Repository 'bcftools_plugin_dosage'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/iuc/bcftools_plugin_dosage

Changeset 6:0fe007201caf (2017-12-12)
Previous changeset 5:e703028148e2 (2017-04-13) Next changeset 7:d31a2e310a52 (2019-02-21)
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/bcftools commit 880627162bdeb854582e9f58ddab451de35feba3
modified:
macros.xml
b
diff -r e703028148e2 -r 0fe007201caf macros.xml
--- a/macros.xml Thu Apr 13 17:43:28 2017 -0400
+++ b/macros.xml Tue Dec 12 13:58:00 2017 -0500
b
@@ -49,7 +49,7 @@
   bgzip -c '$input_file' > $input_vcf &&
   bcftools index $input_vcf &&
 #elif $input_file.is_of_type('vcf_bgzip')
-  ln -s '$input_file' $input_vcf
+  ln -s '$input_file' $input_vcf &&
 #elif $input_file.is_of_type('bcf')
   #set $input_vcf = 'input.bcf'
   ln -s '$input_file' $input_vcf &&
@@ -59,7 +59,7 @@
     bcftools index $input_vcf &&
   #end if
 #elif $input_file.is_of_type('bcf_bgzip')
-  ln -s '$input_file' $input_vcf
+  ln -s '$input_file' $input_vcf &&
 #end if
 ]]>
   </token>