Mercurial > repos > onnodg > blast_annotations_processor
diff test-data/obiclean_output3.txt @ 2:9ca209477dfd draft default tip
planemo upload for repository https://github.com/Onnodg/Naturalis_NLOOR/tree/main/NLOOR_scripts/process_annotations_tool commit 4017d38cf327c48a6252e488ba792527dae97a70-dirty
| author | onnodg |
|---|---|
| date | Mon, 15 Dec 2025 16:43:36 +0000 |
| parents | |
| children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/obiclean_output3.txt Mon Dec 15 16:43:36 2025 +0000 @@ -0,0 +1,424 @@ +[ + { + "labels": [ + "Viridiplantae" + ], + "sizes": [ + 75 + ] + }, + { + "labels": [ + "Streptophyta" + ], + "sizes": [ + 75 + ] + }, + { + "labels": [ + "Magnoliopsida" + ], + "sizes": [ + 75 + ] + }, + { + "labels": [ + "Apiales", + "Asterales", + "Brassicales", + "Caryophyllales", + "Cornales", + "Dipsacales", + "Ericales", + "Fabales", + "Fagales", + "Gentianales", + "Lamiales", + "Malpighiales", + "Malvales", + "Myrtales", + "Poales", + "Ranunculales", + "Rosales", + "Solanales", + "Uncertain taxa" + ], + "sizes": [ + 3, + 13, + 1, + 3, + 1, + 1, + 3, + 8, + 7, + 1, + 7, + 3, + 1, + 1, + 6, + 3, + 7, + 5, + 1 + ] + }, + { + "labels": [ + "Apiaceae", + "Asteraceae", + "Brassicaceae", + "Polygonaceae", + "Cornaceae", + "Adoxaceae", + "Ericaceae", + "Primulaceae", + "Fabaceae", + "Betulaceae", + "Fagaceae", + "Juglandaceae", + "Apocynaceae", + "Lamiaceae", + "Orobanchaceae", + "Plantaginaceae", + "Linaceae", + "Salicaceae", + "Thymelaeaceae", + "Onagraceae", + "Poaceae", + "Ranunculaceae", + "Cannabaceae", + "Rosaceae", + "Ulmaceae", + "Uncertain taxa", + "Convolvulaceae", + "Solanaceae", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa" + ], + "sizes": [ + 3, + 13, + 1, + 3, + 1, + 1, + 1, + 2, + 8, + 4, + 2, + 1, + 1, + 3, + 1, + 3, + 1, + 2, + 1, + 1, + 6, + 3, + 1, + 4, + 1, + 1, + 1, + 3, + 1, + 1 + ] + }, + { + "labels": [ + "Aegopodium", + "Apium", + "Uncertain taxa", + "Achillea", + "Artemisia", + "Cirsium", + "Erigeron", + "Galinsoga", + "Gnaphalium", + "Inula", + "Lactuca", + "Matricaria", + "Tussilago", + "Uncertain taxa", + "Xanthium", + "Cardamine", + "Polygonum", + "Rumex", + "Uncertain taxa", + "Cornus", + "Sambucus", + "Calluna", + "Lysimachia", + "Lathyrus", + "Pisum", + "Trifolium", + "Uncertain taxa", + "Vicia", + "Alnus", + "Betula", + "Carpinus", + "Uncertain taxa", + "Fagus", + "Quercus", + "Juglans", + "Vinca", + "Glechoma", + "Mentha", + "Uncertain taxa", + "Orobanche", + "Plantago", + "Veronica", + "Linum", + "Populus", + "Daphne", + "Uncertain taxa", + "Festuca", + "Poa", + "Uncertain taxa", + "Ranunculus", + "Humulus", + "Filipendula", + "Pyrus", + "Rubus", + "Uncertain taxa", + "Ulmus", + "Uncertain taxa", + "Convolvulus", + "Capsicum", + "Nicandra", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa" + ], + "sizes": [ + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 2, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 2, + 1, + 1, + 4, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 2, + 1, + 1, + 2, + 1, + 1, + 1, + 4, + 1, + 3, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1 + ] + }, + { + "labels": [ + "Aegopodium podagraria", + "Apium graveolens", + "Uncertain taxa", + "Achillea millefolium", + "Uncertain taxa", + "Cirsium arvense", + "Cirsium vulgare", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Gnaphalium uliginosum", + "Inula salicina", + "Lactuca sativa", + "Matricaria chamomilla", + "Tussilago farfara", + "Uncertain taxa", + "Xanthium strumarium", + "Uncertain taxa", + "Polygonum aviculare", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Cornus mas", + "Uncertain taxa", + "Calluna vulgaris", + "Lysimachia thyrsiflora", + "Lysimachia vulgaris", + "Lathyrus pratensis", + "Pisum sativum", + "Trifolium arvense", + "Trifolium medium", + "Trifolium repens", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Vicia faba", + "Alnus incana", + "Betula pendula", + "Carpinus betulus", + "Uncertain taxa", + "Fagus sylvatica", + "Quercus rubra", + "Juglans regia", + "Vinca minor", + "Glechoma hederacea", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Plantago lanceolata", + "Plantago major", + "Veronica chamaedrys", + "Linum usitatissimum", + "Populus tremula", + "Uncertain taxa", + "Daphne mezereum", + "Uncertain taxa", + "Festuca rubra", + "Poa compressa", + "Poa pratensis", + "Poa trivialis", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Ranunculus muricatus", + "Ranunculus repens", + "Uncertain taxa", + "Humulus lupulus", + "Filipendula ulmaria", + "Pyrus communis", + "Rubus idaeus", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Convolvulus arvensis", + "Capsicum annuum", + "Nicandra physalodes", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa", + "Uncertain taxa" + ], + "sizes": [ + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1, + 1 + ] + } +] \ No newline at end of file