Repository 'dc_genotyper'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/geert-vandeweyer/dc_genotyper

Changeset 1:15be98f10c13 (2014-09-25)
Previous changeset 0:e8a32d824f39 (2014-09-25) Next changeset 2:fa8566bd4a51 (2014-09-25)
Commit message:
change to readme file regarding the loc files.
modified:
readme.rst
b
diff -r e8a32d824f39 -r 15be98f10c13 readme.rst
--- a/readme.rst Thu Sep 25 05:24:35 2014 -0400
+++ b/readme.rst Thu Sep 25 05:27:45 2014 -0400
b
@@ -11,3 +11,8 @@
 This is a very early version with several limitations. Current limitations are : no support for indels, no plotting of the noise-models, incorrect syntax in for multi-allelic sites in the VCF file.
 
 Any feedback is welcome
+
+
+INSTALLATION:
+
+After installation, complete the dbsnp.loc and dc_genotyper_indexes.loc files. DCG supports multithreading, but keep tests have shown that using more than 6-8 threads will lead to I/O bottlenecks.