Mercurial > repos > padge > phykit
view test-data/12_YPR191W_Anc_7.548_codon_aln.fasta.clipkit @ 0:37b049bf729a draft
"planemo upload for repository https://github.com/JLSteenwyk/PhyKIT commit cbe1e8577ecb1a46709034a40dff36052e876e7a-dirty"
| author | padge |
|---|---|
| date | Mon, 28 Mar 2022 16:23:18 +0000 |
| parents | |
| children |
line wrap: on
line source
>Kpol ATGTTGGAAA---------GTTAAACGTGTTCAACAATAGTTCGTTATCCATCAATTCCA CAAC--AACTTGATAACGTTTCTAATTGTTTTAAAGTTTAGCTGGTCTCGTTCTACAAGA TGGGTCTCCCATTGTTATCAAGATTTAACTTCCAAACACTACGATAAGTGCTTTGAGTCG TAAGAGAACTGAATTATAGGTGGTAACAAGTCTACGTTTGAATATATCACTTTATCTGCT ATTTCTTGAAGATCTACCATACTACTCAACTTTAGTATGTTTATTAAACTTTTTCAGACC TCGAATTACCAGAACTGTTATTCCTGGCTAAACTGACCTAGCCGTAGCTGAAACATCACT ACAAAAGGCTGAAGATTTGCTATACAACATCCTTTCGATCTGGCTAGGTAACCTGTTTAT TGATTTTAAACGTTTCTTTGGAAATATTAAGTCTTTGCTGCAAATCTACACCAAGAAAAT ATTAGATTGTTGGAAGGTATCAATAAGCTCTTGGAATTCTCAATGACTCATGTTAACTCC TGCCAACTGGTTCCCTTAGTTTCTAAGGCTGAACAAGACTTTTGTTG---GCTAGATCAG AAAAGAAGGTGAAAGTTCAGCTTTGCCATTCCAGTAAGAAGAAAGCTTGCCGATACGAAT TTTATCTGTACTACTTTGATCTATCTAACTACCACCTTTATCGATTCCGCTATAGATAAA TACTCTGATATT-GTTTGTTCTCTTTGTACGTAAGGTTCTATGCTGAGTTATTTCTCAAA TTTAAAAGTTTATCTGAATTAAGAGGACACTGATATTTCTGTTCTAAAGATGACTCCGCG CTAACTTTAGAATGAACAAAATGCCGAACGTCGAATGAATGGATTCTGTAAAATCCTTAA ATTACCAAATTCAGTTACTCGCTGTCGGGATCCCAAATTGCCTATTTAACCATTG >Kpha ATGCTACCTC---------ACTACAGTTTCAAAACAATGATTAGACTGCAATAGTCGCCA AACAGTAATACGAAGAATTATCCTTCTATATTAAAGTGAGGCTGGACTCGTTCTTCAAGA TGGGTTTCTCATTACTTTCGAGGTTCAACTTTCAAACACTACAATAAATGCTTTGAGTAG TAAGGGAACTGAACTTTAGGTGGTGATGAATCCACGTCCGGATTTATCACTTTGAAGGCA GTTTTTTGGAGATTTGCCTTATTATTCGAAAATCGTACGTCTTTCAAACATTTTCAAACC ATGAACTAGTCGAACAGTATTACCTGGCTCATCTGATTTAACTCTAAATAATATTCACCA ACATAAAGCCGAAGATTCGCTATACAATTTGCTTTCGATCAGGTTAGGTAACCAGTCTTT CGATTTGAAAGATTTCTTTGGATAGTTAAAAGCTTCGCTATAAATTTACACTAGGAAAAT ATTACATCGAAGCGAGGAATTGAAAAAATCTTGAAATTCTCACTGAATCTGCATAATTCT TGCCAGCTGGTTCCAATAAAGGCAGAAAACCAATCACCAT---ACTGCAATCGAGGTAAG ACACGTCGGTGAATGTTCAGCTTTGCTATCCCATTGAATTAACGAATACCAACTTCCAAT ATTAAAGATATTACCAAGATGTCTCTGGATACAGATTTGATCACCACTATTGTGGATGCT TACTCCGATGTG-GTTTATTCTCTTTGTACGTCAAGTCATACACTATAAAGTCGGCTCCA TTCAGAAATCTTTCTGAATTGAAAAGGTATCAATATCTCTTCTCTAAATATCACTATGCA GCATCCTTACAGC----------------GCAACTGTGTGTTCAAAAGTTAAAGATTCAA GTTGACTATTTTAATTACCGGCTGTAGGGATTCCAAATTACCTACTACATGATTA >Kbla ATGTTAGATT---------GAAATCAAGTTAGCCCAAATGCTTTCTATATGTGTCTGCTG TTGT--ACTCAAGTGCAGTTTCTCCTTAGTTCAGAGTCCGGGTGGTCAAGATCTGATGGA TGGGTTTCTCATTGTTATCTAGATTTAATTACCAGATACCGTGAAAAACTCTCTAAGTAG TAAGAGAACTGAATTGTGGGTGGTAAACAATCTACGTCTGAATATATCACTTTATCTGCT CATTCTTGAAGATTTACCTTATTTTTCGAATATTGCATGTTTATTAAACTTATTCAATAA AGGAATTAACAGAACTGTCTTACCAGGCTCAACTGATTTCCAAGTCTCTCTTTTAGACCT GTAGACTGCTGAAAATGGGTTATTCAACCTTCTTTCGAAACGGTTGGGTAACCAGTCTAT TGACTTAAGAAATCAATGTTGATATATTAAAACTTCTCTCAAAGTATATACAAGGAAAAT ATTGAATCGTTGGAGGCCGTCAATAAGCCCTTGAAATTCTAGAAGAATCAGAATCCTCAA TGCCAACAGGTACACTTGGCTAGCTCTCAACCACAAGACTTTCAGTG---GCCAGATTAG ATCTTTGGGTGAACGTCGTGGTTTAGTGTACCTGTCAGAAAAACAATCGATGATTTGAAT CTTGGCCACATTGAATTCCATTAAGTTCAATATAAAACTGTTGATGATTGTATACTAAGA TTCAATGATATT-GTCTCTTTACATTATATGTCAGGAACTATCCAGCTCAATAGGTACTA TTCAGCTATTTCAATCAATTAAAAAGGCCAAGATATCACCAAGCAATTGATAACCGAAGT GTTTCGATTGAATGCCTCTGTTGCAAATGAAACAATGGTCTTCCAAGATAAAGGAATCAA ATTGAACGATTCAGTTACTTGCCGTTGGAATTCCAAATTGCCTTCAAAATGATTA >Sdai ATGTTGCATTACAAAACTTAAATTTGCTAGAGTCTCTTTAAACATTACATGTCTTAGCTG TGGT--AGCCAAGTAAAGTTTCCCATTAGATGAAAGTCCAGCAGGGCCAGATCGAATAGA TGGCTATCTCACTATTATCTCGCTTCAATTTCCAAATACAATGATAAATGCTTTACGTAG TTAGAGAACTGAATTGTAAGTGGTAAAGCTTCCACGTTTGAATATATTACTTTGAAAGCT ACTTTTTAGACATTTACCATATTATTTAATCTTACAATGTCTATTAAACATTTTTAGACC TTGAATTACCTGAGCTGTTCTTCCTGGCAAACTCGACCTGGCACGTTATGACCAAAATCT ATATGTAGCTCATGAATTATTATACAATATTCTTATGATCTGGATAGGTAACCAATTCTT TGATTTAACCTATCGCATTGGAGAAATTCAAATTTTGCTGTGATTTTATACGAAGACAAT ATTGTATAATTGGTCGGTGTTAACCTAACTCTTAGGTTCTTAATGATTCTTATTTATTCA TACCAGTTGGTAAACTTAGTTGGATCAAGCGCAATAATCTTTCGTAGAAAGCAAGATAAG AAATGTAGGTCCACGTATAACTTCGGTATTCCAATTGCGCTAGGATTTGGTAATATTATC TTTATCCAAATTACCGTAAGAGCACCCCATACTAACTTGGTATCTTCATCCAGTGATTTC TATAATAATAAGAGGTTGTTCATATTGAATGTCTTGCAGTATCCAGAAATATTAATAATG CTCAGAACTTTTACCGAATTGAGAAAATATTGATCTTTCAGTGCAAAAGAACGCTGTAGA TTAGAATTAGAATCAATTTAAATTGAAACTTGGAAACGTTCGGAAAGGTTAAAAACTCAA ATTGGACAGTTCAACTACCTGCTGTGGGGATACGAAATTACCTTCTTGATGATTG >Scas ATGTTGCTCAACAAAACTTAAGAAGCCGCTCGCTATTCAAGATCATACATGTGATCGCAT CTGA--GACGTAGTAGAATATCTCTTTGGGTGAGAGTCAAGCTGGTCTCGTTCCACTGGA TGGGTGTCACACTACTATCCAGATTTAACTACCAGATACAATGATAAGAGCGTTAAGTAG TGAGAGAACTGAATTATGAGTGGGGAAGAATCTCAGTCCGAATATATTACTTTGAAAGCC AATTTTTAAACATTTACCATACTACTTAATTTTGCCACGTCTTTCAAACAATTTTAAGAA ATGAATTGGTAGAACAGTGTTACCAGGCAAATTTGATTTAGCTCGTTACGAACAGAACCA ACATGTCGCCAAAGATCTACTTTATAACGTCCGTTTGATCTGGGTAGGTAACCATTATAT CGATTTCATCTGTATCTTTAGAGACATTCAAACTTTGCTGTGACTTTATACTAGGAAAAT ATTGCATCATTGCAAGGTGTAAACCTCAATTTACAGTTTTTAATGACTCTTATTTATTCA TACCAATGGGTACTCTAATTATTAGGCACTAAGCAAGACTTACCAAG---GATAGAGAAG ATACATTGGTTCAAGTTTCTCTTAGGTATTCCATTTATAAGAAGCAGCCCTCATTCTATC ATTATCCAAACTACCTCAGCTTATCAGAACACTCCATTAATTCATTCTTCATGTGCCGTT TCTGGAGAAAAT-GTCTTTTCGTTTTAAACCTTTGATGCTATGCTTCTGTTTCACTGAAA TTCAAAGGTCTGCAAGGATTAAAAGGGAATTAATCTTTCCAAGCTAAGGTATGCAACAGA TTAGAACTTGAATCAATTGTCTTTGGTACAGGGACTGATTTGATGCAGTAAAGGATTCAA GCTGGAAAGTTCAATTTACTGCAGTGGGGACACGAAACTACCTTTGCCATGATTA >Snag ATGCTG-------------GAATTTGGCAGAGGGAACGTGTGAGGTTTCCGTTGCTGCGA GGGG--AGTGGGGCACGGTTTCGGTTTGGGTGAAAGTGCAGCTGGGCGCGGTCTGCAGGA CGGGTGTCGCACTTCTGTCGCGGTTCAATTTCCAAACACGGGGCCAAGCGCGCTGCGTTG TCAGGGAGCCGAGCTATCGGCGGAAAGTCGTCGCAGTCTGTATTCATCACATTGAGGGCT GTTTCTTGGGCAGCTGCCATACTACTGGAGCCTCGGACGCCTGTCAAACTTTTTTAAACC ACGAACTGGTCGAGCTGTGCTGCCTGGCGCAGTCGACGTTCTAGTCGCATCGCAGAACCA CTCAAGAGCTGAAAATTTGTTGTATAACGTCCCTACGGAAAGGGTGGGGAACCGGTGCCT CGATATAAACAGTGACGTTGGAAATATTAAACATTTGCCACAAGTCTATACGAGGAAAAT ATCGCATTGAGGGAGAACGTCGTGAGGCGCTTGGAGTTCTGAACGACTCGTGATAGCAGC TGCCTGCAGGTAAACTTGAAAGAAAGTACAGAACGGTACTTTCACTG---ACAAGATGAG GTCCACAGGACCGTGTTCAGCCTTGCCGTACCGCTTCCAAGACAACCGGCAGTTACGAAT TCTATCAACATTGACGAACTGGTGCGTACAAATGTCTTC---------AGCAGAGACTCT TACAATAACGCTAGATTGTTCCAGCTTTTCATCAGACGCAACGCTGAAACGTCGCCACAA GTTAGAAATATATCCGACCTGAGAGGGTGTAGACATCTCCACCCGGTAGATGACCATGAA TTGACCTCAGAGAATCCCACTATTA----TCCACTTGATTGGATGCTGTCAAAAACTCAA GTTGGAAAATTCAACTACTTGCAGTAGGGACCCGAAACTACCTACCTGACGATTG >Kafr ATGTTA-------------GTCACATTATCAAGACAGGTGTCCGTTATCAATTAGTACGG TAATGTAATCGGGGAAGGTTTCTTATTAAGTGAAAGTTCAGGTGGGCACGTTCAGAGAGA TGGCTGGCCCATTATTGTCGAGGTTTAATTATCAAATACCATGGAAAGTTCCTTGAGTAG TTAGAGAGCCGAGTTATAGGCGGTAGTGAATCTATGTACGGATTTATTACCCTGAAAGCG AGTTTTTAAAAATTTACCATATTTTTCAATTATGGAATGTTTGTTAAACTATTTCAGACC CTGAACTCGTAGAACCGTCTTTCCAGGCAAACTCGATTCTCAAATCAGATCTATGGATCA AACTAAGGCTCAGGATGCATTGTACAATATCCTTACGGACTGGTTGGGTAACCAGTTTGT TGATCTCATCAATTTCTCTCGATATATTAAAATTATTCGACAAATCTACACAAAGAAAAT ATCATATTATAGGGAGGCATTGAGAAAACTTTGAAGTTTTACAGGATTCTTGATTGTAGC TGCCAAATGGGAAACTTGAAATCGGAAGCAGTTCGAGGCTTACTCTG---TCGAGAGCAG AGCAACGGGAGAAAGTATAGGGTTGGTATCCCACTCAAAAACGGATATCCACTTTTGAGT CCTTTCGCGATTGCATTCCACTATTCCCAGTTTGAATCAGTCCATTCTTCTTGGGATACG TACCATAACTCCAGACTTTTTCAGCTCTATCTAAAGCACAACGCTGGCATCTGTCAAAGG CTCAACGATATAGGTCAACTAAGAAAACAATGACATTGCAAAACTATGGATGGCCAACAG ATGAAT-----------------------GAAGTTGGATAAGAAATCATCAAGCCATTAA ACTTGATGTTTCAATTACTTGCGGTTGGGACACCAAATTACCTTCAAAAGGATTG >Cgla ATGTTGCT-----------GGGCCAATGTTGAGATCATTGCCCATTACGTATTGTTACTA AGGC--CTTCAGGAAATCTATCTTACTAAATTAAGGTACAGCTGGTCTCGTTCGAACAGA TGGATCGCTCACTGTTGTCTAGATTTAACTTCCAAATACCATACTAAGTGCTTTGAGTGG TGAGGGAACTGAGTTGTGGGTGGCGCTAAGTCTACGTTCGGATATATTACTCTGGAGGCC CCTTCTTGAAAACCTGCCATACTATTTAATGCTACTATGTCTCTCAAACCTCTTCAGACC CTGAATTACCAGAACTGTTATTCCAGGCCAAGTCGACCTTGCTGTTGCTGATTCTAACCA ACTCCAAGCCGAAGACTTACTATACAACATCCATTCGAAATGGATAGGAAACCTGTCTGT TGACTTCAAAAGTTAGCATTGATACTTGAAAGATTCTCTTCAAGTCTACACAAGGAAAAT ATCGAATCGAAGGGTGGTATTAATAAGCACTTAGAGTTTTCACTGAATCTCATTTACTCT TACCACAAGGATCTACCGGCTTCATCCGCCAAGATGAATTTTCACCGAAGAGCAGATAAG AAGAATCGGGGAGTGTTCTTCATAGGTATTCCAGTTCTTCAAGGATTCGGAAATTCCAAC CCTTGAACTATTGGCTTGAATTGTTCCCTCACTGACCTTCTATCGGAAGTTATCACCAAA TATCCAGATGTT-GTTTCTTGACCTTCAGTGTGAGACGGTATGCTACTGTTTATCTGAAA CTCAGAGGTGTTGGCGAGTTGAGAATCCCAAGATATTTCCAAGCGACTGATCGCTATGAA TTGGGAACTGAGCTCT---------TCTCGTAGATATAATTGATGGTGTCAAGGACTCAA ACTAGACAGTTCAACTTTCAGCTGTTGGGATTCTAAGTTGCCTTCCGTATCATTG >Suva ATGTTGCTAG---------GTTGCAATTGCCCAGGGGTAGTTAGATTGCTGTGTCAGCCA GAGC--GCTCCAGTAAAGTGTCCCTTTGGCTCAAGGTCCAGGTGGGCTCGTTCAACCGGA CGGGTAGCTCACTCTTGAACAGGTTCAACTTCCAAACACAATGCCAGGTGCGTTGAGTGG TCAGAGAACCGAATTATAGGGGGATTTAAGTCCACTTGCGGATATATCACTCTAAAAGCC ACTTCTTGGTGACCTTCCTTACTACTCAATCCTGCAGTGGTTGTCAAACTGCTTCAAGCC CCGAGCTACCTGAACTGTTTTGCCTGGCCAGATCGATTATGCTGTTGCTGAGCAGTGCCC GAAAAATGCAGAGGAACAGTTGTTCGCTATTCATTCGAAAGGGCTGGGAAACCATTGCCT CGACCTGAAAGGTCAGCTTGCAAATATCAAGGTTACGCTGCAAATCTACACTAAGAGAAT CTTGAATCACAGGGAAATATCGTTAGGCCTTTGAGATTCTTGACGATTCCTGTTGCCACT TACCCACAGGCAAACACGGTAAGTAAATCCGAACAAATCCTTCTTAGGAAAACAGACAAG ATTCCTCGGTGATCGTTCTGCCTCAGTATCCCTGTGACAAACATCTCAGCCCATACGAAT CTTGGCCGCATTGCCTCGCGCTTTCCGATCCCCGGCTTGGTCAACACTGCCACACAAAAA TTCAGTGACGGC-GTCTCTTCACTTTGACCGTCGAATCAAACAGCTCTGTGTGTCCGCAA CTCAGAGATTTTGCAGACTTGAGAGGGTAAGGATTTATCACCTCGGTAATACACCATGAG AATGCTGTACAATGAACATGTTTTCAACGGCCGAATGAACCGACGGCGTGAAAGACTCAA GCTAGGTAGTTTAACTACTAGCTGTTGGAATTCAAACTTGCCTATTTGATGATTG >Skud ATGTTGCTAG---------GTTGCAATTGCCCAGGGGTAGTGCGGTTGCGGTTTCAGCCA GAGC--GCCCCAGTAAAGTGTCTCCTTGGGTCAAGGTCCAGGCGGGCCCGTTCAACCGGA TGGGTGGCCCACTTTTGAACAGGTTCAACTTCCAAACACCACACCAGACGCCTTGAATGG TGAGAGAACCGAATTATAGGGGGGTCCAAGTCCACTTACGGATACATCACCTTGAAGGCC ACTTCTTGGCGACCTTCCCTATTACTCAATCCTCCAGCGGTTGTCAAACTGATTCAAGCC TCGAACTAACTGAACTGTTTTGCCCGGCTAGATCGATTATGCGGTTGCTGAACAATGTCC GAAAAGCGCCGAAGAACAGTTGTACGCCATCCATTCGAAGGGGTTGGGAAACCACTGTGT TGACTTGAAGAGTCAGCCTGCAAATATCAAGGCTACGCGGCAAATGTACACGAGGAGAAC CTCGGGTTACTGGGAAACATTGTGAGGCCCCTGAGATTTTTGACGACTCATGCTGGCACT TACCTGCAGGCGAGCGTGGCGGGTAAGTCCGAACAAAGCTTTCCTGGGAGAATAGAGGAG ATTCATCGGCGACCGTTCCGCTTTGGTATCCCCGTGACAAGCGTCGCAGCCCATACGAAT CCTGGCCGCATTGCCTTGCGCTGTCCGATCTCCGGTCTGGTCAGCTCCGCTGCTGATAAA TTCCGCGACGGC-GTCTATTCACGCTGCTTGTCGAATCAAACAGCGCCGTATGTCTGCCA CTCAGAGATCTTGCCGATTTGAGAGGGCACGGACTTGACTCCTCCGTAACACTCTATGAG AATGCCGTCCAATGAAGCTGTTTTCCATCATTGAACGAATCGACGGCGTGAAGGACTTAA GCTGAGCAATTCAACTACTGGCCGTCGGGACTCCAACTTGCCTATCTGAAGATTG >Smik ATGTTGCTAG---------GTTTCAATTGCTCAGGGGTAGTTAGACTACTGTTTCAGCAA GAGC--GCTCCAGTAAAGTGTCTCGTTGGCTGAAGGTTCAGGTGGGCTCGTTCATCCGGA TGGGTGTCCCACTTTTAAGCAGATTCAACTTCCAAATACAACAATAGAGGCCTTGAATGG TCAGAGAACCGAACTATAGGGGGACTTAATTCAACTTGTGGATATATCACCTTGAAAGCT ATTTTTTGACGACCTTCCCTACTATTTAATCATACAGTGATTGTTAAACTGCTTTAAACC TCGAGCTAACAGAACAGTTTTACCTGGCCAAATCGATTACGCGGTTGCTGAACAATGCCG GAAAAGCGCAGAAGAACAGTTGTACGCCATTCATTCGAAAAGGTTGGGGAACCATTATGT CGATCTGAAAAGTTAGTTTGCAAATATTAAGGCTTTGCGGCAAATGTACACCAGGAGAAC TTGGAGTTAGTGGGAAACATCGTTAGGCCCTTGGGATTTTTGACGATTCATGTTAGCACT TACCTGCAGGTAAGCGTGGTGAGCAAATCTGAATAAATCCTTTGTAGGAAAATAGAGGAG ATTTATCGGTGACCGTCCGGCTTTGGTGTCCCAGTGACAAGCTTCTTAGCACATACGAAT GTTGGCCACACTGCATGGCACTCTCTGATCTCTGGTTTGGTCAGCTCCGCTACTGATAAG TTCAGTGACGGT-GCCTGTTCACTTTAATTGTTGAATCAAACAGCGCTGTGTGTCTGCTA TTCAGAGATTTTGCCGGTTTGAGAGGCTACCGACCTGTCTCCTCTGTAATACACTATGAA AATGCTGTCCAGTGGAGCTCTTTCCAGTCGTTGAACAAATCGACGGCGTGAAGGACTTAA GTTGGGTAATTCAACTACTAGCCGTTGGGATTCAAACTTGCCTATTTGACGATTG >Scer ATGTTGCAAG---------GTTGCAATTGCCCAGGGGTAGTTAGGTTGCCGTTTCCGCTA GAGC--GCACTACTAAAATATCTCATTGGTTTAAGGTCCAGGAGGGCTCGTTCAACCGGA TGGGTGGCCCACTTTTAAACAGATTCAACTTTCAAACACGACACTAGAAGCTTTGAATAG TCAGAGAACCGAATTATAGGGGGACTTAAGTCTACTTGTGGATACATCACTTTGAAAGCT ACTTTTTGGCGACCTTCCCTACTACTCAATCCTACAGCGGCTATCAAACTGCTTCAAACC TCGAGCTCACCGAACTGTTTTGCCTGGCTAGATCGATTATGCGGTCGCTGAACAATGTCG GAAGAGCGCCGAAGACCAATTGTATGCCATTCATTCGAAAGGGTTAGGAAACCATTGTAT CGATTTGAAGAGTCAGTTTGCAAATATCAAGGCTTTGCGGCAAATCTATACCAGGAGAAC CTTGAGTTAGCGGGAAATGTTGTTAGGCCTTTGAGATTTTTGACGAGTCACGTTAGCACT TGCCTGCAGGTAAGCATGGTGAGTAAATCCGAACAAATTCTTTTTGGGAAAACAGGGAAG GTTTATCGGTGACCGTTCCGCCTTGGTATCCCGGTAACAAACCTCCCAGCTCATATGAAT ATTGGCCACATTGCCTTGCCCTATCCGAGCTCCGGTTTAATCAGCTCGGCTACTGATAAA TTCACTGACGGC-GCCTATTTACTCTGTTTGTAGAACCAGACAGCGCCGTGTATCTTCCA CTCAGAAATTTTGCGGATTTGAGAGGGCAAGGACTTATCCCCTCAATAATACACAATAAG AATGCCGTCCAATGAATCTGTTTCCAGCCATTGAACAATTTGACGCCGTGAAGGACTTAA GTTGGGAAATTCAACTATTAGCCGTCGGGATTCCAACTTGCCTATTTGACGATTG