Mercurial > repos > onnodg > blast_annotations_processor
diff test-data/output_circle_data.txt @ 2:9ca209477dfd draft
planemo upload for repository https://github.com/Onnodg/Naturalis_NLOOR/tree/main/NLOOR_scripts/process_annotations_tool commit 4017d38cf327c48a6252e488ba792527dae97a70-dirty
| author | onnodg |
|---|---|
| date | Mon, 15 Dec 2025 16:43:36 +0000 |
| parents | a3989edf0a4a |
| children | ca2f07b71581 |
line wrap: on
line diff
--- a/test-data/output_circle_data.txt Mon Oct 20 12:26:51 2025 +0000 +++ b/test-data/output_circle_data.txt Mon Dec 15 16:43:36 2025 +0000 @@ -1,530 +1,412 @@ -[ - { - "labels": [ - "Viridiplantae" - ], - "sizes": [ - 3373 - ] - }, - { - "labels": [ - "Streptophyta" - ], - "sizes": [ - 3373 - ] - }, - { - "labels": [ - "Magnoliopsida", - "Pinopsida" - ], - "sizes": [ - 3372, - 1 - ] - }, - { - "labels": [ - "Apiales", - "Asterales", - "Boraginales", - "Brassicales", - "Caryophyllales", - "Celastrales", - "Cornales", - "Dipsacales", - "Ericales", - "Fabales", - "Fagales", - "Gentianales", - "Lamiales", - "Malpighiales", - "Malvales", - "Myrtales", - "Oxalidales", - "Piperales", - "Poales", - "Ranunculales", - "Rosales", - "Solanales", - "Uncertain taxa", - "Cupressales" - ], - "sizes": [ - 66, - 161, - 2, - 6, - 109, - 1, - 2, - 4, - 7, - 141, - 395, - 2, - 226, - 405, - 5, - 6, - 1, - 1, - 321, - 160, - 1161, - 172, - 18, - 1 - ] - }, - { - "labels": [ - "Apiaceae", - "Asteraceae", - "Boraginaceae", - "Brassicaceae", - "Polygonaceae", - "Celastraceae", - "Cornaceae", - "Adoxaceae", - "Ericaceae", - "Primulaceae", - "Fabaceae", - "Betulaceae", - "Fagaceae", - "Juglandaceae", - "Apocynaceae", - "Lamiaceae", - "Orobanchaceae", - "Plantaginaceae", - "Euphorbiaceae", - "Linaceae", - "Salicaceae", - "Malvaceae", - "Thymelaeaceae", - "Onagraceae", - "Oxalidaceae", - "Aristolochiaceae", - "Poaceae", - "Ranunculaceae", - "Cannabaceae", - "Rosaceae", - "Ulmaceae", - "Uncertain taxa", - "Urticaceae", - "Convolvulaceae", - "Solanaceae", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Taxaceae" - ], - "sizes": [ - 66, - 161, - 2, - 6, - 109, - 1, - 2, - 4, - 1, - 6, - 141, - 311, - 77, - 7, - 2, - 76, - 3, - 147, - 1, - 10, - 394, - 1, - 4, - 6, - 1, - 1, - 321, - 160, - 7, - 88, - 1059, - 6, - 1, - 12, - 156, - 4, - 18, - 1 - ] - }, - { - "labels": [ - "Aegopodium", - "Apium", - "Uncertain taxa", - "Achillea", - "Artemisia", - "Calendula", - "Cirsium", - "Erigeron", - "Galinsoga", - "Gnaphalium", - "Inula", - "Lactuca", - "Matricaria", - "Tussilago", - "Uncertain taxa", - "Xanthium", - "Echium", - "Brassica", - "Capsella", - "Cardamine", - "Fagopyrum", - "Persicaria", - "Polygonum", - "Rumex", - "Uncertain taxa", - "Euonymus", - "Cornus", - "Sambucus", - "Calluna", - "Lysimachia", - "Lathyrus", - "Pisum", - "Trifolium", - "Uncertain taxa", - "Vicia", - "Alnus", - "Betula", - "Carpinus", - "Uncertain taxa", - "Fagus", - "Quercus", - "Juglans", - "Vinca", - "Glechoma", - "Mentha", - "Teucrium", - "Uncertain taxa", - "Orobanche", - "Rhinanthus", - "Plantago", - "Veronica", - "Euphorbia", - "Linum", - "Populus", - "Hibiscus", - "Daphne", - "Circaea", - "Uncertain taxa", - "Oxalis", - "Aristolochia", - "Festuca", - "Poa", - "Uncertain taxa", - "Ranunculus", - "Uncertain taxa", - "Humulus", - "Filipendula", - "Pyrus", - "Rubus", - "Uncertain taxa", - "Ulmus", - "Uncertain taxa", - "Urtica", - "Convolvulus", - "Capsicum", - "Nicandra", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Taxus" - ], - "sizes": [ - 41, - 9, - 16, - 2, - 5, - 1, - 19, - 2, - 1, - 1, - 1, - 1, - 2, - 4, - 120, - 2, - 2, - 2, - 1, - 3, - 1, - 1, - 29, - 76, - 2, - 1, - 2, - 4, - 1, - 6, - 16, - 1, - 113, - 1, - 10, - 193, - 19, - 91, - 8, - 15, - 62, - 7, - 2, - 9, - 9, - 1, - 57, - 2, - 1, - 134, - 13, - 1, - 10, - 394, - 1, - 4, - 1, - 5, - 1, - 1, - 28, - 96, - 197, - 158, - 2, - 7, - 19, - 13, - 3, - 53, - 1059, - 6, - 1, - 12, - 1, - 1, - 154, - 4, - 18, - 1 - ] - }, - { - "labels": [ - "Aegopodium podagraria", - "Apium graveolens", - "Uncertain taxa", - "Achillea millefolium", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Cirsium arvense", - "Cirsium vulgare", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Gnaphalium uliginosum", - "Inula salicina", - "Lactuca sativa", - "Matricaria chamomilla", - "Tussilago farfara", - "Uncertain taxa", - "Xanthium strumarium", - "Echium vulgare", - "Brassica oleracea", - "Capsella bursa-pastoris", - "Uncertain taxa", - "Fagopyrum esculentum", - "Uncertain taxa", - "Polygonum aviculare", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Euonymus europaeus", - "Cornus mas", - "Cornus sericea", - "Uncertain taxa", - "Calluna vulgaris", - "Lysimachia thyrsiflora", - "Lysimachia vulgaris", - "Uncertain taxa", - "Lathyrus pratensis", - "Pisum sativum", - "Trifolium arvense", - "Trifolium medium", - "Trifolium repens", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Vicia faba", - "Vicia hirsuta", - "Alnus incana", - "Betula pendula", - "Carpinus betulus", - "Uncertain taxa", - "Fagus sylvatica", - "Quercus rubra", - "Juglans regia", - "Vinca minor", - "Glechoma hederacea", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Plantago lanceolata", - "Plantago major", - "Uncertain taxa", - "Veronica chamaedrys", - "Euphorbia myrsinites", - "Linum usitatissimum", - "Populus tremula", - "Uncertain taxa", - "Hibiscus trionum", - "Daphne mezereum", - "Circaea lutetiana", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Aristolochia clematitis", - "Festuca rubra", - "Poa compressa", - "Poa pratensis", - "Poa trivialis", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Ranunculus acris", - "Ranunculus muricatus", - "Ranunculus repens", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Humulus lupulus", - "Filipendula ulmaria", - "Pyrus communis", - "Rubus idaeus", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Urtica dioica", - "Convolvulus arvensis", - "Capsicum annuum", - "Nicandra physalodes", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Uncertain taxa", - "Taxus baccata" - ], - "sizes": [ - 41, - 9, - 16, - 2, - 5, - 1, - 17, - 2, - 2, - 1, - 1, - 1, - 1, - 2, - 4, - 120, - 2, - 2, - 2, - 1, - 3, - 1, - 1, - 29, - 76, - 2, - 1, - 1, - 1, - 4, - 1, - 1, - 4, - 1, - 16, - 1, - 4, - 89, - 12, - 8, - 1, - 9, - 1, - 193, - 19, - 91, - 8, - 15, - 62, - 7, - 2, - 9, - 9, - 1, - 57, - 2, - 1, - 22, - 109, - 3, - 13, - 1, - 10, - 379, - 15, - 1, - 4, - 1, - 5, - 1, - 1, - 28, - 3, - 1, - 1, - 91, - 197, - 1, - 10, - 146, - 1, - 2, - 7, - 19, - 13, - 3, - 53, - 1059, - 6, - 1, - 12, - 1, - 1, - 154, - 4, - 18, - 1 - ] - } +[ + { + "labels": [ + "Viridiplantae" + ], + "sizes": [ + 3227 + ] + }, + { + "labels": [ + "Streptophyta" + ], + "sizes": [ + 3227 + ] + }, + { + "labels": [ + "Magnoliopsida", + "Pinopsida" + ], + "sizes": [ + 3226, + 1 + ] + }, + { + "labels": [ + "Apiales", + "Asterales", + "Boraginales", + "Brassicales", + "Caryophyllales", + "Celastrales", + "Dipsacales", + "Ericales", + "Fabales", + "Fagales", + "Gentianales", + "Lamiales", + "Malpighiales", + "Poales", + "Ranunculales", + "Rosales", + "Solanales", + "Uncertain taxa", + "Cupressales" + ], + "sizes": [ + 62, + 146, + 2, + 6, + 108, + 1, + 1, + 7, + 141, + 382, + 2, + 220, + 396, + 317, + 157, + 1093, + 170, + 15, + 1 + ] + }, + { + "labels": [ + "Apiaceae", + "Asteraceae", + "Uncertain taxa", + "Boraginaceae", + "Brassicaceae", + "Polygonaceae", + "Celastraceae", + "Adoxaceae", + "Ericaceae", + "Primulaceae", + "Fabaceae", + "Betulaceae", + "Fagaceae", + "Juglandaceae", + "Apocynaceae", + "Lamiaceae", + "Orobanchaceae", + "Plantaginaceae", + "Uncertain taxa", + "Linaceae", + "Salicaceae", + "Poaceae", + "Ranunculaceae", + "Cannabaceae", + "Rosaceae", + "Ulmaceae", + "Urticaceae", + "Convolvulaceae", + "Solanaceae", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Taxaceae" + ], + "sizes": [ + 62, + 137, + 9, + 2, + 6, + 108, + 1, + 1, + 1, + 6, + 141, + 301, + 74, + 7, + 2, + 72, + 1, + 144, + 3, + 10, + 386, + 317, + 157, + 7, + 78, + 1007, + 1, + 9, + 128, + 33, + 15, + 1 + ] + }, + { + "labels": [ + "Aegopodium", + "Apium", + "Uncertain taxa", + "Achillea", + "Calendula", + "Cirsium", + "Erigeron", + "Matricaria", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Echium", + "Brassica", + "Uncertain taxa", + "Fagopyrum", + "Persicaria", + "Polygonum", + "Rumex", + "Uncertain taxa", + "Euonymus", + "Sambucus", + "Uncertain taxa", + "Lysimachia", + "Uncertain taxa", + "Lathyrus", + "Trifolium", + "Uncertain taxa", + "Vicia", + "Alnus", + "Betula", + "Carpinus", + "Uncertain taxa", + "Fagus", + "Quercus", + "Juglans", + "Vinca", + "Glechoma", + "Mentha", + "Uncertain taxa", + "Rhinanthus", + "Plantago", + "Veronica", + "Uncertain taxa", + "Linum", + "Populus", + "Festuca", + "Poa", + "Uncertain taxa", + "Ranunculus", + "Humulus", + "Filipendula", + "Uncertain taxa", + "Ulmus", + "Urtica", + "Convolvulus", + "Capsicum", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Taxus" + ], + "sizes": [ + 8, + 2, + 52, + 1, + 1, + 18, + 1, + 2, + 114, + 9, + 2, + 1, + 5, + 1, + 1, + 3, + 75, + 28, + 1, + 1, + 1, + 1, + 5, + 13, + 97, + 21, + 10, + 177, + 4, + 9, + 111, + 14, + 60, + 7, + 2, + 1, + 5, + 66, + 1, + 131, + 13, + 3, + 10, + 386, + 3, + 7, + 307, + 157, + 7, + 17, + 61, + 1007, + 1, + 9, + 1, + 127, + 33, + 15, + 1 + ] + }, + { + "labels": [ + "Aegopodium podagraria", + "Apium graveolens", + "Uncertain taxa", + "Achillea millefolium", + "Uncertain taxa", + "Cirsium arvense", + "Cirsium vulgare", + "Uncertain taxa", + "Matricaria chamomilla", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Echium vulgare", + "Brassica oleracea", + "Uncertain taxa", + "Fagopyrum esculentum", + "Uncertain taxa", + "Polygonum aviculare", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Euonymus europaeus", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Lathyrus pratensis", + "Uncertain taxa", + "Trifolium arvense", + "Trifolium repens", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Vicia faba", + "Vicia hirsuta", + "Alnus incana", + "Betula pendula", + "Carpinus betulus", + "Uncertain taxa", + "Fagus sylvatica", + "Quercus rubra", + "Juglans regia", + "Vinca minor", + "Glechoma hederacea", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Plantago lanceolata", + "Plantago major", + "Uncertain taxa", + "Veronica chamaedrys", + "Uncertain taxa", + "Linum usitatissimum", + "Populus tremula", + "Uncertain taxa", + "Festuca rubra", + "Poa compressa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Ranunculus acris", + "Ranunculus repens", + "Uncertain taxa", + "Humulus lupulus", + "Filipendula ulmaria", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Urtica dioica", + "Convolvulus arvensis", + "Capsicum annuum", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Taxus baccata" + ], + "sizes": [ + 8, + 2, + 52, + 1, + 1, + 16, + 2, + 1, + 2, + 114, + 9, + 2, + 1, + 5, + 1, + 1, + 3, + 75, + 28, + 1, + 1, + 1, + 1, + 5, + 1, + 12, + 2, + 9, + 86, + 21, + 9, + 1, + 177, + 4, + 9, + 111, + 14, + 60, + 7, + 2, + 1, + 5, + 66, + 1, + 22, + 109, + 4, + 9, + 3, + 10, + 22, + 364, + 3, + 1, + 6, + 307, + 1, + 20, + 136, + 7, + 17, + 61, + 1007, + 1, + 9, + 1, + 127, + 33, + 15, + 1 + ] + } ] \ No newline at end of file