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comparison commons/pyRepetUnit/hmmer/tests/datas/myhmms @ 18:94ab73e8a190

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date Mon, 29 Apr 2013 03:20:15 -0400
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251 //
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454 E -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
455 61 -1194 -5420 -55 570 -1167 -1802 702 -5492 441 -3071 -267 303 -123 727 117 856 1924 -610 -463 -1603 90
456 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
457 C -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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466 E -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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469 E -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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475 E -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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478 C -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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481 C -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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484 C -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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487 C -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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490 E -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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493 E -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
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510 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
511 C -733 -11935 -1329 -894 -1115 -701 -1378 * *
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519 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
520 C -1 -11840 -12882 -894 -1115 -101 -3893 * *
521 83 102 -5296 -3867 1691 21 -1212 -3624 -1510 -259 -602 -1204 -1862 1786 -1626 665 -353 -181 -4888 2391 466 118
522 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
523 C -1 -11935 -12977 -894 -1115 -701 -1378 * *
524 84 -1211 -5433 -3815 -1455 -5755 -850 -140 -2313 -1280 -5448 -4523 -3575 -2241 -1598 -412 3271 384 -5056 -5615 -4936 119
525 - * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *
526 C * * * * * * * * 0
527 //
528 HMMER2.0 [2.3.2]
529 NAME pkinase
530 ACC PF00069
531 DESC Protein kinase domain
532 LENG 294
533 ALPH Amino
534 RF no
535 CS no
536 MAP yes
537 COM hmmbuild -A myhmms pkinase.sto
538 COM hmmcalibrate myhmms
539 NSEQ 67
540 DATE Thu Jan 8 17:50:39 2009
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548 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
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559 - -1 -11253 -12295 -894 -1115 -701 -1378 * *
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575 9 21 -4782 -1460 1735 -1488 -2091 -2941 -1034 378 -4798 -702 -451 -1594 1320 1488 1403 -804 -2034 -4965 -4282 9
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678 - -142 -510 239 64 -403 385 95 -622 235 -461 -723 267 376 51 101 353 107 -365 -302 -244
679 - -2565 -268 -11690 -2050 -399 -2023 -408 * *
680 44 -209 -4375 154 -412 -4696 -1602 1286 -625 -228 -1226 1204 1142 -3970 1548 1745 -106 467 -1483 -4559 -3876 79
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1094 182 1049 -4783 -3158 856 -5105 -1213 -419 -4855 2095 -1055 -3872 -2920 1504 205 611 -175 -804 -4405 -4966 -4284 332
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1402 - -1 -11183 -12226 -894 -1115 -186 -3045 * *
1403 285 2163 763 -1619 -5296 2250 -2060 -4007 1241 -4891 -489 484 -4781 -226 -4515 -4692 -678 -1688 -813 264 -3530 462
1404 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
1405 - -1 -11253 -12295 -894 -1115 -701 -1378 * *
1406 286 -268 -329 -158 917 -541 -1990 350 -4851 1273 -1075 388 -1130 233 840 993 -602 801 -595 -4964 -857 463
1407 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
1408 - -1 -11253 -12295 -894 -1115 -701 -1378 * *
1409 287 109 -243 672 2304 -5103 -4283 488 -4854 -1317 -2269 -656 -492 -1519 2679 -655 -618 -3248 -4404 -4965 -1114 464
1410 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
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1416 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
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1423 - -1 -11253 -12295 -894 -1115 -701 -1378 * *
1424 292 -3345 -4494 -233 -332 -563 -1986 -3051 333 99 1063 -3616 -3072 2953 -1026 -1490 -943 -1528 -1070 -4753 -4151 469
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1426 - -1 -10815 -11857 -894 -1115 -701 -1378 * *
1427 293 -6409 -5751 -7614 -7636 2593 -7311 -4003 -5084 -7219 -150 -151 -6210 -7172 -849 -6723 -6510 -6299 -1387 4881 2807 470
1428 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
1429 - -1 -10749 -11791 -894 -1115 -701 -1378 * *
1430 294 -4057 -3817 -6415 -5791 3203 -1638 -4541 1679 -5412 765 1434 -5333 -5617 -4930 -5182 -4791 -3987 1226 750 -3959 471
1431 - * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *
1432 - * * * * * * * * 0
1433 //