Mercurial > repos > iuc > yahs
comparison test-data/test_03_scaffolds_final.fa @ 0:d87433f2a54d draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/yahs commit 92823b21835509dde34557b6922e1b9a39311069
| author | iuc |
|---|---|
| date | Wed, 29 Jun 2022 13:06:23 +0000 |
| parents | |
| children |
comparison
equal
deleted
inserted
replaced
| -1:000000000000 | 0:d87433f2a54d |
|---|---|
| 1 >scaffold_1 | |
| 2 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAG | |
| 3 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG | |
| 4 TATGTGTCATAAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGC | |
| 5 CATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACA | |
| 6 CTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGG | |
| 7 TACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTG | |
| 8 AAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGT | |
| 9 GTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCAC | |
| 10 TGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC | |
| 11 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG | |
| 12 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG | |
| 13 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG | |
| 14 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG | |
| 15 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC | |
| 16 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC | |
| 17 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT | |
| 18 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA | |
| 19 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG | |
| 20 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT | |
| 21 GTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC | |
| 22 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG | |
| 23 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG | |
| 24 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAG | |
| 25 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG | |
| 26 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC | |
| 27 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC | |
| 28 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT | |
| 29 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA | |
| 30 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG | |
| 31 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT | |
| 32 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC | |
| 33 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG | |
| 34 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG | |
| 35 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG | |
| 36 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG | |
| 37 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC | |
| 38 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC | |
| 39 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGC | |
| 40 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA | |
| 41 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG | |
| 42 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT | |
| 43 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC | |
| 44 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG | |
| 45 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG | |
| 46 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG | |
| 47 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG | |
| 48 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC | |
| 49 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC | |
| 50 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT | |
| 51 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA | |
| 52 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG | |
| 53 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT | |
| 54 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC | |
| 55 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG | |
| 56 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG | |
| 57 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG | |
| 58 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG | |
| 59 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC | |
| 60 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC | |
| 61 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT | |
| 62 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA | |
| 63 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG | |
| 64 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT | |
| 65 GTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC | |
| 66 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG | |
| 67 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG | |
| 68 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG | |
| 69 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG | |
| 70 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC | |
| 71 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC | |
| 72 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGC | |
| 73 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA | |
| 74 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG | |
| 75 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT | |
| 76 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC | |
| 77 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG | |
| 78 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG | |
| 79 CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG | |
| 80 ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG | |
| 81 TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC | |
| 82 ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC | |
| 83 TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT | |
| 84 ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA | |
| 85 AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG | |
| 86 TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT | |
| 87 GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC | |
| 88 GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG | |
| 89 CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCTGGCATTGTAGGTACCAGACACTAACAAACTCGTCGT | |
| 90 CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG | |
| 91 TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA | |
| 92 CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC | |
| 93 ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC | |
| 94 CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCTCGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT | |
| 95 GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG | |
| 96 CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC | |
| 97 ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTGCCTTACGGCTAGGGGAGATCT | |
| 98 AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT | |
| 99 TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA | |
| 100 CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT | |
| 101 CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG | |
| 102 TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA | |
| 103 CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC | |
| 104 ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC | |
| 105 CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT | |
| 106 GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG | |
| 107 CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC | |
| 108 ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT | |
| 109 AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT | |
| 110 TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA | |
| 111 CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT | |
| 112 CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG | |
| 113 TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA | |
| 114 CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC | |
| 115 ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC | |
| 116 CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT | |
| 117 GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG | |
| 118 CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC | |
| 119 ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT | |
| 120 AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT | |
| 121 TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA | |
| 122 CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT | |
| 123 CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG | |
| 124 TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA | |
| 125 CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC | |
| 126 ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC | |
| 127 CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT | |
| 128 GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG | |
| 129 CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC | |
| 130 ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT | |
| 131 AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT | |
| 132 TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA | |
| 133 CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT |