Mercurial > repos > jfrancoismartin > mixmodel4repeated_measures

annotate test-data/test_raw_variable_out.txt @ 0:1422de181204 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
author jfrancoismartin
date Wed, 10 Oct 2018 05:18:42 -0400
parents
children
Ignore whitespace changes - Everywhere: Within whitespace: At end of lines:
rev   line source
0
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
1 variableMetadata var withNA Shapiro.pvalue.residuals Subject.Variance REML pval_time pval_trt pval_inter pvalue.time.T1...T2 pvalue.time.T1...T3 pvalue.time.T2...T3 pvalue.fixfact.A...B pvalue.T1.A....T2.A pvalue.T1.A....T3.A pvalue.T1.A....T1.B pvalue.T1.A....T2.B pvalue.T1.A....T3.B pvalue.T2.A....T3.A pvalue.T2.A....T1.B pvalue.T2.A....T2.B pvalue.T2.A....T3.B pvalue.T3.A....T1.B pvalue.T3.A....T2.B pvalue.T3.A....T3.B pvalue.T1.B....T2.B pvalue.T1.B....T3.B pvalue.T2.B....T3.B estimate.time.T1...T2 estimate.time.T1...T3 estimate.time.T2...T3 estimate.fixfact.A...B estimate.T1.A....T2.A estimate.T1.A....T3.A estimate.T1.A....T1.B estimate.T1.A....T2.B estimate.T1.A....T3.B estimate.T2.A....T3.A estimate.T2.A....T1.B estimate.T2.A....T2.B estimate.T2.A....T3.B estimate.T3.A....T1.B estimate.T3.A....T2.B estimate.T3.A....T3.B estimate.T1.B....T2.B estimate.T1.B....T3.B estimate.T2.B....T3.B
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
2 var1 var1 0 0.00152990892918407 0 254.537609570589 0.989895081688929 0.000142332953130264 0.999851637979215 NA NA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA -575.6908 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
3 var2 var2 0 0.960464619805585 0 262.571810056621 0.443498818238816 0.602652253312485 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
4 var3 var3 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
5 var4 var4 0 0.0441977246388017 7213.02082711591 254.223292186154 0.983046491866558 0.0690481436570156 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
6 var5 var5 0 0.064287156921339 17220.7805833911 266.097162357616 0.983046491866558 0.850330775367304 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
7 var6 var6 0 0.0381978835199867 0 244.361560756404 0.983046491866558 1.69724227738755e-05 0.877939640795251 NA NA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA -535.4342 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
8 var7 var7 0 0.193737436286724 0 254.906518619133 0.0157977802240783 0.293529919182109 0.877939640795251 0.012 0.028 0.977485714285714 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA -453.5379 -432.3569 21.1809 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
9 var8 var8 0 0.014695144502403 15197.0828494013 259.222125604721 1 0.0697160454979429 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
10 var9 var9 0 0.148540192056018 1.8132043075478e-10 259.983587153763 0.983046491866558 0.818040560247076 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
11 var10 var10 0 0.768501224171673 4386.50412060244 262.180681429873 0.983046491866558 0.372670267631705 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
12 var11 var11 0 0.711106348589254 19233.8026294981 260.769418500537 0.983046491866558 0.819708219928867 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
13 var12 var12 0 0.388310543095299 0 254.652163866062 0.000451504869487529 1 0.861541599913403 0.002 0.908 0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 553.8303 -128.3101 -682.1404 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
14 var13 var13 0 0.846722054364422 0 263.195387302844 0.983046491866558 0.102587754537138 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
15 var14 var14 0 0.0360856422369758 0 255.35073473538 0.0804913814946417 1 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
16 var15 var15 0 0.0626184338173826 8153.26008240148 262.067244816087 0.983046491866558 0.592722965710858 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
17 var16 var16 0 0.171687740370142 10568.0720173727 237.006726048068 6.02686289052912e-05 0.372670267631705 0.861541599913403 0 0.008 0.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 563.4853 294.9395 -268.5459 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
18 var17 var17 0 0.746933462377266 23409.8484229528 266.135923308681 0.983046491866558 0.465689496368746 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
19 var18 var18 0 0.735764575145315 0 262.073544952402 0.983046491866558 0.711384175405778 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
20 var19 var19 0 0.194540582137284 0 268.220382686494 0.983046491866558 0.477013011572336 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
21 var20 var20 0 0.287706917791718 0 266.878020990071 0.983046491866558 0.285791545615653 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
22 var21 var21 0 0.0515625925674887 21271.8195701478 265.151387312325 0.983046491866558 0.711384175405778 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
23 var22 var22 0 0.607405931022872 0 263.535518930099 0.983046491866558 0.568870942400682 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
24 var23 var23 0 0.212615804058253 0 263.751117472845 0.983046491866558 0.644803266722344 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
25 var24 var24 0 0.453100802782389 29510.6568674354 260.71769299974 0.989895081688929 0.853232770669574 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
26 var25 var25 0 0.511477701192744 0 286.65672225126 0.983046491866558 0.285791545615653 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
27 var26 var26 0 0.815661522629652 0 281.509414777202 0.983046491866558 0.0688280391920837 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
28 var27 var27 0 0.653920548984792 0 280.838740914533 0.989895081688929 0.14979041564372 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
29 var28 var28 0 0.719759503524831 0 277.41708583405 0.983046491866558 0.196622531113559 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
30 var29 var29 0 0.725675776865143 86615.1480315815 268.196774164521 0.443498818238816 0.121470044896006 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
31 var30 var30 0 0.857478473660295 37081.0431925278 286.162827544403 0.983046491866558 0.253530786238282 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
32 var31 var31 0 0.751744017902084 0 276.362228496729 0.989895081688929 1 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
33 var32 var32 0 0.978108618401383 0 285.72256677923 0.983046491866558 0.306024424517496 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
34 var33 var33 0 0.99993316514364 124822.847216428 276.589351488647 0.147948925847613 0.121470044896006 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
35 var34 var34 0 0.242528626574342 0 281.137098865892 0.983046491866558 0.196622531113559 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
36 var35 var35 0 0.508321244841884 0 273.186257975745 0.983046491866558 0.0141133867640431 0.924958848665671 NA NA NA 0.0146666666666667 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA -603.4358 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
37 var36 var36 0 0.316164521545126 2.61433151397349e-10 268.90084474405 0.983046491866558 0.644803266722344 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
38 var37 var37 0 0.953719843399109 20144.5877011241 271.448160048801 0.800264575774149 0.356750278198418 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
39 var38 var38 0 0.428134779270157 0 285.508280238472 0.989895081688929 0.592722965710858 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
40 var39 var39 0 0.868929253676507 74721.1043100503 271.9525623048 0.983046491866558 0.568870942400682 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1422de181204 planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
jfrancoismartin
parents:
diff changeset
41 var40 var40 0 0.967902408294312 97407.8193511745 276.870664881354 0.983046491866558 0.121470044896006 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA