view test-data/contig12_seq_list.soft.fa @ 0:cc33b1551791 draft default tip

planemo upload commit c1f0c5ceaac87b6b1db12160a8f5b287635db61b
author yating-l
date Mon, 12 Jun 2017 21:09:34 -0400
parents
children
line wrap: on
line source

>contig10:1000-2000
TCGACAAGCCCTCGACTCTGGCTCCAAGTACATTAAAAAATCAGATGATT
TTAACATTGCCTTCAATTAAACAGGTAAGATTTATTACAAAATATTGAAT
AATTTACAAATCGCGTTAATTCATTCTGCAGGAAACCATTTTACTTCCTC
ATAATTCTTTTATTACAAACATTTTTCTAACCACGTGCACCTATATCACA
ACATATGTGGAAAATGGAAGCTCGAATGTAGTAAAAGAAAAAATGGTTAT
ATCAAACACCATTACGCAAGATCGAAAGTATTTGCATGCAAGTAATCCTA
TGATAATAGACATCACTTTTTCAAGGGTAAGCATCAAATCAATTGTAAAA
TTGCACGTCTTAAAACTTGTTTGTTATTTTTAATGTTCAGACTCCAGAAC
TAGTGGTTGGAATGTTCCCAACAAGATATCATTATTTTAACACAATACGT
AGAGACCAACCGGATTCAACTCTAATGGTAGTCACTTCAAAATATACTGT
TATAAATACAATCACGAGACCTGCACATTCTTTGACTTTTATAAATTCAG
GCGACAATCTTTCGCCCACCACAAATACCTACATCAGTCAAATATTTTTT
ACTAAAACTGTCTACGGCAAAAACCAAACACCAACATATGGCACAAGTAT
AAGTAATCTTACACAAGTCGTTATTACAGAATCCCTTTCAGAAACCGGTC
CAGCTTATATAAGTTCAATAGGACCTGAGTATTTTTCAATTTCGGACAAA
AAAAAAAATTATTTACTTCGGTAATAGAAATATCTGACTATCTAATGATA
TACTCAACCAAGTCCTTATTAGAAACGAATACTCTATGTTCAGCAAAATT
TAATAATAGTTTGACTATGGTAGCTTCATATGTTTCTTTGACAAAGACAG
TCTGCGAAAGTGATCCAAAAGTATCTAACAATAACTTAAAGCTTCACACT
AACACTATAAATAATATTGCTACCAATACAGTGGGTAGTTCGCTGATAAA
>contig10:4000-5000
CGTTGATGTCTACAAAAAGACGTATTGAGACTGGCAATACAAACATGGTG
TTTCTGACAACAGGTGACCATTTGCGTGTCGAACCCTTAACAGAAAATAC
AATTAATTCAGTAAATTCTGAATTTATCTCGAGCACAAACATCTTTAACA
CAAATTACTCAGTTATCGCTACTGAACCCTCTCAACTAAGATCAAGAATA
TATAAAGAATCAAATATGTTTGGCCTTACGTCAAACAACAACCTCCAGGT
AAAACCATCTTTTGTAAAACCCCTGCGCAGTTCAGCAATGCCAGTTATAA
ATGCAATTACATTTTCACACGTTTTAGTAAGAGCACCGCATTCTGACTTT
GGTCCAAACTGGCAAGATTCGACATTAGGCATAATATGCCACACTGAAAG
TTGCAAAAAAAAATTATTAAAAGAATTTAAGCACGATATCAAAATGCTTG
AACCATCTGAAATGTTGCAGGATGAAATACCTTCAGTTTCAAAAAAAACA
TCTGAATGGGATAAGATTTCAGTGCTAGCAGAAAATTCGAACGCCATAAT
CCCTATGCATTCTACACCTTCGCATACTAACAAAACAATTAAATATTTTA
AAATAGTAACCCCCACTAAAACAAACCGGGTTAGTATAAAAAACGTATCT
ACAATCAAAACAAATTTTGATGCAAATAAATACATATTTATGAATCACTC
TATCGCTAACCTATCGAAATACTATATGAAGGAACCAATTTCGATTGGTT
CAGACAAATTATTTACATCCTCAAGGATAAGCAACCAGTCACAAGTAATT
GACAAAAGTAATGTTACAACTTTAAGTGACGTGCCTCAAAGATTAAAGAC
TTCAGACTATCTAGCGAACGAATCTTTTACAGAAAACATTTTAGGGTTTT
CCAAGCACTCAGGGCTCAGAAGCAAATCAAGCTTAGGTTCTAATCGAGAT
GAGCATGTGTATGCTTCCAGCGACATAGATAGTATGCTCTTTGGTGCTAT
>contig12:4000-5000
CAGCAAACACATTGTTTATGTCTAACCAAAGTGGACCCTTCTGGGTACCG
CCGTGGCTGGAACGCTTTTATGACAGGACGACCGTGTCGCGACAAGGATA
ACTGTTGTTATTACGGTGCCGTCaggcgatataagaactgtgctgaggat
gagctacagagctgaggatgagatacagtaagctgctagtagagaaagtg
cctagccctatttccagaggtaggaagATTTGGCTCAAAACCTATGTTtt
tttttaatttaacttgtttttatttttaagaaattaaataataggtgtcg
tcaaaaaaaggtattttgaaagaagaggtTTTAAAGTATTAATCAAGCAT
ACGCTGTTTTTTCCAATTTTAAAAAATTATAACTATTCcaaaaaagaaag
taatcttcagcaatccgaagtttgtataccctagcagttatgattaatga
aagtaacaccatattacgttttaaagtattgttgtcagcttcagtaatat
aaaaaaaaaaatttattaattatttcattgtttgtctgatcgtttctttg
acagctacacgttggagtggtcctatttgtaacaaattaaattctaaatt
cttaaaaatacaaaaaatgatattcccaatagtataggataatatgtcga
gaacaccgaagctttaattcattttatgttattttcccacagattttctg
atcgtctctgtggcaactatatgatatagtcgtccgattttgataaaata
aaattcgacattcagaactaattaaaaaatgttatttccaagcctatggg
gttacatgttaaataacacaaaagttataattttttaaaattgttttttt
ccgattattcttatgTAttatatactacttgcaaaagaagtaaagtttca
gcccaatagctttaaaacttagagattagtttgcgtagaaacggcataca
ggcggacggcagacatgtctaaatcgactcgtctagtgatgctaatcaag
>contig12:1000-2000
TAATTATAAAATAAATTAATAAAATTAAATTATTTTCAGTTGGTAATTAC
AGTCGAATAAAACTTCAATAAAATGCGCTTTTTTATTTATTTATGTAATT
GTGCTAAATAAAGAAAATTTAAAAACACTGAACAGGCACATTCTATTAGT
AAAGCTACAGTTTTTTCTTATGAGATTTATTAAGTTTCCGGCGTTTCAAT
ATCATATCATAAAGAGCTTCTAGGCCTTCTTGAAGTCCCTCGCCAGTTAT
CGCACAGGTCGGTTGTATATACCACCCCCTAAAGTGCATCGAGTTGGAAA
AGGTCCTGTTATGTTTTTTGTTATGAAAACAGTTTTTACCATCACGCGAA
TTTTTTTGGTCCTTCACATCAGAACCTTTGCCAGAATGCGGATATATGAA
TGTAGACAACGCCTCTCCACTTAACGTAGTCCTTTGTTCGTCACTTTCAG
GAGCAGGTTTAATGTGAATCATTGATGAATGCAGGTGATTTGATCTTTGC
TCTGTTAACGAGGTTTCTGTAATACTTTGGTTTGACTTGCTACATCCGAT
TAAATTGATGGTGGAAGAAGAGTCGGAACAAGTTAGCATCGATATGTTCG
GCACTGGGTTATAAAGCTCGTTCAGTCCTAAAAGTTTTTCCAGCTCCATT
GCACCACACGCGTTTGGAAGATCTTGCTTATTTGCTAATATCAGCACTGG
AACACCCTTTGAAAAACATAAAAAATAAAGCATTTCGTTTTGTTATAGTT
TTTATTTTATATTAACTTCGTTTTAGTGGTTTACTTTCTTTATATGTATG
TACATAAAAGACTGAACCGCCCACTCAATTTAGCCGTATGTTTATGAAta
tcactatggacggcagtccacgtagtgacgacgcgcaccTTTGGGGAaga
aataaaaatttagagtaatccgattgtttcgagtcatacctaaatcggaa
tgtattgcaaaagctaaaagaattgcataccaagacttttaaaaaatttt