view test-data/ecoli.pair_sample_N100.fastq @ 5:6b71ad5d43fb draft

v0.2.3 clarified help, internal cleanup of Python script

@frag_1
AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTC
+
##%')+.024JMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1_a
GAGACATATTGCCCGTTGCAGTCAGAATGAAAAGCT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMJ420.+)'%##
@frag_200
TGGTAATGGTGATGGTGGTGGTAATGGTGGTGCTAA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_201
TAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCAC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_400
TGGCCACCTGCCCCTGCCTGGCATTGCTTTCCAGAA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_401
TCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCAC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_600
TTGGGCAAATTCCTGATCGACGAAAGTTTTCAATTG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_601
AATTGAAAACTTTCGTCGATCAGGAATTTGCCCAAA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_800
ATATCGACGGTAGATTCGAGGTAATGCCCCACTGCC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_801
GCAGTGGGGCATTACCTCGAATCTACCGTCGATATT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1000
TATAGACCCCGTCAACGTCCGTCCAAATCTCGCAAC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1001
TTGCGAGATTTGGACGGACGTTGACGGGGTCTATAC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1200
ATCACGGCTGGCACCAATGAGCGTACCTGGTGCTTG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1201
AAGCACCAGGTACGCTCATTGGTGCCAGCCGTGATG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1400
CAGTCGCTTTGTGGAACGCAGAAACTGATGCTGTAT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1401
TACAGCATCAGTTTCTGCGTTCCACAAAGCGACTGT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1600
ATCCCTGAGCAATGGCGACAATGTTGATATTGGCGC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1601
CGCCAATATCAACATTGTCGCCATTGCTCAGGGATC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1800
GACACGTAAGTCGATATGTTTATTCTTCAGCCAGCT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_1801
GCTGGCTGAAGAATAAACATATCGACTTACGTGTCT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2000
AAGTCGGCATATTGATCCGCCACTGCCTGGCTGGAA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2001
TCCAGCCAGGCAGTGGCGGATCAATATGCCGACTTC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2200
CGGAGAACTTCATCAATTCATCACCTGCATTGAGCA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2201
GCTCAATGCAGGTGATGAATTGATGAAGTTCTCCGG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2400
TTCAATATCCGCCAGCTCCAGTTCACGTCCCGTTTC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2401
AAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2600
GGATCATTACCATCCACTTCGGCAATCTTCACGCGG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2601
CGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2800
ATTGGCACTGGAAGCCGGGGCATAAACTTTAACCAT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_2801
TGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3000
TGCTTACCCAGTTCCTGGCAAAAACGCTCCCAGCAC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3001
TGCTGGGAGCGTTTTTGCCAGGAACTGGGTAAGCAA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3200
ACGGTGCCACGTTGTCGTAATGAATGCTGCCGGAGA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3201
CTCCGGCAGCATTCATTACGACAACGTGGCACCGTG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3400
GTGAATGAAGCCTGCCAGATGTCGCCCGTGCGCAAT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3401
TTGCGCACGGGCGACATCTGGCAGGCTTCATTCACG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3600
ACGCGCTGGGCGGTTTCCGGCTTGTCACACAGAGCG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3601
GCTCTGTGTGACAAGCCGGAAACCGCCCAGCGCGTT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3800
GGTCGTGCGGAAAAAACAGCCCCTGATTTTTGCCCA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_3801
GGGCAAAAATCAGGGGCTGTTTTTTCCGCACGACCT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4000
CCCGTGGAACAATTCCAGACAACCGACATCGCTTTC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4001
AAAGCGATGTCGGTTGTCTGGAATTGTTCCACGGGC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4200
TTTTCTTGCAGTGGACTGATTTTGCCTCGTGGATAG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4201
TATCCACGAGGCAAAATCAGTCCACTGCAAGAAAAA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4400
GCGGCAGCTGCGCAACAGCTTCAAAGTAGTAGCAAA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4401
TTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4600
CATCGCGTTGGATAACGTCGCCTGAGTCGCTTTGGG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4601
CCAAAGCGACTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGG
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4800
CCTGGATTCAACTGATCACGCAGCGCACGATAAGCT
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_4801
GCTTATCGTGCGCTGCGTGATCAGTTGAATCCAGGC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_5000
AGATAATGAATAGATTTTACTGATGATTCATCATCA
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
@frag_5001
GATGATGAATCATCAGTAAAATCTATTCATTATCTC
+
MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMK