comparison test-data/rnafold_result1.txt @ 6:63c9659a1897 draft

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author rnateam
date Thu, 28 Sep 2017 16:25:39 -0400
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1 >Anolis_carolinensis_chrUn_GL343590.trna2-A 1 >Anolis_carolinensis_chrUn_GL343590.trna2-A
2 UGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGUGAGAGGUAGUGGGAUCGAUGCCCACAUUCUCCA 2 UGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGUGAGAGGUAGUGGGAUCGAUGCCCACAUUCUCCA
3 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).. (-22.00) 3 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).. (-22.00)
4 ,((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))),)), [-23.20]
5 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))).)). {-21.90 d=9.72}
6 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))).)). {-21.90 MEA=58.88}
7 frequency of mfe structure in ensemble 0.142309; ensemble diversity 14.51
4 >Anolis_carolinensis_chrUn_GL343207.trna3-A 8 >Anolis_carolinensis_chrUn_GL343207.trna3-A
5 GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUUGAUGCCCGCAUUCUCCA 9 GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUUGAUGCCCGCAUUCUCCA
6 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). (-29.60) 10 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). (-29.60)
11 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). [-29.88]
12 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). {-29.60 d=0.64}
13 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). {-29.60 MEA=71.81}
14 frequency of mfe structure in ensemble 0.63265; ensemble diversity 1.15