Repository 'package_blast_plus_2_2_29'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/iuc/package_blast_plus_2_2_29

Changeset 1:0b75bc235e70 (2015-09-30)
Previous changeset 0:a2ec897aac2c (2014-01-13) Next changeset 2:18496de7706f (2016-08-18)
Commit message:
Typo and metadata URL correction
modified:
tool_dependencies.xml
b
diff -r a2ec897aac2c -r 0b75bc235e70 tool_dependencies.xml
--- a/tool_dependencies.xml Mon Jan 13 11:29:52 2014 -0500
+++ b/tool_dependencies.xml Wed Sep 30 08:59:56 2015 -0400
b
@@ -45,23 +45,24 @@
                 </actions>
                 <!-- This actions tag is only processed if none of the above tags resulted in a successful installation. -->
                 <actions>
-                    <action type="shell_command">echo ERROR: Automated installation on your operating system and CPU architecture combination is not yet supported.</action>
-                    <action type="shell_command">echo Your machine details (the output from 'uname' and 'arch'):</action>
+                    <action type="shell_command">echo "ERROR: Automated installation on your operating system and CPU architecture combination is not yet supported."</action>
+                    <action type="shell_command">echo "Your machine details (the output from 'uname' and 'arch'):"</action>
                     <action type="shell_command">uname</action>
                     <action type="shell_command">arch</action>
-                    <action type="shell_command">echo Please report this via https://github.com/peterjc/galaxy_blast/issues - thank you!</action>
+                    <action type="shell_command">echo "Please report this via https://github.com/peterjc/galaxy_blast/issues - thank you!"</action>
                     <action type="shell_command">false</action>
                     <!-- The 'false' command will return an error, so Galaxy should treat this as a failed install -->
                 </actions>
                 <!-- The $PATH environment variable is only set if one of the above <actions> tags resulted in a successful installation. -->
                 <action type="set_environment">
                     <environment_variable name="PATH" action="prepend_to">$INSTALL_DIR</environment_variable>
+                    <environment_variable name="BLAST_ROOT_DIR" action="set_to">$INSTALL_DIR</environment_variable>
                 </action>
             </actions_group>
         </install>
         <readme>
 Downloads the precompiled 32bit Linux, 64bit Linux, or Mac OS X BLAST+
-binaries from the NCBI, which is faster than performing a local compliation,
+binaries from the NCBI, which is faster than performing a local compilation,
 avoids any issues with build dependencies, and is more reproducible between
 installations as there is no variability from the compiler or library versions.