comparison test-data/test_03_scaffolds_final.fa @ 0:d87433f2a54d draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/yahs commit 92823b21835509dde34557b6922e1b9a39311069
author iuc
date Wed, 29 Jun 2022 13:06:23 +0000
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:d87433f2a54d
1 >scaffold_1
2 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAG
3 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
4 TATGTGTCATAAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGC
5 CATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACA
6 CTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGG
7 TACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTG
8 AAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGT
9 GTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCAC
10 TGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
11 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
12 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
13 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
14 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
15 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
16 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
17 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
18 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
19 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
20 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
21 GTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
22 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
23 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
24 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAG
25 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
26 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
27 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
28 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
29 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
30 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
31 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
32 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
33 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
34 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
35 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
36 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
37 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
38 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
39 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGC
40 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
41 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
42 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
43 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC
44 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
45 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
46 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
47 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
48 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
49 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
50 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
51 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
52 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
53 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
54 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
55 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
56 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
57 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
58 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
59 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
60 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
61 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
62 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
63 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
64 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
65 GTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
66 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
67 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
68 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
69 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
70 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
71 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
72 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGC
73 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
74 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
75 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
76 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC
77 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
78 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
79 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
80 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
81 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
82 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
83 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
84 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
85 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
86 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
87 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC
88 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
89 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCTGGCATTGTAGGTACCAGACACTAACAAACTCGTCGT
90 CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
91 TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
92 CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
93 ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
94 CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCTCGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
95 GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
96 CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
97 ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTGCCTTACGGCTAGGGGAGATCT
98 AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
99 TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
100 CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT
101 CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
102 TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
103 CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
104 ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
105 CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
106 GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
107 CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
108 ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT
109 AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
110 TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
111 CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT
112 CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
113 TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
114 CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
115 ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
116 CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
117 GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
118 CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
119 ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT
120 AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
121 TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
122 CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT
123 CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
124 TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
125 CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
126 ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
127 CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
128 GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
129 CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
130 ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT
131 AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
132 TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
133 CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT