comparison create_ribosome_profile/test-data/Yeast_rRNA.fasta.fasta @ 0:06b01eb16c4e draft

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author jackcurragh
date Mon, 04 Apr 2022 09:58:52 +0000
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equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:06b01eb16c4e
1 >RDN18-1 Chr 12 18S rRNA
2 TATCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
3 AAGTATAAGCAATTTATACAGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTAT
4 TTGATAGTTCCTTTACTACATGGTATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTTAA
5 AATCTCGACCCTTTGGAAGAGATGTATTTATTAGATAAAAAATCAATGTCTTCGGACTCT
6 TTGATGATTCATAATAACTTTTCGAATCGCATGGCCTTGTGCTGGCGATGGTTCATTCAA
7 ATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTTTCAACGGGTAA
8 CGGGGAATAAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGA
9 AGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTAATTCAGGGAGGTAGTGACAATAAATAACG
10 ATACAGGGCCCATTCGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATGTAAATACCTTAACGAGG
11 AACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTAT
12 ATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACTTTGGGCCCGGTTGGCCGGTCCG
13 ATTTTTTCGTGTACTGGATTTCCAACGGGGCCTTTCCTTCTGGCTAACCTTGAGTCCTTG
14 TGGCTCTTGGCGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCGTA
15 TTGCTCGAATATATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTTTGGTTCTATTTTGTTGGTT
16 TCTAGGACCATCGTAATGATTAATAGGGACGGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGA
17 GGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGACGTTT
18 TCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGATGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAA
19 CCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGTGGTGTTTTTTTAATGACCCACTCGGCACCTT
20 ACGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAG
21 GAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGG
22 GAAACTCACCAGGTCCAGACACAATAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTT
23 GTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGAT
24 AACGAACGAGACCTTAACCTACTAAATAGTGGTGCTAGCATTTGCTGGTTATCCACTTCT
25 TAGAGGGACTATCGGTTTCAAGCCGATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCC
26 CTTAGACGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACGGAGCCAGCGAGTCTAACCTTGGC
27 CGAGAGGTCTTGGTAATCTTGTGAAACTCCGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGTAATTAT
28 TGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCC
29 TGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTAGTACCGATTGAATGGCTTAGTGAGGCCTCAGG
30 ATCTGCTTAGAGAAGGGGGCAACTCCATCTCAGAGCGGAGAATTTGGACAAACTTGGTCA
31 TTTAGAGGAACTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTA
32 >RDN58-2 Chr 12 5.8S rRNA
33 AAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGAT
34 ACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCC
35 TTGGTATTCCAGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTT
36 >RDN5-1 Chr 12 5S rRNA
37 GGTTGCGGCCATATCTACCAGAAAGCACCGTTTCCCGTCCGATCAACTGTAGTTAAGCTG
38 GTAAGAGCCTGACCGAGTAGTGTAGTGGGTGACCATACGCGAAACTCAGGTGCTGCAATC
39 >RDN25-1 Chr 12 25S rRNA
40 GTTTGACCTCAAATCAGGTAGGAGTACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGA
41 AAAGAAACCAACCGGGATTGCCTTAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAAAAGCTCAAATTTG
42 AAATCTGGTACCTTCGGTGCCCGAGTTGTAATTTGGAGAGGGCAACTTTGGGGCCGTTCC
43 TTGTCTATGTTCCTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTGTGGCGAGGAGT
44 GCGGTTCTTTGTAAAGTGCCTTCGAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAGTGG
45 GTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACAGTG
46 ATGGAAAGATGAAAAGAACTTTGAAAAGAGAGTGAAAAAGTACGTGAAATTGTTGAAAGG
47 GAAGGGCATTTGATCAGACATGGTGTTTTGTGCCCTCTGCTCCTTGTGGGTAGGGGAATC
48 TCGCATTTCACTGGGCCAGCATCAGTTTTGGTGGCAGGATAAATCCATAGGAATGTAGCT
49 TGCCTCGGTAAGTATTATAGCCTGTGGGAATACTGCCAGCTGGGACTGAGGACTGCGACG
50 TAAGTCAAGGATGCTGGCATAATGGTTATATGCCGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGA
51 GTCTAACGTCTATGCGAGTGTTTGGGTGTAAAACCCATACGCGTAATGAAAGTGAACGTA
52 GGTTGGGGCCTCGCAAGAGGTGCACAATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGA
53 GTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCC
54 AGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCGAATTTG
55 GGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCT
56 CAGGATAGCAGAAGCTCGTATCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGTTCCGGG
57 GTCGAAATGACCTTGACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTTGTTACTTAA
58 TTGAACGTGGACATTTGAATGAAGAGCTTTTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGG
59 CGATGCGGGATGAACCGAACGTAGAGTTAAGGTGCCGGAATACACGCTCATCAGACACCA
60 CAAAAGGTGTTAGTTCATCTAGACAGCCGGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAATCCGCTAA
61 GGAGTGTGTAACAACTCACCGGCCGAATGAACTAGCCCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGC
62 GTGTTACCTATACTCTACCGTCAGGGTTGATATGATGCCCTGACGAGTAGGCAGGCGTGG
63 AGGTCAGTGACGAAGCCTAGACCGTAAGGTCGGGTCGAACGGCCTCTAGTGCAGATCTTG
64 GTGGTAGTAGCAAATATTCAAATGAGAACTTTGAAGACTGAAGTGGGGAAAGGTTCCACG
65 TCAACAGCAGTTGGACGTGGGTTAGTCGATCCTAAGAGATGGGGAAGCTCCGTTTCAAAG
66 GCCTGATTTTATGCAGGCCACCATCGAAAGGGAATCCGGTTAAGATTCCGGAACCTGGAT
67 ATGGATTCTTCACGGTAACGTAACTGAATGTGGAGACGTCGGCGCGAGCCCTGGGAGGAG
68 TTATCTTTTCTTCTTAACAGCTTATCACCCCGGAATTGGTTTATCCGGAGATGGGGTCTT
69 ATGGCTGGAAGAGGCCAGCACCTTTGCTGGCTCCGGTGCGCTTGTGACGGCCCGTGAAAA
70 TCCACAGGAAGGAATAGTTTTCATGCCAGGTCGTACTGATAACCGCAGCAGGTCTCCAAG
71 GTGAACAGCCTCTAGTTGATAGAATAATGTAGATAAGGGAAGTCGGCAAAATAGATCCGT
72 AACTTCGGGATAAGGATTGGCTCTAAGGGTCGGGTAGTGAGGGCCTTGGTCAGACGCAGC
73 GGGCGTGCTTGTGGACTGCTTGGTGGGGCTTGCTCTGCTAGGCGGACTACTTGCGTGCCT
74 TGTTGTAGACGGCCTTGGTAGGTCTCTTGTAGACCGTCGCTTGCTACAATTAACGATCAA
75 CTTAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCTGACTGTCTAATTAAAACATAGCATTGCGATG
76 GTCAGAAAGTGATGTTGACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAA
77 GAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAA
78 ATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCT
79 ATCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAG
80 AAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTTTGACATTGTGAAGAGACATAGAGGGTGTAGAAT
81 AAGTGGGAGCTTCGGCGCCAGTGAAATACCACTACCTTTATAGTTTCTTTACTTATTCAA
82 TGAAGCGGAGCTGGAATTCATTTTCCACGTTCTAGCATTCAAGGTCCCATTCGGGGCTGA
83 TCCGGGTTGAAGACATTGTCAGGTGGGGAGTTTGGCTGGGGCGGCACATCTGTTAAACGA
84 TAACGCAGATGTCCTAAGGGGGGCTCATGGAGAACAGAAATCTCCAGTAGAACAAAAGGG
85 TAAAAGCCCCCTTGATTTTGATTTTCAGTGTGAATACAAACCATGAAAGTGTGGCCTATC
86 GATCCTTTAGTCCCTCGGAATTTGAGGCTAGAGGTGCCAGAAAAGTTACCACAGGGATAA
87 CTGGCTTGTGGCAGTCAAGCGTTCATAGCGACATTGCTTTTTGATTCTTCGATGTCGGCT
88 CTTCCTATCATACCGAAGCAGAATTCGGTAAGCGTTGGATTGTTCACCCACTAATAGGGA
89 ACGTGAGCTGGGTTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGAATGTTA
90 CCGCAATAGTAATTGAACTTAGTACGAGAGGAACAGTTCATTCGGATAATTGGTTTTTGC
91 GGCTGTCTGATCAGGCATTGCCGCGAAGCTACCATCCGCTGGATTATGGCTGAACGCCTC
92 TAAGTCAGAATCCATGCTAGAACGCGGTGATTTCTTTGCTCCACACAATATAGATGGATA
93 CGAATAAGGCGTCCTTGTGGCGTCGCTGAACCATAGCAGGCTAGCAACGGTGCACTTGGC
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95 TTGTATACGACTTAGATGTACAACGGGGTATTGTAAGCAGTAGAGTAGCCTTGTTGTTAC
96 GATCTGCTGAGATTAAGCCTTTGTTGTCTGATTTGT