Mercurial > repos > jjohnson > mothur_toolsuite
directory /mothur/tools/mothur/ @ 32:ec8df51e841a
| name | size | permissions |
|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 TreeVector.py
|
2465 | -rwxr-xr-x |
|
TreeVector.xml
|
1454 | -rw-r--r-- |
|
align.check.xml
|
2291 | -rw-r--r-- |
|
align.seqs.xml
|
5634 | -rw-r--r-- |
|
amova.xml
|
2497 | -rw-r--r-- |
|
anosim.xml
|
2408 | -rw-r--r-- |
|
bin.seqs.xml
|
2223 | -rw-r--r-- |
|
chimera.bellerophon.xml
|
5090 | -rw-r--r-- |
|
chimera.ccode.xml
|
4292 | -rw-r--r-- |
|
chimera.check.xml
|
3844 | -rw-r--r-- |
|
chimera.perseus.xml
|
2338 | -rw-r--r-- |
|
chimera.pintail.xml
|
9028 | -rw-r--r-- |
|
chimera.slayer.xml
|
7202 | -rw-r--r-- |
|
chimera.uchime.xml
|
8413 | -rw-r--r-- |
|
chop.seqs.xml
|
1992 | -rw-r--r-- |
|
classify.otu.xml
|
5161 | -rw-r--r-- |
|
classify.seqs.xml
|
5978 | -rw-r--r-- |
|
classify.tree.xml
|
3034 | -rw-r--r-- |
|
clearcut.xml
|
4505 | -rw-r--r-- |
|
cluster.classic.xml
|
3608 | -rw-r--r-- |
|
cluster.fragments.xml
|
2480 | -rw-r--r-- |
|
cluster.split.xml
|
6760 | -rw-r--r-- |
|
cluster.xml
|
4854 | -rw-r--r-- |
|
collect.shared.xml
|
7612 | -rw-r--r-- |
|
collect.single.xml
|
6268 | -rw-r--r-- |
|
consensus.seqs.xml
|
3413 | -rw-r--r-- |
|
cooccurrence.xml
|
8684 | -rw-r--r-- |
|
corr.axes.xml
|
3499 | -rw-r--r-- |
|
count.groups.xml
|
2915 | -rw-r--r-- |
|
count.seqs.xml
|
2639 | -rw-r--r-- |
|
create.database.xml
|
2815 | -rw-r--r-- |
|
degap.seqs.xml
|
1286 | -rw-r--r-- |
|
deunique.seqs.xml
|
1460 | -rw-r--r-- |
|
deunique.tree.xml
|
1499 | -rw-r--r-- |
|
dist.seqs.xml
|
3183 | -rw-r--r-- |
|
dist.shared.xml
|
8726 | -rw-r--r-- |
|
fastq.info.xml
|
1717 | -rw-r--r-- |
|
filter.seqs.xml
|
4299 | -rw-r--r-- |
|
get.coremicrobiome.xml
|
3429 | -rw-r--r-- |
|
get.group.xml
|
1235 | -rw-r--r-- |
|
get.groups.xml
|
5806 | -rw-r--r-- |
|
get.lineage.xml
|
5247 | -rw-r--r-- |
|
get.otulabels.xml
|
3411 | -rw-r--r-- |
|
get.otulist.xml
|
2506 | -rw-r--r-- |
|
get.oturep.xml
|
4528 | -rw-r--r-- |
|
get.otus.xml
|
3195 | -rw-r--r-- |
|
get.rabund.xml
|
2226 | -rw-r--r-- |
|
get.relabund.xml
|
2409 | -rw-r--r-- |
|
get.sabund.xml
|
1971 | -rw-r--r-- |
|
get.seqs.xml
|
5498 | -rw-r--r-- |
|
get.sharedseqs.xml
|
4213 | -rw-r--r-- |
|
hcluster.xml
|
4766 | -rw-r--r-- |
|
heatmap.bin.xml
|
5250 | -rw-r--r-- |
|
heatmap.sim.xml
|
5598 | -rw-r--r-- |
|
homova.xml
|
2535 | -rw-r--r-- |
|
indicator.xml
|
3330 | -rw-r--r-- |
|
libshuff.xml
|
3267 | -rw-r--r-- |
|
list.otulabels.xml
|
2717 | -rw-r--r-- |
|
list.seqs.xml
|
2991 | -rw-r--r-- |
|
make.biom.xml
|
2646 | -rw-r--r-- |
|
make.contigs.xml
|
5250 | -rw-r--r-- |
|
make.design.xml
|
1933 | -rw-r--r-- |
|
make.fastq.xml
|
1672 | -rw-r--r-- |
|
make.group.xml
|
1643 | -rw-r--r-- |
|
make.shared.xml
|
2848 | -rw-r--r-- |
|
make.shared_from_biom.xml
|
2402 | -rw-r--r-- |
|
mantel.xml
|
1932 | -rw-r--r-- |
|
merge.files.xml
|
2873 | -rw-r--r-- |
|
merge.groups.xml
|
4491 | -rw-r--r-- |
|
metastats.xml
|
2897 | -rw-r--r-- |
|
mothur_wrapper.py
|
61024 | -rwxr-xr-x |
|
nmds.xml
|
2735 | -rw-r--r-- |
|
normalize.shared.xml
|
3100 | -rw-r--r-- |
|
otu.association.xml
|
2862 | -rw-r--r-- |
|
otu.hierarchy.xml
|
2080 | -rw-r--r-- |
|
pairwise.seqs.xml
|
4209 | -rw-r--r-- |
|
parse.list.xml
|
1865 | -rw-r--r-- |
|
parsimony.xml
|
3056 | -rw-r--r-- |
|
pca.xml
|
2541 | -rw-r--r-- |
|
pcoa.xml
|
1656 | -rw-r--r-- |
|
pcr.seqs.xml
|
5939 | -rw-r--r-- |
|
phylo.diversity.xml
|
4140 | -rw-r--r-- |
|
phylotype.xml
|
2718 | -rw-r--r-- |
|
pre.cluster.xml
|
3461 | -rw-r--r-- |
|
rarefaction.shared.xml
|
5106 | -rw-r--r-- |
|
rarefaction.single.xml
|
4771 | -rw-r--r-- |
|
remove.groups.xml
|
5838 | -rw-r--r-- |
|
remove.lineage.xml
|
5269 | -rw-r--r-- |
|
remove.otulabels.xml
|
3356 | -rw-r--r-- |
|
remove.otus.xml
|
3212 | -rw-r--r-- |
|
remove.rare.xml
|
5523 | -rw-r--r-- |
|
remove.seqs.xml
|
5520 | -rw-r--r-- |
|
reverse.seqs.xml
|
1318 | -rw-r--r-- |
|
screen.seqs.xml
|
6674 | -rw-r--r-- |
|
sens.spec.xml
|
2745 | -rw-r--r-- |
|
seq.error.xml
|
7434 | -rw-r--r-- |
|
sffinfo.xml
|
3242 | -rw-r--r-- |
|
shhh.flows.xml
|
5810 | -rw-r--r-- |
|
shhh.seqs.xml
|
2173 | -rw-r--r-- |
|
sort.seqs.xml
|
4684 | -rw-r--r-- |
|
split.abund.xml
|
5658 | -rw-r--r-- |
|
split.groups.xml
|
2081 | -rw-r--r-- |
|
sub.sample.xml
|
9833 | -rw-r--r-- |
|
summary.qual.xml
|
1479 | -rw-r--r-- |
|
summary.seqs.xml
|
1490 | -rw-r--r-- |
|
summary.shared.xml
|
9501 | -rw-r--r-- |
|
summary.single.xml
|
7639 | -rw-r--r-- |
|
summary.tax.xml
|
3341 | -rw-r--r-- |
|
tree.shared.xml
|
9245 | -rw-r--r-- |
|
trim.flows.xml
|
7029 | -rw-r--r-- |
|
trim.seqs.xml
|
9624 | -rw-r--r-- |
|
unifrac.unweighted.xml
|
6862 | -rw-r--r-- |
|
unifrac.weighted.xml
|
6975 | -rw-r--r-- |
|
unique.seqs.xml
|
1710 | -rw-r--r-- |
|
venn.xml
|
4438 | -rw-r--r-- |