diff test-data/ecoli.pair_sample_N100.fastq @ 2:da64f6a9e32b draft

Uploaded v0.2.0, adds desired count mode

--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/ecoli.pair_sample_N100.fastq	Fri Mar 06 11:48:09 2015 -0500
@@ -0,0 +1,208 @@
+@frag_1
+AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTC
++
+##%')+.024JMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1_a
+GAGACATATTGCCCGTTGCAGTCAGAATGAAAAGCT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMJ420.+)'%##
+@frag_200
+TGGTAATGGTGATGGTGGTGGTAATGGTGGTGCTAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_201
+TAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_400
+TGGCCACCTGCCCCTGCCTGGCATTGCTTTCCAGAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_401
+TCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_600
+TTGGGCAAATTCCTGATCGACGAAAGTTTTCAATTG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_601
+AATTGAAAACTTTCGTCGATCAGGAATTTGCCCAAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_800
+ATATCGACGGTAGATTCGAGGTAATGCCCCACTGCC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_801
+GCAGTGGGGCATTACCTCGAATCTACCGTCGATATT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1000
+TATAGACCCCGTCAACGTCCGTCCAAATCTCGCAAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1001
+TTGCGAGATTTGGACGGACGTTGACGGGGTCTATAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1200
+ATCACGGCTGGCACCAATGAGCGTACCTGGTGCTTG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1201
+AAGCACCAGGTACGCTCATTGGTGCCAGCCGTGATG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1400
+CAGTCGCTTTGTGGAACGCAGAAACTGATGCTGTAT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1401
+TACAGCATCAGTTTCTGCGTTCCACAAAGCGACTGT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1600
+ATCCCTGAGCAATGGCGACAATGTTGATATTGGCGC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1601
+CGCCAATATCAACATTGTCGCCATTGCTCAGGGATC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1800
+GACACGTAAGTCGATATGTTTATTCTTCAGCCAGCT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_1801
+GCTGGCTGAAGAATAAACATATCGACTTACGTGTCT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2000
+AAGTCGGCATATTGATCCGCCACTGCCTGGCTGGAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2001
+TCCAGCCAGGCAGTGGCGGATCAATATGCCGACTTC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2200
+CGGAGAACTTCATCAATTCATCACCTGCATTGAGCA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2201
+GCTCAATGCAGGTGATGAATTGATGAAGTTCTCCGG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2400
+TTCAATATCCGCCAGCTCCAGTTCACGTCCCGTTTC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2401
+AAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2600
+GGATCATTACCATCCACTTCGGCAATCTTCACGCGG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2601
+CGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2800
+ATTGGCACTGGAAGCCGGGGCATAAACTTTAACCAT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_2801
+TGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3000
+TGCTTACCCAGTTCCTGGCAAAAACGCTCCCAGCAC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3001
+TGCTGGGAGCGTTTTTGCCAGGAACTGGGTAAGCAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3200
+ACGGTGCCACGTTGTCGTAATGAATGCTGCCGGAGA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3201
+CTCCGGCAGCATTCATTACGACAACGTGGCACCGTG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3400
+GTGAATGAAGCCTGCCAGATGTCGCCCGTGCGCAAT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3401
+TTGCGCACGGGCGACATCTGGCAGGCTTCATTCACG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3600
+ACGCGCTGGGCGGTTTCCGGCTTGTCACACAGAGCG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3601
+GCTCTGTGTGACAAGCCGGAAACCGCCCAGCGCGTT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3800
+GGTCGTGCGGAAAAAACAGCCCCTGATTTTTGCCCA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_3801
+GGGCAAAAATCAGGGGCTGTTTTTTCCGCACGACCT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4000
+CCCGTGGAACAATTCCAGACAACCGACATCGCTTTC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4001
+AAAGCGATGTCGGTTGTCTGGAATTGTTCCACGGGC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4200
+TTTTCTTGCAGTGGACTGATTTTGCCTCGTGGATAG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4201
+TATCCACGAGGCAAAATCAGTCCACTGCAAGAAAAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4400
+GCGGCAGCTGCGCAACAGCTTCAAAGTAGTAGCAAA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4401
+TTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4600
+CATCGCGTTGGATAACGTCGCCTGAGTCGCTTTGGG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4601
+CCAAAGCGACTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGG
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4800
+CCTGGATTCAACTGATCACGCAGCGCACGATAAGCT
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_4801
+GCTTATCGTGCGCTGCGTGATCAGTTGAATCCAGGC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_5000
+AGATAATGAATAGATTTTACTGATGATTCATCATCA
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
+@frag_5001
+GATGATGAATCATCAGTAAAATCTATTCATTATCTC
++
+MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMK