Mercurial > repos > shantanu > demo_bowtie

diff test-data/bowtie_in5.fastqillumina @ 0:b8d21c7bb4e4 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded
author shantanu
date Mon, 26 Aug 2013 16:47:53 -0400
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/bowtie_in5.fastqillumina	Mon Aug 26 16:47:53 2013 -0400
@@ -0,0 +1,72 @@
+@Dummy:1:1:1761:343/1
+TTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGA
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhh^hOhhhhghhhfhhhhhOhh^hAAhhhhhh
+@Dummy:1:1:1578:331/1
+TGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAGTGGCTTAATATGCTTGGC
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1647:512/1
+TACTGAACAATCCGTACGTTTCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCA
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1570:620/1
+GAGTAACAAAGTaaaGTTTGGAccGTTTTTGTCTCGTGCTCGTCGCTGCG
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhahhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1599:330/1
+AGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCaGAAGGAGTGATGTAATGTC
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhh[hhh_hhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1652:270/1
+AGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGacTTTGCATTGTTTAATTG
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhUhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1746:351/1
+CTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGT
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1582:633/1
+CCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTCTACCAC
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1598:534/1
+GCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAA
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1572:324/1
+AAGGTGCTTaaaTTCgtGGGTCCTGAGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGC
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhJVhOThAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1749:466/1
+TTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCT
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1629:446/1
+AGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGT
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1763:587/1
+AAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGT
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1616:363/1
+TGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGG
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhchhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1768:715/1
+ACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCT
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhchhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1572:270/1
+TGAGATGCTTGCTTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTA
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1673:514/1
+ATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCT
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhPAhhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1634:330/1
+GGATATTCGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATG
++
+hhhhhhhAAhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhWhhAhhhhhhhOOOhhhh