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diff test-data/DBNFile.test_03.out.l.dbn @ 4:63df1e23f4ff draft
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| author | yhoogstrate |
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| date | Thu, 28 Jul 2016 10:25:37 -0400 |
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--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/DBNFile.test_03.out.l.dbn Thu Jul 28 10:25:37 2016 -0400 @@ -0,0 +1,14 @@ +>chr3.rna:5-80(+) x Kt-CD-box.UGU +TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGTAGCCCTTTTTGGGCTACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA +(((((((........))).((((((((((((((((.....))))))))(((......))).))).))))).)))) (((...(((((..(....((..(((((((((((((.....))))))))...)))))..))....)..)))))))) 0.0 +(((((((........))).((((((((((((((((.....))))))))(((......))).))).))))).)))) (((...(((((..(....((..(((((((((((((.....))))))))...)))))..))....)..)))))))) 0.0 +>chr4_SNORD118_revised:1-74(+) x Kt-CD-box.CGU +GAACATGATGATTGGAGATGCATGAAACGTGATTAACGTCTCTGCGTAATCAGGACTTGCAACACCCTGATTG +...((............(((((.((.((((.....)))).))))))).((((((...........)))))))) ...((..((((((............))...)))).(((......))).((((((...........)))))))) 0.0 +>chr4_SNORD118_revised:1-88(+) x Kt-CD-box.CGU +GAACATGATGATTGGAGATGCATGAAACGTGATTAACGTCTCTGCGTAATCAGGACTTGCAACACCCTGATTGCTCCTGTCTGATTT +.........(((.(((((((((.((.((((.....)))).)))))))(((((((...........))))))).)))).)))...... ..(((..((((((............))...))))...........(((((((((...........)))))))))...)))....... 0.0 +>chr3.rna.RC:80-5(-) x Kt-CD-box.UGU +TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGTAGCCCTTTTTGGGCTACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA +(((((((........))).((((((((((((((((.....))))))))(((......))).))).))))).)))) (((...(((((..(....((..(((((((((((((.....))))))))...)))))..))....)..)))))))) 0.0 +(((((((........))).((((((((((((((((.....))))))))(((......))).))).))))).)))) (((...(((((..(....((..(((((((((((((.....))))))))...)))))..))....)..)))))))) 0.0