diff test-data/e_coli_i.ftbl @ 0:9b03a930b08b draft

"planemo upload commit 8e69ff6919990050909511d8bdfb520c19a4af72"

--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/e_coli_i.ftbl	Mon May 04 03:24:12 2020 -0400
@@ -0,0 +1,789 @@
+PROJECT
+	NAME	VERSION	FORMAT	DATE	COMMENT
+	K12_MG1655.ftbl	1		101109	modele E coli K12 MG1655 WT avec voies centrales completes et voies biomasse simplifiees
+
+NETWORK
+	FLUX_NAME	EDUCT_1	EDUCT_2	PRODUCT_1	PRODUCT_2
+
+// Glycolyse.
+// PPP
+// TCA
+// voies anaplerotiques: pepc. enz malique
+// voie glyoxylate
+// avec pool interne unique de CO2 provenant soit du metabolisme soit de l'exterieur (CO2upt laisse libre)
+// saisie differentielle des substrats marques
+
+
+// Uptake substrats
+
+	Glucupt_1	Gluc_1		Glc6P		// fehlt bei wolfgang
+		#ABCDEF		#ABCDEF		// fehlt bei wolfgang
+
+	Glucupt_U	Gluc_U		Glc6P		// fehlt bei wolfgang
+		#ABCDEF		#ABCDEF		// fehlt bei wolfgang
+
+//	CO2upt	CO2_ext		CO2		// entree de CO2 non marque
+//		#A		#A		// ce flux est a laisser libre
+
+//	FTHF0	FTHF_0		FTHF		// prise en charge de FTHF non marque
+//		#A		#A
+
+//	FTHF1	FTHF_1		FTHF		// prise en charge de FTHF marque
+//		#a		#a
+
+
+// Embden Meyerhof Parnas Pathway
+
+	pgi	Glc6P		Fru6P
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+	pfk	Fru6P		FruBP
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+	ald	FruBP		GA3P	GA3P
+		#ABCDEF		#CBA	#DEF
+
+//	tpi	DHAP		GA3P
+//		#ABC		#CBA
+
+	pgk	GA3P		PGA
+		#ABC		#ABC
+
+	eno	PGA		PEP
+		#ABC		#ABC
+
+	pyk	PEP		Pyr
+		#ABC		#ABC
+
+
+// Methylglyoxal Pathway
+
+//	mgs	DHAP		Pyr
+//		#ABC		#ABC
+
+
+// Pentose Phosphate Pathway
+
+	zwf	Glc6P		Gnt6P
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+	gnd	Gnt6P		CO2	Rib5P
+		#ABCDEF		#A	#BCDEF
+
+	edd	Gnt6P		Pyr	GA3P
+		#ABCDEF		#ABC	#DEF
+
+//	ta	Ery4P	Fru6P	GA3P	Sed7P
+//		#ABCD	#abcdef	#def	#abcABCD
+
+//	tk1	GA3P	Sed7P	Rib5P	Rib5P
+//		#ABC	#abcdefg	#abABC	#cdefg
+
+//	tk2	GA3P	Fru6P	Rib5P	Ery4P
+//		#ABC	#abcdef	#abABC	#cdef
+
+	ta	GA3P	Sed7P	Ery4P	Fru6P
+		#ABC	#abcdefg	#defg	#abcABC
+
+	tk1	Rib5P	Rib5P	GA3P	Sed7P
+		#ABCDE	#abcde	#CDE	#ABabcde
+
+	tk2	Rib5P	Ery4P	GA3P	Fru6P
+		#ABCDE	#abcd	#CDE	#ABabcd
+
+
+// Tricarboxylic Acid Cycle
+
+	pdh	Pyr		AcCoA	CO2
+		#ABC		#BC	#A
+
+	citsynth	AcCoA	OAA	ICit
+		#AB	#abcd	#dcbaBA
+
+	idh	ICit		AKG	CO2
+		#ABCDEF		#ABCEF	#D
+
+	akgdh	AKG		Suc	CO2
+		#ABCDE		#BCDE	#A
+
+	fum_a	Suc		Mal
+		#ABCD		#ABCD
+
+	fum_b	Suc		Mal
+		#ABCD		#DCBA
+
+	maldh	Mal		OAA
+		#ABCD		#ABCD
+
+
+// Glyoxylate Shunt
+
+//	gs1	ICit		GlyOx	Suc
+//		#ABCDEF		#AB	#DCEF
+
+//	gs2	GlyOx	AcCoA	OAA
+//		#AB	#ab	#ABba
+
+
+// Anaplerotic Reactions
+
+	ppc	PEP	CO2	OAA			// PEPcarboxylase
+		#ABC	#a	#ABCa
+
+	mae	Mal		Pyr	CO2		// enzyme malique
+		#ABCD		#ABC	#D
+
+//	pck	OAA		PEP	CO2		// PEP carboxykinase
+//		#ABCD		#ABC	#D
+
+
+// Biosynthetic Pathways
+
+	// Glucose-6-Phosphate Family
+
+	bs_glc6P	Glc6P		BM_Glc6P
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+	// Fructose-6-Phosphate Family
+
+	bs_fru6P	Fru6P		BM_Fru6P		// sortie de Fru6P pour biomasse
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+	// Phosphoglycerate Family
+
+	bs_pga	PGA		BM_PGA
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pga_aux	BM_PGA		PGA_Aux
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pga1	BM_PGA		Ser
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pga1_aux	Ser		Ser_Aux
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pga2	Ser		Cys			// ce flux sert de sortie pour PGA hors formation de Gly
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pga2_aux	Cys		Cys_Aux			// ce flux sert de sortie pour PGA hors formation de Gly
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pga3	Ser		Gly	FTHF		// formation de gly pour biomasse
+		#ABC		#AB	#C		// ce flux est reversible
+
+	bs_pga3_aux	Gly		Gly_Aux		// pour conserver Gly comme metabolite intracellulaire
+		#AB		#AB
+
+	// TrioseP Family
+
+	bs_DHAP	GA3P		Glp			// formation glycerolP pour lipides
+		#ABC		#ABC
+
+	// Pyruvate Family
+
+	bs_pyr	Pyr		BM_Pyr
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pyr1	BM_Pyr		Ala
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pyr1_aux	Ala		Ala_Aux		// pour conserver Ala comme metabolite intracellulaire
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pyr2	BM_Pyr	BM_Pyr	AKV	CO2		// AKV et Val ont le meme squelette C
+		#ABC	#abc	#ABbcC	#a		// cette reaction permet d'utiliser eventuellement les donnees obtenues sur Val
+
+	bs_pyr4	AKV		Val		// permet de tenir compte de la sortie de Val
+		#ABCDE		#ABCDE
+
+	bs_pyr4_aux	Val		Val_Aux		// permet de tenir compte de la sortie de Val
+		#ABCDE		#ABCDE
+
+	bs_pyr3	AKV	BM_AcCoA	Leu	CO2
+		#ABCDE	#ab	#abBCDE	#A
+
+	bs_pyr3_aux	Leu		Leu_Aux		// pour conserver Leu comme metabolite intracellulaire
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+
+	// Erythrose-4-Phosphate Family
+
+	bs_e4p	Ery4P		BM_Ery4P		// pour utiliser les donnees sur Ery4P
+		#ABCD		#ABCD
+
+//	bs_e4p_aux	BM_Ery4P		Ery4P_aux		// pour utiliser les donnees sur Ery4P
+//		#ABCD		#ABCD
+
+
+	// Ribose-5-Phosphate Family
+
+	bs_rib5p	Rib5P		BM_Rib5P	// pour utiliser les donnees sur Rib5P
+		#ABCDE		#ABCDE
+
+	bs_rib5p1	BM_Rib5P	FTHF	His		// pour utiliser les donnees sur Rib5P
+		#ABCDE	#a	#EDCBAa
+
+	bs_rib5p1_aux	His		His_Aux		// sortie pour conserver His comme metabolite intracellulaire
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+	bs_rib5p2	BM_Rib5P		Ri5P_Aux		// sortie de Ri5P pour autres besoins que His
+		#ABCDE		#ABCDE			// ce flux est important pour ne pas imposer de fausses contraintes sur FTHF si on considerait His comme seule sortie
+
+
+	// Aromatic Amino Acids
+
+	bs_pep	PEP		BM_PEP
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pep1	BM_PEP	BM_Ery4P	DAHP
+		#ABC	#abcd	#ABCabcd
+
+	bs_pep2	BM_PEP	DAHP	Chor
+		#ABC	#abcdefg	#ABCabcdefg
+
+	bs_pep3a	Chor		Phe	CO2
+		#ABCDEFGHIJ		#ABCEFGHIJ	#D
+
+	bs_pep3b	Chor		Phe	CO2
+		#ABCDEFGHIJ		#ABCEJIHGF	#D
+
+	bs_pep3_aux	Phe		Phe_Aux
+		#ABCEFGHIJ		#ABCEFGHIJ
+
+	bs_pep4a	Chor		Tyr	CO2
+		#ABCDEFGHIJ		#ABCEFGHIJ	#D
+
+	bs_pep4b	Chor		Tyr	CO2
+		#ABCDEFGHIJ		#ABCEJIHGF	#D
+
+	bs_pep4_aux	Tyr		Tyr_Aux
+		#ABCEFGHIJ		#ABCEFGHIJ
+
+	bs_pep5	BM_PEP		PEP_Aux
+		#ABC		#ABC
+
+	bs_pep6	Chor	BM_Rib5P	Trp	PyrCO2
+		#ABCDEFGHIJ	#abcde	#edcbaJEFGHI	#ABCD
+
+	bs_pep6_aux	Trp		Trp_Aux
+		#ABCDEFGHIJK		#ABCDEFGHIJK
+
+	bs_pep7	PyrCO2		Pyr	CO2
+		#ABCD		#ABC	#D
+
+
+	// Acetyl-CoA
+
+	bs_accoa	AcCoA		BM_AcCoA
+		#AB		#AB
+
+	bs_accoa_aux	BM_AcCoA		AcCoA_Aux
+		#AB		#AB
+
+
+	// Alpha-Ketoglutarate Family
+
+	bs_akg	AKG		BM_AKG			// Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG
+		#ABCDE		#ABCDE
+
+	bs_akg1	BM_AKG		Glu			// Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG
+		#ABCDE		#ABCDE
+
+	bs_akg2	Glu		Pro			// Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG
+		#ABCDE		#ABCDE
+
+	bs_akg3	Glu		Gln			// Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG
+		#ABCDE		#ABCDE
+
+	bs_akg4	Glu	CO2	Arg			// Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG
+		#ABCDE	#a	#ABCDEa
+
+	bs_akg4_aux	Arg		Arg_Aux			// Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+
+	// Oxaloacetate Family
+
+	bs_oaa	OAA		BM_OAA
+		#ABCD		#ABCD
+
+	bs_oaa1	BM_OAA		Asp
+		#ABCD		#ABCD
+
+	bs_oaa1_aux	Asp		Asp_Aux
+		#ABCD		#ABCD
+
+	bs_oaa2	Thr	BM_Pyr	Ile	CO2
+		#ABCD	#abc	#ABbCDc	#a
+
+	bs_oaa2_aux	Ile		Ile_Aux
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+	bs_oaa3a	BM_OAA	BM_Pyr	Lys	CO2
+		#ABCD	#abc	#ABCDcb	#a
+
+	bs_oaa3b	BM_OAA	BM_Pyr	Lys	CO2
+		#ABCD	#abc	#abcDCB	#A
+
+	bs_oaa3_aux	Lys		Lys_Aux
+		#ABCDEF		#ABCDEF
+
+	bs_oaa4	BM_OAA		OAA_Aux
+		#ABCD		#ABCD
+
+	bs_oaa5	BM_OAA		Thr
+		#ABCD		#ABCD
+
+	bs_oaa5_aux	Thr		Thr_Aux
+		#ABCD		#ABCD
+
+	bs_oaa6	BM_OAA	FTHF	Met
+		#ABCD	#a	#ABCDa
+
+	bs_oaa6_aux	Met		Met_Aux
+		#ABCDE		#ABCDE
+
+	bs_oaa7	BM_OAA		Asn
+		#ABCD		#ABCD
+
+	bs_oaa7_aux	Asn		Asn_Aux
+		#ABCD		#ABCD
+
+
+// Flux de sortie
+
+	out_co2	CO2		CO2_out			// Sortie de CO2
+		#A		#A
+
+	out_Ac	AcCoA		Acetate			// Sortie d'acetate
+		#AB		#AB
+
+	out_FTHF	FTHF		FTHF_out
+		#A		#A
+
+FLUXES
+	NET
+		NAME	FCD	VALUE(F/C)	ED_WEIGHT	LOW(F)	INC(F)	UP(F)
+
+		Glucupt_1	F	0.7	//0.807194
+		Glucupt_U	D
+//		CO2upt	F	0.669589
+//		FTHF0	F	0.00224836
+//		FTHF1	F	0.001
+
+		pgi	D
+		pfk	D
+		ald	D
+//		tpi	D
+		pgk	D
+		eno	D
+		pyk	F	1.4
+
+		zwf	F	0.2
+		gnd	F	0.15062
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+		ta	D
+		tk1	D
+		tk2	D
+
+		pdh	D
+		citsynth	D
+		idh	D
+		akgdh	D
+		fum_a	D
+		fum_b	D
+		maldh	D
+
+//		gs1	C	0
+//		gs2	D
+
+		ppc	D
+		mae	D
+//		pck	D
+
+		// flux de biomasse
+
+		bs_glc6P	C	0.0109	// sortie de G6P
+		bs_fru6P	C	0.0038	// sortie de F6P
+		bs_pga	C	0.0791		// sortie de PGA pour formation de biomasse
+		bs_pga_aux	D		// sortie de PGA pour formation de biomasse
+		bs_pga1	D			// conversion PGA donne ser
+		bs_pga1_aux	C	0.0109	// conversion PGA donne ser
+		bs_pga2	D
+		bs_pga2_aux	C	0.0046	// conversion PGA donne Cys
+		bs_pga3	D			// reaction de synthese de Gly
+		bs_pga3_aux	C	0.0308	// sortie de Gly
+		bs_DHAP	C	0.0068		// formation de glycerolP pour lipides
+		bs_pyr	C	0.1501	// avant : 0.1547		// sortie de Pyr pour formation de biomasse
+		bs_pyr1	D	// formation d'Ala
+		bs_pyr1_aux	D	// sortie d'Ala. correspond aux sorties de Pyr qui ne sont pas associees a Val et Leu
+		bs_pyr2	D			// synthese d'AKV. consomme 2 Pyr
+		bs_pyr4	D
+		bs_pyr4_aux	C	0.0213	// sortie correspondant a l'utilisation de Val pour la biomasse
+		bs_pyr3	D			// synthese de Leu (AKV+AcCoA consommes)
+		bs_pyr3_aux	C	0.0227	// sortie de Leu
+		bs_e4p	D		// sortie d'Ery4p pour biomasse
+//		bs_e4p_aux	C	0	// sortie d'Ery4p pour Trp
+		bs_rib5p	C	0.0476	// synthese d'His
+		bs_rib5p1	D		// synthese d'His
+		bs_rib5p1_aux	C	0.0048	// sortie d'His
+		bs_rib5p2	D		// sortie de Rib5P autre que His
+		bs_pep	C	0.0381		// sortie de PEP
+		bs_pep1	D			// sortie de PEP
+		bs_pep2	D
+		bs_pep3a	D
+		bs_pep3b	D
+		bs_pep3_aux	C	0.0093
+		bs_pep4a	D
+		bs_pep4b	D
+		bs_pep4_aux	C	0.0069
+		bs_pep5	C	0.0027
+		bs_pep6	D
+		bs_pep6_aux	D
+		bs_pep7	D
+		bs_accoa	C	0.1565	// sortie d'AcCoA pour biomasse
+		bs_accoa_aux	D		// sortie d'AcCoA pour biomasse en dehors de synthese Leu
+		bs_akg	C	0.0571		// sortie d'AKG
+		bs_akg1	D
+		bs_akg2	C	0.0111
+		bs_akg3	C	0.0132
+		bs_akg4	D
+		bs_akg4_aux	D
+		bs_oaa	C	0.0947		// sortie d'OAA pour formation de biomasse
+		bs_oaa1	D			// sortie d'OAA pour Asp
+		bs_oaa1_aux	C	0.0121	// sortie d'Asp
+		bs_oaa2	D			// synthese d'Ile
+		bs_oaa2_aux	C	0.0146	// sortie d'Ile
+		bs_oaa3a	D
+		bs_oaa3b	D
+		bs_oaa3_aux	C	0.0173
+		bs_oaa4	D
+		bs_oaa5	D
+		bs_oaa5_aux	C	0.0128
+		bs_oaa6	D
+		bs_oaa6_aux	C	0.0077
+		bs_oaa7	D
+		bs_oaa7_aux	C	0.0121
+
+		// Flux de sortie
+
+		out_co2	D			// sortie de CO2
+		out_Ac	F	0.213		// sortie d'acetate
+		out_FTHF	D		// sortie de FTHF. a laisser libre pour ne pas imposer de contraintes sur FTHF
+
+
+	XCH
+		NAME	FCD	VALUE(F/C)	ED_WEIGHT	LOW(F)	INC(F)	UP(F)
+
+		Glucupt_1	D
+		Glucupt_U	D
+//		CO2upt	D
+//		FTHF0	D
+//		FTHF1	D
+
+		pgi	C	0.752386	// 2011-02-22 ssg: was F => often unresolved with --irand option
+		pfk	C	0
+		ald	F	0.413926
+//		tpi	F	0.5
+		pgk	C	0.984718	// 2011-02-22 ssg: was F => often unresolved with --irand option
+		eno	F	0.800962
+		pyk	C	0.0109591	// 2010-10-01 ssg: was F => unresolved if co2 uptake is unlimited
+
+		zwf	C	0
+		gnd	C	0
+		edd	C	0
+		ta	F	0.359468
+		tk1	F	0.166316
+		tk2	F	2.11559e-03
+
+		pdh	C	0.0322745	// 2010-10-02 ssg: was F, otherwise unsolvable in monte-carlo
+		citsynth	C	0
+		idh	C	0
+		akgdh	C	0
+		fum_a	F	0.395958
+		fum_b	D
+		maldh	C	0.647115	//********************************************** C pour analyse de sensibilite, F pour minimisation
+
+//		gs1	C	0
+//		gs2	C	0
+
+		ppc	F	0.256772
+		mae	C	0
+//		pck	C	0
+
+		bs_glc6P	D		// sortie de G6P
+		bs_fru6P	D		// sortie de F6P
+		bs_pga	C	0		// conversion PGA donne Ser
+		bs_pga_aux	D		// conversion PGA donne Ser
+		bs_pga1	C	0		// conversion PGA donne Ser
+		bs_pga1_aux	D		// conversion PGA donne Ser
+		bs_pga2	C	0		// ser donne Cys. correspond a la sortie de PGA pour biomasse autre que formation Gly
+		bs_pga2_aux	D
+		bs_pga3	C	0.011799		// reaction de synthese de Gly. cette reaction est reversible
+		bs_pga3_aux	D		// sortie de Gly
+		bs_DHAP	D			// formation de glycerolP pour lipides
+		bs_pyr	C	0		// formation d'Ala
+		bs_pyr1	C	0		// formation d'Ala
+		bs_pyr1_aux	D		// sortie d'Ala. correspond aux sorties de Pyr qui ne sont pas associees a Val et Ile
+		bs_pyr2	C	0		// synthese d'AKV. consomme 2 Pyr
+		bs_pyr4	C	0
+		bs_pyr4_aux	D		// sortie correspondant a l'utilisation de Val pour la biomasse
+		bs_pyr3	C	0		// synthese de Leu (AKV+AcCoA consommes)
+		bs_pyr3_aux	D		// sortie de Leu
+		bs_e4p	C	0		// sortie d'Ery4p
+//		bs_e4p_aux	D		// sortie d'Ery4p pour Trp
+		bs_rib5p	C	0	// synthese d'His
+		bs_rib5p1	C	0	// synthese d'His
+		bs_rib5p1_aux	D		// sortie d'His
+		bs_rib5p2	D		// sortie de Rib5P autre que His
+		bs_accoa	C	0	// sortie d'AcCoA pour biomasse
+		bs_accoa_aux	D		// sortie d'AcCoA pour biomasse en dehors de synthese Leu
+		bs_pep	C	0		// sortie de PEP
+		bs_pep1	C	0		// sortie de PEP
+		bs_pep2	C	0
+		bs_pep3a	C	0
+		bs_pep3b	C	0
+		bs_pep3_aux	D
+		bs_pep4a	C	0
+		bs_pep4b	C	0
+		bs_pep4_aux	D
+		bs_pep5	D
+		bs_pep6	C	0
+		bs_pep6_aux	D
+		bs_pep7	C	0
+		bs_akg	C	0		// sortie d'AKG
+		bs_akg1	C	0
+		bs_akg2	D
+		bs_akg3	D
+		bs_akg4	C	0
+		bs_akg4_aux	D
+		bs_oaa	C	0
+		bs_oaa1	C	0		// sortie d'OAA autres que Met
+		bs_oaa1_aux	D		// sortie d'OAA autres que Met
+		bs_oaa2	C	0		// synthese de Met
+		bs_oaa2_aux	D		// sortie de Met
+		bs_oaa3a	C	0
+		bs_oaa3b	C	0
+		bs_oaa3_aux	D
+		bs_oaa4	D
+		bs_oaa5	C	0
+		bs_oaa5_aux	D
+		bs_oaa6	C	0
+		bs_oaa6_aux	D
+		bs_oaa7	C	0
+		bs_oaa7_aux	D
+
+		// Flux de sortie
+
+		out_co2	D			// sortie de CO2
+		out_Ac	D			// sortie d'acetate
+		out_FTHF	D		// sortie de FTHF. a laisser libre pour ne pas imposer de contraintes sur FTHF
+
+
+EQUALITIES
+	NET
+		VALUE	FORMULA
+
+		0	fum_a-fum_b		// scrambling reaction
+		1	Glucupt_1+Glucupt_U
+		0	bs_oaa3a-bs_oaa3b
+		0	bs_pep3a-bs_pep3b
+		0	bs_pep4a-bs_pep4b
+
+	XCH
+		VALUE	FORMULA
+
+		0	fum_a-fum_b
+
+INEQUALITIES
+	NET
+		VALUE	COMP	FORMULA
+// Inequalities for Input and Output Fluxes are generated automatically
+		1	<=	pyk
+		0.0001	<=	edd
+		0.0001	<=	gnd
+		0.0001	<=	zwf
+		0.0001	<=	ppc
+		0.0001	<=	mae
+//		2	>=	CO2upt // 2010-08-18 too high value makes jacobian rank deficient
+	XCH
+		VALUE	COMP	FORMULA
+// Inequalities for Input and Output Fluxes are generated automatically
+	METAB
+		VALUE	COMP	FORMULA
+//		1.2	>=	AKG
+
+
+FLUX_MEASUREMENTS
+	FLUX_NAME	VALUE	DEVIATION	//		Val	Dev
+	out_Ac	0.213	0.0001
+
+LABEL_INPUT
+	META_NAME	ISOTOPOMER	VALUE
+
+	Gluc_U	#111111	1
+		#000000	0.
+	Gluc_1	#100000	1.
+		#000000	0.
+//	CO2_ext	#0	0.989
+//		#1	0.011
+
+//	FTHF_0	#0	1
+//	FTHF_1	#1	1
+
+
+LABEL_MEASUREMENTS
+	META_NAME	CUM_GROUP	VALUE	DEVIATION	CUM_CONSTRAINTS
+											// Example
+
+PEAK_MEASUREMENTS
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+METAB_MEASUREMENTS
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+OPTIONS
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+	posttreat_R	plot_imass.R