Repository 'mgescan'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/hyungrolee/mgescan

Changeset 12:1a143426370c (2016-02-15)
Previous changeset 11:89461b062f91 (2016-02-15) Next changeset 13:3d8b6dfd5743 (2016-02-15)
Commit message:
Uploaded
modified:
mgescan.sh
b
diff -r 89461b062f91 -r 1a143426370c mgescan.sh
--- a/mgescan.sh Mon Feb 15 04:08:37 2016 -0500
+++ b/mgescan.sh Mon Feb 15 04:15:01 2016 -0500
[
@@ -51,9 +51,7 @@
 
 #set path for transeq
 #export PATH=$user_dir/mgescan/EMBOSS/bin:/usr/bin:$PATH
-transeq --version 2> /dev/null
-res=$?
-if [ 0 -ne $res ]
+if [ "" == "`which transeq`" ]
 then
  echo "EMBOSS is not available."
  exit