phageterm: test-data/Mu-like.fasta comparison

comparison test-data/Mu-like.fasta @ 24:c8f88ae512f3 draft default tip

Uploaded

author	mmonot
date	Tue, 17 Sep 2024 13:35:16 +0000
parents
children

comparison

equal deleted inserted replaced

-:26ceb3225190
+:c8f88ae512f3
+>Enterobacteria phage Mu, Spades assembly
+CCGCGCGCCTGTAACCAGTTCTGCGCATCCGTTGCCATTTTTATATTTCGGGCCATCATA
+ATTTCTTCTCCTTCTTAATTACGCAGCAGCGTTGAAATATCAACGTCCAGGTCTAATTCA
+CGGAAAGCCTGACGCAGATAATCTTCGTTAACACGCTCACCTTTACCGTGAGCCGTCATG
+GCTGCAAGGCGAAGTGAATGATTCAGAATGCGAAGCGCACCTGGTTTCTGCGCAATCTGC
+TGTAATAACTCCAGTTCTTTTTCGCCGTTAATCTGCCAGGCATCCGCAATAGCTTTTACA
+TCGGCTTTTTTGGTTTTATTAATTGCAGTGCGCTTTGCAATACGGGAAAACAGACGGGCA
+AATTCAACCGTTCTGTTACCCCCCGTCATATTTGAATAAACCCGGTGATTTCCCATCAGC
+ACAAGGCCAATACGGGTTGATTCCTGTAACAGGCGGAGTTCTTCCAGAACTTCGGCACCA
+AGATGATCAGCTTCGTCGATGATAACCAGCCCCTGTGTACCTTCAAGGCGACGTCGCAGG
+GCGCGGGAGAGCGGCCCTTTACGGCGTGGTGCGTCATTCATTCCCAGCTCAAACGCCAGT
+TCAGTAAGACATTCCAGAACGCTGGCACAGGATGGCGTAATGGTGATCATCCAGACATTG
+TTATTGGTGCGGCGATATTCACGGGCCGCTTCGGTTTTGCCCACACCAGGATTGCCACAT
+ACAACAGCAATACTTTCAGTCAGGCTGGCAAAACGCATACTTGTCCAGATTTGTTTTACC
+GTCTGCGTTTCCACAAAGCGGGGCGGTTCAGGTAGTTCTGCCACTGCATGATATTTTTCC
+AGCCAGCGTTGCAGCATTTGTGAAACACGCTCGTTATCCCCGTTGTACTTATCATTGATA
+AAACTACTGATAGTTCCGGTAGAAAGCCCGCTCTCAAGAGCAATTTGTTTAAAGGTGGTT
+TCTTCATTTTCTACAAGCGTGCGCAGTCCTGCGCGAATATCGGAAATATTCATCTGAATA
+ACCTCGTAATTAAATTTTGTTTAAACGTTAATTAAATGGCTTTTTTACGTCTGTTCTGTT
+CCAGAATATCCAGCGAATGATTCAGATATTCATCACGCTCAGTTTCGTATTCATCATCAC
+GCTCCTGATTCTTCACCCGTTCCGTATTACCGGAAGGCCGGAAAATACCAACAATTCGTG
+ATTCTGGTGCTGCTGGTTCGGCTATCTGCGGCAGCAGTTCAGCAACTTCCAGCGCGTCCA
+TTTGTTTCTGCGCCTTAATGGCTGCTTTCGTCGCAGATTTCAGTTGTTTCTGGCGGCGGC
+GATATTCACGGCCTGCCGCAGCATCATTAAATGCAACAGGTGCCAGACATTCCGCTTCAC
+AGATAAACCGACCGTCCAGGGTGTAGCAATAAACCGTGCTGTGTAGCTGCTGCGGATCAA
+ACCTGACCACAACTTTTTTCACGCCGGCATTCATTAATGCCATGTTGTAATAAACGTTTT
+TCGCGCCTTTAAGGGAGCCGCCAACTTTAAGCGTAAACTCGCCTTTGCGTGAAACGTTCA
+CCGCCTCGGCAGGCAGTAACAGCATCCGTTTTTGTTCTTCGGTTGGCTTACGCACAATCG
+TTCTGGCGTATTCACGCTCGAAAACATCATCAAACGAGAGTTTGCCCCCGCACATTTCTG
+TTTCACGGCCTGTTCTGGCATTGAACATCGCCACACCTTCGGCAAGGGTTTTCAGAAACA
+GCTCTGCATCAACAGCGCGGTCGCCATAGTTATCAGGTTTTGCCTGCGGATTTGGCCCCG
+TATATGCGCCAGCCAGTGCCGGATGCTTATCAACGTATTCCTCAAGCCCACCAACACCGA
+AAGCACGTTCAACAGGTTTTGCCTGGCCCCAGCCTTTACCGGCAACAACGCTTGTCCAGT
+GCATTTTCGCCCCCATCAGTAAAAACAGTCCTTTTGGATCGTCCTCTTTTACCTTAAAGC
+GGTAGCGATTGGGCGCGCCTCCCGTCAGCCATTTATTCGCAGCACCACGGGTGTTATCAA
+TGGTGATGTGAAAATCCTCCGGGATACCGTAGCGAGTCACAACATCCATGAACGAGAGGC
+GAATTGAATCAATGTTCTCGCTCACATCGCAGCGCCAGCCCAGAATTTTTCGGGTTTTCA
+CATCCTGCCAGAACCATGTTTTCGGACGGATCACATCACCGTTAAACCAGCGTACAAAGA
+CGTTATGCAGATAACCGTCGCCGTTGATCCACTGCATGGCGTCCAGGTGTTCCACAGTTC
+GCTGCTGTGCCGGTATCAGATGCATCAGTGCATGTTCACCTTCACGACAGGCAACAACCA
+TTGCCTCGTCCAGTTGCTGAATCCGGCGAAAGGCCGTGGCACGGGAGGGAATACTCCAGC
+CATGCTCGCGGGCTGCCAGTTCCAGACGCTCATAACATTTGCGGAAAGCGGGTTTTTCCG
+GTCGCAGATAATCTGCAATCAGAAACTGCCAGGCATCCTCGTCAAATTCACTTTTGTGAA
+CATTGCGACGGGATGCTCCACGTCCATCAACAAGTGCAGCCGCCCAGTCAGGCTTCGCAA
+ACTTCTGTACCTGGTAATACTTGTCCCGCAAAGTGGATGCGCTGACCTGGTAATGCCCTG
+CAACGGTCGCAAAAGCCGTTTTCGTTGAAATCCCCTGGTTCAGCATTTCGTCTGCAGCCT
+GAACCGCAGGCAACCATTTTTCAGCAAGTCTGCGCTGGGAATCGCTGGCGTTATCCCATT
+TGCTCCACAGTGCCTCACGATCATAATCATGGGCTTCCAGCGTGGGGCGGGCGATTTCAA
+AATACCCCAGGCTTGTTTCAATCTCTCCTTGTCTCAGCAATAACGCCGCTTTCGCTTCAA
+CAGGTAAAGAGTTCGCATTGTATTCAATTGCTTTACCACCTTTGACACCTGCTCTAGTGC
+GGTTTTGCCATCCTTGCTTTTTAGCAACATAAATCACACCAGCCGATGTTTTCGGCAAAC
+CAGGAAGATTCGCACACTCTTTCGGTGATACCCAAAGTTCCATGTTATTCACCTGCTTGA
+TATCGGCTAGGCCAGATTACTTCCGGTTTAGTTTCTAAGGCGTTAGCAATAATCTGCTCA
+CCCTTTGGCCAGTGTCGTTCTAGCGCATTAGCTAATGTAGTTGGCGCATAACCAAACTGC
+CGGGAAAGAGCTGATAAAGAGAGCTTTCTTTTCTTAAGTCCCGCAATCACATCCGCACGA
+TGCCAATCACGGGCCTTTTCGTTGGAACACATTTAAAAACCCTCCTAAGTTTTGTAATCT
+ATAAAGTTAGCAATTTAACTAAGTGTAAAAACTTAGCTAGCTTACTAAAAAGATAATTAC
+TGAAAAGCTTTTTGTAAAGCTGCTTTTTGGTAAATTCCTTTGATTACTGATTAACGCGTT
+GATAAATAAGGAGTTTAAATTTTGAAAAGTAACTTTATAGAAAAGAATAATACTGAAAAG
+TCAATTTGGTGTTCGCCGCAAGAAATTATGGCTGCTGATGGTATGCCTGGATCTGTTGCT
+GGTGTTCACTATCGAGCAAATGTTCAAGGCTGGACGAAGCAAAAAAAGGAAGGTGTCAAG
+GGGGGGAAAGCTGTTGAATACGATGTGATGTCGATGCCCACCAAAGAACGAGAGCAAGTT
+ATTGCGCACTTGGGGTTATCCACACCGGATACTGGTGCTCAAGCCAATGAGAAACAGGAT
+TCTTCGGAACTGATAAACAAATTAACCACAACCTTAATCAATATGATTGAAGAGCTGGAA
+CCAGATGAAGCACGCAAGGCACTGAAACTTTTAAGTAAAGGGGGGTTGTTGGCGTTAATG
+CCTCTTGTATTTAATGAACAGAAACTTTACAGCTTTATAGGATTTTCACAGCAAAGTATT
+CAGACGTTGATGATGCTAGATGCATTACCTGAAGAAAAACGCAAAGAGATTTTGTCAAAG
+TATGGGATTCATGAACAGGAAAGTGTTGTAGTACCTTCACAGGAACCACAGGAGGTAAAA
+AAAGCCGTATAACAACCATGAACCAGCTAAAACATACTTCACCTCACATAATCACACATG
+TAACATACCTAAACGGCATAAGCTGATTTGTGATATGAGTCATTTGGTGACAGCTTGGTT
+GTTATCGGTTTTGAACGTTTTTTGAAGCTGTTATTGAAATGATTTGCAGTGTTTTTGTTT
+TTCGTATTTTCAATGAAACAAAAGCAATTTTTTACTATCTTTCGCGTTTCATTGATTAAC
+GACTAAAATTTGCACTACAGGCTTGCAAGCCCCACCAAATCTAATCCCATCAGATCCCGA
+ATAATCCAATGTCCTCCCGGTTTTTTTCGTACTTCAAGTGAATCAATACATCCGGTGCAA
+TTATCCAAAACCTCGGTTTACAGGAAACGGTAAACAGGGCTAGGAACGCCGTGCAAAAGA
+ATGGCGATACCTTGTCCGGTGGGCTTACTTTTGAAAACGACTCAATCCTTGCCTGGATTC
+GAAATACTGACTGGGCAAAGATTGGATTTAAAAATGATGCCGACAGCGACACTGATTCAT
+ACATGTGGTTTGAAACAGGCGACAACGGCAATGAATATTTCAAATGGAGAAGCAAACAAA
+GCACCACAACAAAAGACCTGATGAATCTTAAATGGGATGCTTTGTCTGTTCTTGTCAATG
+CCATTGTAAATGGCGAAGTCATATCAAAATCAGCAAACGGCCTCCGTATTGCTTATGGTA
+ATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGGTTCAAATACATACTTCATGTTGACAAACTCCG
+GTGACAACATGGGGACTTATAACGGATTAAGGCCATTATGGATTAATAACGCTACTGGCG
+CTGTTTCGATGGGGCGTGGTCTTAATGTTTCAGGGGATACACTTTCAGACCGTTTTGCTA
+TTAACAGCAGTAATGGTATGTGGATTCAGATGCGCGATAACAACGCTATCTTTGGGAAAA
+ATATAGTTAACACTGATAGCGCTCAGGCGTTGCTTCGCCAGAATCACGCCGACCGCAAAT
+TTATGATTGGCGGTCTGGGAAATAAGCAATTTGGCATCTACATGATTAATAACTCAAGGA
+CAGCCAATGGCACCGATGGTCAGGCGTACATGGATAATAACGGAAACTGGTTATGCGGTG
+CTCAGGTCATTCCGGGAAATTACGCCAACTTTGACTCCCGCTACGTGCGTGACGTTCGGC
+TGGGAACTCAGTCACTGACTGGCGGCTTGTCTCGTGATTACAAGGCGCCATCCGGTCATG
+TTATTACAGGTTTTCATACCAATGGCGACTGGGAAATGCAGGGAGGGGATGACAAGGTTT
+ATATCCGTCCGGTTCAGAAGAATATCAACGGTACCTGGTATAATGTAGCGAGCGCCTGAT
+TATGATGCATCTGAAAAACATTAAGTCAGAAAATCCAAAAACTAAAGAGCAATATCAGCT
+AACAAAGAATTTTGATGTTATCTGGTTATGGTCCGAAGACGGGAAAAACTGGTATGAAGA
+AGTAAATAACTTTCAGGACGACACCATAAAGATTGTATACGACGAAAATAATATTATTGT
+TGCCATAACCAAAGATGCCTCAACGCTTAATCCCGAAGGCTTTAGCGTCGTTGAGATTCC
+AGATATAACAGCCAACCGCCGCGCTGATGATTCAGGAAAGTGGATGTTTAAGGATGGAGC
+TGTAGTTAAACGGATTTATACGGCAGACGAACAGCAACAACAAGCCGAATCACAAAAGGC
+CGCATTGCTTTCCGAAGCTGAATCAGTCATCCAGCCGCTGGAACGCGCTGTCAGGCTGAA
+TATGGCGACGGATGAGGAACGCGCACGACTGGAGTCATGGGAACGCTACAGTGTTCTGGT
+CAGCCGTGTGGATACGGCAAATCCCGAATGGCCACAAAAGCCTGAATAAAAATTAAGGCC
+CGATAGCGGGCCTTCTCTCATTCTGGTTGTTCTGGAAACGTTACTGGCAGGCTGGAGGTG
+TCTGTGGATTCGACCTTCTGCGCGTAGAGCATCCACTCTGTTAATTTTTGTTTATTCTCG
+TCGGAAATGATGCCCAGCCGTAGCTGTGAGTCCCATAGCTGTGTTTTATCCCTGACGAGC
+TGTAGCAGGCTTTGCTTTTCATTTTCCGCTTGTTGCCTCTGCTCTTCCTCGGTATAAGTT
+CGCTTTATCACTACACCATCTTTGAACATCCATTTACCCGAAATATCAGCCCGGCGATTT
+GCTGTAATATCAGGAACCTCAACGACGTTTGCGCCTTCTGGATTAATTGCTGAAACATCC
+TTTTCAATACAAATAATAACGCCGTTGTGGTCATAGACCATTTTCAACGTATCAGGCTGA
+AAGTTCTTTTGTTCCTCATACCAGTTTTTCCCATCCTCTGTATAAAGCCATTTGATGTTA
+AATTGTTTCGTTAGCTGGTATTGCTCTTTTGTTTTAGGGTTGCCAGCAGTAATATTTTTT
+AAGTGCATCATAATTAAATACTCCCCGCGTTATACCACGTTCCATTAATGCAATACTGAA
+TTGGCCTTGCCTGAGTTGTATCAATTAATTCATCACGGTTTCCGTTAACTGAACCCGTAA
+CGACATAACCTGACCTGTCAGACCAGCCGGGACCATTCCATGTCTGAACAGATGACAGAC
+CGCCAAGACGAATACCTGTAATAAACCTTGAGTTACATTCTGCCTGCGTATATGCACCAA
+CATCTCCCGCTGATGGCTTACGTGTTGTGGTGTAAATTTCTGACCAGTCAGCTTCGAATC
+CGTAACCATCACGCGCTGAACGATAAAAAATACCGCCGTTCCTGTAATTCACACGGAACT
+GTACGGCAGGGCAACTCCCCGTATTCATATTGAAGTGGAGGATTAATGTCGATGCGCCAC
+CAATATTTGCGTTATAGACCCCGCTATTCCAGTTCCAGCCAACAGCTTTATCATTTCCGA
+CAGTGCTTCCTGTTTGTCCTAAAGCAAATGCAGGCTGCTGGTTTTTCGTGTTGTAGTCTC
+GTCGCCAGCCAGGAGCATAAGCATCACCATGATTAATATAAGTGAATTGAGCGTTAGTGA
+TTCCGCCGCCGCTGGACGTACTCGGCGTAGTAACGCGTATGGTCATTGCGCCGCGAGTGC
+CAATAACTTCCACCACAGCACCTGCAAGACAAATATTTCCGCAACCTGTATCTGTAATGA
+CCTTATTGTTTGCATAAGCCCATGAGCCTTTGCACATCCAGTAAGGATGGTTAAATGCCC
+CCTGACTCTCCAGCCACGAAATAAATTGTGCGGTTGTCCAGACCTGACTATCGCCACCAA
+TATTCAGCCATGCGCTATATGCGCGACAGGCCCCAATATTTTTGGTGAAGGTATCTTTTC
+CTGGAATATCTGCGCCGTTCTGGTTTTGCTGTAATGCGCCAGAAGCCTGATTTACCGTTT
+CCTGTAAACCGAGGTTTTGGATAACGTCCGCCGGG

Mercurial > repos > mmonot > phageterm

comparison test-data/Mu-like.fasta @ 24:c8f88ae512f3 draft default tip