Repository 'saint_bubblebeam'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/bornea/saint_bubblebeam

Changeset 28:24d4f1350c83 (2016-01-29)
Previous changeset 27:ab9ace68e3b5 (2016-01-29) Next changeset 29:f7b1fe03fb5b (2016-01-29)
Commit message:
Uploaded
modified:
Bubblebeam_For_SAINT_wrapper.xml
b
diff -r ab9ace68e3b5 -r 24d4f1350c83 Bubblebeam_For_SAINT_wrapper.xml
--- a/Bubblebeam_For_SAINT_wrapper.xml Fri Jan 29 09:34:17 2016 -0500
+++ b/Bubblebeam_For_SAINT_wrapper.xml Fri Jan 29 09:37:09 2016 -0500
b
@@ -60,9 +60,9 @@
 
 Bubble graphs are generated for each bait where:
 
-* x axis is the natural log of the NSAF values
-* y axis is the observed log2 fold change (as compared to control)
-* bubble radius is proportional to the average observed spectra
+ * x axis is the natural log of the NSAF values
+ * y axis is the observed log2 fold change (as compared to control)
+ * bubble radius is proportional to the average observed spectra
 
 OPTIONAL: bubble color corresponds to the CRAPome probability of a specific interaction in which an 80% cutoff is applied where prey with less than 80% are colored tan
 
@@ -112,10 +112,10 @@
 
 Suggestions:
 
-* low: 0
-* medium: 0.5
-* high: 0.7
-* very high: 0.9
+ * low: 0
+ * medium: 0.5
+ * high: 0.7
+ * very high: 0.9
 
 List of Uniprot IDs to Include: