Mercurial > repos > rnateam > viennarna_rnacofold
comparison test-data/rnafold_result1.txt @ 7:42b7c0fd4370 draft default tip
planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/rna_tools/vienna_rna commit 36681a08c6e44c663169caaefd964781c43d0d29
author | rnateam |
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date | Wed, 20 Dec 2017 08:33:05 -0500 |
parents | 93c94bf87a04 |
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6:93c94bf87a04 | 7:42b7c0fd4370 |
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1 >Anolis_carolinensis_chrUn_GL343590.trna2-A | 1 >Anolis_caro_chrUn_GL343590.trna2_AlaAGC |
2 UGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGUGAGAGGUAGUGGGAUCGAUGCCCACAUUCUCCA | 2 UGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGUGAGAGGUAGUGGGAUCGAUGCCCACAUUCUCCA |
3 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).. (-22.00) | 3 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).. (-22.00) |
4 ,((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))),)), [-23.20] | 4 >Anolis_caro_chrUn_GL343207.trna3_AlaAGC |
5 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))).)). {-21.90 d=9.72} | |
6 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))).)). {-21.90 MEA=58.88} | |
7 frequency of mfe structure in ensemble 0.142309; ensemble diversity 14.51 | |
8 >Anolis_carolinensis_chrUn_GL343207.trna3-A | |
9 GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUUGAUGCCCGCAUUCUCCA | 5 GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUUGAUGCCCGCAUUCUCCA |
10 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). (-29.60) | 6 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). (-29.60) |
11 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). [-29.88] | |
12 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). {-29.60 d=0.64} | |
13 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). {-29.60 MEA=71.81} | |
14 frequency of mfe structure in ensemble 0.63265; ensemble diversity 1.15 |