Mercurial > repos > jjohnson > mothur_toolsuite
directory /mothur/tools/mothur/ @ 11:11867a45a43d
| name | size | permissions |
|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 TreeVector.py
|
2465 | -rwxr-xr-x |
|
TreeVector.xml
|
1454 | -rw-r--r-- |
|
align.check.xml
|
2275 | -rw-r--r-- |
|
align.seqs.xml
|
5618 | -rw-r--r-- |
|
amova.xml
|
2481 | -rw-r--r-- |
|
anosim.xml
|
2392 | -rw-r--r-- |
|
bin.seqs.xml
|
2244 | -rw-r--r-- |
|
chimera.bellerophon.xml
|
5074 | -rw-r--r-- |
|
chimera.ccode.xml
|
4276 | -rw-r--r-- |
|
chimera.check.xml
|
3828 | -rw-r--r-- |
|
chimera.pintail.xml
|
9012 | -rw-r--r-- |
|
chimera.slayer.xml
|
6862 | -rw-r--r-- |
|
chimera.uchime.xml
|
8109 | -rw-r--r-- |
|
chop.seqs.xml
|
1959 | -rw-r--r-- |
|
classify.otu.xml
|
5182 | -rw-r--r-- |
|
classify.seqs.xml
|
5863 | -rw-r--r-- |
|
clearcut.xml
|
4489 | -rw-r--r-- |
|
cluster.classic.xml
|
3369 | -rw-r--r-- |
|
cluster.fragments.xml
|
2464 | -rw-r--r-- |
|
cluster.split.xml
|
6364 | -rw-r--r-- |
|
cluster.xml
|
4615 | -rw-r--r-- |
|
collect.shared.xml
|
3773 | -rw-r--r-- |
|
collect.single.xml
|
4100 | -rw-r--r-- |
|
consensus.seqs.xml
|
3436 | -rw-r--r-- |
|
corr.axes.xml
|
3887 | -rw-r--r-- |
|
count.seqs.xml
|
2454 | -rw-r--r-- |
|
degap.seqs.xml
|
1270 | -rw-r--r-- |
|
deunique.seqs.xml
|
1444 | -rw-r--r-- |
|
deunique.tree.xml
|
1483 | -rw-r--r-- |
|
dist.seqs.xml
|
3167 | -rw-r--r-- |
|
dist.shared.xml
|
3993 | -rw-r--r-- |
|
fastq.info.xml
|
1338 | -rw-r--r-- |
|
filter.seqs.xml
|
4283 | -rw-r--r-- |
|
get.group.xml
|
1219 | -rw-r--r-- |
|
get.groups.xml
|
4077 | -rw-r--r-- |
|
get.lineage.xml
|
5231 | -rw-r--r-- |
|
get.otulist.xml
|
2527 | -rw-r--r-- |
|
get.oturep.xml
|
4564 | -rw-r--r-- |
|
get.otus.xml
|
3318 | -rw-r--r-- |
|
get.rabund.xml
|
2247 | -rw-r--r-- |
|
get.relabund.xml
|
2779 | -rw-r--r-- |
|
get.sabund.xml
|
1992 | -rw-r--r-- |
|
get.seqs.xml
|
5483 | -rw-r--r-- |
|
get.sharedseqs.xml
|
4439 | -rw-r--r-- |
|
hcluster.xml
|
4750 | -rw-r--r-- |
|
heatmap.bin.xml
|
5950 | -rw-r--r-- |
|
heatmap.sim.xml
|
4683 | -rw-r--r-- |
|
homova.xml
|
2519 | -rw-r--r-- |
|
indicator.xml
|
3404 | -rw-r--r-- |
|
libshuff.xml
|
3349 | -rw-r--r-- |
|
list.seqs.xml
|
2975 | -rw-r--r-- |
|
make.design.xml
|
2021 | -rw-r--r-- |
|
make.fastq.xml
|
1326 | -rw-r--r-- |
|
make.group.xml
|
1627 | -rw-r--r-- |
|
make.shared.xml
|
2947 | -rw-r--r-- |
|
mantel.xml
|
1916 | -rw-r--r-- |
|
merge.files.xml
|
2857 | -rw-r--r-- |
|
merge.groups.xml
|
4292 | -rw-r--r-- |
|
metastats.xml
|
3365 | -rw-r--r-- |
|
mothur_wrapper.py
|
53288 | -rwxr-xr-x |
|
nmds.xml
|
2719 | -rw-r--r-- |
|
normalize.shared.xml
|
3470 | -rw-r--r-- |
|
otu.hierarchy.xml
|
2217 | -rw-r--r-- |
|
pairwise.seqs.xml
|
4193 | -rw-r--r-- |
|
parse.list.xml
|
1886 | -rw-r--r-- |
|
parsimony.xml
|
3138 | -rw-r--r-- |
|
pca.xml
|
2911 | -rw-r--r-- |
|
pcoa.xml
|
1640 | -rw-r--r-- |
|
phylo.diversity.xml
|
4224 | -rw-r--r-- |
|
phylotype.xml
|
2702 | -rw-r--r-- |
|
pre.cluster.xml
|
2992 | -rw-r--r-- |
|
rarefaction.shared.xml
|
3682 | -rw-r--r-- |
|
rarefaction.single.xml
|
3690 | -rw-r--r-- |
|
remove.groups.xml
|
4805 | -rw-r--r-- |
|
remove.lineage.xml
|
5215 | -rw-r--r-- |
|
remove.otus.xml
|
3336 | -rw-r--r-- |
|
remove.rare.xml
|
6211 | -rw-r--r-- |
|
remove.seqs.xml
|
6069 | -rw-r--r-- |
|
reverse.seqs.xml
|
1302 | -rw-r--r-- |
|
screen.seqs.xml
|
6032 | -rw-r--r-- |
|
sens.spec.xml
|
2766 | -rw-r--r-- |
|
sffinfo.xml
|
3210 | -rw-r--r-- |
|
split.abund.xml
|
5783 | -rw-r--r-- |
|
split.groups.xml
|
2163 | -rw-r--r-- |
|
sub.sample.xml
|
10431 | -rw-r--r-- |
|
summary.seqs.xml
|
1458 | -rw-r--r-- |
|
summary.shared.xml
|
3883 | -rw-r--r-- |
|
summary.single.xml
|
4192 | -rw-r--r-- |
|
tree.shared.xml
|
4451 | -rw-r--r-- |
|
trim.seqs.xml
|
8071 | -rw-r--r-- |
|
unifrac.unweighted.xml
|
3963 | -rw-r--r-- |
|
unifrac.weighted.xml
|
4242 | -rw-r--r-- |
|
unique.seqs.xml
|
1694 | -rw-r--r-- |
|
venn.xml
|
4709 | -rw-r--r-- |