view ezBAMQC/src/htslib/test/ce#5.sam @ 18:494b5cd02238

bash script
author youngkim
date Wed, 30 Mar 2016 13:39:05 -0400
parents dfa3745e5fd8
children
line wrap: on
line source

@SQ	SN:CHROMOSOME_I	LN:15072423
@SQ	SN:CHROMOSOME_II	LN:15279345
@SQ	SN:CHROMOSOME_III	LN:13783700
@SQ	SN:CHROMOSOME_IV	LN:17493793
@SQ	SN:CHROMOSOME_V	LN:20924149
I	16	CHROMOSOME_I	2	1	27M1D73M	*	0	0	CCTAGCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAA	#############################@B?8B?BA@@DDBCDDCBC@CDCDCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC	XG:i:1	XM:i:5	XN:i:0	XO:i:1	XS:i:-18	AS:i:-18	YT:Z:UU
II.14978392	16	CHROMOSOME_I	2	1	27M1D73M	*	0	0	CCTAGCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAA	#############################@B?8B?BA@@DDBCDDCBC@CDCDCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC	XG:i:1	XM:i:5	XN:i:0	XO:i:1	XS:i:-18	AS:i:-18	YT:Z:UU
III	16	CHROMOSOME_I	2	1	27M1D73M	*	0	0	CCTAGCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAA	#############################@B?8B?BA@@DDBCDDCBC@CDCDCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC	XG:i:1	XM:i:5	XN:i:0	XO:i:1	XS:i:-18	AS:i:-18	YT:Z:UU
IV	16	CHROMOSOME_I	2	1	27M1D73M	*	0	0	CCTAGCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAA	#############################@B?8B?BA@@DDBCDDCBC@CDCDCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC	XG:i:1	XM:i:5	XN:i:0	XO:i:1	XS:i:-18	AS:i:-18	YT:Z:UU
V	16	CHROMOSOME_I	2	1	27M1D73M	*	0	0	CCTAGCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAA	#############################@B?8B?BA@@DDBCDDCBC@CDCDCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC	XG:i:1	XM:i:5	XN:i:0	XO:i:1	XS:i:-18	AS:i:-18	YT:Z:UU
VI	2048	CHROMOSOME_I	2	1	27M100000D73M	*	0	0	ACTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCAATTATCGATTTCTGAAAAAATTATCGAATTTTCTAGAAATTTTGCAAATTTTTTCATAAAATTATCGATTTTA	#############################@B?8B?BA@@DDBCDDCBC@CDCDCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC