Mercurial > repos > rnateam > viennarna_rnadistance
comparison test-data/sample_3_result.txt @ 7:2d0d76f6a8aa draft default tip
planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/rna_tools/vienna_rna commit 36681a08c6e44c663169caaefd964781c43d0d29
author | rnateam |
---|---|
date | Wed, 20 Dec 2017 08:35:52 -0500 (2017-12-20) |
parents | 63c9659a1897 |
children |
comparison
equal
deleted
inserted
replaced
6:63c9659a1897 | 7:2d0d76f6a8aa |
---|---|
1 >SECIS_1 | 1 >SECIS_1 |
2 AUUUUAUCCAUGAAAGUGUUUCCUCUAAACCUAUGUGGAGGAACACCUGAUGUCCAGGAAAAU | 2 AUUUUAUCCAUGAAAGUGUUUCCUCUAAACCUAUGUGGAGGAACACCUGAUGUCCAGGAAAAU |
3 .((((...(((.(..(((.((((((((........))))))))))).).))).....)))).. (-27.97) | 3 .((((...(((.(..(((.((((((((........))))))))))).).))).....)))).. (-27.97) |
4 .((((...(((.{..(((.((((((((........))))))))))).}.))).....)))}.. [-29.13] | |
5 ..(((...(((....(((.((((((((........)))))))))))...))).....)))... {-26.59 d=5.82} | |
6 .((((...(((.(..(((.((((((((........))))))))))).).))).....)))).. {-27.97 MEA=54.87} | |
7 frequency of mfe structure in ensemble 0.151171; ensemble diversity 8.50 | |
8 >6S_1 | 4 >6S_1 |
9 GAAACCCUAAUGUAUUCGAUAUAGUUCCUGAUAUUUUUGAACCGAACAAUUUUUUAUACCUAGGGAGCUUGGAGUUCCGGCGCGGCGCACAUGCCUUCACACGAGGAAGUGCAAACCGUUAGACAGAGCACCCACCUGCUUUAAUUGAGAGCGGGUUCAAAGGAAGGGAAUCCUAAACGGUACGAUUGGGGUUUCU | 5 GAAACCCUAAUGUAUUCGAUAUAGUUCCUGAUAUUUUUGAACCGAACAAUUUUUUAUACCUAGGGAGCUUGGAGUUCCGGCGCGGCGCACAUGCCUUCACACGAGGAAGUGCAAACCGUUAGACAGAGCACCCACCUGCUUUAAUUGAGAGCGGGUUCAAAGGAAGGGAAUCCUAAACGGUACGAUUGGGGUUUCU |
10 (((((((...(((((.((.....((((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((.(.((((.....))))).))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))))......)))))))....))))))). (-110.38) | 6 (((((((...(((((.((.....((((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((.(.((((.....))))).))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))))......)))))))....))))))). (-110.38) |
11 (((((((,,{(((((,((.....{(((((....(((((((((({{{....,},.........(((.((((.....((.((((.(..((((.{.((((.....)))),.))))...))))).))}.)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))),......))))))).}.,))))))). [-115.12] | |
12 (((((((..((((((.((......(((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((...((((.....))))..))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))).......))))))).)..))))))). {-109.37 d=10.73} | |
13 (((((((..((((((.((......(((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((...((((.....))))..))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))).......))))))).)..))))))). {-109.37 MEA=177.59} | |
14 frequency of mfe structure in ensemble 0.000456946; ensemble diversity 17.02 | |
15 >6S_2 | 7 >6S_2 |
16 UUGUCCCUGCCGUGCUCGUGACUUGGCCAUACAUUCUCUGAACCUAUGUCUUACGGCAUAUGGGUUGCGGGAGUGUAGAGCUGGAGUGAUCGUCUACUCGUAGACGAACCCGAUGCUCUUCGGAUCGCGACCACCUUGAACCUCAGGGUUCGAGAUGCCGGCCUUGACGGCACAGGCGGGGCAUC | 8 UUGUCCCUGCCGUGCUCGUGACUUGGCCAUACAUUCUCUGAACCUAUGUCUUACGGCAUAUGGGUUGCGGGAGUGUAGAGCUGGAGUGAUCGUCUACUCGUAGACGAACCCGAUGCUCUUCGGAUCGCGACCACCUUGAACCUCAGGGUUCGAGAUGCCGGCCUUGACGGCACAGGCGGGGCAUC |
17 .((.(((((((((((.(((.(...((((...((.((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............))))))))))))..)))).).))))))).))))))))).. (-129.27) | 9 .((.(((((((((((.(((.(...((((...((.((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............))))))))))))..)))).).))))))).))))))))).. (-129.27) |
18 .((,(((((((((((.(((.{...((((...,,.((((.((((((..(((....))).....((((((((...{(.(((((.((.((..((((((,....,))))))))))...))))).)}..)))))))).....,,...,,.)))))))))),}..)))).}.))))))).))))))))).. [-132.48] | |
19 .((.(((((((((((.(((.(...((((......((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............))))))))))....)))).).))))))).))))))))).. {-129.23 d=10.34} | |
20 .((.(((((((((((.(((.(...((((...(..((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............)))))))))).)..)))).).))))))).))))))))).. {-128.23 MEA=168.16} | |
21 frequency of mfe structure in ensemble 0.00547171; ensemble diversity 14.91 |