Repository 'pirna_pipeline'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/romaingred/pirna_pipeline

Changeset 9:0ee4dadfdca3 (2017-10-13)
Previous changeset 8:c61e7cc135c2 (2017-10-13) Next changeset 10:42bc59c7db3a (2017-10-13)
Commit message:
Uploaded
modified:
bin/html.pm
b
diff -r c61e7cc135c2 -r 0ee4dadfdca3 bin/html.pm
--- a/bin/html.pm Fri Oct 13 03:12:12 2017 -0400
+++ b/bin/html.pm Fri Oct 13 03:17:10 2017 -0400
b
@@ -234,7 +234,7 @@
     elsif ( $f =~ /exons_sorted\.bam$/) { $Hex{'exons mappers (sorted bam)'} = $f;}
     elsif ( $f =~ /exons_unique_sorted\.bam$/) { $Hex{'exons unique mappers (sorted bam)'} = $f;}        
     elsif ( $f =~ /exons_reads_counts\.txt$/) { $Hex{'read number per exon (txt)'} = $f;}
-    elsif ( $f =~ /TEs_reads_counts\.txt$/) { $HTE{'read number per TE 0 to $misTE mismatches (txt)'} = $f; }
+    elsif ( $f =~ /TEs_reads_counts\.txt$/) { $HTE{"read number per TE 0 to $misTE mismatches (txt)"} = $f; }
     elsif ( $f =~ /TEs_reads_counts_mismatches\.txt$/) { $HTE{"read number per TE with 1 to $misTE mismatches (txt)"} = $f; }
     elsif ( $f =~ /TEs_reads_counts_nomismatches\.txt$/) { $HTE{'read number per TE with no mismatch (txt)'} = $f; }
     elsif ( $f =~ /TEs_unique_sorted\.bam$/) { $HTE{'TEs unique mappers (sorted bam)'} = $f; }