|
[up]
|
|
drwxr-xr-x |
 global_phylo.nh
|
9938 |
-rw-r--r-- |
|
global_samples.vcf.gz
|
32468 |
-rw-r--r-- |
|
mutation_annotation.pb
|
202091 |
-rw-r--r-- |
|
new_samples.vcf.gz
|
347 |
-rw-r--r-- |
|
rename_samples.tabular
|
264 |
-rw-r--r-- |
|
sample_names.txt
|
40858 |
-rw-r--r-- |
|
test_01_annotated_tree.pb
|
26127 |
-rw-r--r-- |
|
test_01_condensed_tree.nh
|
7140 |
-rw-r--r-- |
|
test_01_final_tree.nh
|
7139 |
-rw-r--r-- |
|
test_02_mutation_path.nh
|
251 |
-rw-r--r-- |
|
test_02_uncondensed_tree.nh
|
10324 |
-rw-r--r-- |
|
test_03_condensed_tree.nh
|
7140 |
-rw-r--r-- |
|
test_03_final_tree.nh
|
7139 |
-rw-r--r-- |
|
test_04_mutation_paths.txt
|
251 |
-rw-r--r-- |
|
test_04_subtree_1.nh
|
444 |
-rw-r--r-- |
|
test_04_subtree_1_expanded.txt
|
226 |
-rw-r--r-- |
|
test_04_subtree_1_mutations.txt
|
719 |
-rw-r--r-- |
|
test_04_uncondensed_tree.nh
|
10324 |
-rw-r--r-- |
|
test_05_current_tree.nw
|
7111 |
-rw-r--r-- |
|
test_05_parsimony_scores.tabular
|
62586 |
-rw-r--r-- |
|
test_06_final_tree.nh
|
7178 |
-rw-r--r-- |
|
test_06_mutation_paths.txt
|
251 |
-rw-r--r-- |
|
test_07_single_subtree.nh
|
125 |
-rw-r--r-- |
|
test_07_single_subtree_mutations.txt
|
205 |
-rw-r--r-- |
|
test_08_final_tree.nh
|
7178 |
-rw-r--r-- |
|
test_08_mutation_path.nh
|
251 |
-rw-r--r-- |
|
test_09_final_tree.nh
|
7178 |
-rw-r--r-- |
|
test_09_mutation_path.nh
|
251 |
-rw-r--r-- |
|
test_10_final_tree.nh
|
7178 |
-rw-r--r-- |
|
test_10_mutation_path.nh
|
251 |
-rw-r--r-- |
|
test_11_final_tree.nh
|
7178 |
-rw-r--r-- |
|
test_11_mutation_path.nh
|
251 |
-rw-r--r-- |
|
test_12_final_tree.nh
|
6454 |
-rw-r--r-- |
|
test_12_mutation_path.nh
|
251 |
-rw-r--r-- |
|
test_13_path_clades.tabular
|
13088 |
-rw-r--r-- |
|
test_13_path_mutations.tabular
|
44487 |
-rw-r--r-- |
|
test_13_sample_names.txt
|
4954 |
-rw-r--r-- |
|
test_14_all_paths.txt
|
78965 |
-rw-r--r-- |
|
test_14_path_clades.tabular
|
51842 |
-rw-r--r-- |
|
test_14_path_mutations.tabular
|
199825 |
-rw-r--r-- |
|
test_14_sample_names.txt
|
40858 |
-rw-r--r-- |
|
test_15_mutation_annotated_tree.pb
|
185924 |
-rw-r--r-- |
|
test_15_subtree.json
|
550535 |
-rw-r--r-- |
|
test_15_subtree_no_genotype.vcf
|
157563 |
-rw-r--r-- |
|
test_15_tree.nh
|
48519 |
-rw-r--r-- |
|
test_16_path_mutations.tabular
|
236025 |
-rw-r--r-- |
|
test_16_sample_names.txt
|
45812 |
-rw-r--r-- |
|
test_17_all_paths.txt
|
89605 |
-rw-r--r-- |
|
test_17_path_clades.tabular
|
62854 |
-rw-r--r-- |
|
test_17_path_mutations.tabular
|
236025 |
-rw-r--r-- |
|
test_17_sample_names.txt
|
45812 |
-rw-r--r-- |
|
test_18_all_paths.txt
|
28228 |
-rw-r--r-- |
|
test_18_path_clades.tabular
|
42110 |
-rw-r--r-- |
|
test_18_path_mutations.tabular
|
65320 |
-rw-r--r-- |
|
test_18_sample_names.txt
|
16345 |
-rw-r--r-- |
|
test_19_path_clades.tabular
|
28997 |
-rw-r--r-- |
|
test_19_path_mutations.tabular
|
58397 |
-rw-r--r-- |
|
test_19_sample_names.txt
|
16224 |
-rw-r--r-- |
|
test_20_general_stats.txt
|
152 |
-rw-r--r-- |
|
test_21_aberrant_stats.tabular
|
39 |
-rw-r--r-- |
|
test_21_clades_stats.tabular
|
6426 |
-rw-r--r-- |
|
test_21_mutations_stats.tabular
|
36992 |
-rw-r--r-- |
|
test_21_sample_stats.tabular
|
48325 |
-rw-r--r-- |
|
test_22_total_parsimony_tree.txt
|
26 |
-rw-r--r-- |
|
test_23_equally_parsimoniou.tabular
|
43063 |
-rw-r--r-- |
|
test_23_neighbourhood.tabular
|
43291 |
-rw-r--r-- |
|
test_24_restricted.pb
|
292531 |
-rw-r--r-- |
|
test_25_renamed.pb
|
201598 |
-rw-r--r-- |
