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view test-data/2_short.vcf @ 6:74f595df6e51 draft
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| author | ulfschaefer |
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| date | Thu, 16 Jun 2016 06:39:51 -0400 |
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##fileformat=VCFv4.1 ##FILTER=<ID=LowQual,Description="Low quality"> ##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed"> ##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)"> ##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality"> ##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype"> ##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification"> ##GATKCommandLine=<ID=SelectVariants,Version=2.6-5-gba531bd,Date="Thu May 22 09:15:54 BST 2014",Epoch=1400746554393,CommandLineOptions="analysis_type=SelectVariants input_file=[] read_buffer_size=null phone_home=AWS gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 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