rseqc: 6b33e31bda10 /test-data/

directory /test-data/ @ 49:6b33e31bda10 draft

name	size	permissions
[up]		drwxr-xr-x
bamstats.txt	801	-rw-r--r--
hg19.chrom.sizes	1971	-rw-r--r--
hg19_RefSeq_chr1_1-100000.bed	527	-rw-r--r--
output.DupRate_plot.r	817	-rw-r--r--
output.GC.xls	159	-rw-r--r--
output.GC_plot.r	302	-rw-r--r--
output.NVC.xls	924	-rw-r--r--
output.NVC_plot.r	1583	-rw-r--r--
output.clipping_profile.pdf	4992	-rw-r--r--
output.clipping_profile.r	260	-rw-r--r--
output.clipping_profile.xls	162	-rw-r--r--
output.eRPKM.xls	1210	-rw-r--r--
output.geneBodyCoverage.curves.pdf	4849	-rw-r--r--
output.geneBodyCoverage.r	764	-rw-r--r--
output.geneBodyCoverage.txt	758	-rw-r--r--
output.infer_experiment.txt	195	-rw-r--r--
output.inner_distance.txt	1120	-rw-r--r--
output.inner_distance_freq.txt	1015	-rw-r--r--
output.inner_distance_plot.pdf	8520	-rw-r--r--
output.inner_distance_plot.r	1099	-rw-r--r--
output.junction.xls	163	-rw-r--r--
output.junctionSaturation_plot.r	589	-rw-r--r--
output.junction_plot.r	500	-rw-r--r--
output.pos.DupRate.xls	31	-rw-r--r--
output.qual.r	9725	-rw-r--r--
output.rawCount.xls	613	-rw-r--r--
output.read_distribution.txt	1110	-rw-r--r--
output.saturation.r	2298	-rw-r--r--
output.seq.DupRate.xls	31	-rw-r--r--
output.splice_events.pdf	12367	-rw-r--r--
output.splice_junction.pdf	12378	-rw-r--r--
output2.geneBodyCoverage.curves.pdf	4849	-rw-r--r--
output2.geneBodyCoverage.heatMap.pdf	4849	-rw-r--r--
output2.geneBodyCoverage.r	764	-rw-r--r--
output2.geneBodyCoverage.txt	758	-rw-r--r--
output_read_count.xls	2248	-rw-r--r--
pairend_strandspecific_51mer_hg19_chr1_1-100000.bam	3449	-rw-r--r--
testwig.Forward.wig	1735	-rw-r--r--
testwig.Reverse.wig	20545	-rw-r--r--
testwig.wig	20006	-rw-r--r--

Mercurial > repos > nilesh > rseqc

directory /test-data/ @ 49:6b33e31bda10 draft