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comparison test-data/X_100000_Hum1.bam_Tandom_Duplications.txt @ 0:dd513c72ea56 draft
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| 134 + 71109 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36991539/1 | |
| 135 GAACTACCTGCAACGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCAAAATCAACAAATACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCG | |
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| 148 CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT | |
| 149 + 90707 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28658481/2 | |
| 150 CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT | |
| 151 - 84600 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3102178/2 | |
| 152 CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT | |
| 153 - 84490 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27052876/1 | |
| 154 CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT | |
| 155 - 84490 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21873573/1 | |
| 156 CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT | |
| 157 - 84490 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5331471/1 | |
| 158 #################################################################################################### | |
| 159 9 TD 20606 NT 0 "" ChrID X BP 96786 117393 BP_range 96786 117393 Supports 11 11 + 0 0 - 11 11 S1 12 SUM_MS 458 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 26 0 0 0 11 11 | |
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| 161 GACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAAAAACTCTTCTGGTGCTGCCATAAAA | |
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| 163 TTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAAAAACTCTTCTGG | |
| 164 - 96889 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-28971924/1 | |
| 165 CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA | |
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| 167 CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA | |
| 168 - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-37646907/1 | |
| 169 CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA | |
| 170 - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-25711382/2 | |
| 171 CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA | |
| 172 - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-20017185/1 | |
| 173 CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA | |
| 174 - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-4796567/2 | |
| 175 CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA | |
| 176 - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-1069628/1 | |
| 177 ATCAAACTTTTATACATTAAGAATCATTAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCA | |
| 178 - 96839 42 X_100000_Hum1.bam @HWI-27876204/2 | |
| 179 ATCAAACTTTTATACATTAAGAATCATTAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCA | |
| 180 - 96839 42 X_100000_Hum1.bam @HWI-22209972/2 | |
| 181 ATCAAACTTTTATACATTAAGAATCATTAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCA | |
| 182 - 96839 42 X_100000_Hum1.bam @HWI-1569561/1 | |
| 183 #################################################################################################### | |
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| 186 TGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAATTAAATACAAACAAATAAAATAAAATCAAAC | |
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| 188 AAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAAT | |
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| 190 AAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAAT | |
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| 194 #################################################################################################### | |
| 195 11 TD 63 NT 79 "TATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAACCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAGCTTTGCTTGCCAAAAAAC" ChrID X BP 85861 85925 BP_range 85861 85925 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 10 0 1 1 0 0 | |
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| 197 TCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAACCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAGCTTTGCTTGCCAAAAAACAAATAAATAGT | |
| 198 + 85619 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18164980/2 |