diff test-data/ecoli.sample_N100.fastq @ 0:3a807e5ea6c8 draft

Uploaded v0.0.1

--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/ecoli.sample_N100.fastq	Thu Mar 27 09:40:53 2014 -0400
@@ -0,0 +1,204 @@
+@frag_1
+AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTC
++
+##%')+.024JMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_100
+TAAAGTATTTAGTGACCTAAGTCAATAAAATTTTAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_200
+TGGTAATGGTGATGGTGGTGGTAATGGTGGTGCTAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_300
+CATGGTTGTTACCTCGTTACCTTTGGTCGAAAAAAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_400
+TGGCCACCTGCCCCTGCCTGGCATTGCTTTCCAGAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_500
+TTCGGCATCGCTGATATTGGGTAAAGCATCCTGGCC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_600
+TTGGGCAAATTCCTGATCGACGAAAGTTTTCAATTG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_700
+TAACGGCGATCGACATTTTCTCGCCACGGCAAATCA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_800
+ATATCGACGGTAGATTCGAGGTAATGCCCCACTGCC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_900
+CACCAGTTCGCCTTTTTCATTACCGGCGGTGAAACC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1000
+TATAGACCCCGTCAACGTCCGTCCAAATCTCGCAAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1100
+GGGTGAAGAACTTTAGCGCCGAAGTAGGAAAGCTCC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1200
+ATCACGGCTGGCACCAATGAGCGTACCTGGTGCTTG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1300
+GCGCCGCCATGCCGACCATCCCTTTCATCCCCGGAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1400
+CAGTCGCTTTGTGGAACGCAGAAACTGATGCTGTAT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1500
+CGAGATAATGGCCAGCCGTTCCGTCACTGCCAGCGG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1600
+ATCCCTGAGCAATGGCGACAATGTTGATATTGGCGC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1700
+TCGATAACCTGATCGGTATTGAACAGCATCTGATGA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1800
+GACACGTAAGTCGATATGTTTATTCTTCAGCCAGCT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1900
+GATTAAACGGCTCTTTGGCTTGCGCCAGTTCTTCCT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2000
+AAGTCGGCATATTGATCCGCCACTGCCTGGCTGGAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2100
+CCGCGATTTTTCCGCCGCATAACGCAACTGATGGTA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2200
+CGGAGAACTTCATCAATTCATCACCTGCATTGAGCA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2300
+TCGGTATAACCCATTTCCCGCGCCAGCGTGGTCGCC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2400
+TTCAATATCCGCCAGCTCCAGTTCACGTCCCGTTTC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2500
+CCACGCGCGCGGCAAAGAGATCGTCGAGTTGTGACA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2600
+GGATCATTACCATCCACTTCGGCAATCTTCACGCGG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2700
+GTCATTGCCCGCACCATATCCGCGCAGTACCAACGG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2800
+ATTGGCACTGGAAGCCGGGGCATAAACTTTAACCAT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2900
+GACTGAATGTCTCTGCCGCCTCAACCGTGACTACAT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3000
+TGCTTACCCAGTTCCTGGCAAAAACGCTCCCAGCAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3100
+TTCATTCATCGCCATCAGCGCCGCGACCACCGAACA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3200
+ACGGTGCCACGTTGTCGTAATGAATGCTGCCGGAGA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3300
+CCCGGATACGCCAGCACCCACAGCCACTCATCAAAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3400
+GTGAATGAAGCCTGCCAGATGTCGCCCGTGCGCAAT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3500
+GCGCCTGCCGGAAGCCTGGCAGTAACCGTTCACGGT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3600
+ACGCGCTGGGCGGTTTCCGGCTTGTCACACAGAGCG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3700
+CATTTAGTTTTCCAGTACTCGTGCGCCCGCCGTATC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3800
+GGTCGTGCGGAAAAAACAGCCCCTGATTTTTGCCCA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3900
+GGGATTTCATCACCAATAAACGCCGAGAGGATCTTC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4000
+CCCGTGGAACAATTCCAGACAACCGACATCGCTTTC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4100
+CGGAGGTCGCGGTCAGAATGGTCACTGGCTTATCAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4200
+TTTTCTTGCAGTGGACTGATTTTGCCTCGTGGATAG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4300
+TTCTTCATCATCAAACGCCTGCTTCACCAGCGCCTG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4400
+GCGGCAGCTGCGCAACAGCTTCAAAGTAGTAGCAAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4500
+CGTTTCACCGGCAGACCGAGTGACTTCGCCAGCAGA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4600
+CATCGCGTTGGATAACGTCGCCTGAGTCGCTTTGGG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4700
+TTTCATCATCCACGGCTGCATAACCCAGCTCTTTCA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4800
+CCTGGATTCAACTGATCACGCAGCGCACGATAAGCT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4900
+TGCCAGCTCTTTTGGCAGATCCAACGTTTCACCGAG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_5000
+AGATAATGAATAGATTTTACTGATGATTCATCATCA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM