Mercurial > repos > jfrancoismartin > mixmodel4repeated_measures

diff test-data/test_raw_variable_out.txt @ 0:1422de181204 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
author jfrancoismartin
date Wed, 10 Oct 2018 05:18:42 -0400
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/test_raw_variable_out.txt	Wed Oct 10 05:18:42 2018 -0400
@@ -0,0 +1,41 @@
+variableMetadata	var	withNA	Shapiro.pvalue.residuals	Subject.Variance	REML	pval_time	pval_trt	pval_inter	pvalue.time.T1...T2	pvalue.time.T1...T3	pvalue.time.T2...T3	pvalue.fixfact.A...B	pvalue.T1.A....T2.A	pvalue.T1.A....T3.A	pvalue.T1.A....T1.B	pvalue.T1.A....T2.B	pvalue.T1.A....T3.B	pvalue.T2.A....T3.A	pvalue.T2.A....T1.B	pvalue.T2.A....T2.B	pvalue.T2.A....T3.B	pvalue.T3.A....T1.B	pvalue.T3.A....T2.B	pvalue.T3.A....T3.B	pvalue.T1.B....T2.B	pvalue.T1.B....T3.B	pvalue.T2.B....T3.B	estimate.time.T1...T2	estimate.time.T1...T3	estimate.time.T2...T3	estimate.fixfact.A...B	estimate.T1.A....T2.A	estimate.T1.A....T3.A	estimate.T1.A....T1.B	estimate.T1.A....T2.B	estimate.T1.A....T3.B	estimate.T2.A....T3.A	estimate.T2.A....T1.B	estimate.T2.A....T2.B	estimate.T2.A....T3.B	estimate.T3.A....T1.B	estimate.T3.A....T2.B	estimate.T3.A....T3.B	estimate.T1.B....T2.B	estimate.T1.B....T3.B	estimate.T2.B....T3.B
+var1	var1	0	0.00152990892918407	0	254.537609570589	0.989895081688929	0.000142332953130264	0.999851637979215	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	-575.6908	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var2	var2	0	0.960464619805585	0	262.571810056621	0.443498818238816	0.602652253312485	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var3	var3	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var4	var4	0	0.0441977246388017	7213.02082711591	254.223292186154	0.983046491866558	0.0690481436570156	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var5	var5	0	0.064287156921339	17220.7805833911	266.097162357616	0.983046491866558	0.850330775367304	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var6	var6	0	0.0381978835199867	0	244.361560756404	0.983046491866558	1.69724227738755e-05	0.877939640795251	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	-535.4342	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var7	var7	0	0.193737436286724	0	254.906518619133	0.0157977802240783	0.293529919182109	0.877939640795251	0.012	0.028	0.977485714285714	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	-453.5379	-432.3569	21.1809	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var8	var8	0	0.014695144502403	15197.0828494013	259.222125604721	1	0.0697160454979429	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var9	var9	0	0.148540192056018	1.8132043075478e-10	259.983587153763	0.983046491866558	0.818040560247076	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var10	var10	0	0.768501224171673	4386.50412060244	262.180681429873	0.983046491866558	0.372670267631705	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var11	var11	0	0.711106348589254	19233.8026294981	260.769418500537	0.983046491866558	0.819708219928867	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var12	var12	0	0.388310543095299	0	254.652163866062	0.000451504869487529	1	0.861541599913403	0.002	0.908	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553.8303	-128.3101	-682.1404	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var13	var13	0	0.846722054364422	0	263.195387302844	0.983046491866558	0.102587754537138	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var14	var14	0	0.0360856422369758	0	255.35073473538	0.0804913814946417	1	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var15	var15	0	0.0626184338173826	8153.26008240148	262.067244816087	0.983046491866558	0.592722965710858	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var16	var16	0	0.171687740370142	10568.0720173727	237.006726048068	6.02686289052912e-05	0.372670267631705	0.861541599913403	0	0.008	0.01	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563.4853	294.9395	-268.5459	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var17	var17	0	0.746933462377266	23409.8484229528	266.135923308681	0.983046491866558	0.465689496368746	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var18	var18	0	0.735764575145315	0	262.073544952402	0.983046491866558	0.711384175405778	0.924958848665671	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var19	var19	0	0.194540582137284	0	268.220382686494	0.983046491866558	0.477013011572336	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var20	var20	0	0.287706917791718	0	266.878020990071	0.983046491866558	0.285791545615653	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var21	var21	0	0.0515625925674887	21271.8195701478	265.151387312325	0.983046491866558	0.711384175405778	0.924958848665671	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var22	var22	0	0.607405931022872	0	263.535518930099	0.983046491866558	0.568870942400682	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var23	var23	0	0.212615804058253	0	263.751117472845	0.983046491866558	0.644803266722344	0.924958848665671	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var24	var24	0	0.453100802782389	29510.6568674354	260.71769299974	0.989895081688929	0.853232770669574	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var25	var25	0	0.511477701192744	0	286.65672225126	0.983046491866558	0.285791545615653	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var26	var26	0	0.815661522629652	0	281.509414777202	0.983046491866558	0.0688280391920837	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var27	var27	0	0.653920548984792	0	280.838740914533	0.989895081688929	0.14979041564372	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var28	var28	0	0.719759503524831	0	277.41708583405	0.983046491866558	0.196622531113559	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var29	var29	0	0.725675776865143	86615.1480315815	268.196774164521	0.443498818238816	0.121470044896006	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var30	var30	0	0.857478473660295	37081.0431925278	286.162827544403	0.983046491866558	0.253530786238282	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var31	var31	0	0.751744017902084	0	276.362228496729	0.989895081688929	1	0.924958848665671	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var32	var32	0	0.978108618401383	0	285.72256677923	0.983046491866558	0.306024424517496	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var33	var33	0	0.99993316514364	124822.847216428	276.589351488647	0.147948925847613	0.121470044896006	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var34	var34	0	0.242528626574342	0	281.137098865892	0.983046491866558	0.196622531113559	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var35	var35	0	0.508321244841884	0	273.186257975745	0.983046491866558	0.0141133867640431	0.924958848665671	NA	NA	NA	0.0146666666666667	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	-603.4358	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var36	var36	0	0.316164521545126	2.61433151397349e-10	268.90084474405	0.983046491866558	0.644803266722344	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var37	var37	0	0.953719843399109	20144.5877011241	271.448160048801	0.800264575774149	0.356750278198418	0.861541599913403	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var38	var38	0	0.428134779270157	0	285.508280238472	0.989895081688929	0.592722965710858	0.924958848665671	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var39	var39	0	0.868929253676507	74721.1043100503	271.9525623048	0.983046491866558	0.568870942400682	0.924958848665671	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
+var40	var40	0	0.967902408294312	97407.8193511745	276.870664881354	0.983046491866558	0.121470044896006	0.877939640795251	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA