# HG changeset patch # User yating-l # Date 1493674482 14400 # Node ID ba819b65bef326ba99dbf69ee6c0bde1f628a537 planemo upload for repository https://github.com/goeckslab/trfBig commit 97fd3895fbafc69df1a1c4092f261ba23fc0bd0b-dirty diff -r 000000000000 -r ba819b65bef3 test-data/dbia3.bed --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/dbia3.bed Mon May 01 17:34:42 2017 -0400 @@ -0,0 +1,66063 @@ +contig1 9130 9428 trf 163 1.8 164 86 2 438 36 12 13 37 1.82 AAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTCAACATACAACCTCCTAAGCTTGGAAATAACATTTCTTAATCAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTTATCAAAATCGGACAACTATACCATATAGCTGTCATAGGAAGGATTGGATAATTAGTGGTAAAATAATAT +contig1 15707 15757 trf 20 2.5 19 83 9 55 32 12 2 54 1.49 TATATCATTTATATCTCAG +contig1 16261 16302 trf 12 3.4 12 89 0 64 2 36 24 36 1.69 TCCGTCTGTCCG +contig1 23387 23483 trf 45 2.2 45 92 1 158 19 22 30 27 1.98 TCGGCGAAGAAATGTGCCACTTCGGCGGCACTTCTTGGAGTCACT +contig1 23451 23520 trf 24 2.9 24 80 0 75 15 26 27 30 1.96 TTCGGCGACACTTCTTGAAGTCAG +contig1 24200 24233 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Outfile can be .bed as well. Sequence output is hard + masked, lowercase. + +