23A33 NM:i:1 UG:i:512 BX:Z:AAGTA SRR2057595.10143387_GCATA 16 chr19 4078298 255 57M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A13 NM:i:2 UG:i:53 BX:Z:GCATA SRR2057595.10143631_ATTTT 0 chr19 45095257 255 57M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:57 NM:i:0 UG:i:606 BX:Z:ATTTT SRR2057595.10143687_CGCTT 0 chr19 13129322 255 26M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:26 NM:i:0 UG:i:406 BX:Z:CGCTT SRR2057595.10143772_TGATT 16 chr19 4078299 255 50M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:41G0A7 NM:i:2 UG:i:41 BX:Z:TGATT SRR2057595.10143909_CAGAC 0 chr19 5493782 255 41M * 0 0 * * XA:i:0 MD:Z:41 NM:i:0 UG:i:218 BX:Z:CAGAC SRR2057595.10143972_CTTAC 16 chr19 4078298 255 54M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:42G0A10 NM:i:2 UG:i:49 BX:Z:CTTAC SRR2057595.10144216_CATAA 0 chr19 13129322 255 35M * 0 0 * * XA:i:1 MD:Z:33C1 NM:i:1 UG:i:401 BX:Z:CATAA SRR2057595.10144367_ATGAT 16 chr19 61240306 255 36M * 0 0 * * XA:i:2 MD:Z:16A4T14 NM:i:2 UG:i:716 BX:Z:ATGAT