Repository 'short_reads_trim_seq'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/devteam/short_reads_trim_seq

Changeset 1:25e6fe525306 (2015-11-11)
Previous changeset 0:f17a1585733b (2014-05-19)
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-devteam/tree/master/tools/short_reads_trim_seq commit a1517c9d22029095120643bbe2c8fa53754dd2b7
modified:
short_reads_trim_seq.xml
b
diff -r f17a1585733b -r 25e6fe525306 short_reads_trim_seq.xml
--- a/short_reads_trim_seq.xml Mon May 19 12:34:17 2014 -0400
+++ b/short_reads_trim_seq.xml Wed Nov 11 12:27:21 2015 -0500
b
@@ -8,8 +8,8 @@
 <page>
     <param name="input1" type="data" format="fasta" label="Reads" />
     <param name="input2" type="data" format="qualsolexa,qual454" label="Quality scores" />
- <param name="trim" type="integer" size="5" value="20" label="Minimal quality score" help="bases scoring below this value will trigger splitting"/>
-    <param name="length" type="integer" size="5" value="100" label="Minimal length of contiguous segment" help="report all high quality segments above this length. Setting this option to '0' will cause the program to return a single longest run of high quality bases per read" />
+ <param name="trim" type="integer" value="20" label="Minimal quality score" help="bases scoring below this value will trigger splitting"/>
+    <param name="length" type="integer" value="100" label="Minimal length of contiguous segment" help="report all high quality segments above this length. Setting this option to '0' will cause the program to return a single longest run of high quality bases per read" />
     <conditional name="sequencing_method_choice">
         <param name="sequencer" type="select" label="Select technology">
             <option value="454">Roche (454) or ABI SOLiD</option>
@@ -22,7 +22,7 @@
             </param>
         </when>
         <when value="Solexa">
-            <param name="input3" type="integer" size="5" value="0" label="Restrict length of each read to" help="('0' = do not trim) The quality of Solexa reads drops towards the end. This option allows selecting the specified number of nucleotides from the beginning and then running the tool." />
+            <param name="input3" type="integer" value="0" label="Restrict length of each read to" help="('0' = do not trim) The quality of Solexa reads drops towards the end. This option allows selecting the specified number of nucleotides from the beginning and then running the tool." />
         </when> 
     </conditional>
 </page>