diff test-data/cel_cluster.fa @ 0:eaac585f172a draft

Imported from capsule None

--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/cel_cluster.fa	Tue Jan 27 09:06:24 2015 -0500
@@ -0,0 +1,132 @@
+>chrII:11534525-11540624
+tccaaaatattagaggccccacgaaaaggggagcagaacgaaaaggggat
+ctgcaaaaaggggatctgcgaaaaggggagatacgaaaaggggagatacg
+aaaaggggagcaacgaaaaggggatctggcactgtgccaaacgctatttt
+tctcaaagaaaacaatacaacgatgctccgatgttacgcgtcgcgtgttg
+ttaagcgtatcttctagaagaaaatttcaaaaatcaacgtgcgttgcgtg
+agaaaaattgcgttttgtgcgtttggcacagtgccagctccccttttcgt
+tgctccccttttcgtatctccccttttcgtatctccccttttcgcagatc
+ccctttttgcagatccccttttcgttctgctcccctcgtggggcctcaaa
+taatattgtcaatggagcgcagttgcgcacaccgaaatacgcacgaaatt
+tgaaattggcaggcctagaaagtctggatttaaaatatttatgcatatta
+acctgagtttcggcatgtttagataaatttagattaaaatttattaaata
+aaaatatttaaaatttattaaattcaacattatctttaattttacagaaa
+taaaaaccaaaaaaccaacgaagtgtaacttttcgacaataaatatttat
+aaattattcaattaattggaaatctatttatcacatctcatcgtgaacaa
+gcacatggctaaacaatgcctcgactttatccacccatcctggatttttc
+ctgttgaaaatcttcaaatccttcatagtctgctcaattgccttaacagc
+cttttcccttttcacatccttcgtcaattcctcaaccatcgcctctacaa
+gttgtgatcgtgaggccccttcaacgaatttcttgtccaatacatctctg
+agctgaaaaataagtccctttattcatgtgcaccacctgccactcattca
+ttttagatcctaatcctgtatttctctctctctctcactaatcgtcccgt
+catatctgacccactataatgaggggaccaccactttgccccagatttcg
+taatgagccaacatacactaggccctgttctagcacccccattgtgcatg
+ggagacacatcgtctgttggttcgggtcagctgagatgacgtggcagatg
+acgtcatgtttgttctctagcagatccctatcgtaaaataccgttctttg
+ttcgtttatgagcacttcttgggaaacaagaagaatattagagaatattg
+gattttaggaaatttcttgaccctaataatatgtatctcatggggctaat
+tacgaaagatttagagctcactaaagcagatgtggataagctggaactat
+agtcaattctcacgagatattattattagcttactcgttgaatttgatgc
+cgtgttaggtagaagccgagaacacgatgaaccttggaagttatgtagtc
+gagttttctggaagaaaaagtatatatagtttgataaaaagttacgtcat
+aagttattggtcccgagtgtgtacactagaaacttgcgcaatcagttggt
+caggtggtctaggacctttacatgtaatataattcattggtttgttgctc
+tagatctcaaagaatatggttttcctgctgagaaacaaaatttttttttc
+aaatgttcgcgatattatacgatttttttgcgctgaaaaatacggtatcc
+ggactcgacacgacagtttttcaataaattcggaaaggtacatatgcgcc
+tttgaagagtactgtaattttaaacatttgttgatgcagtaaatattctc
+acggatttttagaggtttttttttgaatatttatacagttatattagagt
+taaaaaaataaatctatttttatcgaaatttatgaaaaatctactcccca
+gaaacaaagtttgaatttacttaaaatgtatgtgcgcctttttaaattca
+acaaaaatttatcaaattttgtctttttaatcacttttacttttttttcg
+aaaaaaaaaaaaactttaaaaacaccgaaaattaaaatttttaattaccg
+taatcctttaaaggcgcacacctctttttcgcaatcataaaaatttacag
+gcacagaatttcctactgtaacgtgttttctcgatagaaacgtttctcca
+aatcgaaatttttattagcaatcatcaattcgtcatgtttctgtgctgga
+gcacattgttatgcagtgctcatgaatattcacagttgaaaatcgaattt
+ttttttcttatttttattaacttctctcctcactcaagtgcaatctcatt
+tcggcggaacgatgaaagcggactcgtttgaaacggattacactgctggc
+tggctccatcttttttatttctggtttttttcccgacacgggaggtcatc
+cgtccacgtcttcaatcttattcgcttctccttctatctatctctcttcc
+aaaaaaatggaacagattgtccgccttctactttccgcatgcgcctattc
+tagacatcgagaagaagcgagagaatccgaaaaactccgccgtccggcgc
+ctagcgttcatcccgtcgcatccaatttccttcacccctgtctccagtct
+ctaatctgtgtttcccagaccttctccttcttcttctcccctctttcttc
+cctttcttttctacgattcctagacctgcccggttgaccatcgggcccac
+catttatcgagcgcgtccgtctgttcgttgctgtgagcgcgcgcgcgcga
+gcgcacactgcacaccatttgaccgcaacgagccgagagagtgtgtgaaa
+tgaagagacgccgagtggacacgttgctctacaccaaacgcgctacacca
+aatgggcggagacccaatggtgcaccaagtcagcagtataaaaggaatgg
+aaatggtccattcagtcatcagttgtttttttattttctcttttctccca
+tcactttctcccttcttcccctctcctaatttccattcccaactattatt
+ctcggatcagatcgagccattgctggtttcttccacagtggtactttcca
+ttagaactatcaccgggtggaaactagcagtggctcgatcttttccactt
+gctccaccgctgtcggggaaccgcgccaattttcgcttcagtgctagacc
+atccaaagtgtctatcaccgggtgaaaattcgcatgggtccccgacgcgg
+aaagataaaatatcttaaaatcgattctagaaacccttggaccagtgtgg
+gtgtccgttgcggtgctacattctctaatctgtatcaccgggtgaacact
+tgcagtggtcctcgtggtttctctgtgagccaggtcctgttccggttttt
+tccgtggtgataacgcatccaaaagtctctatcaccgggagaaaaactgg
+agtaggacctgtgactcattccgatttctggagttttcccctacattcta
+ccattcagctactgattattgaattcctgatataccgagagcccagctga
+tttcgtcttggtaataagctcgtcattgagattatcaccgggtgtaaatc
+agcttggctctggtgtctccgaacctcctgtccgcacctcagtggatgta
+tgccatgatgataagatatcagaaatcctatcaccgggtgtacatcagct
+aaggtgcgggtacaggtgcatttgatatcaaggtgagttatttttaagtg
+ggtcccagagaccttggtggtttttctctgcagtgatagatacttctaac
+aactcgctatcaccgggtgaaaaatcacctaggtctggagcctcctgctc
+tttttttgctgtttttaaacttaaacttaaaactaacactttatcaaaat
+aaagtcttccaaaatcttttttctgatctgccggaagactttccatgaat
+ttgtccaaaactcgttgcactttatcctcgtcgtaatcatttgacaccat
+atctttggataactagaataattgaacattggtttaaaaaaattctctca
+aaaaaaaaatcacaaacctgatgaattttagcctcatctatagcagtatc
+tgcgagaagaatcgtaagattcattgataattctatatattttccaataa
+ttttatccgaagctggatgtgaagtttctacagtacctccgtggcataat
+actacaatggaagcaaaaagagcgacaattaggatcgtcattttagtgga
+gaatgatgaattgacccggctctttgggggttggaggattcattttcccc
+ttcaacaggtgctcaaataattaaagagaatagaaccgacgatatatggg
+tcaaatgtttatacagttgtgctactaaacgtattgttacacgcgttatt
+aataattagaattagaattatatcgttttgtacggattgagaatcccatt
+tgggtcgaaaatgttcttgagcttctttgtcaaaagtcgttcttcaggat
+cttttccgaatgtggagtacggtagcttcagttgaccgattccatgttca
+gctgaaattgacccgccgtgatcgacaacccattcgtagaggaagggata
+gagcctggaatttgaaattattaatagaattaaaattttataaaaaagaa
+aaatctcgaaacttacaatttttcaagttcttcattgtgtttttcagatg
+taatatttaaatgagtgtttccatctcccaaatgtccataagtgacaatt
+cttttagccaaagaaccacatcgttccttcatcacattcgtcaattcata
+ataattttccaatggtaaagaaacatcatgcttatagacatatccatctc
+tggtaaccgccaatggtgcactttctctcaattgccacatcttcgtagct
+tctgcagaagatccagcgagcactccgtcgataatcagattttttgagag
+gcattcatccaaaaatgcgctcattttctccatatcgtgatcttcattgg
+atcctgatgtttcgacaaggatcgagaatggggttggagcattcagtact
+gggtgcaatcctagattcgttttcaaacattccatcgtagcatcgtcgag
+aagttcgaaggaggaaaggatttcagtgaggctggattttgcaagcttca
+gtacttcgcagcattttttgaaggattcgatgcctgaaaaaaattagaaa
+ttgaaaaatttgaacccattatataaatattcaacctaccaagcatcgca
+ctttgtacacttttcggtttaggaaccgcagtcattgtgacgcttgtgat
+aacacccaactgcccttcacttcccaagaataggtgtggagtgtgcaaag
+ttgtgttgtccttccgaatgcttgatcccaaatgtagaacagttccatgt
+tcatcgggaagaaccaccgtgagcccgagaagatgtgcgtgaagacttcc
+gtatcgaatcaaccgaatccctcctgcacacgtggcaatatttcctccaa
+tctgacaggatcctttggctccgagatcaaaaggcatcatatatccgagt
+tttgcaagtttgttgtccaagtcttccagaataaaaccagaatcacactt
+gagaattcccattgtgtcgtcgaaagagaattgcttgttgattttattca
+ttgatataacaacttcatcatgtactggaattgatccaccaacgagtcct
+gtattccctccttgtgggactactgccaatttgttcttggagcaatacgc
+caatattgcagaaacctcttcggtgctcttcgggtagaggacgacactgc
+caggacctggaaattaaaacatttaatatttaaagtacctatttaatatt
+aaataaacctaatcttaaaatacaaatacctttaaattggcctgtccaat
+ctgtagtatgatttgtaatatcgtccttcttcactgcatcttgcccgaga
+aaattctcaaatgccattaaatccgactgcatcacttttgcaaatccttc
+atgtctggcggcaagaactgctgcgtagcttctagttggtcttctgattc
+gtggcaagattttcagaaacatctgaattcagaaacttttcaaaaaataa
+cttgaaacttcaaaagaaatagtaggagacaaagctcggctaggtgaccg
+
+>chrIII:2172325-2172669
+CAGGCAGTCAGTCAGTCTCTCTCCACTCACATTCAGTCAGTCAGTGACCA
+TCACCAGGTTGTGTGTGAGCCCCTTCCATTATTCTTCTGAACCCCCCTCC
+CAACGCGGGAAGACTCGCCGGCAATGACACTGGTTATCTTTTCCATCGTG
+GAATGCCCCCCATTGATTTTTTCCCCTTTTCGGGGGGAAAAAATTGGAAA
+CGAGAAAGGTATCGGGTGTCATAGCCGGCGTGATCATCTTCCTCAAGTAT
+TCCTCTGCTGATTTCGATATTCGGAGGAGCTCGGAGGCTGTTCAGCTGTA
+AAATTGGTTGATTAAGCTCAAAAATCGGCGTTAACGCGGCTTTCC