Mercurial > repos > peterjc > tmhmm_and_signalp

#ID	NN_Cmax_score	NN_Cmax_pos	NN_Cmax_pred	NN_Ymax_score	NN_Ymax_pos	NN_Ymax_pred	NN_Smax_score	NN_Smax_pos	NN_Smax_pred	NN_Smean_score	NN_Smean_pred	NN_D_score	NN_D_pred	HMM_type	HMM_Cmax_score	HMM_Cmax_pos	HMM_Cmax_pred	HMM_Sprob_score	HMM_Sprob_pred
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Pr_scaffold_52_R430	0.516	21	Y	0.612	21	Y	0.991	13	Y	0.896	Y	0.754	Y	S	0.735	21	Y	0.999	Y
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Pr_scaffold_286_R1	0.599	24	Y	0.700	22	Y	0.993	13	Y	0.941	Y	0.821	Y	S	0.510	22	Y	1.000	Y
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Ps_scaffold_14_F896	0.247	19	N	0.404	19	Y	0.924	9	Y	0.811	Y	0.607	Y	S	0.440	21	N	0.961	Y
Ps_scaffold_1670_R4	0.519	22	Y	0.651	22	Y	0.983	4	Y	0.902	Y	0.777	Y	S	0.923	22	Y	0.999	Y
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Ps_scaffold_17_R458	0.712	21	Y	0.771	21	Y	0.987	14	Y	0.922	Y	0.846	Y	S	0.948	21	Y	1.000	Y
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Hp_Contig450.9_F29	0.411	19	Y	0.572	19	Y	0.973	2	Y	0.926	Y	0.749	Y	S	0.414	19	N	0.999	Y
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Hp_Contig464.2_R12	0.957	20	Y	0.750	20	Y	0.814	4	N	0.654	Y	0.702	Y	S	0.836	20	Y	0.993	Y
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Hp_Contig472.2_F34	0.916	19	Y	0.881	19	Y	0.989	13	Y	0.957	Y	0.919	Y	S	0.649	19	Y	1.000	Y
Hp_Contig488.2_R25	0.279	20	N	0.446	20	Y	0.965	4	Y	0.869	Y	0.657	Y	S	0.547	20	Y	0.919	Y
Hp_Contig4938.1_F11	0.280	19	N	0.328	16	N	0.941	3	Y	0.688	Y	0.508	Y	S	0.481	19	N	0.905	Y
Hp_Contig513.1_R12	0.369	21	Y	0.476	21	Y	0.967	4	Y	0.827	Y	0.652	Y	S	0.650	21	Y	0.999	Y
Hp_Contig5262.1_R4	0.630	24	Y	0.513	24	Y	0.940	11	Y	0.566	Y	0.540	Y	S	0.512	27	Y	0.943	Y
Hp_Contig5703.1_R7	0.459	18	Y	0.476	18	Y	0.817	10	N	0.643	Y	0.560	Y	S	0.651	18	Y	0.950	Y
Hp_Contig5709.1_F3	0.469	20	Y	0.591	20	Y	0.971	7	Y	0.833	Y	0.712	Y	S	0.702	20	Y	0.979	Y
Hp_Contig575.1_F18	0.684	23	Y	0.701	23	Y	0.990	13	Y	0.831	Y	0.766	Y	S	0.845	23	Y	1.000	Y
Hp_Contig578.4_R12	0.267	20	N	0.361	20	Y	0.980	7	Y	0.736	Y	0.549	Y	S	0.380	28	N	0.767	Y
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Hp_Contig611.2_R4	0.757	20	Y	0.709	20	Y	0.954	13	Y	0.741	Y	0.725	Y	S	0.393	22	N	0.993	Y
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Hp_Contig74.4_F1	0.845	20	Y	0.777	20	Y	0.975	13	Y	0.812	Y	0.795	Y	S	0.695	20	Y	1.000	Y
Hp_Contig75.2_F70	0.504	19	Y	0.527	19	Y	0.892	11	Y	0.720	Y	0.623	Y	S	0.641	19	Y	0.911	Y
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Hp_Contig799.2_F18	0.258	22	N	0.346	22	Y	0.970	12	Y	0.842	Y	0.594	Y	S	0.270	19	N	0.993	Y
Hp_Contig881.3_F2	0.278	23	N	0.333	23	Y	0.976	1	Y	0.550	Y	0.442	Y	S	0.597	23	Y	0.948	Y
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Hp_Contig923.3_R8	0.311	30	N	0.518	30	Y	0.998	13	Y	0.947	Y	0.733	Y	S	0.400	21	N	0.990	Y
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Pr_scaffold_1_F1150	0.154	28	N	0.183	22	N	0.947	5	Y	0.628	Y	0.405	N	S	0.644	28	Y	0.920	Y
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Pr_scaffold_116_F295	0.240	28	N	0.360	28	Y	0.984	13	Y	0.759	Y	0.559	Y	S	0.299	28	N	0.985	Y
Pr_scaffold_1165_F1	0.524	22	Y	0.415	22	Y	0.936	12	Y	0.525	Y	0.470	Y	S	0.467	22	N	0.971	Y
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Pr_scaffold_118_F324	0.618	24	Y	0.711	24	Y	0.990	3	Y	0.916	Y	0.813	Y	S	0.464	24	N	0.999	Y
Pr_scaffold_118_F335	0.895	23	Y	0.866	23	Y	0.996	13	Y	0.953	Y	0.909	Y	S	0.780	23	Y	1.000	Y
Pr_scaffold_12_R710	0.646	26	Y	0.706	26	Y	0.974	19	Y	0.872	Y	0.789	Y	S	0.586	26	Y	1.000	Y
Pr_scaffold_122_R219	0.463	24	Y	0.603	24	Y	0.980	13	Y	0.883	Y	0.743	Y	S	0.611	26	Y	1.000	Y
Pr_scaffold_1275_R14	0.648	25	Y	0.620	25	Y	0.964	13	Y	0.698	Y	0.659	Y	S	0.702	25	Y	0.980	Y
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Pr_scaffold_130_F159	0.299	18	N	0.444	18	Y	0.913	2	Y	0.811	Y	0.628	Y	S	0.332	22	N	0.945	Y
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Pr_scaffold_1377_F7	0.911	24	Y	0.843	19	Y	0.985	3	Y	0.952	Y	0.898	Y	S	0.473	19	N	1.000	Y
Pr_scaffold_1386_F9	0.796	18	Y	0.800	18	Y	0.982	13	Y	0.883	Y	0.841	Y	S	0.703	18	Y	1.000	Y
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Pr_scaffold_149_R40	0.469	24	Y	0.506	24	Y	0.977	3	Y	0.717	Y	0.612	Y	S	0.354	20	N	0.998	Y
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Pr_scaffold_16_R1513	0.619	24	Y	0.524	24	Y	0.810	13	N	0.509	Y	0.517	Y	S	0.502	24	Y	0.893	Y
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Pr_scaffold_17_R1547	0.517	22	Y	0.643	22	Y	0.984	1	Y	0.880	Y	0.761	Y	S	0.475	22	N	1.000	Y
Pr_scaffold_17_R314	0.216	25	N	0.351	25	Y	0.978	5	Y	0.822	Y	0.586	Y	S	0.666	25	Y	0.990	Y
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Pr_scaffold_17_R943	0.579	21	Y	0.500	21	Y	0.992	12	Y	0.699	Y	0.599	Y	S	0.413	21	N	0.957	Y
Pr_scaffold_173_F58	0.441	22	Y	0.590	22	Y	0.987	13	Y	0.871	Y	0.731	Y	S	0.855	22	Y	0.999	Y
Pr_scaffold_1746_F2	1.000	21	Y	0.938	21	Y	0.990	5	Y	0.933	Y	0.935	Y	S	0.998	21	Y	1.000	Y
Pr_scaffold_18_F446	0.805	22	Y	0.622	22	Y	0.932	14	Y	0.685	Y	0.653	Y	S	0.996	22	Y	0.998	Y
Pr_scaffold_18_F462	0.859	22	Y	0.856	22	Y	0.985	3	Y	0.949	Y	0.902	Y	S	0.898	22	Y	1.000	Y
Pr_scaffold_18_R675	0.364	17	Y	0.387	17	Y	0.863	12	N	0.608	Y	0.497	Y	S	0.429	17	N	0.995	Y
Pr_scaffold_19_F1045	0.689	21	Y	0.746	21	Y	0.988	13	Y	0.924	Y	0.835	Y	S	0.748	21	Y	1.000	Y
Pr_scaffold_19_F1256	0.707	18	Y	0.717	18	Y	0.970	6	Y	0.898	Y	0.807	Y	S	0.622	18	Y	0.992	Y
Pr_scaffold_19_F776	0.533	19	Y	0.582	19	Y	0.962	13	Y	0.877	Y	0.729	Y	S	0.626	21	Y	0.999	Y
Pr_scaffold_19_R1969	0.328	24	Y	0.367	24	Y	0.889	12	Y	0.632	Y	0.499	Y	S	0.518	24	Y	0.990	Y
Pr_scaffold_195_F58	0.501	21	Y	0.555	21	Y	0.979	2	Y	0.859	Y	0.707	Y	S	0.387	21	N	1.000	Y
Pr_scaffold_2_F3007	0.636	18	Y	0.623	18	Y	0.932	12	Y	0.766	Y	0.695	Y	S	0.496	18	N	0.953	Y
Pr_scaffold_2_F3351	0.568	19	Y	0.597	19	Y	0.982	12	Y	0.900	Y	0.749	Y	S	0.378	29	N	0.986	Y
Pr_scaffold_2_R18	0.057	54	N	0.082	20	N	0.884	11	Y	0.509	Y	0.295	N	S	0.460	54	N	0.981	Y
Pr_scaffold_20_F431	0.318	27	N	0.392	23	Y	0.984	13	Y	0.837	Y	0.614	Y	S	0.369	23	N	0.979	Y
Pr_scaffold_20_F528	0.330	28	Y	0.350	28	Y	0.670	25	N	0.361	N	0.356	N	S	0.761	28	Y	0.832	Y
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Ps_scaffold_75_F650	0.511	22	Y	0.651	22	Y	0.998	13	Y	0.949	Y	0.800	Y	S	0.825	22	Y	1.000	Y
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Pr_scaffold_682_F10	0.340	19	Y	0.513	19	Y	0.982	13	Y	0.908	Y	0.711	Y	S	0.648	23	Y	0.998	Y
Pr_scaffold_64_F343	0.600	20	Y	0.657	20	Y	0.988	14	Y	0.952	Y	0.805	Y	S	0.608	24	Y	1.000	Y
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Pr_scaffold_77_R316	0.849	22	Y	0.858	22	Y	0.995	13	Y	0.962	Y	0.910	Y	S	0.953	22	Y	0.999	Y
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Pr_scaffold_39_F355	0.409	18	Y	0.455	18	Y	0.895	2	Y	0.605	Y	0.530	Y	S	0.548	18	Y	0.991	Y
Ps_scaffold_118_F134	0.482	19	Y	0.597	19	Y	0.981	6	Y	0.888	Y	0.743	Y	S	0.528	19	Y	0.981	Y
Ps_scaffold_5_R3563	0.424	19	Y	0.566	19	Y	0.987	6	Y	0.932	Y	0.749	Y	S	0.302	19	N	0.985	Y
Ps_scaffold_53_R22	0.937	20	Y	0.766	20	Y	0.979	14	Y	0.880	Y	0.823	Y	S	0.803	20	Y	0.935	Y
Pr_scaffold_14_R620	1.000	21	Y	0.955	21	Y	0.992	3	Y	0.949	Y	0.952	Y	S	0.967	21	Y	1.000	Y
Hp_Contig1340.1_F7	0.909	22	Y	0.886	22	Y	0.985	13	Y	0.921	Y	0.903	Y	S	0.808	22	Y	0.998	Y
Ps_scaffold_37_R313	0.563	25	Y	0.680	25	Y	0.998	14	Y	0.965	Y	0.823	Y	S	0.805	25	Y	1.000	Y
Pr_scaffold_30_R354	0.230	19	N	0.332	19	Y	0.910	5	Y	0.701	Y	0.517	Y	S	0.617	19	Y	0.963	Y
author	peterjc
date	Tue, 23 Apr 2013 12:47:49 -0400
parents
children